# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04417.fasta.huge -Q ../query/KIAA1092.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1092, 1154 aa vs ./tmplib.24314 library 1986351 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4767+/-0.00548; mu= 23.8419+/- 0.377 mean_var=188.7450+/-45.843, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 9 in 1/39 Lambda= 0.093355 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1964 ( 757 res) ph00746 ( 757) 1507 216.3 1.3e-56 KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 1303 189.2 3e-48 KIAA1069 ( 787 res) hj05486 ( 787) 828 124.9 4.6e-29 KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304) 582 92.7 6.8e-19 KIAA0581 ( 1218 res) pf10976 (1218) 561 89.3 3.7e-18 >>KIAA1964 ( 757 res) ph00746 (757 aa) initn: 1323 init1: 593 opt: 1507 Z-score: 1108.0 bits: 216.3 E(): 1.3e-56 Smith-Waterman score: 1622; 37.154% identity (66.667% similar) in 759 aa overlap (158-907:20-754) 130 140 150 160 170 180 KIAA10 LPRRSSIIKDGTKQKRERKKTVSFSSMPTEKKISSASDC-INSMVEGSELKKVRSNSRIY ::.. . : . .:..::.:.:.:: . KIAA19 PSPPTPSDGGTKRPGLRALKKMGLTEDEDVRAMLRGSRLRKIRSRTWHK 10 20 30 40 190 200 210 220 230 240 KIAA10 HRYFLLDADMQSLRWEPSKKDSEKAK--IDIKSIKEVRTGKNTDIFRSNGISDQISEDCA .: . :. : :. : . .. . .. :. :: :.... .: : . : KIAA19 ERLYRLQEDGLSV-WFQRRIPRAPSQHIFFVQHIEAVREGHQSEGLRRFG-GAFAPARC- 50 60 70 80 90 100 250 260 270 280 290 300 KIAA10 FSVIYGENYESLDLVANSADVANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWVSQMFS ... . ..:::.: .:. :. :: :: : . :: . :: . :. ... KIAA19 LTIAFKGRRKNLDLAAPTAEEAQRWVRGLTKL----RARLDAM--SQRERLDHWIHSYLH 110 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 360 KIAA10 EIDVDNLGHITLCNAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKEL-HKSKDK-AGTEVTKEEFIEVF . : .. ..... . . .: .: .. : ::: :...:. :.:. :::.. KIAA19 RADSNQDSKMSFKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYLLFKECDHSNNDRLEGAEI--EEFLR-- 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 420 KIAA10 HELCTRPEIYFLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQ .: :::. .. :.:.. . :.. .:. ::: .:: . . ..:. :: .. .. KIAA19 -RLLKRPELEEIFHQYSGEDRVLSAPELLEFLE-DQGEEGATLARAQQLIQTYELNETAK 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 KIAA10 EKGWLSIDGFTNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSD .. ...::: ::.::. .: : : :::.:::.::::.::::::: ..:. :::. KIAA19 QHELMTLDGFMMYLLSPEGAALDNTHTCVFQDMNQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGPSS 280 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 540 KIAA10 ITGYIRALKMGCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPL .:.::. .::: :::: :.:: .::::: :::.::.:.::.:.. . .:: : ::. KIAA19 TEAYVRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVVQAVRDHAFTLSPYPV 340 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 KIAA10 ILCLENHCSIKQQKVMVQHMKKLLGDKLYTT---SPNVEESYLPSPDVLKGKILIKAKKL :: :::::...:: .:..:. .::: : : ::: :: ::::. :::..:.:.::: KIAA19 ILSLENHCGLEQQAAMARHLCTILGDMLVTQALDSPNPEE--LPSPEQLKGRVLVKGKKL 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 KIAA10 SSNCSGVEGDVTDEDEGAEMSQRMGKENMEQPNNVPVKRFQLCKELSELVSICKSVQFKE . : .: . .. : : ... .:..: . . . :. ::: :. :...... KIAA19 PAARSE-DGRALSDREEEEEDDEEEEEEVEAAAQRRLAK-QISPELSALAVYCHATRLRT 460 470 480 490 500 510 660 670 680 690 700 710 KIAA10 FQVSFQVQKYWEVCSFNEVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDF .. . .. . .: :..: :.: : ..:: .: : :.::.: .:..:.:..::.. KIAA19 LHPAPNAPQPCQVSSLSERKAKKLIREAGNSFVRHNARQLTRVYPLGLRMNSANYSPQEM 520 530 540 550 560 570 720 730 740 750 760 770 KIAA10 WKCGCQIVAMNFQTPGLMMDLNIGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVS :. :::.::.:::::: :::: : : ::.:::::.:: .:. : :. . :: KIAA19 WNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNAGRFLVNGQCGYVLKPACLRQPDSTFDPE----YPGPP 580 590 600 610 620 780 790 800 810 820 830 KIAA10 PQLLHIKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIFD : :.....:..:: .. .. .::: : .::::.:::::.:.: : .:: : . KIAA19 RTTLSIQVLTAQQLPKLNAEKPHS-IVDPLVRIEIHGVPADCARQETDYVLNNGFNPRWG 630 640 650 660 670 680 840 850 860 870 880 890 KIAA10 ESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIG-DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAH ....::. ::::.::::: : : . ..:.::.:.:. :. ::::. : : : :. KIAA19 QTLQFQLRAPELALVRFVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLSP 690 700 710 720 730 740 900 910 920 930 940 950 KIAA10 ASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDAT :.::... : KIAA19 ATLFIQIRIQRS 750 >>KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182 aa) initn: 1684 init1: 787 opt: 1303 Z-score: 958.0 bits: 189.2 E(): 3e-48 Smith-Waterman score: 1933; 36.977% identity (64.201% similar) in 933 aa overlap (166-982:71-987) 140 150 160 170 180 190 KIAA10 KDGTKQKRERKKTVSFSSMPTEKKISSASDCINSMVEGSELKKVRSNSRIYHRYFLLDAD :...: :: .. :.:..:. :.. :: KIAA04 SGRAGNWDWHPPAMEEPGPPGGLSQDQVERCMGAMQEGMQMVKLRGGSKGLVRFYYLDEH 50 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 KIAA10 MQSLRWEPSKKDSEKAKIDIKSIKEVRTGKNTDIFRSNGISDQISEDCAFSVIYGENYES . .::.::.:. :::::.: ::.:: :.....:. . ... .: ::. .: . :: KIAA04 RSCIRWRPSRKN-EKAKISIDSIQEVSEGRQSEVFQRYP-DGSFDPNCCFSIYHGSHRES 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 KIAA10 LDLVANSADVANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWVSQMFSEIDVDNLGHIT ::::..:..:: ::::::::.. : : : : : .:..: :.: : .. : .. KIAA04 LDLVSTSSEVARTWVTGLRYLMA-GISDEDSLARRQ-RTRDQWLKQTFDEADKNGDGSLS 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 KIAA10 LCNAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKELHKSKDKAGTEVTKEEFIEVFHELCTRPEIYFLL . ...: ...:: .: .... :.: . :. :: . ::: .. . :: ..:.:. KIAA04 IGEVLQLLHKLNVNLPRQRVKQMFREAD-TDDHQGT-LGFEEFCAFYKMMSTRRDLYLLM 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 KIAA10 VQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQEKGWLSIDGFTNY . .:..:. ::. .:. ::..:: .: .. : .::...:: :.. :: :.::::::: KIAA04 LTYSNHKDHLDAASLQRFLQVEQKMAGVTLESCQDIIEQFEPCPENKSKGLLGIDGFTNY 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 KIAA10 LMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSDITGYIRALKMGCR :: ::.:::..: ::: ::::::::.:::::::. ::. . : . : .:. ::: KIAA04 TRSPAGDIFNPEHHHVHQDMTQPLSHYFITSSHNTYLVGDQLMSQSRVDMYAWVLQAGCR 340 350 360 370 380 390 500 510 520 530 540 550 KIAA10 SVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPLILCLENHCSIKQQ ::.: :::::.::... :.:.::.:.:..::. ::::::. .:::.:: .:::::. :: KIAA04 CVEVDCWDGPDGEPIVHHGYTLTSKILFKDVIETINKYAFIKNEYPVILSIENHCSVIQQ 400 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 KIAA10 KVMVQHMKKLLGDKLYTTSPNVEE-SYLPSPDVLKGKILIKAKKLSSNCS--GVEGDVTD : :.:.. .::::: .: . :. . ::::..::::::.:.::: .: : . ::.:.: KIAA04 KKMAQYLTDILGDKLDLSSVSSEDATTLPSPQMLKGKILVKGKKLPANISEDAEEGEVSD 460 470 480 490 500 510 620 630 KIAA10 EDEGAEM------------SQRMGKENM-----------------EQPNNVPV------- :: . :. ..: :: :.::: : KIAA04 EDSADEIDDDCKLLNGDASTNRKRVENTAKRKLDSLIKESKIRDCEDPNNFSVSTLSPSG 520 530 540 550 560 570 KIAA10 ------------------------------------------------------------ KIAA04 KLGRKSKAEEDVESGEDAGASRRNGRLVVGSFSRRKKKGSKLKKAASVEEGDEGQDSPGG 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 KIAA10 ---------KRFQLCKELSELVSICKSVQFKEFQVSFQVQKYWEVCSFNEVLASKYANEN : ..: . ::.::. ::: ..... .. . :.: ::.:. : . ... KIAA04 QSRGATRQKKTMKLSRALSDLVKYTKSVATHDIEM--EAASSWQVSSFSETKAHQILQQK 640 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 740 KIAA10 PGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCGCQIVAMNFQTPGLMMDLNIGWFRQ :.... .:.. :.:..:: .:.::::.::: ::. :::.::.:.:. : :..:: . : KIAA04 PAQYLRFNQQQLSRIYPSSYRVDSSNYNPQPFWNAGCQMVALNYQSEGRMLQLNRAKFSA 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 KIAA10 NGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKPKGS--GAKGDV ::.:::::.:. : . : :. :..: .:: . : ..:::::..:::. : : .:.. KIAA04 NGGCGYVLKPGCMCQGV--FNPNSEDPLPGQLKKQLVLRIISGQQLPKPRDSMLGDRGEI 760 770 780 790 800 810 810 820 830 840 850 860 KIAA10 VDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIFDESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIG .::.: ::: :.:.::....:..: .:: : ..:.. :....::.:.:::.: : : :: KIAA04 IDPFVEVEIIGLPVDCSREQTRVVDDNGFNPTWEETLVFMVHMPEIALVRFLVWDHDPIG 820 830 840 850 860 870 870 880 890 900 910 920 KIAA10 DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGKPHK--RGLSV .:::: :. : .. ::::: :... .::.:::::... : : .:: . KIAA04 RDFIGQRTLAFSSMMPGYRHVYLEGME-----EASIFVHVAVSDISGKVKQALGLKGLFL 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 KIAA10 RKGKKSR--EYASLRTLWIKTVDE--VFKNAQPPIRDATDLRENMQNAVVSFKELCGLSS : : . .:. : .:.. . ..:. : .. :... . :.. .. : .. KIAA04 RGPKPGSLDSHAAGRPPARPSVSQRILRRTASAPTKSQKPGRRGFPELVLGTRDT-GSKG 930 940 950 960 970 980 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA10 VANLMQCMLAVSPRFLGPDNTPLVVLNLSEQYPTMELQGIVPEVLKKIVTTYDMMIQSLK ::. KIAA04 VADDVVPPGPGPAPEAPAQEGPGSGSPRGKAPAAVAEKSPVRVRPPRVLDGPGPAGMAAT 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>KIAA1069 ( 787 res) hj05486 (787 aa) initn: 1422 init1: 709 opt: 828 Z-score: 613.6 bits: 124.9 E(): 4.6e-29 Smith-Waterman score: 1391; 37.329% identity (62.974% similar) in 659 aa overlap (370-916:1-649) 340 350 360 370 380 390 KIAA10 KELHKSKDKAGTEVTKEEFIEVFHELCTRPEIYFLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQG ..:.::...:..:. : ...: .::..:: KIAA10 DLYLLLLSYSDKKDHLTVEELAQFLKVEQK 10 20 30 400 410 420 430 440 450 KIAA10 VAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQEKGWLSIDGFTNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPL . ... . :.::.:.: :.:.. :. :.:.::::.. :: : ::.: :..: ::: ::: KIAA10 MNNVTTDYCLDIIKKFEVSEENKVKNVLGIEGFTNFMRSPACDIFNPLHHEVYQDMDQPL 40 50 60 70 80 90 460 470 480 490 500 510 KIAA10 SHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSDITGYIRALKMGCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTS .:.: ::::::: ::. . : . : :.:. ::: ::.: :::::.:::.. :.:.:: KIAA10 CNYYIASSHNTYLTGDQLLSQSKVDMYARVLQEGCRCVEVDCWDGPDGEPVVHHGYTLTS 100 110 120 130 140 150 520 530 540 550 560 570 KIAA10 QIVFRSVIDIINKYAFFASEYPLILCLENHCSIKQQKVMVQHMKKLLGDKLYTTSPNVEE .:.::.:.. :::.:: .:.:.:: .::::::.::. ..:..: ..:::: .: .. : KIAA10 KILFRDVVETINKHAFVKNEFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGIFGDKLDLSSVDTGE 160 170 180 190 200 210 580 590 600 610 620 KIAA10 -SYLPSPDVLKGKILIKAKKLSSNCS--GVEGDVTDEDEGAEMS---------------- . ::::. ::::::.:.::: . . . ::.:.::: . :. KIAA10 CKQLPSPQSLKGKILVKGKKLPYHLGDDAEEGEVSDEDSADEIEDECKFKLHYSNGTTEH 220 230 240 250 260 270 630 KIAA10 ----------QRMGKENM----EQPNNVPV------------------------------ . . ::.. :.:.. : KIAA10 QVESFIRKKLESLLKESQIRDKEDPDSFTVRALLKATHEGLNAHLKQSPDVKESGKKSHG 280 290 300 310 320 330 640 KIAA10 -----------------------------------------------KRFQLCKELSELV : ..::.:::.:: KIAA10 RSLMTNFGKHKKTTKSRSKSYSTDDEEDTQQSTGKEGGQLYRLGRRRKTMKLCRELSDLV 340 350 360 370 380 390 650 660 670 680 690 700 KIAA10 SICKSVQFKEFQVSFQVQKYWEVCSFNEVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRI .:: ... . .: ::.:. : . .... .:. ::.. :.:..:: .:: KIAA10 VYTNSVAAQDI---VDDGTTGNVLSFSETRAHQVVQQKSEQFMIYNQKQLTRIYPSAYRI 400 410 420 430 440 710 720 730 740 750 760 KIAA10 DSSNMNPQDFWKCGCQIVAMNFQTPGLMMDLNIGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSA ::::.:: .:. :::.::.:.:. : ::.:: . :. ::::::::.: : . . :. KIAA10 DSSNFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMMQLNRAKFKANGNCGYVLKPQQMCK--GTFNP 450 460 470 480 490 500 770 780 790 800 810 820 KIAA10 NTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKPKGS--GAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTK . : .:. . : .:.::::..::: : : .:...::.: ::: :.:.:: ...:. KIAA10 FSGDPLPANPKKQLILKVISGQQLPKPPDSMFGDRGEIIDPFVEVEIIGLPVDCCKDQTR 510 520 530 540 550 560 830 840 850 860 870 880 KIAA10 TVHQNGDAPIFDESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIGDEFIGQYTIPFECLQTGYRHVP .: .:: :...:.. : ...::.:.:::.: : : :: .:.:: :. : : ::::: KIAA10 VVDDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIGRDFVGQRTVTFSSLVPGYRHVY 570 580 590 600 610 620 890 900 910 920 930 940 KIAA10 LQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVF :..:: .::.:::..:.. : .: KIAA10 LEGLT-----EASIFVHITINEIYGKWSPLILNPSYTILHFLGATKNRQLQGLKGLFNKN 630 640 650 660 670 680 >>KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304 aa) initn: 852 init1: 433 opt: 582 Z-score: 431.0 bits: 92.7 E(): 6.8e-19 Smith-Waterman score: 870; 28.035% identity (53.442% similar) in 799 aa overlap (393-1025:1334-2112) 370 380 390 400 410 420 KIAA10 HELCTRPEIYFLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQ :: :: .:: : ::.:.::: KIAA15 IAAASIVTNGTGIESTSLGIFGVGILQLNDFLVNCQGEHCTYDEI-LSIIQKFEPSISMC 1310 1320 1330 1340 1350 1360 430 440 450 460 470 480 KIAA10 EKGWLSIDGFTNYLMSPDCYIF-DPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPS ..: .:..::. .::. . . . : .. .... :::.:.:.::::::: :..: : KIAA15 HQGLMSFEGFARFLMDKENFASKNDESQENIKELQLPLSYYYIESSHNTYLTGHQLKGES 1370 1380 1390 1400 1410 1420 490 500 510 520 530 540 KIAA10 DITGYIRALKMGCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYP .. : ..: .:::::::: ::: :. :.:: :::.:..: :. :.. :.. ::. :. : KIAA15 SVELYSQVLLQGCRSVELDCWDGDDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFINSDLP 1430 1440 1450 1460 1470 1480 550 560 570 580 590 KIAA10 LILCLENHCSIKQQKVMVQHMKKLLGDKLYTT----SPNVEESYLPSPDVLKGKILIKAK .:. .:::::. ::. :.. .: ..:.:: : . .. .::::: :. :.:.: : KIAA15 IIISIENHCSLPQQRKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKKVLLKNK 1490 1500 1510 1520 1530 1540 600 610 620 KIAA10 KLSSNCSGVE-------------------GDVT--------DEDEGAEMS---QRMGKEN ::... . :. :... .::: :.. . .. .: KIAA15 KLKAHQTPVDILKQKAHQLASMQVQAYNGGNANPRPANNEEEEDEEDEYDYDYESLSDDN 1550 1560 1570 1580 1590 1600 630 640 KIAA10 M--EQPNN--------------VP--VKR-------------------F----------Q . ..:.: .: .:. : : KIAA15 ILEDRPENKSCNDKLQFEYNEEIPKRIKKADNSACNKGKVYDMELGEEFYLDQNKKESRQ 1610 1620 1630 1640 1650 1660 650 660 KIAA10 LCKELSELVSICKSVQF--------------KEFQ------------------VSFQ--- . :::.:: :..:.: :: . .::. KIAA15 IAPELSDLVIYCQAVKFPGLSTLNASGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPGETASFNKTS 1670 1680 1690 1700 1710 1720 670 680 690 KIAA10 -------VQKYWE-----------------------VCSFNEVLASKYANENPGDFVNYN ... :: . :.:: :.. . ..... KIAA15 GKSSCEGIRQTWEESSSPLNPTTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRYSQKLTQHT 1730 1740 1750 1760 1770 1780 700 710 720 730 740 750 KIAA10 KRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCGCQIVAMNFQTPGLMMDLNIGWFRQNGNCGYVL : :..:. :::::: :: :: : :.::.:.:: : . :: . :. ::.::::: KIAA15 ACQLLRTYPAATRIDSSNPNPLMFWLHGIQLVALNYQTDDLPLHLNAAMFEANGGCGYVL 1790 1800 1810 1820 1830 1840 760 770 780 790 800 810 KIAA10 RPAIMREE----VSFFSANTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVY .: .. .. . :: .: . ...: . . :.:::: .. :. : . 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