# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03921a.fasta.huge -Q ../query/KIAA1090.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1090, 715 aa
 vs ./tmplib.24314 library

1986790 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0558+/-0.00587; mu= 17.3363+/- 0.401
 mean_var=128.2214+/-30.952, 0's: 0 Z-trim: 14  B-trim: 37 in 2/38
 Lambda= 0.113265

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA1732  ( 1915 res)   bg00050                    (1915)  706 127.5 1.2e-29
KIAA0388  ( 751 res)   hj00039                     ( 751)  347 68.3 3.1e-12
KIAA1076  ( 804 res)   hj06779                     ( 804)  304 61.3 4.2e-10
KIAA0339  ( 1709 res)   hg01304(revised)           (1709)  272 56.5 2.4e-08
KIAA0304  ( 2415 res)   af07172                    (2415)  270 56.4 3.7e-08
KIAA1113  ( 1131 res)   hj06379(revised)           (1131)  209 46.0 2.4e-05
KIAA1125  ( 1205 res)   hk07594                    (1205)  182 41.6 0.00053
KIAA1506  ( 3309 res)   ff04330                    (3309)  183 42.4 0.00084
KIAA0383  ( 1781 res)   hh00708s1                  (1781)  176 40.9  0.0013
KIAA1757  ( 1409 res)   fh19225(revised)           (1409)  164 38.8  0.0044
KIAA1696  ( 635 res)   fj12768                     ( 635)  158 37.3  0.0055
KIAA1876  ( 803 res)   pf01162s1                   ( 803)  154 36.8    0.01


>>KIAA1732  ( 1915 res)   bg00050                         (1915 aa)
 initn: 703 init1: 604 opt: 706  Z-score: 624.4  bits: 127.5 E(): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 706;  40.293% identity (69.231% similar) in 273 aa overlap (359-620:844-1108)

      330       340       350       360       370              380 
KIAA10 RETQESERKPPPYKHIKVNKPYGKVQIYTADISEIPKCNCKPTDENP-------CGFDSE
                                     ::... .:.: : ...        :: :  
KIAA17 CAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRM-QCECTPLSKDERAQGEIACGED--
           820       830       840        850       860       870  

             390       400       410       420       430       440 
KIAA10 CLNRMLMFECHPQVCPAGEFCQNQCFTKRQYPETKIIKTDGKGWGLVAKRDIRKGEFVNE
       ::::.::.::  . :: :..:.:. : ..:. ....: :. ::::: : .:. .. :: :
KIAA17 CLNRLLMIECSSR-CPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLE
              880        890       900       910       920         

             450       460       470       480       490       500 
KIAA10 YVGELIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETL
       : ::..:..:  ::.:.  .:   :.:.... .:.::::  ::: ::::::::.::::: 
KIAA17 YCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQ
     930       940       950       960       970       980         

             510       520       530       540       550       560 
KIAA10 KWTVNGDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCGASNCSGFLGDRPKTSTT
       ::::::. :::.:..  .:.:.::::.:...  :.:   : ::..:: :.:: . ..:  
KIAA17 KWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIR
     990      1000      1010      1020      1030      1040         

             570       580       590        600          610       
KIAA10 LSSEEKGKKTKKKTRRRRAKGEGKRQSEDECFR-CGDGGQLVLCDR---KFCTKAYHLSC
        .    : : ::.  :.. . .:. ..  :  .  .: .:..  .:   .. :   .:.:
KIAA17 AA----GGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTC
    1050          1060      1070      1080      1090      1100     

       620       630       640       650       660       670       
KIAA10 LGLGKRPFGKWECPWHHCDVCGKPSTSFCHLCPNSFCKEHQDGTAFSCTPDGRSYCCEHD
       : :                                                         
KIAA17 LELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNM
        1110      1120      1130      1140      1150      1160     

>>KIAA0388  ( 751 res)   hj00039                          (751 aa)
 initn: 333 init1: 171 opt: 347  Z-score: 311.6  bits: 68.3 E(): 3.1e-12
Smith-Waterman score: 362;  32.479% identity (58.120% similar) in 234 aa overlap (317-529:506-731)

        290       300       310       320       330         340    
KIAA10 FPYMEGDRGSRYQGVRGIGRVFKNALQEAEARFREIKLQREARETQESERKP--PPYKHI
                                     :. :.:.:...   ::  . .:   : .  
KIAA03 AVKESLILKLPTDELMNPSQKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDNSSTQVYNYQPCDHPDRPC
         480       490       500       510       520       530     

          350       360       370          380            390      
KIAA10 KVNKPYGKVQIYTADISEIPKCNCKPTDEN--P-CGFDSECLNR-----MLMFECHPQVC
         . :     :.: .. :   :.:.:  .:  : :   ..: ..     . . :: :..:
KIAA03 DSTCPC----IMTQNFCE-KFCQCNPDCQNRFPGCRCKTQCNTKQCPCYLAVRECDPDLC
         540            550       560       570       580       590

           400              410        420       430       440     
KIAA10 ---PAGEF-------CQNQCFTKRQYPETKIIK-TDGKGWGLVAKRDIRKGEFVNEYVGE
           :.:        :.: :  .:   .  ..  .:  :::   :....:.::..:: ::
KIAA03 LTCGASEHWDCKVVSCKN-CSIQRGLKKHLLLAPSDVAGWGTFIKESVQKNEFISEYCGE
              600        610       620       630       640         

         450       460       470       480       490       500     
KIAA10 LIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETLKWTV
       ::...:   : : .... .. : ......: ..::  :::  :: ::: .::: .    :
KIAA03 LISQDEADRRGK-VYDKYMSSF-LFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVVMV
     650       660        670        680       690       700       

         510       520       530       540       550       560     
KIAA10 NGDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCGASNCSGFLGDRPKTSTTLSSE
       ::: :.:.::   : :: :: :.:                                    
KIAA03 NGDHRIGIFAKRAIQAGEELFFDYRYSQADALKYVGIERETDVL                
       710       720       730       740       750                 

>>KIAA1076  ( 804 res)   hj06779                          (804 aa)
 initn: 293 init1: 215 opt: 304  Z-score: 273.3  bits: 61.3 E(): 4.2e-10
Smith-Waterman score: 304;  34.810% identity (60.759% similar) in 158 aa overlap (396-552:650-803)

         370       380       390       400        410       420    
KIAA10 CNCKPTDENPCGFDSECLNRMLMFECHPQVCPAGEFCQNQC-FTKRQYPETKIIKTDGKG
                                     : .  .  ::  : :..    :. :.  . 
KIAA10 SIPAQPHASTRAGSERRSEQRRLLSSFTGSCDSDLLKFNQLKFRKKK---LKFCKSHIHD
     620       630       640       650       660          670      

          430       440       450       460       470       480    
KIAA10 WGLVAKRDIRKGEFVNEYVGELIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKG
       ::: : . :   :.: ::::. : .     : :. ... :   ::. .:.: ::::   :
KIAA10 WGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCG
        680       690       700       710       720       730      

          490       500       510       520       530       540    
KIAA10 NYSRFMNHSCQPNCETLKWTVNGDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCG
       :..::.::::.::: .   ::... .. ...   : .. :.:..:..  . . :  : ::
KIAA10 NFARFINHSCNPNCYAKVITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFP-IEDVKIPCLCG
        740       750       760       770       780        790     

          550       560       570       580       590       600    
KIAA10 ASNCSGFLGDRPKTSTTLSSEEKGKKTKKKTRRRRAKGEGKRQSEDECFRCGDGGQLVLC
       . :: : :                                                    
KIAA10 SENCRGTLN                                                   
         800                                                       

>>KIAA0339  ( 1709 res)   hg01304(revised)                (1709 aa)
 initn: 233 init1: 197 opt: 272  Z-score: 241.7  bits: 56.5 E(): 2.4e-08
Smith-Waterman score: 272;  35.156% identity (60.938% similar) in 128 aa overlap (425-552:1582-1708)

          400       410       420       430       440       450    
KIAA10 VCPAGEFCQNQCFTKRQYPETKIIKTDGKGWGLVAKRDIRKGEFVNEYVGELIDEEECMA
                                     ::: : . :   :.: ::::. : .     
KIAA03 SAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADM
            1560      1570      1580      1590      1600      1610 

          460       470       480       490       500       510    
KIAA10 RIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETLKWTVNGDTRVGLF
       : :.  .. :   :.. .:.: ::::   :: .::.:: : ::: .   :.... .. ..
KIAA03 REKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIY
            1620      1630      1640      1650      1660      1670 

          520       530       540       550       560       570    
KIAA10 AVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCGASNCSGFLGDRPKTSTTLSSEEKGKKTKKK
       .   : .  :.:..:..  : ..:  : ::. .: : :                      
KIAA03 SKQPIGVDEEITYDYKFP-LEDNKIPCLCGTESCRGSLN                     
            1680       1690      1700                              

          580       590       600       610       620       630    
KIAA10 TRRRRAKGEGKRQSEDECFRCGDGGQLVLCDRKFCTKAYHLSCLGLGKRPFGKWECPWHH

>>KIAA0304  ( 2415 res)   af07172                         (2415 aa)
 initn: 360 init1: 178 opt: 270  Z-score: 238.4  bits: 56.4 E(): 3.7e-08
Smith-Waterman score: 270;  35.766% identity (59.854% similar) in 137 aa overlap (417-552:2279-2414)

        390       400       410       420       430       440      
KIAA10 LMFECHPQVCPAGEFCQNQCFTKRQYPETKIIKTDGKGWGLVAKRDIRKGEFVNEYVGEL
                                     . ..  .: ::  ::.:  ::.: :: : .
KIAA03 LRSTRRATSLELPMAMRFRHLKKTSKEAVGVYRSAIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYSGIV
     2250      2260      2270      2280      2290      2300        

        450       460       470       480       490       500      
KIAA10 IDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETLKWTVN
       :       : :  ...     ::. .:   ..::  .:: .::.::::.::: .    :.
KIAA03 IRSVLTDKREKF-YDGKGIGCYMFRMDDFDVVDATMHGNAARFINHSCEPNCFSRVIHVE
     2310      2320       2330      2340      2350      2360       

        510       520       530        540       550       560     
KIAA10 GDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCL-GNEKTVCRCGASNCSGFLGDRPKTSTTLSSE
       :. .. .::.  :  : :::..:..    ...:  : :::. :  ::             
KIAA03 GQKHIVIFALRRILRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKRCRRFLN            
      2370      2380      2390      2400      2410                 

         570       580       590       600       610       620     
KIAA10 EKGKKTKKKTRRRRAKGEGKRQSEDECFRCGDGGQLVLCDRKFCTKAYHLSCLGLGKRPF

>>KIAA1113  ( 1131 res)   hj06379(revised)                (1131 aa)
 initn: 178 init1: 153 opt: 209  Z-score: 187.9  bits: 46.0 E(): 2.4e-05
Smith-Waterman score: 210;  28.440% identity (52.294% similar) in 218 aa overlap (16-226:750-940)

                              10        20        30        40     
KIAA10                SLMAGSFCWRMLGLVSKVGNRARCFSSVAASEEELLDFSGSELQF
                                     :..:.:. : ::  ..:.       . :.:
KIAA11 TMNPSPGPSALSPGSSGLSNSHTPVRPPSTSSTGSRGSCGSSGRTAEK-------TSLSF
     720       730       740       750       760              770  

          50        60        70        80        90       100     
KIAA10 NSCSLHLSLHPFFNFLLGIHSCFVCKESKTDVKRCVVTQCGKFYHEACVKKYPLTVFESR
       .: ..... .:  .  .   :  : .:.  : .:   . :     :. .   ::..    
KIAA11 KSDQVKVKQEPGTEDEICSFSGGVKQEKTEDGRR---SACMLSSPESSLTP-PLST----
            780       790       800          810       820         

         110       120       130       140       150       160     
KIAA10 GFRCPLHSCVSCHASNPSNPRPSKGKMMRCVRCPVAYHSGDACLAAGCSVIASNSIICTA
            :.: ..  ::  .. .   . : .   :    .:: . :. : : : :       
KIAA11 --NLHLESELDALASLENHVKTEPADMNE--SCK---QSGLSSLVNGKSPIRS-----LM
            830       840       850            860       870       

         170          180       190       200          210         
KIAA10 HFTAR---KGKRHHAHVNVSWCFVCSKGGSLLCCESCPAAFHPDC---LNIEMPDGSWFC
       : .::    :. .    : .:: ::..::.:::::.:: .::  :     . .:.:.:.:
KIAA11 HRSARIGGDGNNKDDDPNEDWCAVCQNGGDLLCCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWIC
            880       890       900       910       920       930  

     220        230       240       250       260       270        
KIAA10 NDCR-AGKKLHFQDIIWVKLGNYRWWPAEVCHPKNVPPNIQKMKHEIGEFPVFFFGSKDY
       . ::  ::                                                    
KIAA11 TFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKKGKTAQGLSPVDQRKCERLLLYLYCHELSIEFQEPVPA
            940       950       960       970       980       990  

>>KIAA1125  ( 1205 res)   hk07594                         (1205 aa)
 initn: 276 init1: 128 opt: 182  Z-score: 163.7  bits: 41.6 E(): 0.00053
Smith-Waterman score: 182;  46.341% identity (73.171% similar) in 41 aa overlap (183-222:109-149)

            160       170       180       190       200       210  
KIAA10 CSVIASNSIICTAHFTARKGKRHHAHVNVSWCFVCSKGGSLLCCESCPAAFHPDCLNIEM
                                     .:.:: . :..:::: :: ..:  :: .  
KIAA11 ELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTS
       80        90       100       110       120       130        

             220       230       240       250       260       270 
KIAA10 -PDGSWFCNDCRAGKKLHFQDIIWVKLGNYRWWPAEVCHPKNVPPNIQKMKHEIGEFPVF
        :.:.::: .:                                                 
KIAA11 EPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPL
      140       150       160       170       180       190        

>>KIAA1506  ( 3309 res)   ff04330                         (3309 aa)
 initn: 164 init1:  91 opt: 183  Z-score: 160.1  bits: 42.4 E(): 0.00084
Smith-Waterman score: 187;  24.352% identity (48.187% similar) in 193 aa overlap (60-223:398-582)

      30        40        50        60        70          80       
KIAA10 ASEEELLDFSGSELQFNSCSLHLSLHPFFNFLLGIHSCFVCKE--SKTDVKRCVVTQCGK
                                     : :.   : ::    . .. .  . .:::.
KIAA15 GVSTADISSNKDDEENSMHNTVVLFSSSDKFTLNQDMCVVCGSFGQGAEGRLLACSQCGQ
       370       380       390       400       410       420       

        90       100       110        120       130       140      
KIAA10 FYHEACVKKYPLTVFESRGFRCPLHSCVSCHA-SNPSNPRPSKGKMMRCVRCPVAYHSGD
        ::  ::.     :  :.:.::    :. :.: .. ..:    :... :  : ..::.  
KIAA15 CYHPYCVSIKITKVVLSKGWRC--LECTVCEACGKATDP----GRLLLCDDCDISYHT--
       430       440         450       460           470           

        150       160            170        180       190          
KIAA10 ACLAAGCSVIASNSIICT-----AHFTARK-GKRHHAHVNVSWCFVCSKGGS--------
        ::    ... ...  :       :  : . : : . . : . :  :.. .:        
KIAA15 YCLDPPLQTVPKGGWKCKWCVWCRHCGATSAGLRCEWQNNYTQCAPCASLSSCPVCYRNY
     480       490       500       510       520       530         

                 200       210              220       230       240
KIAA10 -----LLCCESCPAAFHPDCLNIE-------MPDGSWFCNDCRAGKKLHFQDIIWVKLGN
            .: :..:   .:  : :..       . : .. :. ::                 
KIAA15 REEDLILQCRQCDRWMHAVCQNLNTEEEVENVADIGFDCSMCRPYMPASNVPSSDCCESS
     540       550       560       570       580       590         

              250       260       270       280       290       300
KIAA10 YRWWPAEVCHPKNVPPNIQKMKHEIGEFPVFFFGSKDYYWTHQARVFPYMEGDRGSRYQG
                                                                   
KIAA15 LVAQIVTKVKELDPPKTYTQDGVCLTESGMTQLQSLTVTVPRRKRSKPKLKLKIINQNSV
     600       610       620       630       640       650         

>>KIAA0383  ( 1781 res)   hh00708s1                       (1781 aa)
 initn: 167 init1:  75 opt: 176  Z-score: 156.7  bits: 40.9 E(): 0.0013
Smith-Waterman score: 178;  21.964% identity (42.636% similar) in 387 aa overlap (110-455:212-560)

      80        90       100       110       120       130         
KIAA10 CVVTQCGKFYHEACVKKYPLTVFESRGFRCPLHSCVSCHASNPSNPRPSKGKMMRCVRCP
                                     :.  :  : ... :: . .  ... :. : 
KIAA03 KGAPQYPSAFPSSLPPVSLLPHEKDQPRADPIPICSFCLGTKESNREKKPEELLSCADCG
             190       200       210       220       230       240 

     140       150       160       170       180       190         
KIAA10 VAYHSGDACLAAGCSVIASNSIICTAHFTARKGKRHHAHVNVSWCFVCSKGG----SLLC
        . :   .::            .:    :  :. : .  .. . : .:   :    ..: 
KIAA03 SSGH--PSCLK-----------FCPELTTNVKALRWQC-IECKTCSACRVQGRNADNMLF
               250                  260        270       280       

         200       210          220          230       240         
KIAA10 CESCPAAFHPDCLNI---EMPDGSWFCNDCRA---GKKLHFQDIIWVKLGNYRWWPAEVC
       :.::  .:: .: .    .:: : :.:. ::    :.::  .    .:    : .   . 
KIAA03 CDSCDRGFHMECCDPPLSRMPKGMWICQVCRPKKKGRKLLHEKAAQIK----RRYAKPIG
       290       300       310       320       330           340   

     250        260       270        280       290       300       
KIAA10 HPKN-VPPNIQKMKHEIGEFPVFF-FGSKDYYWTHQARVFPYMEGDRGSRYQGVRGIGRV
       .::: .   . ..  . : . .:   :: :     . ..   .:.        :  ::  
KIAA03 RPKNKLKQRLLSVTSDEGSMNAFTGRGSPDT----EIKINIKQES------ADVNVIGN-
           350       360       370           380             390   

       310        320       330       340       350       360      
KIAA10 FKNALQEAEAR-FREIKLQREARETQESERKPPPYKHIKVNKPYGKVQIYTADISEIPKC
        :... : .   :..   :. . :  : :       .      .:: .: :   :  :. 
KIAA03 -KDVVTEEDLDVFKQA--QELSWEKIECESGVEDCGRYPSVIEFGKYEIQTWYSSPYPQE
             400         410       420       430       440         

        370       380          390            400                  
KIAA10 NCKPTDENPCGFDSECLNRML---MFECHPQVC-----PAGE------------------
         .      : :   ::. :    ..  : . :     ::.:                  
KIAA03 YARLPKLYLCEF---CLKYMKSKNILLRHSKKCGWFHPPANEIYRRKDLSVFEVDGNMSK
     450       460          470       480       490       500      

               410       420        430       440       450        
KIAA10 -FCQNQCFTKRQYPETKIIKTDGKGWGL-VAKRDIRKGEFVNEYVGELIDEEECMARIKH
        .::: :.  . . . : .  : . . . :  .. .::  .   :: :  :. :. .   
KIAA03 IYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTKNDEKGCHL---VGYLSKEKLCQQKYNV
        510       520       530       540          550       560   

      460       470       480       490       500       510        
KIAA10 AHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETLKWTVNGDTRVGLFAVCD
                                                                   
KIAA03 SCIMIMPQHQRQGFGRFLIDFSYLLSRREGQAGSPEKPLSDLGRLSYLAYWKSVILEYLY
           570       580       590       600       610       620   

>>KIAA1757  ( 1409 res)   fh19225(revised)                (1409 aa)
 initn: 185 init1: 108 opt: 164  Z-score: 147.1  bits: 38.8 E(): 0.0044
Smith-Waterman score: 166;  22.857% identity (53.810% similar) in 210 aa overlap (402-591:227-431)

             380       390       400        410       420       430
KIAA10 DENPCGFDSECLNRMLMFECHPQVCPAGEFCQNQCF-TKRQYPETKIIKTDGKGWGLVAK
                                     :.:  . .. :    .. ... .   : : 
KIAA17 QNALEQHLHSSKEFVGKPTILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAA
        200       210       220       230       240       250      

              440       450       460       470           480      
KIAA10 RDIRKGEFVNEYVGELIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDK----DRIIDAGPKGNY
       ::.    .. :: :... ...  .   ..:     . ..:  .:    .  .::   :: 
KIAA17 RDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEV---NGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGND
        260       270       280          290       300       310   

        490       500       510       520         530        540   
KIAA10 SRFMNHSCQPNCETLKWTVNGDTRVGLFAVCDIPAGTELT--FNYNL-DCLGNEKTVCRC
       .::. .:: :: :. .  ..:  .. ..::  :   .:.:  :.:.  .:  : :. : :
KIAA17 ARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNC--NYKVDCAC
           320       330       340       350       360         370 

             550                 560       570       580       590 
KIAA10 --GASNCSGF----------LGDRPKTSTTLSSEEKGKKTKKKTRRRRAKGEGKRQSEDE
         :  ::             :   : .  :...: . .:...:  . . ..:......:.
KIAA17 HKGNRNCPIQKRNPNATELPLLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELEMEQQNEASEENNDQ
             380       390       400       410       420       430 

             600       610       620       630       640       650 
KIAA10 CFRCGDGGQLVLCDRKFCTKAYHLSCLGLGKRPFGKWECPWHHCDVCGKPSTSFCHLCPN
                                                                   
KIAA17 QSQEVPEKVTVSSDHEEVDNPEEKPEEEKEEVIDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFEN
             440       450       460       470       480       490 




715 residues in 1 query   sequences
1986790 residues in 2037 library sequences
 Scomplib [34.26]
 start: Thu Dec 18 15:08:44 2008 done: Thu Dec 18 15:08:45 2008
 Total Scan time:  0.530 Total Display time:  0.240

Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]