# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj07515.fasta.huge -Q ../query/KIAA1084.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1084, 778 aa vs ./tmplib.24314 library 1986727 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0056+/-0.00651; mu= 10.3901+/- 0.441 mean_var=172.2746+/-43.749, 0's: 0 Z-trim: 52 B-trim: 123 in 1/39 Lambda= 0.097716 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 250 48.4 4.9e-06 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 232 45.5 1.9e-05 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 229 44.9 2.3e-05 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 236 46.7 2.4e-05 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 227 44.7 3e-05 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 226 44.7 3.7e-05 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 226 44.9 4.4e-05 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 220 43.8 6.3e-05 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 219 43.8 7.5e-05 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 215 43.0 9e-05 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 216 43.4 0.00011 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 212 42.5 0.00012 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 213 42.8 0.00012 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 212 42.5 0.00012 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 211 42.3 0.00012 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 215 43.3 0.00012 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 211 42.4 0.00013 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 213 42.9 0.00014 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 209 42.1 0.00016 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 208 42.2 0.00023 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 209 42.5 0.00023 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 205 41.6 0.00025 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 203 41.4 0.00032 KIAA1782 ( 545 res) aj00273 ( 545) 201 41.1 0.00038 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 200 40.9 0.00039 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 200 40.9 0.00041 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 201 41.2 0.00043 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 199 40.8 0.00046 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 202 41.5 0.00047 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 199 40.9 0.00049 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 197 40.5 0.00058 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 196 40.4 0.00061 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 198 40.9 0.00064 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 195 40.4 0.00081 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 192 39.8 0.00095 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 194 40.3 0.00097 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 191 39.7 0.001 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 194 40.4 0.001 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 187 38.8 0.0011 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 183 38.5 0.002 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 185 39.0 0.0021 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 185 39.1 0.0023 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 183 38.6 0.0023 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 180 38.2 0.0031 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 183 39.0 0.0036 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 168 35.7 0.0048 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 175 37.5 0.0052 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 177 38.1 0.0058 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 173 37.2 0.0061 KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 177 38.2 0.0063 >>KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165 aa) initn: 189 init1: 104 opt: 250 Z-score: 200.2 bits: 48.4 E(): 4.9e-06 Smith-Waterman score: 250; 31.111% identity (73.333% similar) in 90 aa overlap (652-738:628-715) 630 640 650 660 670 680 KIAA10 LKELQDNAQCQPNSDTSLSGNNVVEYIPNAERPYRCRLCHYTSGNKGYIKQHLRVHRQRQ :.:..: :...: ..... .: ::: .. 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KIAA19 TQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKG 360 370 380 390 400 410 730 740 750 760 770 KIAA10 QLRNHEREQHSLPDTLSIATSNEPRISSDTADGKCVQEGIYVFCYAGCSDLHMT .::::.: KIAA19 HLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIE 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1141 ( 914 res) hk01833 (914 aa) initn: 477 init1: 213 opt: 226 Z-score: 183.1 bits: 44.9 E(): 4.4e-05 Smith-Waterman score: 226; 31.068% identity (64.078% similar) in 103 aa overlap (631-731:803-905) 610 620 630 640 650 KIAA10 LLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQDNAQCQPNSD--TSLSGNNVVEYIPNAERPYRCR :: . :. : .. . . ..:.:::: KIAA11 YVCDYCGKAFGLSAELVRHQRIHTGEKPYVCQECGKAFTQSSCLSIHRRVHTGEKPYRCG 780 790 800 810 820 830 660 670 680 690 700 710 KIAA10 LCHYTSGNKGYIKQHLRVHRQRQPYQCPICEHIADNSKDLESHMIHHCKTRIYQCKQCEE : . ..:. . :: :.: ..::.: .: . : :..:. : . .:::..:.. 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KIAA15 YACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVECR 380 390 400 410 420 430 >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 680 init1: 215 opt: 219 Z-score: 178.9 bits: 43.8 E(): 7.5e-05 Smith-Waterman score: 219; 34.884% identity (63.953% similar) in 86 aa overlap (646-731:470-555) 620 630 640 650 660 670 KIAA10 ASDDDILKELQDNAQCQPNSDTSLSGNNVVEYIPNAERPYRCRLCHYTSGNKGYIKQHLR . : .::.::.: : : .:. .. : : KIAA09 QHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQKSTLRGHQR 440 450 460 470 480 490 680 690 700 710 720 730 KIAA10 VHRQRQPYQCPICEHIADNSKDLESHMIHHCKTRIYQCKQCEESFHYKSQLRNHEREQHS .: ..::.: : . ... :..: : . .::.:: ..: ::.:: :.: KIAA09 IHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTG 500 510 520 530 540 550 740 750 760 770 KIAA10 LPDTLSIATSNEPRISSDTADGKCVQEGIYVFCYAGCSDLHMT KIAA09 EKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKPF 560 570 580 590 600 610 >>KIAA1572 ( 492 res) fh23424 (492 aa) initn: 315 init1: 188 opt: 215 Z-score: 177.5 bits: 43.0 E(): 9e-05 Smith-Waterman score: 215; 27.612% identity (60.448% similar) in 134 aa overlap (623-756:318-447) 600 610 620 630 640 650 KIAA10 VKTGISMSLLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQDNAQCQPNSDTSLSGNNVVEYIPNAE : :: . :: . . .: .... . . 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