# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06779.fasta.nr -Q ../query/KIAA1076.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1076, 804 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7783515 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0312+/-0.000219; mu= 6.2317+/- 0.012 mean_var=207.5701+/-39.618, 0's: 42 Z-trim: 140 B-trim: 130 in 1/64 Lambda= 0.089021 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119618696|gb|EAW98290.1| hCG1812756 [Homo sapie (1048) 5622 735.5 2.6e-209 gi|166977692|sp|Q9UPS6.2|SET1B_HUMAN RecName: Full (1923) 5622 735.8 3.9e-209 gi|73995176|ref|XP_543382.2| PREDICTED: similar to (1925) 4931 647.1 2e-182 gi|26251880|gb|AAH40775.1| Setd1b protein [Mus mus ( 911) 4720 619.6 1.8e-174 gi|27371314|gb|AAH41681.1| Setd1b protein [Mus mus ( 917) 4720 619.6 1.8e-174 gi|149063329|gb|EDM13652.1| rCG21620 [Rattus norve (1091) 4720 619.6 2e-174 gi|211830050|gb|AAH38367.2| Setd1b protein [Mus mu (1103) 4720 619.7 2e-174 gi|166977693|sp|Q8CFT2.2|SET1B_MOUSE RecName: Full (1985) 4720 620.0 2.9e-174 gi|194674646|ref|XP_591902.4| PREDICTED: similar t (1965) 4417 581.1 1.5e-162 gi|149622223|ref|XP_001506028.1| PREDICTED: hypoth (1287) 2632 351.6 1.2e-93 gi|109099078|ref|XP_001092613.1| PREDICTED: simila ( 560) 2596 346.5 1.7e-92 gi|123884540|sp|Q08D57.1|SET1B_XENTR RecName: Full (1956) 2338 314.0 3.6e-82 gi|82234463|sp|Q66J90.1|SET1B_XENLA RecName: Full= (1938) 2282 306.8 5.2e-80 gi|82231199|sp|Q5F3P8.1|SET1B_CHICK RecName: Full= (2008) 2181 293.9 4.3e-76 gi|148687701|gb|EDL19648.1| mCG11130 [Mus musculus ( 807) 2107 283.9 1.8e-73 gi|166977691|sp|Q1LY77.2|SET1B_DANRE RecName: Full (1844) 2083 281.3 2.5e-72 gi|47223666|emb|CAF99275.1| unnamed protein produc (1830) 1918 260.1 5.9e-66 gi|119917047|ref|XP_001251265.1| PREDICTED: simila (1708) 1545 212.1 1.5e-51 gi|148685638|gb|EDL17585.1| mCG141846, isoform CRA (1006) 1541 211.3 1.5e-51 gi|119572565|gb|EAW52180.1| hCG1998636, isoform CR (1189) 1527 209.6 5.9e-51 gi|126334524|ref|XP_001364653.1| PREDICTED: simila (1706) 1528 209.9 6.8e-51 gi|194219010|ref|XP_001915080.1| PREDICTED: SET do (1707) 1528 209.9 6.8e-51 gi|68052990|sp|O15047.3|SET1A_HUMAN RecName: Full= (1707) 1527 209.8 7.4e-51 gi|114662085|ref|XP_523492.2| PREDICTED: SET domai (1707) 1527 209.8 7.4e-51 gi|29437232|gb|AAH49883.1| Setd1a protein [Mus mus ( 849) 1487 204.3 1.7e-49 gi|119508422|ref|NP_821172.2| SET domain containin (1716) 1487 204.7 2.6e-49 gi|27552784|gb|AAH42890.1| Setd1a protein [Mus mus ( 458) 1459 200.4 1.4e-48 gi|20071601|gb|AAH27450.1| SETD1A protein [Homo sa ( 469) 1454 199.7 2.2e-48 gi|73958366|ref|XP_848999.1| PREDICTED: similar to (1330) 1458 200.8 3e-48 gi|16307411|gb|AAH10250.1| Setd1a protein [Mus mus ( 316) 1439 197.6 6.5e-48 gi|189517169|ref|XP_001920852.1| PREDICTED: simila (2257) 1396 193.1 1e-45 gi|210105454|gb|EEA53465.1| hypothetical protein B (2482) 1330 184.7 3.9e-43 gi|189238620|ref|XP_969339.2| PREDICTED: similar t (1268) 1208 168.7 1.3e-38 gi|212510240|gb|EEB13451.1| mixed-lineage leukemia ( 574) 1194 166.5 2.8e-38 gi|108872954|gb|EAT37179.1| hypothetical protein A (1670) 1169 163.8 5.1e-37 gi|119572564|gb|EAW52179.1| hCG1998636, isoform CR (1010) 1120 157.3 2.9e-35 gi|47217812|emb|CAG07226.1| unnamed protein produc (1884) 1115 157.0 6.7e-35 gi|71051743|gb|AAH98812.1| RGD1311624 protein [Rat ( 216) 1067 149.6 1.2e-33 gi|113206662|gb|ABI34482.1| SET domain containing ( 175) 1039 145.9 1.3e-32 gi|189522655|ref|XP_699940.3| PREDICTED: SET domai (1391) 1045 147.8 2.8e-32 gi|157020798|gb|EAA03662.4| AGAP002246-PA [Anophel (1669) 1012 143.7 6e-31 gi|193669173|ref|XP_001945277.1| PREDICTED: simila (1282) 1000 142.0 1.5e-30 gi|198414837|ref|XP_002125245.1| PREDICTED: simila ( 754) 981 139.2 5.7e-30 gi|110767088|ref|XP_395451.3| PREDICTED: similar t (1406) 971 138.3 2.1e-29 gi|190580050|gb|EDV20136.1| hypothetical protein T ( 217) 957 135.5 2.2e-29 gi|115631595|ref|XP_791552.2| PREDICTED: hypotheti (1963) 971 138.5 2.5e-29 gi|210116876|gb|EEA64617.1| hypothetical protein B ( 292) 941 133.6 1.1e-28 gi|51951109|gb|EAL24598.1| CG40351, isoform A [Dro (1641) 941 134.5 3.3e-28 gi|194181998|gb|EDW95609.1| GE25383 [Drosophila ya (1628) 940 134.4 3.6e-28 gi|190614619|gb|EDV30143.1| GF23123 [Drosophila an ( 236) 926 131.6 3.7e-28 >>gi|119618696|gb|EAW98290.1| hCG1812756 [Homo sapiens] (1048 aa) initn: 5622 init1: 5622 opt: 5622 Z-score: 3913.9 bits: 735.5 E(): 2.6e-209 Smith-Waterman score: 5622; 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