# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06550.fasta.huge -Q ../query/KIAA1073.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1073, 675 aa vs ./tmplib.24314 library 1986830 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5497+/-0.00511; mu= 12.4758+/- 0.349 mean_var=107.0584+/-25.261, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.123955 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0371 ( 1203 res) hh00252 (1203) 966 183.9 7e-47 KIAA0647 ( 1195 res) hj03819s1 (1195) 909 173.7 8.2e-44 KIAA1682 ( 775 res) fh23774 ( 775) 392 81.1 4.1e-16 >>KIAA0371 ( 1203 res) hh00252 (1203 aa) initn: 1227 init1: 934 opt: 966 Z-score: 933.5 bits: 183.9 E(): 7e-47 Smith-Waterman score: 1178; 38.503% identity (62.567% similar) in 561 aa overlap (129-627:49-593) 100 110 120 130 140 150 KIAA10 SNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTG-AVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVL :.: : . ....::::..: : .. KIAA03 ANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKES----LV 20 30 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 KIAA10 DASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFP .. : .:. :: .. . :. .::: . .: . . .. . . : . : KIAA03 NVPLQLIESVEC--------RDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWL-KRLNNAIRP 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 KIAA10 VSNNLPLFAFEYK----EVFP---ENGWKLYDPLL--------EYRRQGIP-NESWRITK .. ::.: :. ::. :. : : : .:.:. :..:::.. 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