# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ah03682.fasta.huge -Q ../query/KIAA1066.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1066, 1346 aa vs ./tmplib.24314 library 1986159 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0827+/- 0.008; mu= -7.4665+/- 0.542 mean_var=288.8383+/-69.158, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 24 in 1/39 Lambda= 0.075465 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0516 ( 1382 res) hg00484s2 (1382) 2772 316.3 2.3e-86 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 426 61.0 2e-09 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 397 57.7 1.5e-08 KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405) 351 52.8 5.1e-07 >>KIAA0516 ( 1382 res) hg00484s2 (1382 aa) initn: 3804 init1: 1283 opt: 2772 Z-score: 1642.5 bits: 316.3 E(): 2.3e-86 Smith-Waterman score: 4682; 57.101% identity (78.150% similar) in 1373 aa overlap (16-1346:62-1382) 10 20 30 40 KIAA10 RAALAAAVAAMMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGS :. ::: .. ::.:::::::::::: KIAA05 VPARVGSVPCGQVPPLCRRRPGPPARPLATMELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGS 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 KIAA10 IYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYE ::::::::: :::::::::::::: ::::::::....:::.:::::::.:::::.:::: KIAA05 IYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYE 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 KIAA10 REKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERES ::::::..::::::::::. :::::.:: .:: : :::::::::::::::::::::::. 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KIAA05 VDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDD------- 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 KIAA10 LCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEK .:: :: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::: KIAA05 --DDSD-IPTAQRKRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEK 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 KIAA10 KKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHYKSPTT--AGFSQRRNHAMCPISAG-SR :.:.:::::::::::::. .:.: : ::..:..::. . ..:. .. . . :. KIAA05 KRSSIWQFFSRLFSSSSN--TTKKPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSK 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 KIAA10 PLEFFPDDDCTSSA-RREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQED ..:. .. .: : ::::::::::::. ::...:::.:: ::::: ::::.. .:: . KIAA05 AFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVT--NGQGE 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 KIAA10 TRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAP-GRDPLTCDR ..:::.::::: ::: ::: .::::::.:::::: . :.:. : . .: : KIAA05 NKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCAVGVNLSGGKTR--DGGSVVGASVFYKDVAGLDT 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 KIAA10 EGDGEPKSAHTSPEK------KKAKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTV ::. . .....: .: .. ::: ... :: ::: ::: ...::.:::: :::.. KIAA05 EGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNI 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 KIAA10 VDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSD-----------VNPEDPGADGVLAG .:.:::::.:::::.:.:.: ..::: :: . .: .. . .:..:.: KIAA05 LDSFTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGG 850 860 870 880 890 900 860 870 880 890 900 910 KIAA10 ITLVGCATR-CNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQST-EEATEATEVPD ::.:::... . .. :. : .::.:: : :..:. . : :::::::: . KIAA05 ITVVGCSAEGVTGAATSPSTNGASPVMDKPPEMEAE--NSEVDENVPTAEEATEATE-GN 910 920 930 940 950 920 930 940 950 960 KIAA10 PGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDP--APTPSS-GP--QPGSENGPEPDSSSTRP-EPEPS : .: . . : :::::::: . : . .: : .... :. :. : : . KIAA05 AGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLGVQIPEDLSPVYQSSNDSDAYKDQISVLPNEQDLV 960 970 980 990 1000 1010 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA10 GDPTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALA . . :: :::::::::: :::::.::.:.:::::::::::.::.::::: :::::: KIAA05 REEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA10 DGTLAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQI :::::::::: :::::::::::.:::.::::::::.::.:.:::::.::..:.:::.:.: KIAA05 DGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKI 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA10 EKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGT :::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: KIAA05 EKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGT 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA10 GKLGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEG :::::::::::::.:. .::::::::::.:::::::: :::: . :. 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KIAA05 SGTDLTGDKAGPSAQEPGSQTP---LKSMLVISGGEGYIDFRMGD-EGGESELLGEDLP- 1310 1320 1330 1340 1350 1330 1340 KIAA10 VKPVLSKAERSHIIVWQVSYTPE ..: ..::::::.::::: : : KIAA05 LEPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE 1360 1370 1380 >>KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609 aa) initn: 570 init1: 281 opt: 426 Z-score: 261.2 bits: 61.0 E(): 2e-09 Smith-Waterman score: 533; 24.037% identity (49.696% similar) in 986 aa overlap (448-1341:701-1609) 420 430 440 450 460 470 KIAA10 SVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQ .:. : : .:.. . ....: :: . KIAA03 EQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEA-RP 680 690 700 710 720 480 490 500 510 520 KIAA10 AKVK-LENRIKELEEELKRVKSEAII--ARREPKEE--AEDVSSYLCTESDKIPM---AQ : .: ::. ..: .: :.. :. .: ..: :. : ..:. .. . :. :: KIAA03 AFLKFLEQSMRENKE--KQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQ 730 740 750 760 770 780 530 540 550 560 570 KIAA10 R-------------RRFTRVE-MARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQ : : ..: ::::.: . . : . .:: .: . : .. KIAA03 RNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIG 790 800 810 820 830 840 580 590 600 610 620 630 KIAA10 EKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHYKSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRP :: ... : . . .. . .. :... : . .. ... . . : KIAA03 GKKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSL-YTAASVIDTASKYKMLW------KLP 850 860 870 880 890 900 640 650 660 670 680 690 KIAA10 LEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTR :: : : ..: . .::. ... . : : . : . . :. . .:. KIAA03 LE---DADIIKGASQATNREN---IQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDA- 910 920 930 940 950 700 710 720 730 740 KIAA10 MKNVPVPVYCRPLVEKD--------PTMKL-WCAA---GVNLSGWRPNEDDAGNGVKPA- .... . .. : : ::. : :: ::. :.. .. . :: : . : KIAA03 LRDLSAAMH-RDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAF 960 970 980 990 1000 1010 750 760 770 780 790 KIAA10 -PGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKEL------PEMDAT---SSRVWILTSTLTT .. :. .. .:. .. : : . . : ... : .::. .: . KIAA03 DEAKRKLASSKSCL-DPEFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 800 810 820 830 840 850 KIAA10 SKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDY--PPGEMFLDSDVNPEDPGAD ..: ... : ..::.:..:::...:. . . :: . .. :: : . KIAA03 GQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 860 870 880 890 KIAA10 GVLAGITLVGCATRCNVPRSNC---SSRGD----TPVLDKGQGEVATI-----ANGKVNP . . . :: . . : : :. :: : .:. . . .. . .: KIAA03 LDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 900 910 920 930 940 950 KIAA10 SQS---TEEATEATEVPDPGPSE-PETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGP-QPGSENGP : : .:...: . : : : . . . .:. : :: ::. : KIAA03 SPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGT 1200 1210 1220 1230 1240 1250 960 970 980 990 1000 KIAA10 EP----------DSSSTRPEPEP--SGDPTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKK : .: :: : : :: . :: .:::...: ..:... . . KIAA03 SPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEAYQSS----VWLGTEDGCVHVYQSSDSIRD 1260 1270 1280 1290 1300 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA10 CLHSIKLKD--SVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQ-WDLSNYHLMDLGHPHHS .:.::. :: .......:.:.::.: :....: : :. :: .:.. . :: KIAA03 RRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQR-EAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSP 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA10 IRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLD : :. : :.::: .:.: :..: :.:.:. : . : .. . ::::... . KIAA03 ITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGS 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA10 STLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKML-GTGKL----GFSFVRITALLVAGSRLWVGTGN . . ::: : ..: .::. : : .:: :. . . .::::::: :::::. KIAA03 AHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSA 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA10 GVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYC :::...: . : . .: : : : :: : KIAA03 GVVLTMPTSP----------GTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVR-----------F---- 1490 1500 1510 1520 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA10 SMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPG-------NVLATLNGSVLDSP-AEGPGPAAPASEVE .: .:: :. ... .: . : .:. ::: .::.:: : KIAA03 -LAAVQL-----PDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHR--DSPWHRGPAPARP----- 1530 1540 1550 1560 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA10 GQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSKAERSHIIVWQVSYTP ..::.:::.:: :::...: . .: . : : .:...:.: KIAA03 -----KMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDST----------NHLLLWRV 1570 1580 1590 1600 KIAA10 E >>KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284 aa) initn: 323 init1: 221 opt: 397 Z-score: 245.5 bits: 57.7 E(): 1.5e-08 Smith-Waterman score: 397; 30.651% identity (58.621% similar) in 261 aa overlap (925-1181:851-1097) 900 910 920 930 940 950 KIAA10 KVNPSQSTEEATEATEVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPE ::.: : . : : ..: : :: KIAA16 AVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSF------PLAAPVLCMEYIPE 830 840 850 860 870 960 970 980 990 1000 1010 KIAA10 -PDSSSTRPEPEPSGDPTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLK--DS . . .: : .::. ... ::. :: :.: . ..:.: . .:: : . . 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