# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh12158.fasta.nr -Q ../query/KIAA1059.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1059, 1297 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7819269 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9207+/-0.000193; mu= 12.5382+/- 0.011 mean_var=109.8845+/-21.381, 0's: 40 Z-trim: 56 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.122351 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109658610|gb|AAI17418.1| Sortilin-related VPS10 (1222) 8177 1455.1 0 gi|114632721|ref|XP_508024.2| PREDICTED: VPS10 dom (1230) 7844 1396.4 0 gi|119917737|ref|XP_609898.3| PREDICTED: similar t (1222) 7667 1365.1 0 gi|27151696|sp|Q8VI51.1|SORC3_MOUSE RecName: Full= (1219) 7582 1350.1 0 gi|194205680|ref|XP_001916849.1| PREDICTED: simila (1160) 7380 1314.4 0 gi|73998822|ref|XP_544009.2| PREDICTED: similar to (1135) 7144 1272.8 0 gi|119569974|gb|EAW49589.1| sortilin-related VPS10 (1287) 6770 1206.8 0 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