# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh12146s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1058.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1058, 2095 aa vs ./tmplib.24314 library 1985410 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1641+/-0.00497; mu= 17.6586+/- 0.338 mean_var=100.6147+/-24.178, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.127863 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1395 ( 2051 res) hj07927s1 (2051) 739 148.7 1.5e-35 KIAA1771 ( 1302 res) pj02581(revised) (1302) 727 146.2 5.3e-35 KIAA0694 ( 595 res) hk03987s1 ( 595) 548 112.8 2.8e-25 >>KIAA1395 ( 2051 res) hj07927s1 (2051 aa) initn: 2151 init1: 643 opt: 739 Z-score: 729.9 bits: 148.7 E(): 1.5e-35 Smith-Waterman score: 2674; 30.665% identity (58.229% similar) in 1999 aa overlap (311-2094:171-2026) 290 300 310 320 330 KIAA10 DKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGL-- : . . .:.. : :: .:. .: : KIAA13 VTTDTQRERQKGLPRQVFEQDASGDERSGPEDSNDSRRGSGSPEDTPRSSGASSIFDLRN 150 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 KIAA10 ---DSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVK--------LFYLDPDAQKLDFSSAEPEVKSFE :: :: : . : .. ..:. . .: :: .. ..:: . KIAA13 LAADSLLPSLLERAAPEDVDRRNETLRRQHRPPALLTLYPAPDEDEAVERCSRPEPP--R 210 220 230 240 250 390 400 410 420 430 440 KIAA10 EKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLN :.::.:::::: .:.:... .::.: :.:.:.. ..::: .:. ::: KIAA13 EHFGQRILVKCLSLKFEIE-------------IEPIFGILALYDVREKKKISENFYFDLN 260 270 280 290 300 450 460 470 480 490 500 KIAA10 HFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEK :.. .: . .:. : : ...::::: : :::::: ..:: KIAA13 SDSMKGLLRA------HGT-----------HPAISTLARSAIFSVTYPSPDIFLVIKLEK 310 320 330 340 510 520 530 540 550 560 KIAA10 VLQ-GSITHCAEPYM--KSSDSSKVAQKVLK---NAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFK- ::: :.:..: :::: : :..: .:. : :.: : :::.:::::::.: : . KIAA13 VLQQGDISECCEPYMVLKEVDTAKNKEKLEKLRLAAEQFCTRLGRYRMPFAWTAVHLANI 350 360 370 380 390 400 570 580 KIAA10 -DASGNLDKNA-----------------------------RFSAI----------YRQDS ...:.::... ::.. ..:.. KIAA13 VSSAGQLDRDSDSEGERRPAWTDRRRRGPQDRASSGDDACSFSGFRPATLTVTNFFKQEA 410 420 430 440 450 460 590 600 610 620 630 KIAA10 NKLSNDDMLKLLADFRKPEKMAK-LPVILGNLDITIDNVSSDFPNY-VNSSYIPTKQFET ..::..:..:.:::.:.: .. . : . ..: : :. . . :.. .. . : . KIAA13 ERLSDEDLFKFLADMRRPSSLLRRLRPVTAQLKIDISPAPEN-PHFCLSPELLHIKPYPD 470 480 490 500 510 520 640 650 660 670 680 690 KIAA10 CSKTPITFEVEEFVPCIPKHTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKD : : :. :: : .. :.: : : :::::. :...:.. ...::.:. ... KIAA13 PRGRP-TKEILEF-PAREVYA-PHTSYRNLLYVYPHSLNFSSRQ--GSVRNLAVRVQYM- 530 540 550 560 570 580 700 710 720 730 740 750 KIAA10 SDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAAVLHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTF . :. :: : :.:. . ::: ::. :..:...::::.:.:..::. . :.::::.:: KIAA13 TGEDPSQALPVIFGKSSCSEFTREAFTPVVYHNKSPEFYEEFKLHLPACVTENHHLLFTF 590 600 610 620 630 640 760 770 780 790 800 810 KIAA10 FHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVTSEQHIPVSANLPSGYLGYQELG .:::: . . ..:: ::..:.:::. :. :. .:::.. : .:. : KIAA13 YHVSC------QPRPGTALETPVGFTWIPLLQHRRLRTGPFCLPVSVDQPPP--SYSVLT 650 660 670 680 690 820 830 840 850 860 870 KIAA10 MGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTESGAQAL------- : ..:::: : .... ::.:. :: .: .:: . : :: . KIAA13 PDVAL-PGMRWVDGHKGVFSVELTAVSSVHPQDPYLDKFFTLVHVLEEGAFPFRLKDTVL 700 710 720 730 740 750 880 890 900 910 920 KIAA10 --GN---ELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQ-EEVAVNVTR----VI :: :: : .:. . ..:: .:..: :.. : ::. : .. KIAA13 SEGNVEQELRASLAALRLASPEPLVAFSHHVLDKLVRLVIRPPIISGQIVNLGRGAFEAM 760 770 780 790 800 810 930 940 950 KIAA10 IHVVAQCHE--------EGLESHLRSYVKYAYK---AEPYV------------------- :::. :. .: .: .::.::.. .:: . KIAA13 AHVVSLVHRSLEAAQDARGHCPQLAAYVHYAFRLPGTEPSLPDGAPPVTVQAATLARGSG 820 830 840 850 860 870 960 970 980 KIAA10 --ASEY------------------KTVHEELTKSMTTIL---KPSADFLTSNK-----LL :: : .: .:... ... : . . ....:.. .: KIAA13 RPASLYLARSKSISSSNPDLAVAPGSVDDEVSRILASKLLHEELALQWVVSSSAVREAIL 880 890 900 910 920 930 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA10 KYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSKVKLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPE ...::::....:::: ::. .... :. :::. . . ..:. . .. . . . : KIAA13 QHAWFFFQLMVKSMALHLLLGQRLDTPRKLRFPGRFLDDITALVGSVGLEVITRVHKDVE 940 950 960 970 980 990 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA10 ASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYISCFAP-----GDPKTLFEYKFEFLRVV ... : ::: :.. ....::::::. . . . : .: .:. ..:: :.. KIAA13 LAEHLNASLAFFLSDLLSLVDRGFVFSLVRAHYKQVATRLQSSPNPAALLTLRMEFTRIL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1100 1110 1120 1130 KIAA10 CNHEHYIPLNLPM-PFGK------------GRIQRYQDLQLD------YSLTDEFCRNHF :.::::. :::: :.. .. . ... : . :. : ..:: KIAA13 CSHEHYVTLNLPCCPLSPPASPSPSVSSTTSQSSTFSSQAPDPKVTSMFELSGPFRQQHF 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA10 LVGLLLREVGTALQEFREVRLI----AISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPL :.:::: :.. ::. : .. :::....:: :. : ::: . .::.: ::::: KIAA13 LAGLLLTELALALEPEAEGAFLLHKKAISAVHSLLCGHDTDPRYAEATVKARVAELYLPL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA10 FGLLIENVQRINVRDVSPFPVNAGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGA ... ... :.. : . : :. . :. : . .: . :. :. KIAA13 LSIARDTLPRLH--DFAEGP---GQRSRLASM-------LDSDTEG-------EGDIAGT 1180 1190 1200 1210 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA10 ISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTDSGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSV :. .. .. : . : . :.: .. .: .: ..: KIAA13 INPSVAMAIAGGPLAPGSRASISQGPPTASRAGCALSAESS------------------- 1220 1230 1240 1250 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA10 VRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKAST-SELMDFFTISEVCLHQFQYM ..:: : :..::. .. ::. : : .: .. . .:: :.: KIAA13 -----------RTLLACVLWVLKN-TEPALLQRWATDLTLPQLGRLLDLLYLCLAAFEYK 1260 1270 1280 1290 1300 1380 1390 1400 KIAA10 GKRYIARTGM--------MHARLQQ--LGSLD------------------NSLTFNHSYG ::. . : . :.:::.. ::.. ... . .: KIAA13 GKKAFERINSLTFKKSLDMKARLEEAILGTIGARQEMVRRSRERSPFGNPENVRWRKSVT 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA10 H----SDA------DVLHQSLLEANIATEVCLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMK : :: .. :..:.:.:.:::. :..:::: ... . .. ..... .. KIAA13 HWKQTSDRVDKTKDEMEHEALVEGNLATEASLVVLDTLEIIV----QTVMLSEARESVLG 1370 1380 1390 1400 1410 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA10 KVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAALCYEILKCCNSKL :. : : : . :: :.. ... :.:. ::: ..: ...:: :: ..:. :.:.. KIAA13 AVLKVVLYSLGSAQSALFLQHGLATQRALVSKFPELLFEEDTELCADLCLRLLRHCGSRI 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA10 SSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLSII :.:::.:: ::.:::.::. :. .:.:...:: .:.:.:.. . ... ....::. : KIAA13 STIRTHASASLYLLMRQNFEI-GH-NFARVKMQVTMSLSSLVGTTQNFSEEHLRRSLKTI 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA10 NNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYAST . :. : .. ..:. .:.:: .. .: :..::::..:::::.::.: .:..: .. KIAA13 LTYAEEDMGLRDSTFAEQVQDLMFNLHMILTDTVKMKEHQEDPEMLIDLMYRIARGYQGS 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1640 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA10 PELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACL :.:: :::..:: :.. :. .:::.:.::..:::::::. : : : KIAA13 PDLRLTWLQNMAGKHAELGNHAEAAQCMVHAAALVAEYLALLE---------DHRH---- 1600 1610 1620 1630 1640 1700 1710 1720 1730 1740 KIAA10 RRSRGGVFRQGCTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDV-------HFNEDVLMELLEQCAD . ::..:. :. :. ::... .:. : ::.: :. :::: : KIAA13 -------LPVGCVSFQNISSNVLEESAISDDILSPDEEGFCSGKHFTELGLVGLLEQAAG 1650 1660 1670 1680 1690 1750 1760 1770 1780 1790 1800 KIAA10 GLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYF . . :: . ..:: .::: : .::...:: .. :..:..:. . . .:..:::: KIAA13 YFTMGGLYEAVNEVYKNLIPILEAHRDYKKLAAVHGKLQEAFTKIMHQSSGWERVFGTYF 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1810 1820 1830 1840 1850 1860 KIAA10 RVAFFGQAAQYQFTDSETDVEGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSE ::.:.: . : : : .:..::::..: :.:::.:: ..:...::.. KIAA13 RVGFYG---------------AHFGDLDEQEFVYKEPSITKLAEISHRLEEFYTERFGDD 1760 1770 1780 1790 1800 1870 1880 1890 1900 1910 1920 KIAA10 NVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSHNIRRFMFEMPFT :..:.::. :. . :::. ::::.:.: :.:: ::..: : :.:....: :.: ::: KIAA13 VVEIIKDSNPVDKSKLDSQKAYIQITYVEPYFDTYELKDRVTYFDRNYGLRTFLFCTPFT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1930 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA10 QTGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELR :. .: . :: ::.:.:.. : :::.: :: : ....: :.:.::::..:.::. :: KIAA13 PDGRAHGELPEQHKRKTLLSTDHAFPYIKTRIRVCHREETVLTPVEVAIEDMQKKTRELA 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1990 2000 2010 2020 2030 2040 KIAA10 QLCSSAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFL----DDTNTKRYPDNKVKLLKEV . : ::. :::::. :: ::: :..:: .: . :. ::..: KIAA13 FATEQDPPDAKMLQMVLQGSVGPTVNQGPLEVAQVFLAEIPEDPKLFRH-HNKLRL---C 1930 1940 1950 1960 1970 2050 2060 2070 2080 2090 KIAA10 FRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQLG :..: . : .:: :. :: :: ::..:.. :: .. . :. .. ..: KIAA13 FKDFCKKCEDALRKNKALIGPDQKEYHRELERNYCRLREALQPLLTQRLPQLMAPTPPGL 1980 1990 2000 2010 2020 2030 KIAA13 RNSLNRASFRKADL 2040 2050 >>KIAA1771 ( 1302 res) pj02581(revised) (1302 aa) initn: 1819 init1: 658 opt: 727 Z-score: 720.2 bits: 146.2 E(): 5.3e-35 Smith-Waterman score: 1872; 31.689% identity (61.622% similar) in 1196 aa overlap (983-2094:176-1275) 960 970 980 990 1000 1010 KIAA10 SEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSKVKLLRN :. .::::....:::..:: :.:.. :. KIAA17 LTGRLPTKKLFHEELALQWVVCSGSVRESALQQAWFFFELMVKSMVHHLYFNDKLEAPRK 150 160 170 180 190 200 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA10 QRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQI .::: . . ..:. . :...:. . : . : ::: :.. .. :::::::. : KIAA17 SRFPERFMDDIAALVSTIASDIVSRFQKDTEMVERLNTSLAFFLNDLLSVMDRGFVFSLI 210 220 230 240 250 260 1080 1090 1100 1110 KIAA10 NN---YISC--FAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPF-------------- .. .: .. .:..: ...:::..:.::::. :::: . KIAA17 KSCYKQVSSKLYSLPNPSVLVSLRLDFLRIICSHEHYVTLNLPCSLLTPPASPSPSVSSA 270 280 290 300 310 320 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA10 ---GKGRIQRYQDLQLD--YSLTDEFCRNHFLVGLLLREVGTALQEFRE----VRLIAIS ..: :: .. . :. : ..:.:.::.: :... :. : .. .:. KIAA17 TSQSSGFSTNVQDQKIANMFELSVPFRQQHYLAGLVLTELAVILDPDAEGLFGLHKKVIN 330 340 350 360 370 380 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA10 VLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPVNAGMTVKD ...::: .:. : ::.. . .::.: :::::.:...:.: .. : . . : . KIAA17 MVHNLLSSHDSDPRYSDPQIKARVAMLYLPLIGIIMETVPQL--YDFTETHNQRGRPI-- 390 400 410 420 430 440 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA10 ESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGS-LI .: . ..:: ..... ::.: . : : : :: :. KIAA17 -CIATDDYE----SESGSMISQTVAM----AIAGTSVPQLTR-P-----------GSFLL 450 460 470 480 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA10 STDSGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDD .. :: . ..:.: .:::.:.:..::. .. KIAA17 TSTSGRQHTTFSAESS---------------------------RSLLICLLWVLKNADET 490 500 510 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA10 ALFTYWNKASTSELMDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIARTGM--------MHARLQQ--LG .: ... :. .: .. . .:. :.: ::. . : . :.:.:.. :: KIAA17 VLQKWFTDLSVLQLNRLLDLLYLCVSCFEYKGKKVFERMNSLTFKKSKDMRAKLEEAILG 520 530 540 550 560 570 1400 1410 KIAA10 SL-------------------------DNSLTFNHSYGH----------SDADVLHQSLL :. ...: . ... : : :.. :..:. KIAA17 SIGARQEMVRRSRGQLERSPSGSAFGSQENLRWRKDMTHWRQNTEKLDKSRAEIEHEALI 580 590 600 610 620 630 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA10 EANIATEVCLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNV ..:.:::. : :::: . . . . . .... .. :. : : . .:: . :.. KIAA17 DGNLATEANLIILDTLEIVVQTVS----VTESKESILGGVLKVLLHSMACNQSAVYLQHC 640 650 660 670 680 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA10 FTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYT :.. :.:. ::: ..: ....:: :: ..:. :.:....::..:: ::.:::.::. KIAA17 FATQRALVSKFPELLFEEETEQCADLCLRLLRHCSSSIGTIRSHASASLYLLMRQNFEIG 690 700 710 720 730 740 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA10 GKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDL ..:.:...:: .:.:.:.. ... ...::. : . :. : ...:.: ..:.:: KIAA17 --NNFARVKMQVTMSLSSLVGTSQNFNEEFLRRSLKTILTYAEEDLELRETTFPDQVQDL 750 760 770 780 790 800 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA10 TKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLS . .. .: :..::::..:::::.::.: .::.: ..:.:: :::..:: : . .. . KIAA17 VFNLHMILSDTVKMKEHQEDPEMLIDLMYRIAKGYQTSPDLRLTWLQNMAGKHSERSNHA 810 820 830 840 850 860 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA10 EAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQGCTAFRVITPNI :::.: :: .:::::::. : .. : ::..:. :. :. KIAA17 EAAQCLVHSAALVAEYLSMLEDRKYLPV--------------------GCVTFQNISSNV 870 880 890 900 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA10 DEEASMMEDVGMQDV-------HFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIY ::... .:: : .:.:. :. :::: : .. : :: . ..::..:::. 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