# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh11838.fasta.huge -Q ../query/KIAA1057.ptfa ./tmplib.24314 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
KIAA1057, 977 aa
vs ./tmplib.24314 library
1986528 residues in 2037 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6039+/-0.00506; mu= 19.6517+/- 0.345
mean_var=94.3133+/-22.591, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40
Lambda= 0.132065
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2037)
KIAA0570 ( 3412 res) hk03615s2 (3412) 582 122.5 9e-28
KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123) 234 55.6 4.2e-08
KIAA0055 ( 1120 res) ha01049 (1120) 230 54.8 7e-08
KIAA1891 ( 780 res) fk02783 ( 780) 186 46.2 1.9e-05
KIAA1003 ( 917 res) hk09911 ( 917) 166 42.5 0.00029
KIAA1063 ( 593 res) hj04848 ( 593) 163 41.7 0.00033
KIAA1097 ( 980 res) hk07058 ( 980) 159 41.2 0.00077
KIAA0891 ( 1371 res) hk08201 (1371) 159 41.4 0.00094
KIAA0529 ( 952 res) hg02898s1 ( 952) 149 39.3 0.0028
KIAA1372 ( 773 res) fj03335 ( 773) 146 38.6 0.0037
KIAA1203 ( 727 res) fg03361 ( 727) 142 37.8 0.006
KIAA1515 ( 757 res) fh04655(revised) ( 757) 139 37.3 0.0092
>>KIAA0570 ( 3412 res) hk03615s2 (3412 aa)
initn: 696 init1: 276 opt: 582 Z-score: 590.5 bits: 122.5 E(): 9e-28
Smith-Waterman score: 838; 26.039% identity (57.479% similar) in 722 aa overlap (1-693:1717-2360)
10 20 30
KIAA10 LADSSPSNLQIIIKELLSMHHQPDPALTKE
.. .: : ..: . ....: : .
KIAA05 LFLLPSLKDRQQPKCKSHSSRAAAYDLLVEMVKGSVENYRLIHNWVMAQHMQSHAPY--K
1690 1700 1710 1720 1730 1740
40 50 60 70 80 90
KIAA10 FDYLPPVDSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQQLYMQPGLPESLLSVDDDTDNPDDSVFY
.:: : : :. :::: : :::::. ...::::: : ...... . : ...
KIAA05 WDYWPHEDVRAECRFVGLTNLGATCYLASTIQQLYMIPEARQAVFTAKYSEDMKHKTTLL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
100 110 120 130 140 150
KIAA10 QVQSLFGHLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKELYVREQQDAYEFFTSLIDQMDEYLKKMG
..:..: .::::. . : :. : : . : .. : . ::.: ::::.:: ...:. ..
KIAA05 ELQKMFTYLMESECKAYNPRPFCKTYTMDKQPLNTGEQKDMTEFFTDLITKIEEMSPEL-
1810 1820 1830 1840 1850 1860
160 170 180 190 200 210
KIAA10 RDQIFKNTFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEG
.. . :. : :. ... . :: : . : :... :.. ... :::. . ..:::
KIAA05 KNTV-KSLFGGVITNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEG
1870 1880 1890 1900 1910 1920
220 230 240 250 260 270
KIAA10 SNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNME
.: : : .: .: . ::.:.:.:: .: .. ::. :. . . : . .. :: :.:
KIAA05 DNMYTCSHCGKKVRAEKRACFKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRLDMT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
280 290 300 310 320 330
KIAA10 PYTVSGMARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYS
::: . . ..:: :. . : : ..: . . .:.:.:: ::.: : .:::::
KIAA05 PYTEDFLM---GKSERKEGFKEV------SDHSKDSESYEYDLIGVTVHTGTADGGHYYS
1990 2000 2010 2020 2030
340 350 360 370 380
KIAA10 FIKD---RRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQ-TNPYTDVR-
::.: .. ..::: :::. .. :: . : ::::::. :.::. :. . :
KIAA05 FIRDIVNPHAYKNNKWYLFNDAEVKPFD--SAQLASECFGGEMTTKTYDSVTDKFMDFSF
2040 2050 2060 2070 2080 2090
390 400 410 420 430 440
KIAA10 RRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPRPHRPN
.. .::::::.:. :: . . : .
KIAA05 EKTHSAYMLFYKRME------------------------------PE---EENGREY---
2100 2110
450 460 470 480 490 500
KIAA10 NDRLSILTKLVKKGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMKNRDVYSSDYFSFVLSLASL
.... ..:. . . .:..:....... ::.:. .: :
KIAA05 --KFDVSSELL------------------EWIWHDNMQFLQDKNIFEHTYFGFMWQLCSC
2120 2130 2140 2150
510 520 530 540 550 560
KIAA10 NATKLKHPYYPCMAKVSLQLAIQFLFQTYLRTKKKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQW
. : : .. .. .:. .:...:....:.: . .:: . ...: ::.:
KIAA05 IPSTLPDP--KAVSLMTAKLSTSFVLETFIHSKEKPTM--LQWIELLTKQFNNSQAACEW
2160 2170 2180 2190 2200 2210
570 580 590 600 610
KIAA10 LVEYFISSEGRELIKIFLLECN---VREV--RVAVATILE-KTLDSALFYQDKLKS----
... . ... . .: :..: ::.. :. . .: . . . . :. : ...
KIAA05 FLDRMADDDWWPM-QI-LIKCPNQIVRQMFQRLCIHVIQRLRPVHAHLYLQPGMEDGSDD
2220 2230 2240 2250 2260
620 630 640 650 660
KIAA10 -------------LHQLLEVLLALLDKDVPENCKNCAQYFFLFNTFVQKQGIRAGDLLLR
. .....:: .... : . :. ..:: .. :. :.: . ...::
KIAA05 MDTSVEDIGGRSCVTRFVRTLLLIMEHGVKPHSKHLTEYFAFLYEFA-KMGEEESQFLLS
2270 2280 2290 2300 2310 2320
670 680 690 700 710 720
KIAA10 HSALRHMISFLLGASR-QNNQIRRWSSAQAREFGNLHNTVALLVLHSDVSSQRNVAPGIF
.:. :. : .:.. .: :.. : ...:
KIAA05 LQAISTMVHFYMGTKGPENPQVEVLSEEEGEEEEEEEDILSLAEEKYRPAALEKMIALVA
2330 2340 2350 2360 2370 2380
730 740 750 760 770 780
KIAA10 KQRPPISIAPSSPLLPLHEEVEALLFMSEGKPYLLEVMFALRELTGSLLALIEMVVYCCF
KIAA05 LLVEQSRSERHLTLSQTDMAALTGGKGFPFLFQHIRDGINIRQTCNLIFSLCRYNNRLAE
2390 2400 2410 2420 2430 2440
>>KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123 aa)
initn: 362 init1: 138 opt: 234 Z-score: 237.4 bits: 55.6 E(): 4.2e-08
Smith-Waterman score: 368; 27.760% identity (55.521% similar) in 317 aa overlap (47-351:125-404)
20 30 40 50 60 70
KIAA10 LSMHHQPDPALTKEFDYLPPVDSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQQLYMQPGLPESLLS
::.: : ::..::..: : . : : . :::
KIAA14 CGDGVPAPQKVLFPTERLSLRWERVFRVGAGLHNLGNTCFLNATIQCLTYTPPLANYLLS
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120 130
KIAA10 VDDDTDNPDDSVFYQVQSLFGHLMES---KLQYYVPENFWKIFKMWNKELYVREQQDAYE
. . . : : .. . .:.... . . : .: . .: ... .:.::.:
KIAA14 KEHARSCHQGS-FCMLCVMQNHIVQAFANSGNAIKPVSFIRDLKKIARHFRFGNQEDAHE
160 170 180 190 200 210
140 150 160 170 180
KIAA10 FFTSLIDQMDEYL----KKMGRDQ----IFKNTFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMAL
:. :: :.. :. :. . .. : : .. :. : . . .. .
KIAA14 FLRYTIDAMQKACLNGCAKLDRQTQATTLVHQIFGGYLRSRVKCSVCKSVSDTYDPYLDV
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
KIAA10 NLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRF
: . . .. .:. ::...:: : :::.: :::.: . :: :. .::.. : ::
KIAA14 ALEIRQAANIVRALELFVKADVLSGENAYMCAKCKKKVPASKRFTIHRTSNVLTLSLKRF
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
KIAA10 GFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGMARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKV
. .. .:. : .. .: .::..:: :... :: : :
KIAA14 A-NFSGGKITK---DVGYPEFLNIRPY----MSQN--------NGDPVMYG---------
340 350 360
310 320 330 340 350 360
KIAA10 ALTENYELVGVIVHSGQA-HAGHYYSFIKDRRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYE
: .:.:::: . :::::: ..: ..:.::..::...
KIAA14 -------LYAVLVHSGYSCHAGHYYCYVK----ASNGQWYQMNDSLVHSSNVKVVLNQQA
370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
KIAA10 CFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLS
KIAA14 YVLFYLRIPGSKKSPEGLISRTGSSSLPGRPSVIPDHSKKNIGNGIISSPLTGKRQDSGT
420 430 440 450 460 470
>>KIAA0055 ( 1120 res) ha01049 (1120 aa)
initn: 285 init1: 143 opt: 230 Z-score: 233.3 bits: 54.8 E(): 7e-08
Smith-Waterman score: 344; 24.870% identity (50.259% similar) in 386 aa overlap (34-376:767-1117)
10 20 30 40 50 60
KIAA10 SSPSNLQIIIKELLSMHHQPDPALTKEFDYLPPVDSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQQ
: :: . :. ...:::: : :::::...:
KIAA00 TVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQC
740 750 760 770 780 790
70 80 90 100 110
KIAA10 LYMQPGLPESL-LSVDDDTDNPDDSVFYQ--VQSLFGHLMES----KLQYYVPENFWKIF
: : : . . . .: : .. . .. : :: .:.. . .: :..: .
KIAA00 LCNAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITI
800 810 820 830 840 850
120 130 140 150
KIAA10 KMWNKELYVREQQDAYEFFTSLIDQMDEYLKKMGRDQIFKNT------------------
: .. :::. :.. :.: . : :.: . .:.
KIAA00 GKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKH
860 870 880 890 900 910
160 170 180 190 200
KIAA10 -----------FQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQ--SLEISLDQFVRG
::: ... : : .. . :::: :.: ..: . .:. : : .
KIAA00 KQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKE
920 930 940 950 960 970
210 220 230 240 250 260
KIAA10 EVLEGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFD--WESGRSIKYDEQIRF
: : .: .:: .:. .: ..:. : .:: ::..:: ::..: :.. : . .. :
KIAA00 EKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ----KLQTSVDF
980 990 1000 1010 1020 1030
270 280 290 300 310 320
KIAA10 PWM-LNMEPYTVSGMARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQ
: :.. :... :.... ..:.: .: : :
KIAA00 PLENLDLSQYVIG-------------------------PKNNL---KKYNLFSVSNHYGG
1040 1050 1060
330 340 350 360 370 380
KIAA10 AHAGHYYSFIKDRRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLND--ETLEYECFGGEYRPKVYDQTNP
.::: .. :. .. .:.::.: . ...... . : : :.: :
KIAA00 LDGGHYTAYCKN---AARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
390 400 410 420 430 440
KIAA10 YTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPR
>>KIAA1891 ( 780 res) fk02783 (780 aa)
initn: 236 init1: 96 opt: 186 Z-score: 189.7 bits: 46.2 E(): 1.9e-05
Smith-Waterman score: 198; 26.452% identity (57.419% similar) in 155 aa overlap (188-334:449-602)
160 170 180 190 200 210
KIAA10 TFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCE
: . :. :. :. :.: :.: ::::
KIAA18 PPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCE
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250 260 270
KIAA10 KCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGM
.: . . : : : :.. :.::..: . : ... .: .:.. ....
KIAA18 NCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLVLELPVKRITSF
480 490 500 510 520 530
280 290 300 310 320
KIAA10 ARQDSS-------SEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSG-QAHAGHYY
. . : ....:: . . .: . . . :. : : .:.:::: ....::::
KIAA18 SSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVP-YLLSSVVVHSGISSESGHYY
540 550 560 570 580 590
330 340 350 360 370 380
KIAA10 SFIKDRRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYW
:. ..
KIAA18 SYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDS
600 610 620 630 640 650
>>KIAA1003 ( 917 res) hk09911 (917 aa)
initn: 259 init1: 142 opt: 166 Z-score: 168.4 bits: 42.5 E(): 0.00029
Smith-Waterman score: 220; 29.193% identity (52.174% similar) in 161 aa overlap (194-353:541-669)
170 180 190 200 210 220
KIAA10 SDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKR
.:: : : .. :.:.: : ::.::. :
KIAA10 AAQGWLAFIVEYIRRFVVSCTPSWFWGPVVTLEDCLAAFFAADELKGDNMYSCERCKKLR
520 530 540 550 560 570
230 240 250 260 270 280
KIAA10 ITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWM-LNMEPYTVSGMARQDS
:: . :: .: ::: :: : :.: . .. :: :...:. . ..
KIAA10 NGVKYCKVLRLPEILCIHLKRFRH--EVMYSFKINSHVSFPLEGLDLRPFLA-----KEC
580 590 600 610 620
290 300 310 320 330 340
KIAA10 SSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRGCGKGK
.:.. .:.:..:: : : : .::: .. .. .:.
KIAA10 TSQI----------------------TTYDLLSVICHHGTAGSGHYIAYCQN---VINGQ
630 640 650
350 360 370 380 390 400
KIAA10 WYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQ
::.:.: . :
KIAA10 WYEFDDQYVTEVHETVVQNAEGYVLFYRKSSEEAMRERQQVVSLAAMREPSLLRFYVSRE
660 670 680 690 700 710
>>KIAA1063 ( 593 res) hj04848 (593 aa)
initn: 236 init1: 93 opt: 163 Z-score: 167.3 bits: 41.7 E(): 0.00033
Smith-Waterman score: 329; 26.389% identity (51.111% similar) in 360 aa overlap (37-358:235-574)
10 20 30 40 50 60
KIAA10 SNLQIIIKELLSMHHQPDPALTKEFDYLPPVDSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQQLYM
. : . :. :: : : ::.:: . : :
KIAA10 KMQGVGEKFSTWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLINLGNTCFMNCIVQALTH
210 220 230 240 250 260
70 80 90 100 110 120
KIAA10 QPGLPESLLSVDD--DTDNPDDSVFYQVQSLFGHLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKELY
: : . .:: . ..:.. . ...::: ... .. . ..: .. .. ..:
KIAA10 TPLLRDFFLSDRHRCEMQSPSSCLVCEMSSLFQEFYSGHRSPHIPYKLLHLVWTHARHLA
270 280 290 300 310 320
130 140 150 160 170
KIAA10 VREQQDAYEFFTSLIDQM------DEYLKKMGR--------DQIFKNTFQGIYSDQKICK
:::::.::. . .: . :. :: . :::: . .:. . : .:.
KIAA10 GYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQIFTGGLQSDVTCQ-VCH
330 340 350 360 370 380
180 190 200
KIAA10 DCPHRYE-----------REEAFMALNLG-----------VTSCQSLEISLDQFVRGEVL
. : :. : :.. .: : .:.: : :
KIAA10 GVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTTTLTDCLRRFTRPEHL
390 400 410 420 430 440
210 220 230 240 250 260
KIAA10 EGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLN
.: : :. . ..:. .:.:: : .:: :: . . :.: . :: :.
KIAA10 GSSAKIKCSGCHSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRRKI--TTYVSFPLELD
450 460 470 480 490 500
270 280 290 300 310 320
KIAA10 MEPYTVSGMARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHY
: :. :: ::.: ::. .: : .. ..: : .:. :.: ..:::
KIAA10 MTPF----MA---SSKESRMNGQ-YQQ-----PTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHY
510 520 530 540
330 340 350 360 370 380
KIAA10 YSFIKDRRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRY
:::... : .:.: .:..: . ...:
KIAA10 TSFIRQH----KDQWFKCDDAIITKASIKDVLDSEGYLLFYHKQFLEYE
550 560 570 580 590
>>KIAA1097 ( 980 res) hk07058 (980 aa)
initn: 272 init1: 132 opt: 159 Z-score: 160.8 bits: 41.2 E(): 0.00077
Smith-Waterman score: 207; 31.373% identity (53.595% similar) in 153 aa overlap (202-353:615-734)
180 190 200 210 220 230
KIAA10 CPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCI
:.: : :.:.: : :::::. : :: .
KIAA10 MEYVKRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDE-LKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKV
590 600 610 620 630 640
240 250 260 270 280 290
KIAA10 KSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWM-LNMEPYTVSGMARQDSSSEVGENG
...: .: ::: :: : : : . .. :: :...:. .:..
KIAA10 QNFPEILCIHLKRFRH--ELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPF----LAKD----------
650 660 670 680
300 310 320 330 340 350
KIAA10 RSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRGCGKGKWYKFNDTV
:: . :. :.:..:: : : : .::: .. .. . . ::.:.:
KIAA10 ---------SPAQIVT----YDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLN---NLWYEFDDQS
690 700 710 720 730
360 370 380 390 400 410
KIAA10 IEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKK
. :
KIAA10 VTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTF
740 750 760 770 780 790
>>KIAA0891 ( 1371 res) hk08201 (1371 aa)
initn: 297 init1: 149 opt: 159 Z-score: 159.2 bits: 41.4 E(): 0.00094
Smith-Waterman score: 171; 25.143% identity (52.000% similar) in 175 aa overlap (194-363:1112-1258)
170 180 190 200 210 220
KIAA10 SDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKR
.:. :. :.: ::: .:.:: .::..:
KIAA08 LQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
230 240 250 260 270 280
KIAA10 ITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWM-LNMEPYTVSGMARQDS
. :. . ::.::...: ::.: :. : .. ..:: :.. . .
KIAA08 EASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFRSFIWRD-KINDLVEFPVRNLDLSKFCI--------
1150 1160 1170 1180 1190
290 300 310 320 330 340
KIAA10 SSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIK--DRRGCGK
:.. .: .:.: .:: : : .::: . . . :. .
KIAA08 -------GQKEEQ------------LPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDRSSQR
1200 1210 1220 1230
350 360 370 380 390
KIAA10 GK--WYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQR
. : :.:... : .. . .:
KIAA08 SDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDLGPAAEAA
1240 1250 1260 1270 1280 1290
>>KIAA0529 ( 952 res) hg02898s1 (952 aa)
initn: 311 init1: 130 opt: 149 Z-score: 150.7 bits: 39.3 E(): 0.0028
Smith-Waterman score: 186; 29.114% identity (51.266% similar) in 158 aa overlap (195-351:759-883)
170 180 190 200 210 220
KIAA10 DQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKRI
:. .. :. : : . . .:: .:::..
KIAA05 KKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQ
730 740 750 760 770 780
230 240 250 260 270 280
KIAA10 TVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWM-LNMEPYTVSGMARQDSS
..:. . ::: :::.:: ::... . :. : : . :: :.: . .. :
KIAA05 ATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYS-RYMRD-KLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNA-----
790 800 810 820 830 840
290 300 310 320 330 340
KIAA10 SEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRGCGKGKW
: : :.:..: : : .::: .: :.. :::
KIAA05 ---------------GPCR--------YNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNK---DDGKW
850 860 870
350 360 370 380 390 400
KIAA10 YKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQN
: :.:. .
KIAA05 YYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDED
880 890 900 910 920 930
>>KIAA1372 ( 773 res) fj03335 (773 aa)
initn: 277 init1: 95 opt: 146 Z-score: 148.6 bits: 38.6 E(): 0.0037
Smith-Waterman score: 199; 30.252% identity (59.664% similar) in 119 aa overlap (33-151:183-296)
10 20 30 40 50 60
KIAA10 DSSPSNLQIIIKELLSMHHQPDPALTKEFDYLPPVDSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQ
. : . ..:..: .:: : : :::.:...:
KIAA13 IKDLHVPNEDRIKQLLGQDAWTSQKSELAGFYPRLMAKSDTGKIGLINLGNTCYVNSILQ
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
KIAA10 QLYMQPGLPESLLSVDDDTDNPDDSVFYQVQSLFGHLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKE
:.: . . .: . .....: .. ..: ::: : .:. :::: . :.
KIAA13 ALFMASDFRHCVLRLTENNSQP---LMTKLQWLFGFLEHSQRPAISPENF--LSASWTPW
220 230 240 250 260
130 140 150 160 170 180
KIAA10 LYVREQQDAYEFFTSLIDQMDEYLKKMGRDQIFKNTFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAF
. ::: :.. :.:.. : : :
KIAA13 FSPGTQQDCSEYLKYLLDRLHEEEKTGTRICQKLKQSSSPSPPEEPPAPSSTSVEKMFGG
270 280 290 300 310 320
977 residues in 1 query sequences
1986528 residues in 2037 library sequences
Scomplib [34.26]
start: Thu Dec 18 15:07:26 2008 done: Thu Dec 18 15:07:27 2008
Total Scan time: 0.660 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]