# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh03308.fasta.nr -Q ../query/KIAA1050.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1050, 829 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825410 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0510+/-0.000196; mu= 9.4229+/- 0.011 mean_var=107.0186+/-20.545, 0's: 29 Z-trim: 33 B-trim: 403 in 2/65 Lambda= 0.123978 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|13638422|sp|Q01538.2|MYT1_HUMAN RecName: Full=M (1121) 5593 1011.8 0 gi|148675514|gb|EDL07461.1| myelin transcription f (1008) 5339 966.3 0 gi|148675515|gb|EDL07462.1| myelin transcription f (1078) 5339 966.3 0 gi|76363256|sp|Q8CFC2.1|MYT1_MOUSE RecName: Full=M (1127) 5339 966.3 0 gi|123232095|emb|CAM20796.1| myelin transcription (1169) 5339 966.3 0 gi|2209115|gb|AAC53456.1| myelin transcription fac (1078) 5301 959.5 0 gi|149033885|gb|EDL88668.1| myelin transcription f ( 922) 5292 957.8 0 gi|73992779|ref|XP_543112.2| PREDICTED: similar to (1312) 5270 954.0 0 gi|76668584|ref|XP_581853.2| PREDICTED: similar to (1100) 5181 938.1 0 gi|149734182|ref|XP_001495632.1| PREDICTED: simila (1094) 5088 921.4 0 gi|149636000|ref|XP_001508606.1| PREDICTED: simila (1136) 4972 900.7 0 gi|114683167|ref|XP_514796.2| PREDICTED: myelin tr ( 867) 4695 851.0 0 gi|74149331|dbj|BAE22433.1| unnamed protein produc ( 652) 4260 773.1 0 gi|119595562|gb|EAW75156.1| hCG1641026, isoform CR ( 912) 4078 740.7 6.3e-211 gi|123232098|emb|CAM20799.1| myelin transcription (1089) 3984 724.0 8.3e-206 gi|123232099|emb|CAM20800.1| myelin transcription ( 786) 3543 645.0 3.6e-182 gi|31657206|gb|AAH53638.1| MYT1 protein [Homo sapi ( 846) 3386 616.9 1.1e-173 gi|346275|pir||A45033 myelin transcription factor ( 725) 3322 605.4 2.7e-170 gi|38382796|gb|AAH62313.1| MYT1 protein [Homo sapi ( 591) 2692 492.6 1.9e-136 gi|148271077|ref|NP_001087244.1| myelin transcript (1187) 2689 492.4 4.7e-136 gi|148704992|gb|EDL36939.1| myelin transcription f (1186) 2687 492.0 6e-136 gi|76363254|sp|P97500.2|MYT1L_MOUSE RecName: Full= (1187) 2687 492.0 6e-136 gi|1835755|gb|AAC53157.1| zinc finger protein Png- (1188) 2687 492.0 6e-136 gi|148704991|gb|EDL36938.1| myelin transcription f (1213) 2687 492.0 6.1e-136 gi|194220996|ref|XP_001503699.2| PREDICTED: simila (1185) 2673 489.5 3.4e-135 gi|111598918|gb|AAH94438.1| Myt1l protein [Mus mus (1185) 2672 489.3 3.9e-135 gi|148271081|ref|NP_001087247.1| myelin transcript (1184) 2669 488.8 5.6e-135 gi|148271075|ref|NP_032692.2| myelin transcription (1185) 2669 488.8 5.6e-135 gi|149051058|gb|EDM03231.1| myelin transcription f (1185) 2669 488.8 5.6e-135 gi|124297191|gb|AAI31678.1| Myt1l protein [Mus mus (1185) 2667 488.4 7.2e-135 gi|148704990|gb|EDL36937.1| myelin transcription f (1210) 2667 488.4 7.3e-135 gi|109101874|ref|XP_001096422.1| PREDICTED: myelin (1187) 2666 488.2 8.2e-135 gi|76789661|sp|Q9UL68.2|MYT1L_HUMAN RecName: Full= (1186) 2662 487.5 1.3e-134 gi|6491868|gb|AAF14051.1|AF036943_1 myelin transcr (1192) 2656 486.5 2.8e-134 gi|76363255|sp|P70475.2|MYT1L_RAT RecName: Full=My (1187) 2647 484.8 8.6e-134 gi|73979689|ref|XP_540068.2| PREDICTED: similar to (1183) 2646 484.7 9.7e-134 gi|152012544|gb|AAI50282.1| MYT1L protein [Homo sa (1132) 2644 484.3 1.2e-133 gi|187952561|gb|AAI37274.1| Myelin transcription f (1184) 2644 484.3 1.2e-133 gi|1531647|gb|AAB40718.1| C2-HC type zinc finger p ( 815) 2640 483.5 1.5e-133 gi|123232096|emb|CAM20797.1| myelin transcription ( 603) 2634 482.3 2.6e-133 gi|1511632|gb|AAC52728.1| neural zinc finger facto (1187) 2602 476.8 2.3e-131 gi|2624929|gb|AAC53457.1| myelin transcription fac (1182) 2586 473.9 1.6e-130 gi|114620080|ref|XP_528132.2| PREDICTED: suppressi (1047) 2469 453.0 3e-124 gi|117306500|gb|AAI26539.1| Myelin transcription f (1144) 2464 452.1 6e-124 gi|194214933|ref|XP_001488773.2| PREDICTED: simila (1050) 2441 448.0 9.7e-123 gi|73999356|ref|XP_544076.2| PREDICTED: similar to (1031) 2437 447.2 1.6e-122 gi|194672909|ref|XP_616463.4| PREDICTED: similar t (1134) 2430 446.0 4e-122 gi|94730577|sp|Q9QX27.2|ST18_RAT RecName: Full=Sup (1032) 2414 443.1 2.7e-121 gi|149060964|gb|EDM11574.1| suppression of tumorig (1009) 2412 442.8 3.4e-121 gi|77628157|ref|NP_695222.2| suppression of tumori (1044) 2412 442.8 3.5e-121 >>gi|13638422|sp|Q01538.2|MYT1_HUMAN RecName: Full=Myeli (1121 aa) initn: 5593 init1: 5593 opt: 5593 Z-score: 5406.3 bits: 1011.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5593; 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