# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg00971s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1025.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1025, 1917 aa vs ./tmplib.24314 library 1985588 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9274+/-0.00911; mu= 2.3889+/- 0.619 mean_var=320.4459+/-75.560, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.071647 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0593 ( 2005 res) hj02824s1 (2005) 4157 445.1 7.9e-125 >>KIAA0593 ( 2005 res) hj02824s1 (2005 aa) initn: 4591 init1: 1745 opt: 4157 Z-score: 2333.0 bits: 445.1 E(): 7.9e-125 Smith-Waterman score: 6102; 51.865% identity (74.246% similar) in 1957 aa overlap (21-1917:145-2005) 10 20 30 40 50 KIAA10 VSISLISAGGHIAVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQAILGESGGMQ :..::. .. ::::::::.. . ..: KIAA05 LVPQSDIPTPSPVGSTHCSSSCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSVQ 120 130 140 150 160 170 60 70 80 90 100 KIAA10 SAASHLVSQDGGMITMHSPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKR--SQMSTPTL . .. . : . :. . . ...:::: :: ::.: :::.:: .::.:.:: : : KIAA05 KWVK-FSSVSDGFNSDSTSHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLC 180 190 200 210 220 230 110 120 130 140 150 160 KIAA10 EEEPASNPATWDFVDPTQRVSCSCSRHKLLK-RCAVGPNRPPTVSQPGFSAGPSSSSSLP :: :.. :.::::. :::..::: ::: :: : : .. :...: ... :: KIAA05 EEATAAKVASWDFVEATQRTNCSCLRHKNLKSRNAGQQGQAPSLGQ--------QQQILP 240 250 260 270 280 170 180 190 200 210 220 KIAA10 PPASSKHKTAERQEKGDKLQKRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVS :::: :.:::..: ::::: ::::: ::.... :. :. .:.: ... ::... : KIAA05 -----KHKTNEKQEKSEKPQKRPLTPFHHRVSVSDDVGMDADSASQRLVISAPDSQVRFS 290 300 310 320 330 340 230 240 250 260 270 280 KIAA10 SSRKYDKQMAVPSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDP-PSVPVN . : : . ::. . : . :: :: :::.: :.. ::.: . 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KIAA05 EDREIYPQHLKSLAFSAFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGPGLAMETALRSPDRPECIRLYA 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA10 PPFILAPIKDKQTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCVVN :::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::.:::::::..: KIAA05 PPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELLETCIIN 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1570 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA10 IALPNRSRRSKVSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLG : .:::.::.: ::::.:::::::::.:.:::.:::::::::::::.::::::::: ::. KIAA05 IDVPNRARRKKSSARKFGLQKLWEWCLGLVQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKDWSCLLS 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1630 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA10 ECSLQTISKKLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVFGRSTA . .::..::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:. ::::::::. 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