# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg00935s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1024.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1024, 917 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825981 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5580+/-0.000188; mu= 11.6744+/- 0.011 mean_var=85.6738+/-16.609, 0's: 26 Z-trim: 31 B-trim: 105 in 1/65 Lambda= 0.138564 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109082105|ref|XP_001109121.1| PREDICTED: hypoth ( 916) 6010 1212.0 0 gi|148688945|gb|EDL20892.1| cDNA sequence AF529169 ( 855) 5165 1043.1 0 gi|126273659|ref|XP_001363522.1| PREDICTED: simila ( 916) 5102 1030.5 0 gi|53801355|gb|AAU93887.1| DD1 protein [Gallus gal ( 916) 5002 1010.5 0 gi|149632360|ref|XP_001507379.1| PREDICTED: simila ( 917) 4423 894.8 0 gi|189539379|ref|XP_001340825.2| PREDICTED: simila ( 897) 1443 299.1 6.1e-78 gi|149018933|gb|EDL77574.1| rCG25695, isoform CRA_ ( 111) 708 151.4 2.1e-34 gi|149018932|gb|EDL77573.1| rCG25695, isoform CRA_ ( 70) 425 94.7 1.6e-17 gi|47213984|emb|CAG01859.1| unnamed protein produc ( 798) 378 86.1 6.8e-14 gi|126333796|ref|XP_001374051.1| PREDICTED: simila ( 233) 329 75.9 2.3e-11 gi|49522711|gb|AAH75669.1| A730017C20Rik protein [ ( 151) 325 75.0 2.9e-11 gi|149064323|gb|EDM14526.1| rCG46944, isoform CRA_ ( 151) 310 72.0 2.3e-10 gi|183986250|gb|AAI66445.1| RGD1312005 protein [Ra ( 189) 307 71.4 4.2e-10 gi|149064327|gb|EDM14530.1| rCG46944, isoform CRA_ ( 193) 307 71.5 4.3e-10 gi|119582784|gb|EAW62380.1| hCG2036615 [Homo sapie ( 190) 295 69.1 2.2e-09 gi|148677899|gb|EDL09846.1| RIKEN cDNA A730017C20, ( 107) 280 65.9 1.1e-08 gi|194668873|ref|XP_001256363.2| PREDICTED: simila ( 190) 278 65.7 2.4e-08 gi|114601614|ref|XP_001148621.1| PREDICTED: simila ( 447) 278 65.9 4.5e-08 gi|109078548|ref|XP_001096726.1| PREDICTED: simila ( 314) 271 64.4 9.1e-08 gi|47213643|emb|CAF90347.1| unnamed protein produc ( 212) 223 54.7 5.2e-05 >>gi|109082105|ref|XP_001109121.1| PREDICTED: hypothetic (916 aa) initn: 6010 init1: 6010 opt: 6010 Z-score: 6489.5 bits: 1212.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6010; 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