# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06112.fasta.nr -Q ../query/KIAA1018.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1018, 1040 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826729 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1523+/-0.000186; mu= 14.2556+/- 0.010 mean_var=78.1267+/-15.186, 0's: 33 Z-trim: 39 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.145102 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|168278791|dbj|BAG11275.1| myotubularin-related (1017) 6781 1429.9 0 gi|109080444|ref|XP_001109813.1| PREDICTED: simila (1016) 6406 1351.4 0 gi|149691096|ref|XP_001491319.1| PREDICTED: simila (1028) 5089 1075.7 0 gi|160409997|sp|Q69ZT1.2|MTMRF_MOUSE RecName: Full (1020) 4707 995.7 0 gi|109458866|ref|XP_219706.4| PREDICTED: similar t (1020) 4646 983.0 0 gi|73951017|ref|XP_536169.2| PREDICTED: similar to (1029) 4547 962.3 0 gi|194676731|ref|XP_584913.4| PREDICTED: similar t ( 932) 4373 925.8 0 gi|194034538|ref|XP_001925568.1| PREDICTED: simila ( 845) 4372 925.6 0 gi|190689811|gb|ACE86680.1| myotubularin related p ( 533) 3422 726.5 8.6e-207 gi|158255410|dbj|BAF83676.1| unnamed protein produ ( 533) 3416 725.3 2.1e-206 gi|28839601|gb|AAH47882.1| MTMR15 protein [Homo sa ( 533) 3392 720.2 6.7e-205 gi|126277238|ref|XP_001373737.1| PREDICTED: simila (1112) 3365 714.8 5.8e-203 gi|73951023|ref|XP_856727.1| PREDICTED: similar to ( 733) 2811 598.7 3.5e-168 gi|94733114|emb|CAK04388.1| novel protein [Danio r ( 988) 2666 568.5 6e-159 gi|160409999|sp|Q1LWH4.2|MTMRF_DANRE Coiled-coil d ( 988) 2666 568.5 6e-159 gi|156229743|gb|AAI51827.1| Si:ch211-201b11.2 prot ( 988) 2665 568.3 6.9e-159 gi|148726022|emb|CAN88260.1| novel protein [Danio ( 988) 2665 568.3 6.9e-159 gi|47220527|emb|CAG05553.1| unnamed protein produc ( 986) 2648 564.7 8.1e-158 gi|148675312|gb|EDL07259.1| mCG11826 [Mus musculus ( 985) 2133 456.9 2.3e-125 gi|210085717|gb|EEA34170.1| hypothetical protein B ( 652) 1891 406.1 3e-110 gi|190586773|gb|EDV26826.1| hypothetical protein T (1087) 1781 383.2 3.8e-103 gi|26346827|dbj|BAC37062.1| unnamed protein produc ( 468) 1495 323.1 2.1e-85 gi|109732710|gb|AAI16271.1| Mtmr15 protein [Mus mu ( 469) 1239 269.5 2.9e-69 gi|215504808|gb|EEC14302.1| coiled-coil domain-con ( 542) 1164 253.8 1.7e-64 gi|1705491|gb|AAB37739.1| Hypothetical protein C01 ( 865) 957 210.7 2.7e-51 gi|198415862|ref|XP_002123827.1| PREDICTED: simila ( 823) 930 205.0 1.3e-49 gi|187034978|emb|CAP25905.1| Hypothetical protein ( 862) 881 194.8 1.7e-46 gi|72006605|ref|XP_783783.1| PREDICTED: hypothetic ( 956) 733 163.8 3.8e-37 gi|162683772|gb|EDQ70179.1| predicted protein [Phy ( 784) 640 144.3 2.4e-31 gi|212508124|gb|EEB11912.1| conserved hypothetical ( 718) 603 136.5 4.8e-29 gi|91087593|ref|XP_972078.1| PREDICTED: similar to (1326) 576 131.1 3.8e-27 gi|212003162|gb|EEB08822.1| coiled-coil domain-con ( 698) 572 130.0 4.2e-27 gi|5441488|emb|CAB46759.1| human MTMR15 homolog [S ( 703) 560 127.5 2.4e-26 gi|194698198|gb|ACF83183.1| unknown [Zea mays] ( 386) 540 123.1 2.8e-25 gi|222844623|gb|EEE82170.1| predicted protein [Pop (1028) 545 124.5 2.8e-25 gi|222635045|gb|EEE65177.1| hypothetical protein O ( 848) 538 123.0 6.7e-25 gi|218197677|gb|EEC80104.1| hypothetical protein O ( 949) 538 123.0 7.3e-25 gi|157353348|emb|CAO45274.1| unnamed protein produ ( 882) 535 122.3 1.1e-24 gi|186489458|ref|NP_001117447.1| unknown protein [ ( 891) 526 120.5 4e-24 gi|211582056|emb|CAP80220.1| Pc12g05930 [Penicilli ( 787) 507 116.4 5.7e-23 gi|83765208|dbj|BAE55351.1| unnamed protein produc ( 809) 478 110.4 3.9e-21 gi|220700471|gb|EED56809.1| conserved hypothetical ( 814) 478 110.4 3.9e-21 gi|119409626|gb|EAW19574.1| conserved hypothetical ( 822) 474 109.5 7.1e-21 gi|50254661|gb|EAL17408.1| hypothetical protein CN ( 988) 472 109.2 1.1e-20 gi|210067329|gb|EEA21421.1| conserved hypothetical ( 825) 470 108.7 1.3e-20 gi|218717583|gb|EED17004.1| conserved hypothetical ( 825) 469 108.5 1.5e-20 gi|66846611|gb|EAL86943.1| conserved hypothetical ( 822) 467 108.1 2e-20 gi|159123250|gb|EDP48370.1| conserved hypothetical ( 822) 467 108.1 2e-20 gi|145018759|gb|EDK03038.1| hypothetical protein M ( 853) 465 107.7 2.7e-20 gi|46099041|gb|EAK84274.1| hypothetical protein UM (1179) 465 107.8 3.4e-20 >>gi|168278791|dbj|BAG11275.1| myotubularin-related prot (1017 aa) initn: 6781 init1: 6781 opt: 6781 Z-score: 7665.2 bits: 1429.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6781; 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