# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk09604y2.fasta.nr -Q ../query/KIAA1000.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1000, 1956 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7794090 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6121+/-0.000208; mu= 9.1413+/- 0.011 mean_var=148.9859+/-29.935, 0's: 41 Z-trim: 199 B-trim: 905 in 2/64 Lambda= 0.105076 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|205371801|sp|Q9Y2K3.4|MYH15_HUMAN RecName: Full (1946) 12362 1887.7 0 gi|119600132|gb|EAW79726.1| hCG1811516 [Homo sapie (1946) 12356 1886.8 0 gi|114588362|ref|XP_516637.2| PREDICTED: myosin, h (1946) 12234 1868.3 0 gi|109032981|ref|XP_001095819.1| PREDICTED: simila (1926) 11810 1804.0 0 gi|74002605|ref|XP_848707.1| PREDICTED: similar to (2106) 10347 1582.3 0 gi|194222881|ref|XP_001917202.1| PREDICTED: myosin (1964) 10301 1575.3 0 gi|194664006|ref|XP_605047.4| PREDICTED: similar t (1955) 9945 1521.3 0 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