# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj07083.fasta.huge -Q ../query/KIAA0980.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0980, 1406 aa vs ./tmplib.23663 library 1986099 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8592+/-0.0101; mu= 3.1149+/- 0.686 mean_var=410.7260+/-100.259, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.063285 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 1182 123.5 2.5e-28 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 349 47.7 2.5e-05 KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956) 266 40.1 0.0048 >>KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313 aa) initn: 1327 init1: 654 opt: 1182 Z-score: 600.3 bits: 123.5 E(): 2.5e-28 Smith-Waterman score: 1567; 30.071% identity (59.429% similar) in 1400 aa overlap (6-1348:10-1285) 10 20 30 40 KIAA09 GTGVVPRSWPRAGG-------RRRRLPAC---YGMDE-EENHYVSQLREVYSSCDT ::. .:: :: : . ::::: :.... ..:.:...: :: KIAA15 FPRRRRAPEPRDASAGGGLPAVRALRRDRQKVSTVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA09 TGTGFLDRQELTQLCLKLHLEQQLPVLLQTLLGNDHFARVNFEEFKEGFVAVLSSNAGVR :::: : ..:::.:: : ::. ::: :::: .. ..::.:..:::... .:: : KIAA15 TGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILS-----R 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA09 PSDEDSSSLESAASSAIPPKYVNGSKWYGRRSRPELCDAATEARRVP--EQQTQASLKSH ... : : :::: :.: ::::: ::. ... : .: : . . :: KIAA15 TLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFPEVTVIEPLDEEARPSH 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA09 LWRSASLESVESPKSDEEAESTKEAQNELFEAQGQLQTWDSEDFGSPQKSCSPSFDTPES . : .: .: : ..: .::.:::. :. .:... :.. :: : : KIAA15 I-----------PAGDC-SEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 KIAA09 QIRGVWEELGVGSSGHLSEQELAVVCQSVGLQGLEKEELEDLFNKLDQDGDGKVSLEEFQ ... : :.::. .:::....:. .:.. :::... : ::..:..:: :: .:.:.: KIAA15 KLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGT--MSVEDFF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA09 LGLFSHEPALLLESSTRVKPSKAWSHYQVPEESGCHTTTTSSLVSLCSSLRLFSSIDDGS :::.. .: .:: . : .: .::: .:::.:...: . .:.:: .::: KIAA15 YGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIG-FRVFSCLDDGM 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 KIAA09 GFAFPDQVLAMWTQEGIQNGREILQSLDFSVDEKVNLLELTWALDNELMTVDSAVQQAAL : : ...: : .:::.:..:::..::::.: ..:: ::: ::.:::... ....:::: KIAA15 GHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQAAL 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 KIAA09 ACYHQELSYQQGQVEQLARERDKARQDLERAEKRNLEFVKEMDDCHSTLEQLTEKKIKHL : .. :. . .:.:..::..: :.::..::: . ...:.:: :...:. .: ....: KIAA15 ASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRKL 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA09 EQGYRERLSLLRSEVEAERELFWEQAHRQRAALEWDVGRLQAEEAGLREKLTLALKENSR .. :.::.. :..:.. ::: . .:: .:: :: .. . ..:: .:..:.:.:::::: KIAA15 DEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKENSR 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 KIAA09 LQKEIVEVVEKLSDSERLALKLQKDLEFVLKDK---LEPQSAELLAQEERFAAVLKEYEL :..:..: .:::.. : :. :::..:: :: .: :.:.:::.. ::::.. . .::: KIAA15 LENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEYER 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 KIAA09 KCRDLQDRNDELQAELE-----GLWARLPKNRHSPSW---SPDGRRRQLPGLGPAGISFL .:: :::. ::::.::: : ::: ..::: . .: . ::: : KIAA15 QCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPL-KNSPSEEVEANSGGIEPEHGLG----SEE 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 KIAA09 GNSAPVSIETELMMEQVKE-HYQD---LRTQLETKVNYYEREIAALKRNFEKERKDMEQA : .:::.::..::.:: :..: :: .:: :: .::... . .: ...:.: KIAA15 CNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQR 640 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 740 KIAA09 RRREVSVLEGQKADLE-ELHE-KSQEVIWGLQEQLQDTARGPEPEQMGLAPCCTQALCGL .. :. .:: : .::. :. : ..: .. :.: .... : :. : . 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KIAA15 ------------------VQKMVENLKKQISELKIKN-QQLDLENTELSQKNSQNQEKLQ 900 910 920 930 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA09 EPPLR-PAASCRGQAERLQAIQEERARSWSRGTQEQASEQQARAEGALEPGCHKHSVEVA : : :. . : .. ::: ::. . .. :: :. .: KIAA15 ELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEERE-------QEKFNLKEE-----LER-CKVQS---- 940 950 960 970 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA09 RRGSLPSHLQLADPQGSWQEQLAAPEEGETKIALEREKDDMETKLLHLEDVVRALEKHVD ..: : :. . . : ... :. : ::. :. :: . ...... KIAA15 --STLVSSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQ------LHRCPDLSDFQQKIS 980 990 1000 1010 1020 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA09 --LRENDRL--EFHRLSEENTLLKNDLGRVRQELEAAESTHDAQRKEIEVLKKDKEKACS : :..: : . :::: . . :.. . :: .: ..: : ... . : KIAA15 SVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAK-SSLLEHRIATMKQEQKSWE---HQSASLKS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA09 EMEVLNRQNQNYKDQLSQLNVRVLQLGQEASTHQAQNEEHRVTIQMLTQSLEEVVRSGQQ .. . ... :: .: ....:... .. .. . : ..: . .. : ..:... .:.. KIAA15 QLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQQEKEALKQEVMSLHKQLQNA--GGKS 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA09 QSDQIQKLRVELECLNQEHQSLQLPWSELTQTLEESQDQVQGAHLRLR------QAQAQH . .: :. ::... : :..: . ..: :. . . ::. .:. : KIAA15 WAPEIATHPSGLH--NQQKR---LSWDKLDHLMNEEQQLLWQENERLQTMVQNTKAELTH 1150 1160 1170 1180 1190 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA09 LQE-VRLVPQDRVAELHRLLSLQG-----EQARRRLDAQREEHEKQLKATEERVEEAEMI .: :: . .. . . .. :. .: :: . : . .. .:. . ....: . . . KIAA15 SREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECDQFQKEQSPANRKVSQMNSL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA09 LKNMEML------LQEKVDKLKEQFEKNTKSDLLLKELYVENAHLVRALQATEEKQRGAE ...: . :..: :: ::. .:. KIAA15 EQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQLMENSVVGSSREGCSSLPEIVCEDAAPEVHCDA 1260 1270 1280 1290 1300 1310 >>KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919 aa) initn: 149 init1: 83 opt: 349 Z-score: 187.6 bits: 47.7 E(): 2.5e-05 Smith-Waterman score: 469; 24.018% identity (52.094% similar) in 1528 aa overlap (1-1406:404-1847) 10 20 KIAA09 GTGVVPRSWPR-AGGRRRRLPACYGMDEEE : : :: : : . : .. ... KIAA04 GSERTADASNGSLRGLSGQRTPSPPRRSSPGRGRSPRRGPSPACSDSSTLALIHSALHKR 380 390 400 410 420 430 30 40 50 60 70 80 KIAA09 NHYVSQLREVY-SSCDTTGTGFLDRQELTQLCLKLHLEQQLPVLLQTLLGNDHFARVNFE . :...: : .: : :: : .: . . ::.:: : : . : : KIAA04 QLQVQDMRGRYEASQDLLGT--LRKQLSDSESERRALEEQL----QRLRDKTDGAMQAHE 440 450 460 470 480 90 100 110 120 130 140 KIAA09 EFKEGFVAVLSSNAGV-RPSDEDSSSLESAASSAIPPKY----VNGSKWYGRRSRPELCD . .. . :.: . : ... . ::. : ..: . ..... ::.: .: . KIAA04 DAQREVQRLRSANELLSREKSNLAHSLQVAQQQAEELRQEREKLQAAQEELRRQRDRLEE 490 500 510 520 530 540 150 160 170 180 190 200 KIAA09 AATEARRVPEQQTQASLKSHLWRSA-SLESVESPKS--DEEAESTKEAQNELFEAQGQLQ .: : : .. .: :: .::..:. .: .: ..:: .. . .:: KIAA04 EQEDA-----VQDGARVRRELERSHRQLEQLEGKRSVLAKELVEVREALSRATLQRDMLQ 550 560 570 580 590 600 210 220 230 240 250 KIAA09 TWDSEDFGSPQKSCSPSFDTPESQIRGVWEELGVGSS-GHLSEQELAVVCQSVGLQGL-- . .: . :. . . :. . :: .. .: ..:: . ... ... :. : KIAA04 AEKAEVAEALTKAEAGRVELELSMTKLRAEEASLQDSLSKLSALNESLAQDKLDLNRLVA 610 620 630 640 650 660 260 270 280 290 300 KIAA09 ----EKEELEDLFNKLDQDG----DGKVSLEEFQLGLFSHEPALL-LESSTRV-KPSKAW :: :. . .:.. . . :::..: .: : ::.: :: . .. KIAA04 QLEEEKSALQGRQRQAEQEATVAREEQERLEELRL---EQEVARQGLEGSLRVAEQAQEA 670 680 690 700 710 310 320 330 340 350 360 KIAA09 SHYQVPEESGCHTTTTSSLVSLCSSLRLFSSIDDGSGFAFPDQVLAMWTQEGIQNGREIL . :.: .. .:..: .: :: .: : . .:. :.. 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KIAA04 EALERAAREKEALAKEHAGLAVQLVAAEREGRTLSEEATRLRLEKEALEGSLFEVQRQLA 770 780 790 800 810 820 430 440 450 460 470 480 KIAA09 RDKARQDLERAEKRNLEFVKEMDDCHSTLEQLTEKKIKHLEQGYRERLSLLRSEVEAERE . .::.. .:: . : ..:: . : : .. : :.. .. . .. :.:::: KIAA04 QLEARREQLEAEGQALLLAKET--LTGELAGLRQQIIATQEKASLDKELMAQKLVQAERE 830 840 850 860 870 880 490 500 510 520 530 540 KIAA09 LFWEQAHRQRAALEWDVGRLQAE-EAGLREKLTLALKENSRLQKEIVEVVEKL-SDSERL . ..:::: : :. ::: : ::. :: . . .:.::.: :.. .: ...:.: KIAA04 A-QASLREQRAAHEEDLQRLQREKEAAWRELEAERAQLQSQLQREQEELLARLEAEKEEL 890 900 910 920 930 940 550 560 570 580 KIAA09 -----ALKLQKDLEFVLKDKLEPQ------------SAELLAQEERFAAVLKEYELKCRD ::. ..: ..: .. . : : .:.. .. .:.. :.: . :: KIAA04 SEEIAALQQERDEGLLLAESEKQQALSLKESEKTALSEKLMGTRHSLATISLEMERQKRD 950 960 970 980 990 1000 590 600 610 620 630 KIAA09 LQDRNDE-------LQAELEGLWARLPKNRHSPSWSPDGRR--RQLPGLGPAGISFLGNS :.:... : .::. : : ... . . . . :: .: :: : : .. 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KIAA04 HARGLELKLEAARAEAAELGLRLSAAEGRAQGLEAELARVEVQRRAAEAQLGGLRSALRR 1290 1300 1310 1320 1330 1340 910 920 930 940 950 960 KIAA09 DTEATQSPAPAPAPASHGPSERWSRMQPCGVDGDIVPKEPEPFGASAAGLEQPGAREL-P ..:.::: : : :. : . : .:. ::..:.. : : KIAA04 GLGLGRAPSPAPRP----------------VPGS--PARDAPAEGSGEGLNSPSTLECSP 1350 1360 1370 1380 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA09 LLGTERDASQTQPRMWEPPLRPAASCRGQA----ERLQAIQEERA--RSWSRGTQEQASE . :.: : : : : :: ..:.. :.:: :. . . ..: .: KIAA04 GSQPPSPGPATSPA--SPDLDPEA-VRGALREFLQELRSAQRERDELRTQTSALNRQLAE 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA09 QQARAEGALEPGCHKHSVEVARRGSLPSHLQLADPQGSWQEQLAAPEEGETKIALEREKD ..:. ..: . .... : : .. .. .. : .:: ::. . :::. KIAA04 MEAERDSAT---SRARQLQKAVAESEEARRSVDGRLSGVQAELALQEESVRRS--ERERR 1450 1460 1470 1480 1490 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA09 DMETKLLHLEDVVRALEKHVDLRENDRLEFHRLSEENTLLKNDLGRVRQELEAAESTH-- .. :: ..: :. .:: ... .. ... ..: :..: :... :.:.:: KIAA04 ATLDQVATLERSLQATES--ELRASQE-KISKMKANETKLEGDKRRLKEVLDASESRTVK 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA09 -DAQRKEIEVLKKDKEKACSEMEVLNRQNQNYKDQL------SQLNVRVLQLGQEA-STH . ::. .: . .. . :. :. . :. :.: :.... .::: : . KIAA04 LELQRRSLEGELQRSRLGLSDREAQAQALQDRVDSLQRQVADSEVKAGTLQLTVERLNGA 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA09 QAQNEEH----RVTIQMLTQSLEEVVRSGQQQSDQIQKLRVELECLNQEHQSLQLPWSEL :. :: : .. ::..: . : .. :. .:. : ....: :: . KIAA04 LAKVEESEGALRDKVRGLTEALAQSSASLNSTRDKNLHLQKALTACEHDRQVLQERLDAA 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA09 TQTLEESQ-------DQVQG-----AHLRLRQAQAQ-HLQEVRLVPQDRV-AELHRLLSL :.: :.. .::: : :.:....:. .::..: : ..: .: : .. 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