# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg02182.fasta.huge -Q ../query/KIAA0978.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0978, 1368 aa vs ./tmplib.23663 library 1986137 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1301+/-0.0092; mu= -6.9612+/- 0.622 mean_var=311.6495+/-73.743, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 3 in 1/39 Lambda= 0.072651 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1685 ( 1505 res) pf04287 (1505) 686 86.7 3.4e-17 KIAA1713 ( 1652 res) fh22344 (1652) 376 54.2 2.2e-07 >>KIAA1685 ( 1505 res) pf04287 (1505 aa) initn: 1154 init1: 629 opt: 686 Z-score: 400.5 bits: 86.7 E(): 3.4e-17 Smith-Waterman score: 1153; 28.278% identity (52.799% similar) in 1411 aa overlap (19-1368:285-1505) 10 20 30 40 KIAA09 LTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSLALGSAAIRGQA : ..::..:::..:.:. :.... . 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