# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh13674.fasta.huge -Q ../query/KIAA0970.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0970, 1151 aa vs ./tmplib.23663 library 1986354 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3984+/-0.00772; mu= 0.3497+/- 0.522 mean_var=237.1478+/-57.984, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.083285 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598) 283 48.2 1.2e-05 KIAA0283 ( 1471 res) ha06139s1 (1471) 248 43.9 0.00021 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 206 39.0 0.0088 >>KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598 aa) initn: 232 init1: 99 opt: 283 Z-score: 193.3 bits: 48.2 E(): 1.2e-05 Smith-Waterman score: 581; 24.837% identity (51.410% similar) in 922 aa overlap (225-1080:273-1162) 200 210 220 230 240 KIAA09 GKGGTQVDTEIEEKDEETKAFEALLSNIVKPVA--SDIQARTVVLTWSPP----SSLING ::: : .. :.. :::. : : :: KIAA15 TYTCRVISAGGNDSRSAHLRVRQLPHAPEHPVATLSTVERRAINLTWTKPFDGNSPLIRY 250 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 300 KIAA09 --ETDESSVPELYGYEVLISSTGKDGKYKSVYVGEETNITLNDLKPAMDYHAKVQAEYNS : .:...: . ::..:. : : :..:.. : :: .:. .. : . 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