# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06404.fasta.huge -Q ../query/KIAA0967.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0967, 1578 aa vs ./tmplib.23663 library 1985927 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1498+/-0.00548; mu= 5.0226+/- 0.368 mean_var=251.1132+/-60.332, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.080936 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0316 ( 1379 res) fg06820 (1379) 1516 191.4 1e-48 >>KIAA0316 ( 1379 res) fg06820 (1379 aa) initn: 928 init1: 557 opt: 1516 Z-score: 966.3 bits: 191.4 E(): 1e-48 Smith-Waterman score: 1539; 30.347% identity (58.919% similar) in 1295 aa overlap (41-1257:119-1349) 20 30 40 50 60 70 KIAA09 TRKAHRIEQMVARWLRRSRDSSARAKVAAADGPARNPTQTLIPVRHTVKIDKDTLLQDYG : : . : . :. . :.. .: .: .: KIAA03 SQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVL-GFG 90 100 110 120 130 140 80 90 100 110 120 130 KIAA09 FHISESLPLTVVAVTAGGSAHGKLFPGDQILQMNNEPAEDLSWERAVDILREAEDSLSIT : . :..: .:: :: ..:::.:::::...:.::. ::..:..: ..:. .: KIAA03 FVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLT 150 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 KIAA09 VVRCTSGVPKSSFLTEEKRARLKTNPVKVHFAEEVLISGHS----QGNSLLCMPNVLKLY :.. :::.:.. :.::::.:::::.:.:::.:.:. . :::: ::::::.: KIAA03 VIQ-PYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVY 210 220 230 240 250 260 190 200 210 220 230 240 KIAA09 LENGQTKAFKFEANTTVKDIILTVKEKLSIRSIEYFALALEEQY--SISRLHLLHEEELI :::::::.:.:. .:..::.:::..:::::..::.:.: ::.. . ..: ::::.: . 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