# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06174s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0965.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0965, 489 aa vs ./tmplib.23663 library 1987016 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8928+/-0.00531; mu= 13.8826+/- 0.361 mean_var=127.3822+/-32.448, 0's: 0 Z-trim: 42 B-trim: 22 in 1/39 Lambda= 0.113637 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 611 112.4 2.5e-25 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 580 107.2 7.5e-24 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 463 88.1 4.7e-18 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 458 87.2 7.5e-18 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 455 86.7 1.1e-17 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 447 85.7 3.4e-17 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 327 65.3 1.5e-11 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 318 63.8 4.3e-11 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 292 59.5 8.1e-10 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 294 60.2 8.7e-10 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 264 54.7 1.6e-08 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 264 55.2 2.3e-08 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 262 55.5 5.1e-08 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 256 53.9 6e-08 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 249 52.5 1.1e-07 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 248 52.8 1.8e-07 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 234 50.5 8.7e-07 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 230 49.3 9e-07 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 229 49.5 1.4e-06 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 225 48.5 1.5e-06 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 219 47.4 2.9e-06 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 224 49.0 3e-06 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 217 47.0 3.2e-06 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 217 47.1 3.5e-06 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 214 47.0 7.3e-06 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 209 46.0 1.1e-05 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 205 45.8 2.5e-05 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 201 44.7 2.6e-05 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 201 44.7 2.7e-05 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 196 44.1 5.5e-05 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 192 43.4 8.9e-05 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 186 41.8 9.7e-05 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 186 41.9 0.00011 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 175 41.1 0.00093 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 170 39.9 0.0011 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 159 37.9 0.0035 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 156 37.4 0.0048 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 150 36.4 0.0093 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 152 37.0 0.0094 KIAA0641 ( 1326 res) hj03494s1 (1326) 152 37.0 0.0095 >>KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760 aa) initn: 1026 init1: 349 opt: 611 Z-score: 546.7 bits: 112.4 E(): 2.5e-25 Smith-Waterman score: 1022; 39.069% identity (65.587% similar) in 494 aa overlap (15-489:25-473) 10 20 30 40 KIAA09 RAPGRLRSVRRLSRPRARPEAVS--VTMAMTAGTTTTFPMSNHTRERVTV :::::.... .. . .:. :: ..: . . 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KIAA11 EERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFYIG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 KIAA09 ETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPP : :::::.:::: ..::::::::.:::..::..:.::: : :: KIAA11 EMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSC--LK---------------- 240 250 260 270 290 300 310 320 330 KIAA09 SDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVF--MQTGYNKL---CDWWSLG ::. ... ..: :::::::.::.. :. :..: ::::::: KIAA11 -------MNDDGTVQS------SVA---VGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLG 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 KIAA09 VIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPPEVP-ISEKAKDLILRFCIDSENRI : ::::: : :: .:. ::: :.:: .: . :: .: .::.::::: :. . : :. KIAA11 VCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRL 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 KIAA09 GNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHIRERPAAIPIEIKSIDDTSNFDDFPESDILQP---VPNT :..:.:..: : ::::..::.::. : ...: .:::::: ..:.:. .: KIAA11 GQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNFD--VDDDVLRNTEILPPG 380 390 400 410 420 430 460 470 480 KIAA09 TEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL .. ... :...:. ...:::. . :... : KIAA11 SHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIMQSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERR 440 450 460 470 480 490 KIAA11 IRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRALSNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNR 500 510 520 530 540 550 >>KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428 aa) initn: 774 init1: 353 opt: 580 Z-score: 520.1 bits: 107.2 E(): 7.5e-24 Smith-Waterman score: 962; 40.470% identity (68.668% similar) in 383 aa overlap (97-470:114-457) 70 80 90 100 110 120 KIAA09 RETRQKKLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAF : : ... .. .:.. .:::::::: KIAA06 ESLLDGLNSLVLDLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAF 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 KIAA09 GEVRLVQKKDTGHIYAMKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKR :::.::..: . ..::::.: : .:... . : . ::::.. :.. :::..::.::: : KIAA06 GEVQLVRHKASQKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDR 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 KIAA09 NLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLL ::..::..::::...:. . : . :. ..:: .:.:::.::::..:.::::.::::.:: KIAA06 YLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLL 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 KIAA09 DAKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAY : .::.::.::: : . .. ...: KIAA06 DKHGHLKLADFGTCMKMDET-------GMVHCD--------------------------- 270 280 310 320 330 340 350 360 KIAA09 STVGTPDYIAPEVFMQTG----YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMN ..:::::::.:::. . : :.. :::::.::..::::.: :: ... :: :.:. KIAA06 TAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMD 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 KIAA09 WKETLVFPPEVPISEKAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDW--EHIRERP :..: :: .. ::..::.:: : : : :.: .:::::. ::::.. .: ..::: KIAA06 HKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETA 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 KIAA09 AAIPIEIKSIDDTSNFDDFPES--DILQ-PVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQR : . :..: :.:::::. .. :. :.:.. . ... :...:: : KIAA06 APVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKA----FVGNQLPFIGFTYYRENLLLSD 410 420 430 440 450 460 480 KIAA09 GSIPTYMKAGKL KIAA06 SPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKEL 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583 aa) initn: 753 init1: 463 opt: 463 Z-score: 416.0 bits: 88.1 E(): 4.7e-18 Smith-Waterman score: 743; 36.782% identity (66.379% similar) in 348 aa overlap (111-455:383-705) 90 100 110 120 130 140 KIAA09 EGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHI : .::...:.:. ::.: : ::...:: . KIAA09 HLEEQDSGGSNTPEQDDLSEGRSSKAKKPPGENDFDTIKLISNGAYGAVYLVRHRDTRQR 360 370 380 390 400 410 150 160 170 180 190 200 KIAA09 YAMKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDM .::: . :.... ..:. . .:::::. :.. .:: :: ::. .:.: ..::.. ::: KIAA09 FAMKKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVGMFCSFETRRHLCMVMEYVEGGDC 420 430 440 450 460 470 210 220 230 240 250 260 KIAA09 MTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLC ::: . .: : ...:..:::::.. .:. :..:::.::::::. . ::.::.:::: KIAA09 ATLLKNIGALPVEMARMYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSMGHIKLTDFGLS 480 490 500 510 520 530 270 280 290 300 310 320 KIAA09 TGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVF . :..: ... : :. : .. :::.::::::. KIAA09 KMGLMSLTTNLY--------------------EGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPEVI 540 550 560 570 330 340 350 360 370 KIAA09 MQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPP-EVPISEKA .. ::.: :::..:.:.::.:.: :: ..::.: . .:.. . ...: . . .: KIAA09 LRQGYGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVIS--DDILWPEGDEALPTEA 580 590 600 610 620 630 380 390 400 410 420 430 KIAA09 KDLILRFC-IDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHI-RERPAAIPIEIKSIDDTSNFD . :: . . :.: .:. :.: : ::. .:: . :.. :: ...: :::: :: KIAA09 QLLISSLLQTNPLVRLGAGGAFEVKQHSFFRDLDWTGLLRQKAEFIP-HLESEDDTSYFD 640 650 660 670 680 440 450 460 470 480 KIAA09 DFPESDILQPVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL .:: . : . : : KIAA09 T--RSDRYHHVNSYDEDDTTEEEPVEIRQFSSCSPRFSKVYSSMEQLSQHEPKTPVAAAG 690 700 710 720 730 740 >>KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308 aa) initn: 787 init1: 458 opt: 458 Z-score: 412.4 bits: 87.2 E(): 7.5e-18 Smith-Waterman score: 767; 37.349% identity (69.880% similar) in 332 aa overlap (114-441:365-672) 90 100 110 120 130 140 KIAA09 ADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYAM :::..:.:. ::.: : ::...:: . .:. KIAA05 SHLEEEQPPAPESPESRALVGQSRRKPCESDFETIKLISNGAYGAVYLVRHRDTRQRFAI 340 350 360 370 380 390 150 160 170 180 190 200 KIAA09 KILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDMMTL : . :.... ..:. .. .:::::. :.. .::.:: ::. .:.: ..::.. ::: :: KIAA05 KKINKQNLILRNQIQQVFVERDILTFAENPFVVSMFCSFETRRHLCMVMEYVEGGDCATL 400 410 420 430 440 450 210 220 230 240 250 260 KIAA09 LMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCTGL : . : . ...:..:::::.. .:. :..:::.::::::. . ::.::.:::: KIAA05 LKNMGPLPVDMARLYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSLGHIKLTDFGL---- 460 470 480 490 500 510 270 280 290 300 310 320 KIAA09 KKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTV-GTPDYIAPEVFMQ : .....: .. .:. :.. . : :::.::::::... KIAA05 -----------------SKIGLMSMATNLYEGHIEKDAREFIDKQVCGTPEYIAPEVIFR 520 530 540 550 330 340 350 360 370 380 KIAA09 TGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPP-EVPISEKAKD ::.: :::..::..::.:.: :: ..::.: . .:.. . ...: . . :.: KIAA05 QGYGKPVDWWAMGVVLYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVVS--DEIMWPEGDEALPADAQD 560 570 580 590 600 610 390 400 410 420 430 KIAA09 LILRFCIDSE-NRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHI-RERPAAIPIEIKSIDDTSNFDDF :: :. .: .:.:..:..:.: :::: ..:: . :.. .: .... :::: :: KIAA05 LITRLLRQSPLDRLGTGGTHEVKQHPFFLALDWAGLLRHKAEFVP-QLEAEDDTSYFDTR 620 630 640 650 660 670 440 450 460 470 480 KIAA09 PESDILQPVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL : KIAA05 SERYRHLGSEDDETNDEESSTEIPQFSSCSHRFSKVYSSSEFLAVQPTPTFAERSFSEDR 680 690 700 710 720 730 >>KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329 aa) initn: 756 init1: 455 opt: 455 Z-score: 409.7 bits: 86.7 E(): 1.1e-17 Smith-Waterman score: 759; 38.739% identity (68.769% similar) in 333 aa overlap (113-441:41-349) 90 100 110 120 130 140 KIAA09 LADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYA .:::..:.:. ::.: : ::..:.: . .: KIAA08 SSCDSPDTPETDDSIEGHGASLPSKKTPSEEDFETIKLISNGAYGAVFLVRHKSTRQRFA 20 30 40 50 60 70 150 160 170 180 190 200 KIAA09 MKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDMMT :: . :.... ..:. . .:::::. :.. .::.:: ::. ::.: ..::.. ::: : KIAA08 MKKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMFCSFDTKRHLCMVMEYVEGGDCAT 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 250 260 KIAA09 LLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCT- :: . .: . ...:..:::::.. .:. :..:::.::::::. . ::.::.:::: KIAA08 LLKNIGALPVDMVRLYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSMGHIKLTDFGLSKM 140 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 KIAA09 GLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVFM :: .:: : ... : :. : .. :::.::::::.. KIAA08 GLM---------SLTTN------------LYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPEVIL 200 210 220 330 340 350 360 370 380 KIAA09 QTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPP-EVPISEKAK . ::.: :::..:.:.::.:.: :: ..::.: . .:.. . .:.: . . :. KIAA08 RQGYGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVIS--DEIVWPEGDEALPPDAQ 230 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 KIAA09 DLILRFCIDSE-NRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHI-RERPAAIPIEIKSIDDTSNFDD :: .. .. .:.:.... :.: :::: :.:: . :.. :: ...: :::: :: KIAA08 DLTSKLLHQNPLERLGTGSAYEVKQHPFFTGLDWTGLLRQKAEFIP-QLESEDDTSYFDT 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 KIAA09 FPESDILQPVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL : KIAA08 RSERYHHMDSEDEEEVSEDGCLEIRQFSSCSPRFNKVYSSMERLSLLEERRTPPPTKRSL 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137 aa) initn: 761 init1: 442 opt: 447 Z-score: 400.5 bits: 85.7 E(): 3.4e-17 Smith-Waterman score: 768; 34.987% identity (66.841% similar) in 383 aa overlap (103-479:73-423) 80 90 100 110 120 130 KIAA09 KLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLV :.:.: . .:::..:.:. ::.: : .: KIAA03 LEEMAHLGNYDSGTAETPETDESVSSSNASLKLRR-KPRESDFETIKLISNGAYGAVYFV 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 KIAA09 QKKDTGHIYAMKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIM ..:.. . .::: . :.... ..:. . .:::::. :.. .::.:. ::. .:.: ..: KIAA03 RHKESRQRFAMKKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMYCSFETRRHLCMVM 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 KIAA09 EFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHV :.. ::: ::. . : . ...:..:::::.. .:. :..:::.::::::. . ::. KIAA03 EYVEGGDCATLMKNMGPLPVDMARMYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLVTSMGHI 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 KIAA09 KLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSK-RKAETWKKNRRQLAYSTVGT ::.:::: : ....:... ... : :. : .. :: KIAA03 KLTDFGL---------------------SKVGLMSMTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGT 230 240 250 260 320 330 340 350 360 KIAA09 PDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVM----NWKETL :.::::::... ::.: :::..:.:.::.:.: :: ..::.: . .:. :: : KIAA03 PEYIAPEVILRQGYGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVISDEINWPEKD 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA09 VFPPEVPISEKAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHI-RERPAAIPIE :: : .. :.:: . .:.:..:. :.: : ::...::. . :.. :: . KIAA03 EAPP--PDAQDLITLLLR--QNPLERLGTGGAYEVKQHRFFRSLDWNSLLRQKAEFIP-Q 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 KIAA09 IKSIDDTSNFDDFPESDILQPVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKA ..: :::: :: .:. . . . : : ...:. : ..: . ..: : KIAA03 LESEDDTSYFDT--RSEKYHHMETEEEDDTNDEDF---NVEIRQFSSCSHRFSKVFSSID 380 390 400 410 420 430 KIAA09 GKL KIAA03 RITQNSAEEKEDSVDKTKSTTLPSTETLSWSSEYSEMQQLSTSNSSDTESNRHKLSSGLL 440 450 460 470 480 490 >>KIAA0175 ( 656 res) ha02337 (656 aa) initn: 380 init1: 254 opt: 327 Z-score: 299.3 bits: 65.3 E(): 1.5e-11 Smith-Waterman score: 381; 24.927% identity (57.185% similar) in 341 aa overlap (106-438:3-289) 80 90 100 110 120 130 KIAA09 VAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDD----FESLKVIGRGAFGEVRL ::: :. .: ..:: :.:..:.: KIAA01 TCKRTMKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKL 10 20 30 140 150 160 170 180 190 KIAA09 VQKKDTGHIYAMKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLI . . ::.. :.::. :. . .. .:..: . : . . .... .. ..... KIAA01 ACHILTGEMVAIKIMDKNTL--GSDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMV 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 KIAA09 MEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGH .:. :::... ....: :.::::. . . : :. .:. :. :::.::.:::.: . KIAA01 LEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHK 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 KIAA09 VKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGT .:: :::::. :... :. .: . :. 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KIAA18 ENLLLDAEANIKIADFGFS--------------------NEFTLGS-----KLDTF---- 190 200 210 310 320 330 340 350 360 KIAA09 RQLAYSTVGTPDYIAPEVFMQTGYN-KLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKV :.: : :::.:. :. : ::::::.: .. : :: ... .: ..: KIAA18 -------CGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERV 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 KIAA09 MNWKETLVFPPEVPISEKAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHIRERP . : . : .: .... :: . KIAA18 LRGKYRVPF----YMSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTE 270 280 290 300 310 320 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 402 init1: 132 opt: 294 Z-score: 267.6 bits: 60.2 E(): 8.7e-10 Smith-Waterman score: 387; 27.688% identity (54.301% similar) in 372 aa overlap (88-451:19-348) 60 70 80 90 100 110 KIAA09 SNLILQHEERETRQKKLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDF-E .:. . .:. .. ..:: :. .:: : KIAA02 SLSARNSVLGGKMSFFSFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKRD-LNPEDFWE 10 20 30 40 120 130 140 150 160 170 KIAA09 SLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYAMKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVV . .: ::::.: .:.:.:. . : :.. : .:.. .: :::. : .: KIAA02 IIGELGDGAFGKVYKAQNKETSVLAAAKVI---DTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIV 50 60 70 80 90 100 180 190 200 210 220 230 KIAA09 KMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDT-LTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFI :.. .: . ::....:: :: . ..... . ::: . : ..:. :.. .:. .: KIAA02 KLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVMLELERPLTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKII 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 KIAA09 HRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAE :::.: :.:. : .::.:::. . : :: .: KIAA02 HRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSA---KNTRT---------------IQ--------- 170 180 190 300 310 320 330 340 350 KIAA09 TWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVFM-QTG----YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCS ::. : .::: ..:::: : .:. :. : ::::. . :: :: KIAA02 -----RRD---SFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHE 200 210 220 230 240 360 370 380 390 400 410 KIAA09 ETPQETYRKVMNWKETLVFPPEVPISEKAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEG .:... :. . . . : : . ::. :. :.. .: . . .. ::: KIAA02 LNPMRVLLKIAKSEPPTLAQPSR-WSSNFKDF-LKKCLE-KNVDARWTTSQLLQHPFVTV 250 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 KIAA09 VDWEHIRERPAAIPIEI-KSIDDTSNFDDFPESDILQPVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYK . . ::: : :. . ..: .. :. :.. :.: . KIAA02 DSNKPIRELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLS 310 320 330 340 350 360 470 480 KIAA09 RFEGLTQRGSIPTYMKAGKL KIAA02 QNACILESVSEKTERSNSEDKLNSKILNEKPTTDEPEKAVEDINEHITDAQLEAMTELHD 370 380 390 400 410 420 489 residues in 1 query sequences 1987016 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:23:25 2008 done: Thu Dec 18 15:23:25 2008 Total Scan time: 0.440 Total Display time: 0.170 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]