# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05306.fasta.huge -Q ../query/KIAA0951.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0951, 679 aa vs ./tmplib.23663 library 1986826 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.8532+/- 0.005; mu= 22.2772+/- 0.342 mean_var=96.7002+/-23.082, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.130425 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1260 ( 817 res) hh15752 ( 817) 4449 848.0 0 KIAA1480 ( 682 res) fj05645 ( 682) 3569 682.3 3.9e-197 KIAA1070 ( 826 res) hj05602 ( 826) 2133 412.2 9.3e-116 KIAA1366 ( 550 res) fj02695 ( 550) 2076 401.2 1.3e-112 KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022) 139 37.2 0.0091 >>KIAA1260 ( 817 res) hh15752 (817 aa) initn: 4448 init1: 4448 opt: 4449 Z-score: 4525.3 bits: 848.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 4449; 98.792% identity (99.698% similar) in 662 aa overlap (18-679:157-817) 10 20 30 40 KIAA09 GTNIKRNADDITSNDHGEDKDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNM :: :::.::::::::::::::::::::::: KIAA12 IWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTED-DIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNM 130 140 150 160 170 180 50 60 70 80 90 100 KIAA09 IDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 IDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGD 190 200 210 220 230 240 110 120 130 140 150 160 KIAA09 PKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 PKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKV 250 260 270 280 290 300 170 180 190 200 210 220 KIAA09 GCNMLDTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLN ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 GCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLN 310 320 330 340 350 360 230 240 250 260 270 280 KIAA09 YDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 YDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMY 370 380 390 400 410 420 290 300 310 320 330 340 KIAA09 TDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 TDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSW 430 440 450 460 470 480 350 360 370 380 390 400 KIAA09 ADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 ADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDT 490 500 510 520 530 540 410 420 430 440 450 460 KIAA09 KFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 KFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIF 550 560 570 580 590 600 470 480 490 500 510 520 KIAA09 QYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA12 QYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVL 610 620 630 640 650 660 530 540 550 560 570 580 KIAA09 IETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:: KIAA12 IETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHI 670 680 690 700 710 720 590 600 610 620 630 640 KIAA09 QNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: KIAA12 QNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPN 730 740 750 760 770 780 650 660 670 KIAA09 TLMGMQPLHTFKTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV :: ::::::::.:::::::::::::::::::: KIAA12 TLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV 790 800 810 >>KIAA1480 ( 682 res) fj05645 (682 aa) initn: 3193 init1: 2817 opt: 3569 Z-score: 3631.2 bits: 682.3 E(): 3.9e-197 Smith-Waterman score: 3569; 75.735% identity (90.882% similar) in 680 aa overlap (1-679:7-682) 10 20 30 40 50 KIAA09 GTNIKRNADDITSNDHGEDKDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILA :.. :....:...:: ::.::.....: ::::::::::::::::::::::::: KIAA14 PRVWSPGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGAK-PVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 KIAA09 SYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIF :::::::::.:::.:.::::::::::::::::::::::::::. ::.. :::::.:.:.: KIAA14 SYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA09 GSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNMLDT ::: ::::::::::::.::::::.::::::.:::::::::::.::: .::::::::.::: KIAA14 GSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA09 TDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGV .:::.::..:. :::..: : :: ::.:::::::::::::::.::::::::::::::::: KIAA14 VDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 KIAA09 NQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKE :::::::::.:.:: ::::. .:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.. KIAA14 NQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA09 NPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAHGD ::::::::::::::::::: :.:.::::::.:::::::::::::::: :::.:.:.:::: KIAA14 NPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 KIAA09 EVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKP :::::::.::.:::.:: ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: KIAA14 EVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA09 NRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVSTTT :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: .:::::.::...:.:.:::: KIAA14 NRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTT 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 KIAA09 KVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKRDY :::::: : . ::: .: : .::::::.:: . .... . . .:.:. ::: KIAA14 KVPPPDTTHSSHITRRPNGKTW-STKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDY 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 KIAA09 STELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNT-TNDITHIQNEEIM ::::::::::::::::::.::::::::.:::::.: :.:::::.. . .. .::. KIAA14 STELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELA 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 KIAA09 SLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNTLMGMQ .::. .: :::. ::::::: :::::::::::::::.:::::::::::.:.:.: KIAA14 ALQLGPTHH--ECEAGPPHDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQ 600 610 620 630 640 650 660 670 KIAA09 PLHTFKTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV :: ..::..: :::.:::.:::::: KIAA14 TLHPYNTFAAGFNSTGLPHSHSTTRV 660 670 680 >>KIAA1070 ( 826 res) hj05602 (826 aa) initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133 Z-score: 2170.1 bits: 412.2 E(): 9.3e-116 Smith-Waterman score: 3453; 75.037% identity (89.069% similar) in 677 aa overlap (18-679:166-826) 10 20 30 40 KIAA09 GTNIKRNADDITSNDHGEDKDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNM :: ::..... ::::::::::::::::::. 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KIAA10 HLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFS 620 630 640 650 660 520 530 540 550 560 570 KIAA09 TGPEDTTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQR . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. :::: KIAA10 VD----------QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQR 670 680 690 700 710 580 590 600 610 620 630 KIAA09 NTTNDITHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFM .::::.:: :.:::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.: KIAA10 TTTNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLM 720 730 740 750 760 770 640 650 660 670 KIAA09 TPNTITMIPNTLMGMQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV :::::::::::. :.::::::.::.::::.: ::.:::::: KIAA10 TPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV 780 790 800 810 820 >>KIAA1366 ( 550 res) fj02695 (550 aa) initn: 2313 init1: 1852 opt: 2076 Z-score: 2113.7 bits: 401.2 E(): 1.3e-112 Smith-Waterman score: 2302; 62.167% identity (79.929% similar) in 563 aa overlap (138-679:1-550) 110 120 130 140 150 160 KIAA09 PKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKV ::: :::::.:::.::::: ::::.:: :: KIAA13 KAIAQSGTAISSWSVNYQPLKYTRLLAAKV 10 20 30 170 180 190 200 210 220 KIAA09 GCNMLDTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLN ::. :... ::::. : .::..: . :: ::::::::.::::.::::.:::.:::::: KIAA13 GCDREDSAEAVECLRRKPSRELVDQDVQPARYHIAFGPVVDGDVVPDDPEILMQQGEFLN 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 KIAA09 YDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMY ::...:::::::::::. ...::::. . :::.::::::::::::::::.::::::::: KIAA13 YDMLIGVNQGEGLKFVEDSAESEDGVSASAFDFTVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMY 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 KIAA09 TDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSW :::::..: : :::::.:::::::::::::::: :::.: ::.:::.::::::.: .: : KIAA13 TDWADRDNGEMRRKTLLALFTDHQWVAPAVATAKLHADYQSPVYFYTFYHHCQAEGRPEW 160 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 400 KIAA09 ADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDT ::.:::::.:::::.::.: :.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA13 ADAAHGDELPYVFGVPMVGATDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDT 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 KIAA09 KFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLN-EI :::::::::::::.:::.: :.. ::::::::::::.:::.:::::::::::::::. :. KIAA13 KFIHTKPNRFEEVVWSKFNSKEKQYLHIGLKPRVRDNYRANKVAFWLELVPHLHNLHTEL 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 KIAA09 FQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTV : .:::..:: : .: : :: : :.:: ::. : . .: . ::. KIAA13 F---TTTTRLPPY-ATRWPP---RPPAGA-PGTRRPP-PPATLPPEP-EP-EPGPRAYDR 340 350 360 370 530 540 550 560 570 580 KIAA09 LIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITH . .::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.. :. :: .. . . KIAA13 FPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNILAFAALYYKRDRRQELRCRRLSPPGGSGSGVP- 380 390 400 410 420 430 590 600 610 620 630 KIAA09 IQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAH----------DTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPF . .. ..: ..: ::: . ..:: .:::::::.:::.:::.:. KIAA13 -GGGPLLPAAGRELPPEEELVSLQLKRGGGVGADPAEALRPACPPDYTLALRRAPDDVPL 440 450 460 470 480 490 640 650 660 670 KIAA09 MTPNTITMIPNTLMGMQP-----LHTFKTF-----SGGQNSTNLPHGHSTTRV ..:...:..:. : : :: : : .. .....::: :::::: KIAA13 LAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSLHPFGPFPPPPPTATSHNNTLPHPHSTTRV 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022 aa) initn: 72 init1: 48 opt: 139 Z-score: 141.5 bits: 37.2 E(): 0.0091 Smith-Waterman score: 141; 19.733% identity (50.133% similar) in 375 aa overlap (332-675:566-924) 310 320 330 340 350 KIAA09 TLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQS--EMKPSWADSAH-GD---- :.::..: :. ....:: :: KIAA14 CIASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGV 540 550 560 570 580 590 360 370 380 390 400 KIAA09 --EVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSK---NDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF :: . :. . :..: :. . . ...:. : :.. :. . .:.. KIAA14 RWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRK---NRKIHKDAES 600 610 620 630 640 650 410 420 430 440 450 460 KIAA09 IHT---KPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEI .. . . : .. .: . .: .:.. .. ... :: :. . . . KIAA14 AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNID-SPKLYSNLLTSRK----ELPPNGDTKSMV 660 670 680 690 700 470 480 490 500 510 KIAA09 FQYVSTTTKV---PPPDMT---------SFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSK ... . .. : :. : .. .... .. . : . :.. : :: KIAA14 MDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSP 710 720 730 740 750 760 520 530 540 550 560 570 KIAA09 DPHKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHP : : .. :: .. .::.: .: . : : . :: : ...:: ::. KIAA14 LSHGHIP-SAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNID--HPLTKSSSKR---DHRRS 770 780 790 800 810 820 580 590 600 610 620 630 KIAA09 SPQRNTTNDITHIQNEEIMSLQ--MKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCP--PDYTLTLRRS .::: ::. . :. . . : ... :. :. .. . : :. .: KIAA14 VDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSP 830 840 850 860 870 880 640 650 660 670 KIAA09 PDDIPFMTPNTITMIPNTLMGMQPLHTFKTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV :. .: .:. . .:.: :. :. ... : ..... :. : KIAA14 PSTLPRNSPTKRVDVPTT-PGV-PMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLS 890 900 910 920 930 KIAA14 RQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKP 940 950 960 970 980 990 679 residues in 1 query sequences 1986826 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:22:51 2008 done: Thu Dec 18 15:22:52 2008 Total Scan time: 0.530 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]