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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0949, 1559 aa vs ./tmplib.23663 library 1985946 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7574+/-0.0103; mu= -2.4497+/- 0.695 mean_var=516.7567+/-124.060, 0's: 0 Z-trim: 40 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056420 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003) 424 50.6 1.8e-06 KIAA1319 ( 1208 res) fh13717 (1208) 393 48.2 1.2e-05 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 363 46.1 8.4e-05 KIAA2034 ( 1571 res) ah04445 (1571) 356 45.4 0.00011 KIAA0373 ( 1540 res) hh00281 (1540) 343 44.3 0.00022 KIAA0216 ( 2067 res) hf00331s1 (2067) 341 44.3 0.00029 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 326 42.9 0.00056 KIAA0402 ( 3284 res) hg01127s1 (3284) 330 43.7 0.0007 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 308 41.4 0.0015 KIAA1633 ( 1852 res) fh23696 (1852) 311 41.8 0.0015 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 309 41.7 0.0017 KIAA1052 ( 1456 res) hh04964 (1456) 297 40.5 0.0029 KIAA0635 ( 864 res) hj03253 ( 864) 290 39.6 0.0032 KIAA0568 ( 1426 res) hh02280 (1426) 291 40.0 0.004 KIAA0336 ( 1635 res) hg01120 (1635) 292 40.2 0.0041 KIAA1262 ( 1362 res) hh15990 (1362) 283 39.4 0.0062 KIAA1119 ( 1854 res) hf00569y1 (1854) 282 39.5 0.0077 KIAA1601 ( 690 res) fj10228 ( 690) 272 38.0 0.0079 >>KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003 aa) initn: 147 init1: 74 opt: 424 Z-score: 207.9 bits: 50.6 E(): 1.8e-06 Smith-Waterman score: 437; 23.381% identity (55.104% similar) in 911 aa overlap (38-906:166-971) 10 20 30 40 50 60 KIAA09 ALLGEETMMEQEMTRLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKR ...:: . .::..:. . : :.:. 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KIAA15 MAEELKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQVQKLEAKVRELEA 1850 1860 1870 1880 1890 1900 860 870 880 890 900 910 KIAA09 AIVRSPEHQPSAMSLLAPPSSRRKESSTPEEFSRRLKERMHHNIPHRFNVGLNMRATKCA . ... :.. . : :: . : .:. ::. KIAA15 ELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKLQSKVKSYKRQFEE 1910 1920 1930 1940 1950 1960 920 930 940 950 960 970 KIAA09 VCLDTVHFGRQASKCLECQVMCHPKCSTCLPATCGLPAEYATHFTEAFCRDKMNSPGLQT KIAA15 AEQQANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPKHKE 1970 1980 1990 2000 2010 >>KIAA2034 ( 1571 res) ah04445 (1571 aa) initn: 177 init1: 112 opt: 356 Z-score: 176.1 bits: 45.4 E(): 0.00011 Smith-Waterman score: 484; 22.723% identity (53.327% similar) in 977 aa overlap (8-894:522-1465) 10 20 30 KIAA09 LSLTKNCALLGEET----MMEQEMTRLHRRVSEVEAV : .::: .:. : ::.....:.:: KIAA20 EAELCAEAEETRGRLAARKQELELVVSELEARVGEEEECSRQMQTEKKRLQQHIQELEAH 500 510 520 530 540 550 40 50 60 70 80 KIAA09 LSQKE-------VELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDDKALQL : .: .: ..:.. . .:.:: . : .. : : :. .: :. .. 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KIAA20 RIHEAAVQELRQRHGQALGELAEQLE-QARRGKGAWEKTRLALEAEVSELRAELSSLQTA 790 800 810 820 830 300 310 320 330 340 KIAA09 MQRHEEEAHE--------KGKILSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVELSEANKLAANSSLF :. :.. .. .:. . ..: .: . :.. . .. ..: : . : .... KIAA20 RQEGEQRRRRLELQLQEVQGRAGDGERARAEAAE-KLQRAQAELENVSGALNEAESKTIR 840 850 860 870 880 890 350 360 370 380 390 KIAA09 TQRNMKAQE-------EMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKISHQDHSDKNR ...... : :...: . :. : ... .::. :.::::. . . . KIAA20 LSKELSSTEAQLHDAQELLQEETRAKLALGSRVRAMEAEAAGLREQLEEEAAARERAGRE 900 910 920 930 940 950 400 410 420 430 440 450 KIAA09 LLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAA----LESQLRQ : ...: : ..::. :. . . .: :. :: : .. :: :. KIAA20 LQTAQAQLSEWRRRQEEEAGALEAGEEARRRAAREAEA-LTQRLAEKTETVDRLERGRRR 960 970 980 990 1000 1010 460 470 480 490 500 510 KIAA09 AKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRKFDAL--RNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELN . ::...: . :.. : :.. .. ::::: : ... .:. .::. .. .. : . 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KIAA06 RTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQ 680 690 700 710 720 730 330 340 350 360 370 KIAA09 IRSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNM-KAQEEMISELRQQ--KFYLETQAGKLEAQN .. ..: . : ::.. :... : . .. .. :: :: .. : :: .. : ...: KIAA06 LKVIQQSL-EQEEAEHKATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVEN 740 750 760 770 780 790 380 390 400 410 420 KIAA09 RKLEEQ-----LEKISHQDHSDKNRLLE----LETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQL :: . :. .:... :.::. :. .:...:. :.. :: ::. .: KIAA06 LLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQET--QKRCLTQNDL 800 810 820 830 840 850 430 440 450 460 470 480 KIAA09 SLQERESQLTALQAARAALESQ---LRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRKFDA ..: . :...:. .. :... : . : .::. .:: ..: : .. :.: ...: KIAA06 KMQTQ--QVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEA 860 870 880 890 900 490 500 510 520 530 540 KIAA09 LRNSCTV----ITDLEEQLNQLTEDNAELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHL . :. . .:.:. .. :. . ::.... :. . : . .:. ::. ... ..: KIAA06 EQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQKKQELQDERD-SLAAQLEITLTKADSEQL 910 920 930 940 950 960 550 560 570 580 590 600 KIAA09 RREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTML--EEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGD : :.:.... ... :. :. : .... . .: : : .: . . :.. 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KIAA04 KEESAAKAELALEL-HKTQGTLEGFKVETADLKEVLAGKEDSEHRLVLELESLRRQLQQA 1350 1360 1370 1380 1390 1400 310 320 330 340 350 KIAA09 AHEKGKILSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVEL-SEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMISE :.:.. . : . . .. . : : . : .:.. :. ..: .. : . ..:. KIAA04 AQEQAALREECTRLWSRGEATATDAEAREAALRKEVEDLTKEQSETRKQAEKDRSALLSQ 1410 1420 1430 1440 1450 1460 360 370 380 390 400 410 KIAA09 LRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEE--QLEK-ISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQ .. . :: : .. .. .. : ::. .. :. .:. .. . : :.:: KIAA04 MKILESELEEQLSQHRGCAKQAEAVTALEQQVASLDKHLRNQRQFMDEQAAEREHEREEF 1470 1480 1490 1500 1510 1520 420 430 440 450 460 470 KIAA09 KLELKRQLTELQLSLQE-----RESQLTALQAARAALESQLRQAKTELEETTAEAEEEIQ . :..: .:. . . :.:: . :.. :...::. :..: . . : . KIAA04 QQEIQRLEGQLRQAAKPQPWGPRDSQQAPLDGEVELLQQKLREKLDEFNELAIQKESADR 1530 1540 1550 1560 1570 1580 480 490 500 510 KIAA09 ALTAHRDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQ-------LTEDNAELNNQNFY------- . ...::.: . : ...:.:.... : .:. :..:.. 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