# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pg00224.fasta.huge -Q ../query/KIAA0934.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0934, 1585 aa vs ./tmplib.23663 library 1985920 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1368+/-0.00603; mu= 11.8071+/- 0.409 mean_var=129.5462+/-30.474, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.112684 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1463 ( 1166 res) fh18591s1 (1166) 6309 1038.3 0 KIAA0184 ( 863 res) ha02918 ( 863) 4902 809.5 0 >>KIAA1463 ( 1166 res) fh18591s1 (1166 aa) initn: 6307 init1: 5449 opt: 6309 Z-score: 5544.6 bits: 1038.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 6309; 76.930% identity (93.310% similar) in 1166 aa overlap (421-1585:1-1166) 400 410 420 430 440 450 KIAA09 VAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFYGCLLAEVVPVPIEVPLTRKD ::. ::.::::::::::.:::::::::::: KIAA14 DPVMFMVAFYGCLLAEVIPVPIEVPLTRKD 10 20 30 460 470 480 490 500 510 KIAA09 AGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFKGWPKLLWFVTESKHLSKPPR ::.:::::::::::...::::..: :::::. .::: ::::::.: : ::.::.:::::. KIAA14 AGGQQIGFLLGSCGIALALTSEVCLKGLPKTQNGEIVQFKGWPRLKWVVTDSKYLSKPPK 40 50 60 70 80 90 520 530 540 550 560 570 KIAA09 DWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHCQALTQACGYTEAETIVNVLD :: :::. :... ::::::: :.:::.::::.: :.:.:::::.:::.:.:.:::::::: KIAA14 DWQPHISPAGTEPAYIEYKTSKEGSVMGVTVSRLAMLSHCQALSQACNYSEGETIVNVLD 100 110 120 130 140 150 580 590 600 610 620 630 KIAA09 FKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKVCQYKAKVACVKSRDMHWALV ::::.:::::....::: ::.::.:::.::. ::::.:.: .::::: :: ::.:::.. KIAA14 FKKDAGLWHGMFANVMNKMHTISVPYSVMKTCPLSWVQRVHAHKAKVALVKCRDLHWAMM 160 170 180 190 200 210 640 650 660 670 680 690 KIAA09 AHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSKGLRQEVICPCASSPEALTVA :::::::..:::::::::.:::::::.:::::::..:::.::. :.:::::.: ::.::: KIAA14 AHRDQRDVSLSSLRMLIVTDGANPWSVSSCDAFLSLFQSHGLKPEAICPCATSAEAMTVA 220 230 240 250 260 270 700 710 720 730 740 750 KIAA09 IRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTVQDVGLVMPGAIMCSVKPDGV :::: . :::..:::.::.::::::..:.: :.::::::: ::::..:: ::::: KIAA14 IRRPGVPGAPLPGRAILSMNGLSYGVIRVNTEDKNSALTVQDVGHVMPGGMMCIVKPDGP 280 290 300 310 320 330 760 770 780 790 800 810 KIAA09 PQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMTSSGAPISEYPFIRTGLLGFV ::::.::::::.:: . . : :.::.:.:::::::.:..:.:.:... ::::.:::::: KIAA14 PQLCKTDEIGEICVSSRTGGMMYFGLAGVTKNTFEVIPVNSAGSPVGDVPFIRSGLLGFV 340 350 360 370 380 390 820 830 840 850 860 870 KIAA09 GPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDERIV :::.:::::::::::..::::::::::::::.:::: .: :::::::::::.:..::::: KIAA14 GPGSLVFVVGKMDGLLMVSGRRHNADDIVATGLAVESIKTVYRGRIAVFSVSVFYDERIV 400 410 420 430 440 450 880 890 900 910 920 930 KIAA09 IVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHLSETKQL .:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: KIAA14 VVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHISQTKQL 460 470 480 490 500 510 940 950 960 970 980 990 KIAA09 FLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVGNLVSGKRIAQASGRDLGQIE ::::::::::.::::::::::::::::::: .:::::::::::.:::::::.:::::::: KIAA14 FLEGSLHPCNILMCPHTCVTNLPKPRQKQPGVGPASVMVGNLVAGKRIAQAAGRDLGQIE 520 530 540 550 560 570 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA09 DNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANSLTCVQLHKRAEKIAVMLMER .:: .:: ::.:.::::::.::::.:. ::: .:. . . .:.:::::::.:: .: .. KIAA14 ENDLVRKHQFLAEILQWRAQATPDHVLFMLLNAKGTTVCTASCLQLHKRAERIASVLGDK 580 590 600 610 620 630 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA09 GHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPHPQNIATTLPTVKMIVEVSRS :::. ::.:.:.:::::.:::::::::::::.:.:::::: ::...:::::.:::.::.. KIAA14 GHLNAGDNVVLLYPPGIELIAAFYGCLYAGCIPVTVRPPHAQNLTATLPTVRMIVDVSKA 640 650 660 670 680 690 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA09 ACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKRPAQICKPCNPDTLAYLDFSV ::..:.: . .:::::::::::::.::: :.::::::.:: :. :: .:. :::::::: KIAA14 ACILTSQTLMRLLRSREAAAAVDVKTWPTIIDTDDLPRKRLPQLYKPPTPEMLAYLDFSV 700 710 720 730 740 750 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA09 STTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLDPYCGLGFVLWCLCSVYSGHQ ::::::.::::::.:..:.::.:::::::: ::..::::::::::::.:::::::::::: KIAA14 STTGMLTGVKMSHSAVNALCRAIKLQCELYSSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQ 760 770 780 790 800 810 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA09 SILIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTKGLGSQTESLKARGLDLSRVR :.:::: :::.: ::: .:.:::.::::::::::::::::::.:.: ::.::..:: :: KIAA14 SVLIPPMELENNLFLWLSTVNQYKIRDTFCSYSVMELCTKGLGNQVEVLKTRGINLSCVR 820 830 840 850 860 870 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA09 TCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRVNLAICLQGTSGPDPTTVYVD :::::::::::.:: :::::::::.:: ::::::.:: :::.:::::::::::::::::: KIAA14 TCVVVAEERPRVALQQSFSKLFKDIGLSPRAVSTTFGSRVNVAICLQGTSGPDPTTVYVD 880 890 900 910 920 930 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA09 MRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPETKGPLGDSHLGEIWVHSAHN ...::::::::::::.:.:: : :::::::::...:.:::::::.::::::::::.: :. KIAA14 LKSLRHDRVRLVERGAPQSLLLSESGKILPGVKVVIVNPETKGPVGDSHLGEIWVNSPHT 940 950 960 970 980 990 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA09 ASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDT-QTIWARTGYLGFLRRTELTDANGERHDALYVV ::::.::: .:.::.::::.::::::. ::.:::::::::.:::::: :.:::::::::: KIAA14 ASGYYTIYDSETLQADHFNTRLSFGDAAQTLWARTGYLGFVRRTELTAATGERHDALYVV 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA09 GALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNLLVVVVELDGSEQEALDLVP :::::..::::.::::::::::: : :.:..::::::::::::::::: ::::::::::: KIAA14 GALDETLELRGLRYHPIDIETSVSRIHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELCGSEQEALDLVP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA09 LVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.::::::::::::::: KIAA14 LVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDPGVIPINSRGEKQRMHLRDSFLADQLDPIYVAYNM 1120 1130 1140 1150 1160 >>KIAA0184 ( 863 res) ha02918 (863 aa) initn: 4902 init1: 4902 opt: 4902 Z-score: 4310.0 bits: 809.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 4902; 81.576% identity (94.786% similar) in 863 aa overlap (723-1585:1-863) 700 710 720 730 740 750 KIAA09 RPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTVQDVGLVMPGAIMCSVKPDGVPQ :::::::::::: ::::: .: :: .:.: KIAA01 EKLSVLTVQDVGQVMPGANVCVVKLEGTPY 10 20 30 760 770 780 790 800 810 KIAA09 LCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMTSSGAPISEYPFIRTGLLGFVGP ::.:::.::.:: . ::::.:::: :.:::.::. :.:..:::: . :: :::::::.:: KIAA01 LCKTDEVGEICVSSSATGTAYYGLLGITKNVFEAVPVTTGGAPIFDRPFTRTGLLGFIGP 40 50 60 70 80 90 820 830 840 850 860 870 KIAA09 GGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDERIVIV .:::.:::.:::::.. :::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.: KIAA01 DNLVFIVGKLDGLMVTGVRRHNADDVVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDDRIVLV 100 110 120 130 140 150 880 890 900 910 920 930 KIAA09 AEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHLSETKQLFL ::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::: :: KIAA01 AEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKAPLGGIHISETKQRFL 160 170 180 190 200 210 940 950 960 970 980 990 KIAA09 EGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVGNLVSGKRIAQASGRDLGQIEDN ::.::::::::::::::::::::::::::.::::..:::::.::::::::::.:...::. KIAA01 EGTLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEVGPASMIVGNLVAGKRIAQASGRELAHLEDS 220 230 240 250 260 270 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA09 DQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANSLTCVQLHKRAEKIAVMLMERGH :::::::::..::::::.::::: :. ::: .:..... ::::::::::..:. :::.:. KIAA01 DQARKFLFLADVLQWRAHTTPDHPLFLLLNAKGTVTSTATCVQLHKRAERVAAALMEKGR 280 290 300 310 320 330 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA09 LQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPHPQNIATTLPTVKMIVEVSRSAC :. :::::::::::.::::::::::: ::::.:::::::::..:::::::::::::.::: KIAA01 LSVGDHVALVYPPGVDLIAAFYGCLYCGCVPVTVRPPHPQNLGTTLPTVKMIVEVSKSAC 340 350 360 370 380 390 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA09 LMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKRPAQICKPCNPDTLAYLDFSVST ..::: . .::::.:::::::.:::: ::::::.:::. :.. .: .::.:::::::::: KIAA01 VLTTQAVTRLLRSKEAAAAVDIRTWPTILDTDDIPKKKIASVFRPPSPDVLAYLDFSVST 400 410 420 430 440 450 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA09 TGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLDPYCGLGFVLWCLCSVYSGHQSI ::.:::::::::::::.::::::::::::::..::::::::::::.:::::::::::::. KIAA01 TGILAGVKMSHAATSALCRSIKLQCELYPSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSV 460 470 480 490 500 510 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA09 LIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTKGLGSQTESLKARGLDLSRVRTC :.:: :::.: .::: ::::::.: :::::::::.::::::.:: :. .:..:: :::: KIAA01 LVPPLELESNVSLWLSAVSQYKARVTFCSYSVMEMCTKGLGAQTGVLRMKGVNLSCVRTC 520 530 540 550 560 570 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA09 VVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRVNLAICLQGTSGPDPTTVYVDMR .:::::::::::::::::::::::: :::::.::::::.:::::::.:::::::::::: KIAA01 MVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLPARAVSTTFGCRVNVAICLQGTAGPDPTTVYVDMR 580 590 600 610 620 630 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA09 ALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPETKGPLGDSHLGEIWVHSAHNAS ::::::::::::::::::::::::::::::..:::. :::::::::::::::: : :::. KIAA01 ALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVKVIIAHTETKGPLGDSHLGEIWVSSPHNAT 640 650 660 670 680 690 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA09 GYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDTQTIWARTGYLGFLRRTELTDANGERHDALYVVGAL ::.:.::.:.:..:::..::::::::::::::::::::::::::::.: :::::::::.: KIAA01 GYYTVYGEEALHADHFSARLSFGDTQTIWARTGYLGFLRRTELTDASGGRHDALYVVGSL 700 710 720 730 740 750 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA09 DEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNLLVVVVELDGSEQEALDLVPLVT ::..::::::::::::::::::::.:..::::::::::::::::::: ::.::::: ::: KIAA01 DETLELRGMRYHPIDIETSVIRAHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELDGLEQDALDLVALVT 760 770 780 790 800 810 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA09 NVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM :::::::::.:::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA01 NVVLEEHYLVVGVVVIVDPGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM 820 830 840 850 860 1585 residues in 1 query sequences 1985920 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:22:04 2008 done: Thu Dec 18 15:22:05 2008 Total Scan time: 0.860 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]