# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03734.fasta.huge -Q ../query/KIAA0927.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0927, 1001 aa vs ./tmplib.23663 library 1986504 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5658+/-0.00971; mu= -9.8384+/- 0.656 mean_var=445.1456+/-107.087, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.060789 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048) 980 101.2 7.3e-22 KIAA1894 ( 2977 res) ff08107 (2977) 894 94.2 2.7e-19 >>KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048 aa) initn: 648 init1: 269 opt: 980 Z-score: 484.3 bits: 101.2 E(): 7.3e-22 Smith-Waterman score: 980; 32.258% identity (59.253% similar) in 589 aa overlap (331-894:138-707) 310 320 330 340 350 360 KIAA09 ELTGSASEESQETTTSTIITTTVITTEQAPALCSVSFSNPEGYIDSSDYPLLPLNNFLEC : :..: .. :: . : ..: :: :: KIAA18 FLGYRLEGATKLTCLGGGRRVWSAPLPRCVAECGASVKGNEGTLLSPNFPSNYDNNH-EC 110 120 130 140 150 160 370 380 390 400 410 KIAA09 TYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSDGELLSIR-GVDG---PTLTVLANQTLLVEGQVIRSPT :.. . .: :..:...: .: .:. :.. : :. : : :. : : .. : . 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