# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03560mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0912.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0912, 1300 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7810385 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1050+/-0.000198; mu= 10.3592+/- 0.011 mean_var=125.4478+/-24.061, 0's: 31 Z-trim: 115 B-trim: 342 in 2/66 Lambda= 0.114510 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119597761|gb|EAW77355.1| centrosomal protein 15 (1275) 8222 1370.9 0 gi|114656899|ref|XP_523070.2| PREDICTED: centrosom (1710) 7492 1250.4 0 gi|109081038|ref|XP_001113236.1| PREDICTED: simila (1710) 7320 1222.0 0 gi|218512101|sp|O94986.3|CE152_HUMAN RecName: Full (1654) 6243 1044.0 0 gi|114656901|ref|XP_001166117.1| PREDICTED: centro (1654) 6156 1029.7 0 gi|194206676|ref|XP_001918230.1| PREDICTED: centro (1574) 5768 965.6 0 gi|74000612|ref|XP_535469.2| PREDICTED: similar to (1301) 5764 964.8 0 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5.4e-73 gi|189537675|ref|XP_694227.3| PREDICTED: similar t (1560) 1613 279.1 1.5e-71 gi|149636838|ref|XP_001509619.1| PREDICTED: hypoth (1360) 1440 250.5 5.4e-63 gi|118095787|ref|XP_413819.2| PREDICTED: similar t (1769) 1238 217.2 7.3e-53 gi|47220517|emb|CAG05543.1| unnamed protein produc ( 530) 958 170.5 2.6e-39 gi|198427705|ref|XP_002122978.1| PREDICTED: simila (1326) 786 142.4 1.8e-30 gi|190585653|gb|EDV25721.1| hypothetical protein T (2002) 766 139.3 2.4e-29 gi|47220518|emb|CAG05544.1| unnamed protein produc ( 845) 694 127.0 4.9e-26 gi|210112063|gb|EEA59848.1| hypothetical protein B (1526) 653 120.5 8.1e-24 gi|156225710|gb|EDO46525.1| predicted protein [Nem (2008) 576 107.9 6.6e-20 gi|115702473|ref|XP_788275.2| PREDICTED: similar t (1338) 538 101.5 3.9e-18 gi|121915630|gb|EAY20417.1| viral A-type inclusion (4263) 537 101.8 9.8e-18 gi|89289329|gb|EAR87317.1| Viral A-type inclusion (2519) 522 99.1 3.8e-17 gi|165896309|gb|EDR23762.1| intracellular protein (1080) 496 94.4 4.1e-16 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Viral A-type inclusion (1813) 443 85.9 2.5e-13 gi|212506338|gb|EEB10581.1| hypothetical protein P (1175) 439 85.1 3e-13 gi|1945080|dbj|BAA19691.1| myosin [Mus musculus] (1938) 442 85.8 3e-13 gi|70832071|gb|EAN77575.1| hypothetical protein, c (2872) 444 86.3 3.1e-13 >>gi|119597761|gb|EAW77355.1| centrosomal protein 152kDa (1275 aa) initn: 8222 init1: 8222 opt: 8222 Z-score: 7342.6 bits: 1370.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 8222; 100.000% identity (100.000% similar) in 1275 aa overlap (26-1300:1-1275) 10 20 30 40 50 60 KIAA09 DLLEVGLPPGLEFPRGNSLRGLRRTMSLDFGSVALPVQNEDEEYDEEDYEREKELQQLLT ::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 MSLDFGSVALPVQNEDEEYDEEDYEREKELQQLLT 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA09 DLPHDMLDDDLSSPELQYSDCSEDGTDGQPHHPEQLEMSWNEQMLPKSQSVNGPSCQGLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 DLPHDMLDDDLSSPELQYSDCSEDGTDGQPHHPEQLEMSWNEQMLPKSQSVNGPSCQGLE 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA09 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