# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk10471.fasta.huge -Q ../query/KIAA0909.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0909, 1234 aa vs ./tmplib.23663 library 1986271 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1423+/-0.00904; mu= -9.0538+/- 0.610 mean_var=476.5692+/-113.676, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.058750 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0833 ( 1734 res) hg01719s1 (1734) 1484 141.4 1.2e-33 >>KIAA0833 ( 1734 res) hg01719s1 (1734 aa) initn: 3511 init1: 1197 opt: 1484 Z-score: 695.9 bits: 141.4 E(): 1.2e-33 Smith-Waterman score: 3321; 42.334% identity (57.728% similar) in 1637 aa overlap (44-1225:106-1729) 20 30 40 50 60 70 KIAA09 SPSPRPLRPGVTLPPGALTMNTKDTTEVAENSHHLKIFLPKKLLECLPRCPLLPPERLRW :: :.:::::::::::::.: :: :: :: KIAA08 KSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLECLPKCSSLPKERHRW 80 90 100 110 120 130 80 90 100 110 120 130 KIAA09 NTNEEIASYLITFEKHDEWLSCAPKTRPQNGSIILYNRKKVKYRKDGYLWKKRKDGKTTR :::::::.::::::::.:::. .:::::::::.::::::::::::::: ::::::::::: KIAA08 NTNEEIAAYLITFEKHEEWLTTSPKTRPQNGSMILYNRKKVKYRKDGYCWKKRKDGKTTR 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 190 KIAA09 EDHMKLKVQGMECLYGCYVHSSIVPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPALEDCGKGCSP ::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: :.: KIAA08 EDHMKLKVQGVECLYGCYVHSSIIPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPAIEDCGKPCGP 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 KIAA09 IFCSISSDRREWLKWSREELLGQLKPMFHGIKWSCGNGTEE--FSVEHLVQQILDTHPTK :.:::..:..:: ::..:::.::::::::::::.:.::. ::::.:::::::.: :: KIAA08 ILCSINTDKKEWAKWTKEELIGQLKPMFHGIKWTCSNGNSSSGFSVEQLVQQILDSHQTK 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 KIAA09 PAPRTHACLCSGGLGSG-SLTHKCSSTKHRIISPKVEPRA-------------LTLTSIP : :::: :::.:.::.: :. :::.:.::::::::::::. .. . 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KIAA08 --YALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTAV 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA09 TLPARNKGSFLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHR----MRELKQNQELEGLPQPGLAT . . ..:.::::::::::::::::::::: : :.....: KIAA08 IVQQKLRSSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHSPLVDHRLYKRSERIEKGQGT 1690 1700 1710 1720 1730 1234 residues in 1 query sequences 1986271 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:02 2008 done: Thu Dec 18 15:21:03 2008 Total Scan time: 0.780 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]