# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk08702.fasta.huge -Q ../query/KIAA0893.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0893, 974 aa vs ./tmplib.23663 library 1986531 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9940+/-0.00697; mu= 13.6933+/- 0.472 mean_var=175.0064+/-41.889, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 135 in 1/39 Lambda= 0.096950 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0596 ( 1531 res) hg01605 (1531) 219 43.9 0.00018 KIAA1242 ( 504 res) fh10406 ( 504) 208 41.7 0.00028 KIAA1449 ( 680 res) fk04105 ( 680) 203 41.2 0.00054 KIAA1736 ( 1244 res) ph00725 (1244) 194 40.3 0.0018 KIAA1824 ( 958 res) fh17057 ( 958) 177 37.8 0.0082 >>KIAA0596 ( 1531 res) hg01605 (1531 aa) initn: 258 init1: 105 opt: 219 Z-score: 172.0 bits: 43.9 E(): 0.00018 Smith-Waterman score: 254; 26.075% identity (53.226% similar) in 372 aa overlap (573-931:429-754) 550 560 570 580 590 600 KIAA08 IGMDGLGNEVSALNQQCNGSKGNGSNGSSVTSFTTPPQDSSQRLTH-DASNIHTST-PRN .:: : .:.. :: . ..:..: :: :: KIAA05 VYSALYHSSCVWSVEVYPEVKDSNQACLPPSSFITCSSDNTIRLWNTESSGVHGSTLHRN 400 410 420 430 440 450 610 620 630 640 650 660 KIAA08 PGSTNHIPFLEESPCGSQISSEHSVIKPPLGDSPGSLSRSKGEEDDKSKKQFVCINILED :.. : .. . .. .... : :: :.. : : .:. 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