# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh03683.fasta.huge -Q ../query/KIAA0876.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0876, 1119 aa vs ./tmplib.23663 library 1986386 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5074+/-0.00964; mu= -9.9176+/- 0.650 mean_var=408.9449+/-99.844, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 24 in 1/39 Lambda= 0.063422 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100) 2155 212.4 2.8e-55 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 2010 199.1 2.8e-51 KIAA0234 ( 1512 res) ha02764 (1512) 434 55.1 8.9e-08 KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214) 408 52.6 4e-07 KIAA0239 ( 849 res) ha06313 ( 849) 397 51.4 6.3e-07 KIAA1807 ( 702 res) fk00712 ( 702) 386 50.3 1.1e-06 KIAA0215 ( 857 res) ha02776 ( 857) 387 50.5 1.2e-06 KIAA0783 ( 899 res) hk05408 ( 899) 277 40.5 0.0013 >>KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100 aa) initn: 3845 init1: 2113 opt: 2155 Z-score: 1084.2 bits: 212.4 E(): 2.8e-55 Smith-Waterman score: 3842; 54.690% identity (75.704% similar) in 1066 aa overlap (7-1066:37-1055) 10 20 30 KIAA08 RIFGASPPRNLAIQKCASRTAAAMG-SEDHGAQNPS : : :: . . . . : .: .. ::: KIAA07 SEQLSPSAEQVSQISQISLGRRPLSSLPPPPSRALAPTRAPDTALTIMEVAEVESPLNPS 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 KIAA08 CKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTYDDIDDVVIPAPI ::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.:::::::::: :::::...::::: KIAA07 CKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 KIAA08 QQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLERKYWKNLTFVSPI ::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::::::::::::.:: KIAA07 QQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPI 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 KIAA08 YGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTED :::::.::.::. : .:::. : :.::.::.::: :::::::::::::::::::::::: KIAA07 YGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTED 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 KIAA08 MDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLRHKMTLISPIILK :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::: .:: KIAA07 MDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLK 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 KIAA08 KYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDYGKVATQCTCRKD ::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: :::::: KIAA07 KYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKD 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 KIAA08 MVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSASRASLKAKLLRR :::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.:: ..::...: : ... : : KIAA07 MVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVR-KASRS 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 KIAA08 SHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPEEEEEEPQPLPHGR . :: :.:: .. .::.. ::: : :.: KIAA07 FQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGAEV---PNPDSVTD 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 KIAA08 EAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEALWLPSPLEPPVLG . . .:. .. ::: :.:.::..... . : .. .. : . . . 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KIAA06 VRQVEDGLTFPDYSDSTEVKFEELKNVKLEEEDEEEE--QEAAALDLSVNPAS---VGGR 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 KIAA08 VPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTG . . : . .. . ..: .::. . . .. . . . . KIAA06 LVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETSEPLSCRAQGQTGVLTVHSYAKGDGRVTVGE 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 KIAA08 PEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPSTFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEAS : .:.: : .. . .: :: . . .:.::.::.. : . :: :... .: KIAA06 PCTRKKGSAA-RSFSERELAEVADEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPL-VLQECVS 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 KIAA08 SDEEASPFSGEEDVSDPDALRPLLSLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYP .:: . .. ::.. . .: :: :.:: .:.::..:: . :. :.::.: .: KIAA06 DDETSEQLTPEEEAEETEAWAKPLSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIF-- 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 KIAA08 YCQALQTEKEAPIASLGEGCP-ATLPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGD :: ... .......: :. . ..:.:.:::::::::: : .:. .. :. . KIAA06 -----QTYHQVEFGGFNQNCGNASDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEE 690 700 710 720 730 780 790 800 810 820 830 KIAA08 DGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTT :::: :..: :: ..:::::::. : ..: : ::::.:.: .::::.::::::: .. KIAA06 DGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRAN 740 750 760 770 780 790 840 850 860 870 880 890 KIAA08 DRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSY : ::.:: ::.:. ::::.:. :: :::.: :: :.::::..:.:: :...: :.:::. KIAA06 DDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSH 800 810 820 830 840 850 900 910 920 930 940 950 KIAA08 EHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVSITCLKHKSGG--HAVQLLRAVSLGQVVITKN .: :.:::.::.::::.:.:::::.:: :::..:: . .: :.... :: ::.:. KIAA06 GRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSITAGQKVISKH 860 870 880 890 900 910 960 970 980 990 1000 1010 KIAA08 RNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDDGSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTD .:: .:.:.:. ...: :::::::::.:::::::.:.:.::.:.:::.:::.:..:::: KIAA06 KNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFDDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTD 920 930 940 950 960 970 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA08 GNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGSQLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPA :..: :::..: ..:::::::::::.::: :..::.:::::::.::::... . KIAA06 GQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDGSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEI 980 990 1000 1010 1020 1030 1080 1090 1100 1110 KIAA08 FSGEEAKAAK-RPRVGTPLATEDSGRSQDYVAFVESLLQVQGRPGAPF :. .:.: : : :: . :: . : :..: KIAA06 FTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDYIEPALYRAIME 1040 1050 1060 1070 >>KIAA0234 ( 1512 res) ha02764 (1512 aa) initn: 465 init1: 430 opt: 434 Z-score: 231.5 bits: 55.1 E(): 8.9e-08 Smith-Waterman score: 452; 33.871% identity (61.694% similar) in 248 aa overlap (106-330:348-592) 80 90 100 110 120 130 KIAA08 EWKPRQTYDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRH : : . . . .. ::. .:. . : : KIAA02 LPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVH 320 330 340 350 360 370 140 150 160 170 KIAA08 QDFDDL-ERKYWKNLTF----VSPIYGADI------SG--------SLYDDD----VAQW . .: :...:. .. :. ::::: :: .: .. .. : KIAA02 MVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGW 380 390 400 410 420 430 180 190 200 210 220 230 KIAA08 NIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSW :.. . .. . : . .. : :...:.:: :: ..: :: :: :::::::.::::.: KIAA02 NLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW 440 450 460 470 480 490 240 250 260 270 280 290 KIAA08 YAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLRHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFM :..: ...::.. . : .. .:.. .::..: : ..:.: : .: ::::. KIAA02 YGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFV 500 510 520 530 540 550 300 310 320 330 340 350 KIAA08 ITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDYGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPER :::: .::.:::.:.: ::..:: : :. :. :: KIAA02 ITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGR---QCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKM 560 570 580 590 600 610 360 370 380 390 400 410 KIAA08 YELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPK KIAA02 AAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCK 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214 aa) initn: 438 init1: 194 opt: 408 Z-score: 219.8 bits: 52.6 E(): 4e-07 Smith-Waterman score: 408; 36.842% identity (60.000% similar) in 190 aa overlap (780-956:238-422) 750 760 770 780 790 800 KIAA08 LIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELVNEGWTCS .. : : : :: :::. : . . : : KIAA12 SRSSGAQQSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGV-PYIPEGQWLC- 210 220 230 240 250 260 810 820 830 840 850 860 KIAA08 RCAAHAWT--AECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERHPVD-ISAI :: .. . ..: :: .:::...:.: .: ::.::: .::. : :.. .:.. :. : KIAA12 RCCLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNI 270 280 290 300 310 320 870 880 890 900 910 KIAA08 PEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLM--EP------DDW : :::: : :.. : :: ::: .: :.::::::. ::..: :: . 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