# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06640y1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0865.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0865, 1900 aa vs ./tmplib.23663 library 1985605 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.1925+/-0.0129; mu= -37.7261+/- 0.866 mean_var=824.1193+/-197.972, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 12 in 2/38 Lambda= 0.044677 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1486 ( 677 res) fj07162 ( 677) 1013 82.0 5.2e-16 KIAA0727 ( 1010 res) hk03490y1 (1010) 984 80.3 2.6e-15 KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 ( 578) 529 50.8 1.1e-06 KIAA0389 ( 1296 res) hj00061 (1296) 477 47.8 2.1e-05 KIAA0216 ( 2067 res) hf00331s1 (2067) 449 46.1 0.0001 >>KIAA1486 ( 677 res) fj07162 (677 aa) initn: 812 init1: 450 opt: 1013 Z-score: 379.2 bits: 82.0 E(): 5.2e-16 Smith-Waterman score: 1271; 43.124% identity (61.460% similar) in 589 aa overlap (1219-1777:36-595) 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA08 LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASD : ...::: ::::.:.::.:::::::: KIAA14 FLLHLALPGDLNFGSVPLYMISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASD 10 20 30 40 50 60 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA08 IARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSG--------PRHFHPSSMSVCA :::::::::.: : : ::: : : :::. :: . : .::. . :.. : KIAA14 IARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPA 70 80 90 100 110 120 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA08 AVDGLGQ-CLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVS- : : . : : :. : ::::: . ::.:: : :.::::::::::.:.::.: :.:: KIAA14 PQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGTDDDSSCGS-RRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSS 130 140 150 160 170 180 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA08 --ACLSAAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDA : :. .:: :.::::::.:: ::::: ::::.:::.:: :..: .. : KIAA14 TAASKSGKTPERTEASAKPRPHSDEYS--KKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPR 190 200 210 220 230 240 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA08 RPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAARP---DSPDPGESV : . .. . ..: :: .. :::::::.:. : .. : .:.: KIAA14 RTSLPRDSSLSQM-----------GSPAGDPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAV 250 260 270 280 290 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA08 YEEMKCCLPDDGGPGAG-SFLLHG-----ASP--PLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFP ::::: . :: : : .: :. :.: : : : . : : :::::::: KIAA14 YEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFP 300 310 320 330 340 350 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA08 NLLPHRPPLLVFPPTPVTCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLS-PQY ::: ::::::::::.:: ::: ::::::::::: :::::: :..: :: :.:: . :.. 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KIAA07 EQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDN 340 350 360 370 380 390 830 840 850 860 870 880 KIAA08 NEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSG : :::.:.:. :::... . .... .:: : .::. . .:: ..:. :. .: KIAA07 NSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQI-IVDLVEQQHKG 400 410 420 430 440 450 890 900 910 920 930 940 KIAA08 FLTLLDEESQMIWSVESN-FPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMH ....::. . . .: .. : . :.: : . .: .: : .. : . : : : KIAA07 IIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKL---GKHAHFSSRKLCASDKIL-EFDRDFRIRH 460 470 480 490 500 510 950 960 970 980 990 1000 KIAA08 YAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFR ::: :.:.:.: :.::::.: :.. .: .: : :.... .: KIAA07 YAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNM--------------WP----- 520 530 540 550 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA08 GHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMD :.: : .... :. :.: :. ...:.. KIAA07 ------------------EGK--LSITEVTKR--------------PLTAATLFKNSMIA 560 570 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA08 IIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSD .. .: . :....::.::..: :. ::. :..:.:.:: :.. : :. : .. KIAA07 LVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEK 580 590 600 610 620 630 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA08 FLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQG-WQMGVRKVFLKYWHAD-QLNDLC :: ::: ... .. : : . ....: .: .: :.:.. .. :..: KIAA07 FLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELR 640 650 660 670 680 690 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA08 LQ-LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQN : : : .. ::: :: ::: KIAA07 AQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMR 700 710 720 730 740 750 >>KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 (578 aa) initn: 462 init1: 259 opt: 529 Z-score: 211.5 bits: 50.8 E(): 1.1e-06 Smith-Waterman score: 529; 29.231% identity (63.077% similar) in 325 aa overlap (40-361:14-337) 10 20 30 40 50 60 KIAA08 RGEISKGCIFLLVGASHPHCGCFQLCNVFRSH-EMEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCE :: .. . :::..: .: : ... : . KIAA08 PPARALGRAVAMASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQ 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA08 QIK--AYYEREKAFQKQEGFLKRLKHAKNPKVHFNLTDMLQDAIIHHNDKEVLRLLKEGA :.: : ::.. .:.. :: .. :: :. . : .: .... .:: .::. . KIAA08 QLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKRSTGGRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKV 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA08 DPHTLVSSGGSLLHLCARYDNAFIAEILIDRGVNVNHQDEDFWTPMHIACACDNPDIVLL .: .: . :: : . :...:...:.::: .:...:::.: : .: . ..: . KIAA08 SPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVKLLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKI 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA08 LVLAGANVLLQDVNGNIPLDYAVEGTESSSILLTYLDENGVDLTSLRQMKLQRPMSMLTD :: ::..: . .::.: : : . ... : . .:. .. .:.. ..:..: KIAA08 LVQYGADLLAVNSDGNMPYDLC-EDEPTLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIAD 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 KIAA08 VKHFLSSGGNVNEKNDEGVTLLHMACASGYKEVVSLILEHGGDLNIVDDQYWTPLHLAAK .. ....: ... . .:.::::.: :.:: ... :.:.:: ... : . : ::: :: KIAA08 IHCMIAAGQDLDWIDAQGATLLHIAGANGYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAF 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 KIAA08 YGQTNLVKLLLMHQANPHLVNCNEEKASDIAASEFIEEMLLKAEIAWEEKMKEPLSASTL .:: ....::. : :. . .: :. : .. .::. . . :: : KIAA08 WGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 KIAA08 AQEEPYEEIIHDLPVLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEKDIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENP KIAA08 LSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNLYRKEYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRT 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0389 ( 1296 res) hj00061 (1296 aa) initn: 866 init1: 183 opt: 477 Z-score: 188.9 bits: 47.8 E(): 2.1e-05 Smith-Waterman score: 966; 28.881% identity (58.002% similar) in 831 aa overlap (420-1198:38-803) 390 400 410 420 430 440 KIAA08 VLPIAKQDSLLEKDIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENPM-MSGSTKPEQVKLMPPAPND-- ::. .:. ..:.: .. . :: .: KIAA03 PPSKMEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSK 10 20 30 40 50 60 450 460 470 480 490 500 KIAA08 ----DLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELP-IYSSMVSQLYF : .: ::...::..:. :.....:::....::. :::: ..: :::: . . : KIAA03 KDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSY- 70 80 90 100 110 120 510 520 530 540 550 560 KIAA08 SSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAG .:: .. :::.:. ...::... . : .:.::: :.::.: .: ..:.:: : KIAA03 --QGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYG 130 140 150 160 170 180 570 580 590 600 610 620 KIAA08 ASRATLDSRFKHVVCILEAFGHAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLE ... .:.:. .. .:::::.:::. :. :: : :. :..: : :....:. . :::: KIAA03 TGQ-DIDDRIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNE-KSSVVGGFVSHYLLE 190 200 210 220 230 240 630 640 650 660 670 KIAA08 KSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEKYGLHLNNLCAHRYLNQTIQD---DASTGERS :::. : . :. ::: : : : . . :::.. ::::. . : .. KIAA03 KSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDNFRYLNRGCTRYFANKETDKQI 250 260 270 280 290 300 680 690 700 710 KIAA08 L-NREKLAVLK-------------------RALNVVGFSSLEVENLFVILAAILHLGDIR : ::.. :: :.. .:... : .:: ..:..::::.: KIAA03 LQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNID 310 320 330 340 350 360 720 730 740 750 760 770 KIAA08 FT---ALNEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYF-----KGDMIIRRH : . . : . .. : :: : .: .. :.: .::: .. :: .: KIAA03 FEEAGSTSGGCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLRVSLTTRVMLTTAGGTKGTVIKVPL 370 380 390 400 410 420 780 790 800 810 820 830 KIAA08 TIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQTLDIGILDIFGFEEFQKN .. :. :: :::..::.::. .:: .:.:. . .. ::.::: ::: :..: KIAA03 KVEQANNARDALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCFPFET-----SSYFIGVLDIAGFEYFEHN 430 440 450 460 470 840 850 860 870 880 890 KIAA08 EFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSGF :::.:.:. :::.....:: .. .:: .::. .. .. . ::. .:.. : :. KIAA03 SFEQFCINYCNEKLQQFFNERILKEEQELYQKEGLGVNEVHYVDNQD-CIDLIEAKLVGI 480 490 500 510 520 530 900 910 920 930 940 950 KIAA08 LTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMHYA : .::::... ...: . ... .. .. : . :.: : : :.: KIAA03 LDILDEENRLPQPSDQHFTSAVHQKHKDHFRLTIPRKSKLAVHRNIRDDEG--FIIRHFA 540 550 560 570 580 590 960 970 980 990 1000 1010 KIAA08 GRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFRGH : : :... .:::.:.: ..: .. :.. : .::.:. .. KIAA03 GAVCYETTQFVEKNNDALHMSLESLICESRDKFIRELFESSTNN---------------- 600 610 620 630 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA08 KSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMDII ::. .: .: : .: ........ .: .. KIAA03 -----------------NKD----TK--QKAGKLSF---------ISVGNKFKTQLNLLL 640 650 660 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA08 GKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSDFL ::.. ::.::.:: . :.. . .::: :.. .. ... ::: : :: .. 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