# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06577s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0864.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0864, 1402 aa vs ./tmplib.23663 library 1986103 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4448+/-0.00959; mu= -3.3278+/- 0.648 mean_var=399.2623+/-98.557, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.064187 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1662 ( 1653 res) fj03879s1 (1653) 816 91.4 1.5e-18 KIAA1118 ( 1165 res) hk07196(revised) (1165) 262 39.9 0.0033 >>KIAA1662 ( 1653 res) fj03879s1 (1653 aa) initn: 905 init1: 281 opt: 816 Z-score: 425.0 bits: 91.4 E(): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 816; 44.984% identity (76.375% similar) in 309 aa overlap (1037-1340:1350-1644) 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA08 CLQDTLCLHQGPHPKALPAPAPNWQATQGEADSMTGLRERIQELEAQMDVMREELGHKDL .:. .:....: :.::... : : KIAA16 ELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWR-------L 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA08 EGDAATLREKYQRDLES-----LKATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEK .:.: . :.: . . .:::..: :: .::. .:.:::.:.:::..:..:: KIAA16 QGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEK 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA08 DRLLAEETAATISAIEAMKNAHREEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSVQ . ::::::::: :::::::.:..::. ::: :.. :... ..::.:. ...... 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