# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06521.fasta.huge -Q ../query/KIAA0861.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0861, 982 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986523 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1977+/-0.0062; mu= 4.5306+/- 0.420
 mean_var=146.8751+/-34.894, 0's: 0 Z-trim: 10  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.105828

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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>>KIAA0362  ( 1108 res)   hh00083                         (1108 aa)
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                                     ..:::. :.:::..::..:. :..::::::
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       .::..:: ::::::::::::..:::::.: :..:. .:::::.::: .: ::::::.::.
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        :: .::: .. :: ..: .::...:: ...:.:  :.: ..:  ..:  ..  . ..: 
KIAA03 ELAETELPNDVQSTSSVLCAHTEKKDKAKEDLRLALKEGHSVLESLRELQAEGSEPSVNQ
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KIAA08 NQLENVTTMERLLVQLDETEKAFSHFWSEHHLKLNQCLQLQHFEHDFCKAKLALDNLLEE
       .::.: .:..:::.::.::: ::..::..:. ::.:::::.:::. : ..:  ::   ..
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KIAA08 QAEFTGIGDSVMHVEQILKEHKKLEEKSQESLEKAQLLALVGDQLIQSHHYAADAIRPRC
        : :: ::.:. :::..:..  ..::::  ..:.:. :.: :.::: ..:::.:.:::.:
KIAA03 IATFTDIGNSLAHVEHLLRDLASFEEKSGVAVERARALSLDGEQLIGNKHYAVDSIRPKC
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KIAA08 VELRHLCDDFINGNKKKWDILGKSLEFHRQLDKVSQWCEAGIYLLASQAVDKCQSREGVD
        :::::::.:     ..  .:.::::.::.:.   .::. :::::::: ::::::..:..
KIAA03 QELRHLCDQFSAEIARRRGLLSKSLELHRRLETSMKWCDEGIYLLASQPVDKCQSQDGAE
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KIAA08 IALNDIATFLGTVKEYPLLSPKEFYNEFELLLTLDAKAKAQKVLQRLDDVQEIFHKRQVS
        ::..:  :: :  :  .   . .:.:.: .:. :   ...::.:.  ...:.::.::.:
KIAA03 AALQEIEKFLETGAENKIQELNAIYKEYESILNQDLMEHVRKVFQKQASMEEVFHRRQAS
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KIAA08 LMKLAAKQTRPVQPVAPHPESSPKWVSSKTSQPSTSVPLARPLRTSEEPYTETELNSRGK
       : ::::.::::::::::.::.      .:.  ::   :  :  : ::.  .:     :: 
KIAA03 LKKLAARQTRPVQPVAPRPEAL-----AKSPCPS---PGIR--RGSENSSSEGGALRRGP
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KIAA08 EDDETKFEVKSEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIKEIKSII
             ..  . :. ::.. ::.   :..  :. :  ::... .::.::. :..:.  ..
KIAA03 ------YRRAKSEMSESRQGRGSAG-EEEESLAIL--RRHVMSELLDTERAYVEELLCVL
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KIAA08 DGYITPMDFIWLKHLIPDVLQNNKDFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEKCAENPELLAHCF
       .:: . ::   . ::.   :.:.:: ::::..:.:.:::: ::.:::. .. :::...::
KIAA03 EGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDCPELVGRCF
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KIAA08 LKRKEDLQIYFKYHKNLPRARAIWQECQDCAYFGVCQRQLDHNLPLFKYLKGPSQRLIKY
       :.: ::.::: :: .: ::....:..:.:: .:  :::.:::.: : .::  : ::. ::
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KIAA08 QMLLKGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQALAVIEDLIKSCELA
       :.::: .:                       : ...   . .::.::. :  ..:. . .
KIAA03 QLLLKEML-----------------------KYSRNCEGAEDLQEALSSILGILKAVNDS
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KIAA08 VDLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRY-KMKDLIRFKPSQRQIYLFERGIVF
       . : :.:    ..: :::::..: ::::: ::  . :.:.: :::: ::...: :....:
KIAA03 MHLIAITGYDGNLGDLGKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLF
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KIAA08 CKIRMEPGDQGL--SPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEIASRNGLEKYILQAASK
       :: : : :. :   .: ::.:..... ...: .  .:. .::::      : ::.:: . 
KIAA03 CKKREENGE-GYEKAPSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNAREEVYIVQAPTP
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KIAA08 EIRDCWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQ-FEMSTS-----KGSGAGSGPWIKNMERATTS
       ::.  : .:: :.:  : .  .. .. . .:.: :       : . :    .:...    
KIAA03 EIKAAWVNEIRKVLTSQLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEER
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       : :: :  : .                                                 
KIAA03 KTDPLSLEGYVSSAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGL
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KIAA08 QWVNHRTAIENFALTLKTTAQMLQTFGSCLATAELPRSMLSTEDLLMSH-TRQRDKLQDE
       .:.  :  .:.:: . . .  .::.    : : . ::.   . .:. .: : ..  :.: 
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       : . :  .: :.:. ...      .:.   . :: .:.. .:.  .. . .  . ... .
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        .::.    : :.  ... :.   .:: .:    ::...    : :.. : :   .. .:
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        . .. :     . . .:  :        .:. .:    :   .  . . :      :  
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        :::   .  : :   :. .. . :   :.  : :       ::   .: .. :.   . 
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         .: .: .      : .  . .    ::   :..  .  .    : .. .         
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KIAA08 QVSLMKLAAKQTRPVQPVAPHPESSP-KWVSSKTSQPSTSVPLARPLRTSEEPYTETELN
        . :   .: ...:.: .: .:.. : : . .::..     : . : : : .:  .: . 
KIAA19 TAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGP-RDSCQP-DHTSVF
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KIAA08 SRGKE-----DDETKFEV----KSEEIFESHH---ERGNPELEQQARLGDLSPR-RRIIR
       :.: :       : :. .    .:  . .:.      :    :...:    : : :.:. 
KIAA19 SKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMA
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       ... ::. ::. .  .::.:.  :.    .  .:. :....  .:::...:..::.. ::
KIAA19 EMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEME----RMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFL
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KIAA08 KELEKCAENPELLAHCFLKRKEDLQIYFKYHKNLPRARAIWQECQDCAYFGVCQRQLDHN
       .:::.: . :  ... ::...:.. .:  : :: :.. :. .  .  :.:   ::.:  .
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       . : .::  : ::. :: .::. ::        : . : :. . . :  :. . .   .:
KIAA19 MDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLK-------EASCG-LAQGQELGELRAAEVVVCFQL
            950       960              970        980       990    

           680       690       700       710       720       730   
KIAA08 QQALAVIEDLIKSCELAVDLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIRF
       ...    .::     ::.:  :.  :  .. . :.:  .  : :    . .:        
KIAA19 RHG----NDL-----LAMD--AIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIV-CCGRKKY--------
             1000             1010      1020       1030            

           740       750       760       770       780       790   
KIAA08 KPSQRQIYLFERGIVFCKIRMEPGDQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEIAS
           :...:::  :.: : .   :.. .   : .:...:   ... .    :  .:::  
KIAA19 ---LRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDV---YLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWF
            1040      1050         1060      1070      1080        

              800       810       820       830       840       850
KIAA08 R---NGLEKYILQAASKEIRDCWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQFEMSTSKGSGAGSGP
       :   .. . :::::.: :... : . :...: .:   .:..   .....   . : :. :
KIAA19 RRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQA--LKSR---ELRIQEMASMGIGNQP
     1090      1100      1110      1120           1130      1140   

              860       870       880       890       900          
KIAA08 WIKNMERATTSKEDPASSTGGIKGCSSREFSSMDTFEDCEGAEDMEKESSALSL---AGL
       ..    :  :   : :  . :   :.       :..   .:.:.. . :.:.:    :. 
KIAA19 FMDVKPRDRT--PDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSI--VKGTESQMRGSTAVSSSDHAAP
          1150        1160      1170        1180      1190         

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KIAA08 FQ------SDDSHETCSSKSAFLERGESSQGEKEERDEEETATRSTEEERAGASTGRLAP
       :.      ::.:  . ::.:.                                       
KIAA19 FKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDE
    1200      1210      1220      1230      1240      1250         

>>KIAA1112  ( 694 res)   hj05505s1                        (694 aa)
 initn: 171 init1:  78 opt: 213  Z-score: 183.2  bits: 44.9 E(): 4.4e-05
Smith-Waterman score: 233;  27.564% identity (52.885% similar) in 312 aa overlap (488-773:309-599)

       460       470       480       490       500       510       
KIAA08 EVKSEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIKEIKSIIDGYITPM
                                     :  .: ..: ::. :::....: .::.   
KIAA11 DEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQC
      280       290       300       310       320       330        

       520       530        540       550         560         570  
KIAA08 DFIWLKHLIPDVLQNNK-DFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEK--CAENPEL--LAHCFLK
            :.   :......   .::::...:. . ..:.: ::.    : :.:  :. :::.
KIAA11 R----KR--ADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQ-KAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLE
          340         350       360        370       380       390 

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KIAA08 RKEDLQIYFKYHKNLPRA----RAIWQECQDCAYFGVC---QRQLDHNLPLFKYLKGPSQ
       .. :.::: .: .: : :      . .  .   .: .:   :...: .:  :  :  : :
KIAA11 HQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGF--LLTPVQ
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KIAA08 RLIKYQMLLKGLLDFESPE-----DMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQALAVI
       .. :: . :  :: .  :.     :.:     . . :.   .: .      .. :  . :
KIAA11 KICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSI
     450       460       470       480       490       500         

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KIAA08 ED------LIKSCELAV--DLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIR
       ::      :..: ::    .:. ::. :.  ..   ..:         :.  :  :::.:
KIAA11 EDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQ-PQAKSQQRMFFLFD-------HQLIYCKKDLLR
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KIAA08 FKPSQRQIYLFERGIVFCKIRMEPG-DQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEI
             .  :   :.    . .: : :. :  : :.:.:..:                  
KIAA11 RDVLYYKGRLDMDGLEV--VDLEDGKDRDL--HVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQ
             570         580         590       600       610       

             800       810       820       830       840       850 
KIAA08 ASRNGLEKYILQAASKEIRDCWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQFEMSTSKGSGAGSGPW
                                                                   
KIAA11 KQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKGRRTAAPPPRLPG
       620       630       640       650       660       670       

>>KIAA1639  ( 2584 res)   af14886                         (2584 aa)
 initn: 209 init1:  98 opt: 205  Z-score: 168.8  bits: 44.1 E(): 0.00028
Smith-Waterman score: 353;  23.696% identity (52.609% similar) in 460 aa overlap (475-922:302-708)

          450       460       470       480       490       500    
KIAA08 LNSRGKEDDETKFEVKSEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIK
                                     : : .:::..      .:..:: .:. ...
KIAA16 VSPAYLDRRLKLSPEWGAAEAPEFPGEAVSEDEYKARLSS------VIQELLSSEQAFVE
             280       290       300       310             320     

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KIAA08 EIKSIIDGYITPMDFIWLKHLIPDVLQNNKDFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEKCAENPE
       :.. . . ..  ..     : .: .. ..:  .: :.:.. .::. .::.::..:  . .
KIAA16 ELQFLQSHHLQHLER--CPH-VPIAVAGQKAVIFRNVRDIGRFHSSSFLQELQQCDTDDD
         330       340          350       360       370       380  

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KIAA08 LLAHCFLKRKEDLQIYFKYHKNLPRARAI---------WQECQDCAYFGVCQRQLDHNLP
       . : ::.: .  .. :...  .  .:...         ...  . : ..    :     :
KIAA16 V-AMCFIKNQAAFEQYLEFLVGRVQAESVVVSTAIQEFYKKYAEEALLAGDPSQPPPP-P
             390       400       410       420       430        440

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KIAA08 LFKYLKGPSQRLIKYQMLLKGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQ
       : .::. : .:. .:: ::: :.                   ..  .  .. :.   :.:
KIAA16 LQHYLEQPVERVQRYQALLKELI-------------------RNKARNRQNCAL---LEQ
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KIAA08 ALAVIEDLIKSCELAVDLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIRFKP
       : ::.  : .  :  . .. . . :  .  ::. . .: : ::       .:     .: 
KIAA16 AYAVVSALPQRAENKLHVSLMENYPGTLQALGEPIRQGHFIVWE-GAPGARMP----WKG
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KIAA08 SQRQIYLFERGIVFCKIRMEPGDQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEI--AS
        .:...::.  .:.:: : .   . .:  : :.. ::: .... .  .:. : ::.    
KIAA16 HNRHVFLFRNHLVICKPRRDSRTDTVS--YVFRNMMKLSSIDLNDQVEGDDRAFEVWQER
           540       550       560         570       580       590 

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KIAA08 RNGLEKYILQAASKEIRDCWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQFEMSTSKGSGAGSGPWIK
       .....::.::: .  :.. : .::  .  .:.  .     :.::   .  . :  :  .:
KIAA16 EDSVRKYLLQARTAIIKSSWVKEICGI--QQRLALPVWRPPDFEEELADCT-AELGETVK
             600       610         620       630       640         

           860       870       880        890       900       910  
KIAA08 NMERATTSKEDPASSTGGIKGCSSREFSSMDTF-EDCEGAEDMEKESSALSLAGLFQSDD
          :.: .   :    .  :  .. . .    . :: .:       : :: : .:   :.
KIAA16 LACRVTGT---PKPVISWYKDGKAVQVDPHHILIEDPDG-------SCALILDSLTGVDS
      650          660       670       680              690        

            920       930       940       950       960       970  
KIAA08 SHETCSSKSAFLERGESSQGEKEERDEEETATRSTEEERAGASTGRLAPAGATAGFQARA
       ..  : . ::                                                  
KIAA16 GQYMCFAASAAGNCSTLGKILVQVPPRFVNKVRASPFVEGEDAQFTCTIEGAPYPQIRWY
      700       710       720       730       740       750        

>>KIAA0424  ( 567 res)   hh01267                          (567 aa)
 initn: 138 init1:  57 opt: 181  Z-score: 158.0  bits: 39.9 E(): 0.0011
Smith-Waterman score: 181;  28.402% identity (59.763% similar) in 169 aa overlap (488-644:155-314)

       460       470       480       490       500       510       
KIAA08 EVKSEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIKEIKSIIDGYITPM
                                     :  .: ... ::. :::..:.: .::.   
KIAA04 EGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQC
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KIAA08 DFIWLKHLIPDVLQNNK-DFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEKCAEN--PEL--LAHCFLK
            :.   :......   .::::...:.:.   :...:::  .:  :.:  .. :::.
KIAA04 R----KR--RDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQM-GFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLE
                190       200       210        220       230       

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KIAA08 RKEDLQIYFKYHKN-LPRARAIWQECQDCAY---FGVC---QRQLDHNLPLFKYLKGPSQ
       ... . :: .: .: :     . .  .:  :   : .:   :...:  . .  .:  : :
KIAA04 HQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMID--IAIDGFLLTPVQ
       240       250       260       270       280         290     

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KIAA08 RLIKYQMLLKGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQALAVIEDLIK
       .. :: . :  :: . . .                                         
KIAA04 KICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASV
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>>KIAA0142  ( 802 res)   ha01169                          (802 aa)
 initn:  67 init1:  67 opt: 167  Z-score: 144.3  bits: 37.9 E(): 0.0064
Smith-Waterman score: 192;  21.765% identity (48.431% similar) in 510 aa overlap (491-982:253-716)

              470       480       490       500       510       520
KIAA08 SEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIKEIKSIIDGYITPMDFI
                                     .....::::. : ::...... :. :.   
KIAA01 EKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPL---
            230       240       250       260       270            

              530       540       550       560          570       
KIAA08 WLKHLIPDVLQNNKDFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEKCAENPEL---LAHCFLKRKEDL
          .    . . : ..:.::..:.  :. . ... ::.:.. ::    .. :::.   ..
KIAA01 ---QTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQ-QMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQM
        280       290       300        310       320       330     

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KIAA08 Q-IYFKYHKNLPRARAIWQE-CQDCAYFGVCQRQLDHN-LPLFKYLKGPSQRLIKYQMLL
       . .:. :  : : :  .  :  .. . :   .   . . : :   :. : .:: ::  ::
KIAA01 KTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLL
         340       350       360       370       380       390     

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KIAA08 KGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQALAVIEDLIKSCELAVDLA
       : :   .  ::.. :  ..  :          .::..   :   : .   :  :: .   
KIAA01 KEL--ERHMEDYHTDRQDIQKSM---------AAFKNLSAQCQEVRKR--KELELQILTE
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           700       710       720       730       740       750   
KIAA08 AVTE-CPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIRFKPSQRQIYLFERGIVFCKIR
       :. .   :::  ::..   .   .    ..          . ..: . ::    :.  . 
KIAA01 AIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSE----------EKNERYLLLFPN--VLLMLS
            450       460       470                 480         490

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KIAA08 MEPGDQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRG-SHRK-FEIASRNGLEKYILQAASKEIRD
         :  .:    . ..  .    ..: .:  . .::. ::: : . .:. ...  ...  .
KIAA01 ASPRMSG----FIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEI-SGSMIERILVSCNNQQDLQ
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KIAA08 CWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQFEMSTSKGSGAGSGPWIKNMERATTSKEDPASSTGG
        :  ...:     :... . ::: ..  .  .    : :   . ..:  ::  : . .  
KIAA01 EWVEHLQK-----QTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHAD-SKPAPLTPAYH
         550            560       570       580        590         

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KIAA08 IKGCSSREFSSMDTFEDCEGAEDMEKESSALSLAGLFQSDD---SHETCS----SKSAFL
            :.. .   :..   :  .  :  .  ::. :  .     :   :     :::   
KIAA01 TLPHPSHHGTPHTTIN--WGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKT
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KIAA08 ERG--ESSQGEKEERDEEETATRSTEEERAGASTGRLAPAGATAGFQARALRPRTSAQES
        .    . . :..  ::: .. .::   .  :.  ..  :  :.. ..:     .: .::
KIAA01 MKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSA-KTRQTLNSSSRKES
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