# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06101.fasta.huge -Q ../query/KIAA0852.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0852, 1017 aa vs ./tmplib.23663 library 1986488 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.1196+/-0.0105; mu= -24.3852+/- 0.711 mean_var=473.1850+/-115.405, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 24 in 1/39 Lambda= 0.058960 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0136 ( 950 res) ha03621s1 ( 950) 385 47.9 7.6e-06 >>KIAA0136 ( 950 res) ha03621s1 (950 aa) initn: 721 init1: 178 opt: 385 Z-score: 196.8 bits: 47.9 E(): 7.6e-06 Smith-Waterman score: 775; 25.000% identity (52.652% similar) in 1056 aa overlap (9-1015:35-943) 10 20 30 KIAA08 SQHFGRPRTTHEFLFGALAELVDNARDADATRIDIYAE :.: . :.:.:::.::: : :.. .:. . 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