# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06032.fasta.huge -Q ../query/KIAA0851.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0851, 607 aa vs ./tmplib.23663 library 1986898 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7113+/-0.00443; mu= 20.1738+/- 0.302 mean_var=71.9375+/-16.888, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.151216 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0966 ( 1150 res) hj06369 (1150) 895 205.4 2.1e-53 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 635 148.8 2.7e-36 KIAA0348 ( 1443 res) hg01551(revised) (1443) 588 138.6 3.5e-33 KIAA0274 ( 932 res) ha06690 ( 932) 249 64.3 5e-11 >>KIAA0966 ( 1150 res) hj06369 (1150 aa) initn: 949 init1: 438 opt: 895 Z-score: 1050.6 bits: 205.4 E(): 2.1e-53 Smith-Waterman score: 1010; 37.986% identity (66.819% similar) in 437 aa overlap (121-529:164-594) 100 110 120 130 140 150 KIAA08 YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDG :: . . . . . . . .:. .. .. KIAA09 KPEKIIPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSES 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 KIAA08 FYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELS--AQPEVHRFALP ::.: :::::...:: : . : . : ...:.:: :: .....:. . :.: . .: KIAA09 FYYSLTYDLTNSVQRQS--TGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIP 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 KIAA08 VLHGFITMHSCSIN-------------------------GKYFDWILISRRSCFRAGVRY ...::. .. .: : :::::: :::.:: KIAA09 MIQGFVQIEELVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRY 260 270 280 290 300 310 250 260 270 280 290 300 KIAA08 YVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVAN ::.:..:..::.:::::..: .. ::::::::.:::::: . .:.: :.... . KIAA09 KRRGVDKNGNVANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQV-GYRYNPRPRLDRSEK 320 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 360 KIAA08 H-MDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHK . . : ::. :. :: :::::::..: : :: . ... .: .... . :..::::. KIAA09 ETVAYFCAHFEEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSHLTYVSFDFHE 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 KIAA08 ECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSL .:..:... .. : : . .. .... :: :: :. .:::.:: :::::::::::.:. 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KIAA09 VTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLR------IDSSDEDR---ISEVRKVLNSGNFYFA 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 KIAA08 TTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQP-EVHRFALPVLHGF . . .:. :. .::.. .:.:: :: : .:. . . : .. : KIAA09 WSASGI-SLDLSLNAHRSMQEQT----TDNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGG 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 KIAA08 ITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASF . ... : :::: :: :::.:. ::: ...::.::::::::.:. . : .:: KIAA09 VEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSF 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 KIAA08 VQTRGSIPVFWSQRPNLKY-KPLPQISK-VANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQK .: :::.:.:: : :.:. . ..:. . .:.::: . .::::.:.::...: KIAA09 IQIRGSVPLFWEQ-PGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSK 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 KIAA08 GSEKPLEQTFATMV-SSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRL-SILLDQVAEMQDELSYF .:. : ..: . . .: .. .... ::.:. :. . ..: :.: :: .. : ..: KIAA09 EGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQKFLD-YGFF 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 KIAA08 LVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDE ... .: : :. :.::.::::::: .:..:. . : ::. :: ...: . . KIAA09 YFNGS-EVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALG---LAEKPQLVTR 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 KIAA08 FEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDG :...... :. :... .: :::::::. :: . . :: :. : .::: :. KIAA09 FQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALE------GK----AKLKDGARSVTRTIQNNFFDS 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 KIAA08 FRQDSID-LFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTE .:..:: :.::: KIAA09 SKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKP 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0348 ( 1443 res) hg01551(revised) (1443 aa) initn: 540 init1: 242 opt: 588 Z-score: 687.6 bits: 138.6 E(): 3.5e-33 Smith-Waterman score: 680; 30.928% identity (60.825% similar) in 485 aa overlap (78-537:8-459) 50 60 70 80 90 100 KIAA08 DDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPIFGILGTIHLVAG----NYLIVITKKIKVGE .: :: ..: .: ..:...: .::. KIAA03 YGKLTDAYGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGR 10 20 30 110 120 130 140 150 KIAA08 FFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFS-----TTYD . . ..: : : .. . .... ..: :...:. :::: . .: KIAA03 IPDAEIYKITATDFYPLQE--------EAKEEERLIA-LKKILSSGVFYFSWPNDGSRFD 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 KIAA08 LTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQPEVH--RFALPVLHGFITM :: :. .. : :. . : :: .::. : .: . : .. : .:. KIAA03 LTVRTQKQGDDSSEW---------GNSFFWN-QLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTI 90 100 110 120 130 220 230 240 250 260 270 KIAA08 HSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQT .. . : :.:: :: :.:.:...::....::..:::::::..... . .:::: KIAA03 RTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQI 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 KIAA08 RGSIPVFWSQRPNLKY--KPLPQISKVANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSE :::.:.:: : :.:. . : . . .:.::. ::.::..::....:.: KIAA03 RGSVPLFWEQ-PGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGE 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 KIAA08 KPLEQTFATMV-SSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDS . :...: .. .: .: .: ::::. :. . ..: :: ... : : : . KIAA03 EVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLHWE--DFDVFT 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 KIAA08 AGQVVAN--QEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFE :. :. :.:..: ::.:::::::..::..: . :. ::. ::. .. :.: KIAA03 KGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGL----SSKPIVDRFV 320 330 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 KIAA08 KIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFR . .: :. :... .: ..:. ::. :: ...: . :: :: : ..:: :: . KIAA03 ESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALE------GK-AKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVK 380 390 400 410 420 520 530 540 550 560 KIAA08 QDSIDLFL-----GNYSVDE----LESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMA :..: :.: :. .:. :.: . : .:: KIAA03 QEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTW 430 440 450 460 470 480 570 580 590 600 KIAA08 GDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKID KIAA03 NVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDDSSPADIFAVGFEEMVELSAGNIV 490 500 510 520 530 540 >>KIAA0274 ( 932 res) ha06690 (932 aa) initn: 594 init1: 137 opt: 249 Z-score: 289.9 bits: 64.3 E(): 5e-11 Smith-Waterman score: 626; 28.383% identity (57.707% similar) in 532 aa overlap (78-539:118-639) 50 60 70 80 90 100 KIAA08 DDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPIFGILGTIHLVAGNYLIVITKKIKVGEFFSH ::..: .... : :...:::. :.... .: KIAA02 VRELLGRLDLGNRTKMGQKGSSGLFRAVSAFGVVGFVRFLEGYYIVLITKRRKMADIGGH 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 KIAA08 VVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQ--- ...:. : ... . ...: :. .: ....: ..:::: .:::.:.:: KIAA02 AIYKVEDTNMIYIPNDSVRVTH---PDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNL 150 160 170 180 190 200 170 180 190 KIAA08 ------------RLSNTSPE----FQEMSLLERADQ-----------RFVWNGHLLRELS ..... : :.. .:. .. . ..::::.:: .. KIAA02 TVLRMPLEMLKSEMTQNRQESFDIFEDEGLITQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGELLDIIK 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 250 KIAA08 AQPEVHR-FALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAAN . ::: . : ..::: . . : :. ::.::: ::.:. :: . :: .:: KIAA02 ST--VHRDWLLYIIHGFCGQSKLLIYGRPVYVTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDVAN 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 KIAA08 FVETEQIV-------HYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANHMDGFQ ::::::. :: .:.::.:::.:..::: . . : : :. .. : : KIAA02 EVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVRGSVPLYWSQDIST-MMPKPPIT--LDQADPFA 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 KIAA08 R----HFDSQVIIYGKQVII-NLINQKGS---EKPLEQTFATMVSSLGSGM-----MRYI . :::.. .:. .:: ::.... . :. : . ... :. :.. . . :: KIAA02 HVAALHFDQMFQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERILSEELVAAVTYLNQFLPPEHTIVYI 380 390 400 410 420 430 360 370 380 390 400 KIAA08 AFDFHKECKNMR---WDRLSILLDQVAEMQDEL-----SYFLV--------DSAGQVVAN .:. : :. :::... ..:.. . :: . . .: :. . KIAA02 PWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDSYCSILRPDEKWNELGGCVIPT 440 450 460 470 480 490 410 420 430 440 450 KIAA08 ---QEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNA : :..:.::.:::::::. : .... .: :: ::.. .:. . . ..... KIAA02 GRLQTGILRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLID-KPNLQFDTDAVRLFEEL 500 510 520 530 540 550 460 470 480 490 500 510 KIAA08 WADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSIDL . :.... . ::.:. .. : : ... :::.: :::. :::::.: KIAA02 YEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDADRQDSINL 560 570 580 590 600 610 520 530 540 550 560 570 KIAA08 FLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWG ::: . : . : .: :. KIAA02 FLGVFHPTEGKPHL-WELPTDFYLHHKNTMRLLPTRRSYTYWWTPEVIKHLPLPYDEVIC 620 630 640 650 660 670 607 residues in 1 query sequences 1986898 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:18:42 2008 done: Thu Dec 18 15:18:43 2008 Total Scan time: 0.490 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]