# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05607.fasta.huge -Q ../query/KIAA0848.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0848, 988 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986517 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0078+/-0.0079; mu= 3.0850+/- 0.536
 mean_var=230.5280+/-56.799, 0's: 0 Z-trim: 24  B-trim: 106 in 1/39
 Lambda= 0.084472

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)            ( 966) 2262 289.3 1.6e-78
KIAA1854  ( 572 res)   fg02232                     ( 572) 1057 142.2 1.8e-34
KIAA1910  ( 760 res)   fh21867                     ( 760)  873 119.9 1.2e-27
KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                    (1559)  370 58.9 5.7e-09
KIAA0405  ( 706 res)   hg01274                     ( 706)  305 50.6 8.1e-07
KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                    (1496)  311 51.7 8.1e-07
KIAA1469  ( 662 res)   fj01881                     ( 662)  291 48.9 2.5e-06
KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                    (1618)  275 47.4 1.8e-05
KIAA1465  ( 785 res)   fh13187                     ( 785)  269 46.3 1.8e-05
KIAA1904  ( 821 res)   af00058                     ( 821)  260 45.2   4e-05
KIAA1163  ( 437 res)   hj05329                     ( 437)  239 42.4 0.00015
KIAA1484  ( 700 res)   fj06928                     ( 700)  232 41.7 0.00038
KIAA0644  ( 887 res)   hj03618                     ( 887)  233 42.0 0.00041
KIAA0806  ( 1073 res)   hk04165(revised)           (1073)  231 41.8 0.00056
KIAA0416  ( 529 res)   hh00236                     ( 529)  211 39.0  0.0019
KIAA1497  ( 730 res)   hg01608                     ( 730)  205 38.5  0.0039
KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                     ( 640)  202 38.0  0.0046


>>KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)                 (966 aa)
 initn: 2348 init1: 1044 opt: 2262  Z-score: 1501.5  bits: 289.3 E(): 1.6e-78
Smith-Waterman score: 2426;  42.157% identity (68.235% similar) in 1020 aa overlap (6-985:12-961)

                     10        20        30        40        50    
KIAA08       EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID--
                  :  : :.. .    :::    :  .:.:.:.. :. .  .  .: ::  
KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQD----LHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYY
               10        20              30        40          50  

              60        70        80        90       100       110 
KIAA08 -EPCFDPCYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHL
        : : . : :: :.... . :...:. ..:.:.      ..: :. : . .:: : :.. 
KIAA09 GEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNY
             60        70        80        90       100       110  

             120       130       140       150       160       170 
KIAA08 NNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNV
       ..:  ..::.:..:::.::::.::. :.::.:..:::...:.:::::::.:::::.::: 
KIAA09 TGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNY
            120       130       140       150       160       170  

             180       190       200       210       220       230 
KIAA08 IKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHI
       :. :: .:: .:  :.::::::::.  ::.:::. : ::::::::::::.: : :.:.:.
KIAA09 ISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHM
            180       190       200       210       220       230  

             240       250       260       270       280       290 
KIAA08 GRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTEL
        . ..:::::::::::.::...::.::. : :.:::::..:::::..::.:: :. : ::
KIAA09 DK-VVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQEL
             240       250       260       270       280       290 

               300       310       320       330       340         
KIAA08 CP--LLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQ
       ::  :.:: :..     :..  :  .   : :.:. .::  :.::. ::   : :: :.:
KIAA09 CPRRLISDYEMR-----PQTPLSTTGYLHTTPASV-NSVA-TSSSAVYKPPLKPPKGTRQ
             300            310       320         330       340    

     350         360        370       380       390       400      
KIAA08 PRTPR--PPSTSQALYPG-PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKER
       :  ::  : : . .   :  :  :   :::. :.:. :::.:.:::.:.::::.:::.::
KIAA09 PNKPRVRPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQER
          350       360       370       380       390       400    

        410       420       430       440       450       460      
KIAA08 GFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINL
        ...:.:: :.: : ::.::. : :  . :.:: . ..::::::::::::..:: :: .:
KIAA09 KIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDL
          410       420       430       440       450       460    

        470       480       490       500       510       520      
KIAA08 PNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNL
        ::. :.:::: ::.:.: .: :::::.::....:.::::: ..:. .:::.::::::::
KIAA09 TNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNL
          470       480       490       500       510       520    

        530       540       550       560       570       580      
KIAA08 LRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQ
       :...:. .:.: .: :::::.:.:  :::.:::..:....::::..::::::::.: .: 
KIAA09 LQAMPSGVFSGLTLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKL
          530       540       550       560       570       580    

        590       600       610       620       630          640   
KIAA08 WIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQ---PGDSHL
       :.: ..   .: .:.:..:..... :.:.:. :.:::..  :. .  .:..   :. .  
KIAA09 WVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSA
          590       600       610       620       630       640    

                650       660         670       680       690      
KIAA08 IGAP-----TSASPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKK
       . .:     ....:  ..  ::   :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:.
KIAA09 V-TPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKN
           650       660       670       680       690       700   

        700       710       720       730              740         
KIAA08 LPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGH
          ... ... :.....:: . ..    :::::.::  .       :.:  :.   :.::
KIAA09 QSDHTSTNNS-DVSSFNMQ-YSVY----GGGGGTGGHPHAHVHHRGPAL--PKVKTPAGH
           710        720            730       740         750     

     750       760       770                  780       790        
KIAA08 VYEYIPHPVTQMCNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGM
       ::::::::. .::.::::. ::           : .:. :: ..  . ..  :  : : .
KIAA09 VYEYIPHPLGHMCKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQ
         760       770       780       790       800       810     

      800       810       820       830       840       850        
KIAA08 GEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVS
               :.   : :         :...:                  :: . :: . ::
KIAA09 QPP----PQLQLQPGE---------EERRE-----------------SHHLRSPAYS-VS
             820                830                        840     

      860       870       880       890          900       910     
KIAA08 GVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLY
        .      :: .  .        .. :   :..   :. :   : :.  ::.       :
KIAA09 TIEPRE--DLLSPVQDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSL--PEYPK-FPCS----PAAY
          850         860       870       880          890         

         920       930       940       950        960       970    
KIAA08 GTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTK
          :.  .:. .:  . .:    :.::.: .:.:  .. :.  . ....::::.:::...
KIAA09 TFSPNY-DLR-RPHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFV--EPNRNEYLELKAKLNVE
         900         910        920       930         940       950

          980          
KIAA08 PDYLEVLEKTTYRF  
       ::::::::: :     
KIAA09 PDYLEVLEKQTTFSQF
              960      

>>KIAA1854  ( 572 res)   fg02232                          (572 aa)
 initn: 1928 init1: 989 opt: 1057  Z-score: 710.6  bits: 142.2 E(): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 1939;  50.345% identity (77.414% similar) in 580 aa overlap (26-605:11-567)

               10        20        30        40        50        60
KIAA08 EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCY
                                .:.. . :.: :    :   :. .   . :   : 
KIAA18                HRRCLKMLSGVWFLSVLTVA-G----ILQTESRKTAKDICKIRCL
                              10        20             30        40

               70        80        90       100       110       120
KIAA08 CEVKESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLG
       :: ::....:.:..::::..: .     : ..:.:. : . .:: : :.. .:::...::
KIAA18 CEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLG
               50        60        70        80        90       100

              130       140       150       160       170       180
KIAA08 NNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAF
       ::.::.:.::::.::: ::::.:..:::...:.::::::::::::::::: :. ::.:::
KIAA18 NNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAF
              110       120       130       140       150       160

              190       200       210       220       230       240
KIAA08 RNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQL
        .:.::.::::::::.  ::.:.:. : :::::::::::::. . :.:.::: ..::.::
KIAA18 SKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVFRFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIG-GIMEIQL
              170       180       190       200       210          

              250       260       270       280       290       300
KIAA08 EENPWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEV
       :::::::::... ::.::. :  :..::.:.:::::..::::. .. . .:::  : :  
KIAA18 EENPWNCTCDLLPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSAS--
     220       230       240         250       260       270       

              310       320       330       340       350       360
KIAA08 EASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQ
       ..:    :...  .   ::   ..        . ..  .... ::  ..: :::   ...
KIAA18 DSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPAL--------NPTRAPKASRPPKMRNRP-TPRVTVSKD
         280       290               300       310        320      

              370       380       390       400       410       420
KIAA08 ALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLN
           :    ::  :::. :.:. ::..:.:. . .: ::.:::.:: :.:::.: :.: .
KIAA18 RQSFG----PIMVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTS
        330           340       350       360       370       380  

              430       440       450       460       470       480
KIAA08 AKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIE
        :::::..: .: .:..:. ..:::::::::::::. .:.::: :: .:. :.:::: .:
KIAA18 PKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLE
            390       400       410       420       430       440  

              490       500       510       520       530       540
KIAA08 KLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSL
        : :.:: :::::.:::.:.:::.::.: .:. . ::.::::::::::.:: . :.::.:
KIAA18 VLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTAL
            450       460       470       480       490       500  

              550       560       570       580       590       600
KIAA08 ARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDV
       .:::::.:.: .::: :::..: :..::::.:::::::::.. .:.: :  .:  ....:
KIAA18 TRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEV
            510       520       530       540       550       560  

              610       620       630       640       650       660
KIAA08 LCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGG
        :.::                                                       
KIAA18 TCESPAKHAG                                                  
            570                                                    

>>KIAA1910  ( 760 res)   fh21867                          (760 aa)
 initn: 1623 init1: 742 opt: 873  Z-score: 588.0  bits: 119.9 E(): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1690;  38.850% identity (72.230% similar) in 713 aa overlap (18-724:59-740)

                            10        20        30        40       
KIAA08              EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIED
                                     :.:    .:::.:: : .: ...       
KIAA19 LASDIGALNELELCLWRAGWSLLLCDEIGDELLALKMLLWILLLET-SLCFAA-------
       30        40        50        60        70         80       

        50         60        70        80        90       100      
KIAA08 SEEIDEPCFDP-CYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTN
       ..   . : .  : :.  :. .:. :..::::.....:   :. ..:.:. ::. .:. :
KIAA19 GNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPN
               90       100       110       120       130       140

        110       120       130       140       150       160      
KIAA08 SFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQ
        : .. ::::... ::.:..:  ::: ::...:::....::.  ::..:::::..:::::
KIAA19 EFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQ
              150       160       170       180       190       200

        170       180       190       200       210       220      
KIAA08 ADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRG
       ::.:... :. :::..:.::.:::::::::  ::.:.:. : .:::::::::::.: :. 
KIAA19 ADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEE
              210       220       230       240       250       260

        230       240       250       260       270       280      
KIAA08 MLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREI
       .:..:  .. :. ::.:::.:::....:: ::: :: .::.: ..::.: ...:::: : 
KIAA19 VLEQIP-GIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGKDLNET
               270       280       290       300       310         

        290       300       310       320       330       340      
KIAA08 RKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKP
        . .::::   ..:..::  :    ..:...   :   : .   : .. .. . .. :. 
KIAA19 TEQDLCPL--KNRVDSSLPAP---PAQEETFAPGP---LPTPFKTNGQEDHATPGSAPNG
     320         330          340          350       360       370 

         350          360       370       380       390       400  
KIAA08 -TKQP---RTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVN
        :: :   .    :... :   . :.: .:       .:  :: ::.:. ::   :: .:
KIAA19 GTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKP-LAN-----SLP--CPGGCSCD-HIPGSGLKMN
             380       390        400              410        420  

            410       420       430       440       450       460  
KIAA08 CKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGA
       :..:. .....: :.  :...:.: .: :..: .: : ....: :: :::: :. :....
KIAA19 CNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATVENNT
            430       440       450       460       470       480  

            470       480       490       500       510       520  
KIAA08 FINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFL
       : :: .:. :....: .. :.   : :::.:.::  :.:.:. : :..:. ::.:..:.:
KIAA19 FKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILIL
            490       500       510       520       530       540  

            530       540       550       560       570       580  
KIAA08 NNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLV
       ::::::.::.:.:::.::..:.:..:::.::::::::..:..:.::::. :::.:.: .:
KIAA19 NNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECSCTIV
            550       560       570       580       590       600  

            590       600       610       620        630       640 
KIAA08 PFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEML-HVAPAGESPAQPGDS
       ::::: : ..:  ...:. :..: :. ..:   .  . .::..  ...:.  : .. ...
KIAA19 PFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHSK-NST
            610       620       630       640       650        660 

             650       660       670       680       690       700 
KIAA08 HLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRS
        :  . : .. :      . : .:::. .::..: ...:...:.....:: : :.   :.
KIAA19 GLAETGTHSNSYL---DTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNR-KRSKRRD
             670          680       690       700       710        

             710       720       730       740       750       760 
KIAA08 KRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQM
         . . .....:  :   .  .:                                     
KIAA19 ANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD                 
       720       730       740       750       760                 

>>KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                         (1559 aa)
 initn: 377 init1: 211 opt: 370  Z-score: 252.9  bits: 58.9 E(): 5.7e-09
Smith-Waterman score: 463;  25.303% identity (50.433% similar) in 577 aa overlap (55-624:70-543)

           30        40        50        60        70        80    
KIAA08 MLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQIT
                                     :   : :    :   . : . :.  . .  
KIAA08 GWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTC----SAASVDCHGLGLRAVPRGI
      40        50        60        70            80        90     

           90       100       110       120       130       140    
KIAA08 EFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLH
          ..  .: :.::.. ..   .:  :.:   ..: .: .. :. :::. :: :.:: :.
KIAA08 PRNAE--RLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLN
         100         110       120       130       140       150   

          150       160       170       180       190       200    
KIAA08 ENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLF
       .:::.:. .  : .  .:  :. . : :. :   :::... .. : :..: :  .  . :
KIAA08 KNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAF
           160       170       180       190       200       210   

           210       220       230       240       250       260   
KIAA08 KAV-SLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPY
       .:. .:  : : .: .. ..  . ..:. . .  :.:. :   : :... :..::..   
KIAA08 RALRDLEILTLNNNNISRILVTS-FNHMPK-IRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQ---
           220       230        240        250       260           

           270        280       290        300       310       320 
KIAA08 TALVGDIT-CETPFHFHGKDLREIRKTE-LCPLLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKP
          ::..: : .: :..: .. ...: : .::             :::            
KIAA08 RRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCP------------APHS------------
      270       280       290       300                            

             330       340       350       360       370       380 
KIAA08 SSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIP
                                       .::: .                      
KIAA08 --------------------------------EPPSCNAN-------------------S
                                          310                      

             390       400       410       420       430       440 
KIAA08 IICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWN
       : ::. :::. .:      :.:. .:. .:   ::. .   .. : .: :. :  . : .
KIAA08 ISCPSPCTCSNNI------VDCRGKGLMEIPANLPEGI--VEIRLEQNSIKAIPAGAFTQ
           320             330       340         350       360     

             450       460       470       480       490       500 
KIAA08 FSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFN
       ...:  . ...:.:: .   :: .: .: :: : :: : ... :.: :: ::. : .. :
KIAA08 YKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNAN
         370       380       390       400       410       420     

             510       520       530        540       550       560
KIAA08 VIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLE
        :  ..  .:. . ::.:: : .: :.:.    ::   :.  :.: .: :.         
KIAA08 KINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFV------CDC
         430       440       450       460       470               

              570          580       590       600       610       
KIAA08 HLNAIVQIDLNENPWDCT---CDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIE
       ::. ...  :..:: . .   :.  : .   . ::...      : . :.   :      
KIAA08 HLKWLADY-LQDNPIETSGARCS-SPRRLANKRISQIKS-KKFRCSGSEDYRSRFSSECF
     480        490       500        510        520       530      

       620       630       640       650       660       670       
KIAA08 LEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFS
       ....:::                                                     
KIAA08 MDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLR
        540       550       560       570       580       590      

>>KIAA0405  ( 706 res)   hg01274                          (706 aa)
 initn: 269 init1: 209 opt: 305  Z-score: 214.3  bits: 50.6 E(): 8.1e-07
Smith-Waterman score: 315;  27.857% identity (58.571% similar) in 280 aa overlap (392-663:184-435)

             370       380       390        400       410       420
KIAA08 LYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGL-TVNCKERGFNNISELLPRPLN
                                     ::..: .. ::. .. .:        . ..
KIAA04 PKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFR-------EAIS
           160       170       180       190       200             

              430       440       450       460       470       480
KIAA08 AKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIE
        : :.::.: ....         .:. :.. .:::. ..: :: :: .:. :...:: . 
KIAA04 LKLLFLSKNHLSSV---PVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLT
        210       220          230       240       250       260   

                490       500       510         520       530      
KIAA08 K--LTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKL--LFLNNNLLRTLPTDAFA
       .  .. : :  : .:.    ::...:.        .:. .:  :.:..: .  .:  ::.
KIAA04 NKGIAEGTFSHLTKLK----EFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFS
           270           280       290       300       310         

         540       550       560       570       580       590     
KIAA08 GT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETI-SSV
       .  .: ::.. .:  : . . ::...:. . :.   .::: : :..    .:.. : ::.
KIAA04 NLRKLERLDISNNQ-LRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSL
     320       330        340       350       360       370        

          600       610       620        630       640       650   
KIAA08 SVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVL-CPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPY
       .: :  .:..::..    :: .....: ::            . ::   .  ::..::: 
KIAA04 NVRG-FMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPT-----------TTPGLPLFTPAPSTASPT
      380        390       400                  410       420      

           660       670       680       690       700       710   
KIAA08 EFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQ
         .::   .:                                                  
KIAA04 T-QPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQV
         430       440       450       460       470       480     

>>KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                         (1496 aa)
 initn: 576 init1: 248 opt: 311  Z-score: 214.2  bits: 51.7 E(): 8.1e-07
Smith-Waterman score: 318;  26.347% identity (52.096% similar) in 334 aa overlap (338-663:7-292)

       310       320       330       340       350         360     
KIAA08 HSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTS--QALYPG
                                     ..:..   :. . .  : :.     ::   
KIAA02                         SRPWWLRASERPSAPSAMAKRSRGPGRRCLLALVLF
                                       10        20        30      

         370       380       390       400       410       420     
KIAA08 PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLY
            .:    .:     ::. : :      .  :: : .  .. .  . :.   .. : 
KIAA02 CAWGTLAVVAQKPGAG--CPSRCLC------FRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQ---TSILD
         40        50                60        70        80        

         430       440       450       460       470       480     
KIAA08 LSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPG
       :  : :..:  . :  . .:. : :.::.:. . .::: .: ::: :.:  :.:...   
KIAA02 LRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQ
          90       100       110       120       130       140     

         490       500       510       520       530       540     
KIAA08 MFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNL
        :.:: ::. ::..:: :. ..: .:. .:.:. :::.:: .  :               
KIAA02 AFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHL---------------
         150       160       170       180       190               

         550       560       570       580       590        600    
KIAA08 RKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS-SVSVVGDVLCRS
                : :...::... .. :. :   : :... . . ..: . : .. . ..:. 
KIAA02 ---------VPGTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEY
                       200       210       220       230       240 

          610       620       630          640       650           
KIAA08 PENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESP---AQPGDSHLIGAPTSASPYEFS--PPG
       :. .  :.: ::      :: :.     : :   ..: :. .    ::..   :.    :
KIAA02 PRRIQGRSVATIT-----PEELNC----ERPRITSEPQDADV----TSGNTVYFTCRAEG
             250            260           270           280        

     660       670       680       690       700       710         
KIAA08 GPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRL
       .: :                                                        
KIAA02 NPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEV
      290       300       310       320       330       340        

>>KIAA1469  ( 662 res)   fj01881                          (662 aa)
 initn: 320 init1: 171 opt: 291  Z-score: 205.4  bits: 48.9 E(): 2.5e-06
Smith-Waterman score: 300;  25.484% identity (58.387% similar) in 310 aa overlap (356-652:116-402)

         330       340       350       360       370       380     
KIAA08 SSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICP
                                     :.  . :.   :.     :..   :: .  
KIAA14 AGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLE-
          90       100       110       120       130       140     

         390       400       410       420       430       440     
KIAA08 TGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFS-S
            .::..: ....   :.:    :. :      . :.:: : .. :     :..  .
KIAA14 -----ELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYL------RLLFLSRNHLSTIP----WGLPRT
               150       160             170       180             

          450       460       470       480         490       500  
KIAA08 LDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEK--LTPGMFRGLQSLHYLYFEFNV
       .. :.: .:::: ... .. .: .:: : :.:: ...  :   .: .: .:     :...
KIAA14 IEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLT----ELSL
     190       200       210       220       230       240         

            510         520       530        540       550         
KIAA08 IREIQPAAFSLMP--NLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVL
       .:.   ::   .:  ::. :.:..: .  .: .::.   .: ::.. .: .  ::  :..
KIAA14 VRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLP-QGIF
         250       260       270       280       290       300     

     560       570       580       590        600       610        
KIAA08 EHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS-SVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIEL
       . :. :.:. : .::: : : .   ..:....  .:.: : ..:..::..    .. .. 
KIAA14 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRG-LMCQAPEKVRGMAIKDLNA
          310       320       330       340        350       360   

      620             630       640       650       660       670  
KIAA08 EVL-CPE-----MLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLL
       :.. : .      .... :  . . :....   ::.. .:                    
KIAA14 ELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRK
           370       380       390        400       410       420  

            680       690       700       710       720       730  
KIAA08 VLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGG
                                                                   
KIAA14 TITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTAL
            430       440       450       460       470       480  

>>KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                         (1618 aa)
 initn: 477 init1: 200 opt: 275  Z-score: 190.1  bits: 47.4 E(): 1.8e-05
Smith-Waterman score: 422;  24.823% identity (49.645% similar) in 564 aa overlap (55-617:118-565)

           30        40        50        60        70        80    
KIAA08 MLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQIT
                                     :   : :    .   . : . :.  : .  
KIAA08 TPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTC----TGTTVDCHGTGLQAIPKNI
        90       100       110       120           130       140   

           90       100       110       120       130       140    
KIAA08 EFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLH
          ..  .: :. :.. ... :.:  :..   ..: .: .  .. :::. .: :.:: :.
KIAA08 PRNTE--RLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLN
             150       160       170       180       190       200 

          150       160       170       180       190       200    
KIAA08 ENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLF
       .:.: .. .  : . ..:  :. . :.:. :   :::. . :. : :. : :  .  . :
KIAA08 RNQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAF
             210       220       230       240       250       260 

           210       220       230       240       250       260   
KIAA08 KAV-SLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPY
       .:. .:  : : .: . ..   . ..:. . :  ..:. :   : :... :..::.. : 
KIAA08 RALRGLEVLTLNNNNITTIPVSS-FNHMPK-LRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPT
             270       280        290        300       310         

           270       280       290       300       310       320   
KIAA08 TALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKPSS
        .:  .  :  :  ..: .. :..:.:                                 
KIAA08 IGLFTQ--CSGPASLRGLNVAEVQKSE---------------------------------
     320         330       340                                     

           330       340       350       360       370       380   
KIAA08 MLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPII
             :. :.              : .. : :. .  :  :                  
KIAA08 ------FSCSG--------------QGEAGRVPTCT--LSSGS-----------------
                              350       360                        

           390       400       410       420       430       440   
KIAA08 CPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFS
       ::. :::.  :      :.:. .:.. :   ::. ..  .: :  : :..:  . :  . 
KIAA08 CPAMCTCSNGI------VDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLEL--NGIKSIPPGAFSPYR
         370             380       390       400         410       

           450       460       470       480       490       500   
KIAA08 SLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVI
       .:  . :.::.:. .   :: .: .:.:: : :: :  :  :.: :: .:. : .. : :
KIAA08 KLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKI
       420       430       440       450       460       470       

           510       520       530       540       550       560   
KIAA08 REIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLN
         :.: ::. . ::.:: : .: ..          :::.              :..  : 
KIAA08 NCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ----------SLAK--------------GTFTSLR
       480       490       500                               510   

           570       580       590       600       610       620   
KIAA08 AIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCP
       ::  . : .::. : :.:  . ....: . . . : . : ::. :... .  :.      
KIAA08 AIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRT-NPIETSG-ARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRC
           520       530       540         550       560       570 

           630       640       650       660       670       680   
KIAA08 EMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAA
                                                                   
KIAA08 SAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRL
             580       590       600       610       620       630 

>>KIAA1465  ( 785 res)   fh13187                          (785 aa)
 initn: 341 init1: 227 opt: 269  Z-score: 190.0  bits: 46.3 E(): 1.8e-05
Smith-Waterman score: 302;  27.090% identity (52.174% similar) in 299 aa overlap (384-670:60-329)

           360       370       380       390        400       410  
KIAA08 RPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTC-NLHINDLGLTVNCKERGFNNIS
                                     ::  :.: . . ...   ..:  . . .. 
KIAA14 FTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGSCPEPCACVDKYAHQF---ADCAYKELREVP
      30        40        50        60        70           80      

            420       430       440       450       460       470  
KIAA08 ELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSL
       : ::   :.  : ::.: :  . :. : . ...  : :..:..  :. ::.  : .::.:
KIAA14 EGLP--ANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNL
         90         100       110       120       130       140    

            480       490       500       510       520       530  
KIAA08 FLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPT
        :. : : ..  . .:.:..:. : .. : .  .   :.. .:.:. : .::: ::::  
KIAA14 DLSHNFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLA-
          150       160       170       180       190       200    

            540       550       560       570       580       590  
KIAA08 DAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS
                            :  :... :.:. ...: .::. : : :: .. :  .  
KIAA14 ---------------------P--GTFDALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTR
                                  210       220       230       240

             600       610       620         630       640         
KIAA08 -SVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVA--PAGESPAQPGDS------HL
        :.    .. : ::  :    :  .      :  .:..  :  :.:. :  .      : 
KIAA14 VSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRLPALPCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHC
              250       260       270       280       290       300

             650       660       670       680       690       700 
KIAA08 I--GAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRS
       :  : ::    .... ::: : :   .::                               
KIAA14 IADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPPVLSGEDDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPA
              310       320       330       340       350       360

>>KIAA1904  ( 821 res)   af00058                          (821 aa)
 initn: 345 init1: 215 opt: 260  Z-score: 183.8  bits: 45.2 E(): 4e-05
Smith-Waterman score: 308;  32.663% identity (60.302% similar) in 199 aa overlap (413-608:48-222)

            390       400       410       420         430       440
KIAA08 ICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNA--KKLYLSSNLIQKIYRSDFW
                                     : .:. .:.  . : :. : .. .  :.. 
KIAA19 PGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINSTVHDLRLNENKLKAVLYSSLN
        20        30        40        50        60        70       

              450       460       470       480       490       500
KIAA08 NFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEF
        :..:  :.: .:.:::..::::..  .:. : :. : . .:: ::.::.. :..:. . 
KIAA19 RFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKLSNLTEGMLRGMSRLQFLFVQH
        80        90       100       110       120       130       

              510       520       530       540       550       560
KIAA08 NVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLE
       :.:. . :.:::  :.:  . :..: :  :   .::  ::: :       .   .::   
KIAA19 NLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFA--SLASL-------MVCELAG---
       140       150       160       170                180        

              570       580       590       600        610         
KIAA08 HLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVL-CRSPENLTHRDVRTIELE
                   ::..: :::  :  :. ....:.   : : :.::...           
KIAA19 ------------NPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPY
                     190       200       210       220       230   

     620       630       640       650       660       670         
KIAA08 VLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAV
                                                                   
KIAA19 HSLNAIIVLQAKCRNGSLPARPVSHPTPYSTDAQREPDENSGFNPDEILSVEPPASSTTD
           240       250       260       270       280       290   




988 residues in 1 query   sequences
1986517 residues in 2037 library sequences
 Scomplib [34.26]
 start: Thu Dec 18 15:18:35 2008 done: Thu Dec 18 15:18:36 2008
 Total Scan time:  0.660 Total Display time:  0.300

Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]