# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05386.fasta.huge -Q ../query/KIAA0846.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0846, 691 aa vs ./tmplib.23663 library 1986814 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0068+/-0.00541; mu= 16.3151+/- 0.368 mean_var=107.1890+/-25.394, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.123879 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0351 ( 590 res) hg01609 ( 590) 292 63.0 8.8e-11 KIAA0277 ( 583 res) ha06833 ( 583) 247 55.0 2.3e-08 KIAA1032 ( 1702 res) ff09715 (1702) 248 55.7 4e-08 KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 214 49.6 2.5e-06 KIAA0959 ( 820 res) hj05718 ( 820) 196 46.1 1.6e-05 KIAA1308 ( 745 res) fh08652 ( 745) 188 44.6 4e-05 KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304) 172 42.3 0.00059 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 170 41.8 0.00064 KIAA0451 ( 983 res) pf06424 ( 983) 153 38.5 0.0036 >>KIAA0351 ( 590 res) hg01609 (590 aa) initn: 299 init1: 196 opt: 292 Z-score: 285.4 bits: 63.0 E(): 8.8e-11 Smith-Waterman score: 300; 29.197% identity (59.489% similar) in 274 aa overlap (136-390:63-326) 110 120 130 140 150 160 KIAA08 EVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLE--PIELAEHLT : ..:. ..:: :. : :.: ..: KIAA03 TMYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQIT 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 KIAA08 FLEHKSFRRISFTDYQS-----YVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQ ... :. :. . : :. : .. : :: .: :: .:. : . 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