# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05861.fasta.nr -Q ../query/KIAA0835.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0835, 1167 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7804076 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4557+/-0.000206; mu= 8.8524+/- 0.011 mean_var=145.3352+/-28.182, 0's: 33 Z-trim: 114 B-trim: 264 in 2/64 Lambda= 0.106387 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|13638422|sp|Q01538.2|MYT1_HUMAN RecName: Full=M (1121) 7463 1158.3 0 gi|123232095|emb|CAM20796.1| myelin transcription (1169) 6952 1079.9 0 gi|76363256|sp|Q8CFC2.1|MYT1_MOUSE RecName: Full=M (1127) 6808 1057.8 0 gi|73992779|ref|XP_543112.2| PREDICTED: similar to (1312) 6608 1027.1 0 gi|148675515|gb|EDL07462.1| myelin transcription f (1078) 6497 1010.0 0 gi|148675514|gb|EDL07461.1| myelin transcription f (1008) 6050 941.4 0 gi|119595562|gb|EAW75156.1| hCG1641026, isoform CR ( 912) 5948 925.7 0 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