# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05861.fasta.huge -Q ../query/KIAA0835.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0835, 1167 aa vs ./tmplib.23663 library 1986338 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0531+/-0.0085; mu= -25.2632+/- 0.567 mean_var=455.9706+/-109.538, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.060063 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1050 ( 829 res) hh03308 ( 829) 5593 500.0 6.2e-142 KIAA1106 ( 1154 res) fg01888 (1154) 2929 269.2 2.5e-72 KIAA0535 ( 1047 res) hg03847 (1047) 2484 230.6 9.4e-61 KIAA0702 ( 988 res) hg01814(revised) ( 988) 273 39.0 0.0042 >>KIAA1050 ( 829 res) hh03308 (829 aa) initn: 5593 init1: 5593 opt: 5593 Z-score: 2640.0 bits: 500.0 E(): 6.2e-142 Smith-Waterman score: 5593; 100.000% identity (100.000% similar) in 829 aa overlap (339-1167:1-829) 310 320 330 340 350 360 KIAA08 EEEEEEEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSA :::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 EEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSA 10 20 30 370 380 390 400 410 420 KIAA08 QKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 QKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLE 40 50 60 70 80 90 430 440 450 460 470 480 KIAA08 QAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGLGEPGKAAKPLDTVRKSYYSKDPSRAEKREIKC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 QAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGLGEPGKAAKPLDTVRKSYYSKDPSRAEKREIKC 100 110 120 130 140 150 490 500 510 520 530 540 KIAA08 PTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 PTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRN 160 170 180 190 200 210 550 560 570 580 590 600 KIAA08 THRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 THRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRP 220 230 240 250 260 270 610 620 630 640 650 660 KIAA08 NVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQCFDYSQD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 NVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQCFDYSQD 280 290 300 310 320 330 670 680 690 700 710 720 KIAA08 AEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRENA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 AEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRENA 340 350 360 370 380 390 730 740 750 760 770 780 KIAA08 FPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQASRQDEWDRPLDYTKPSRLRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 FPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQASRQDEWDRPLDYTKPSRLRE 400 410 420 430 440 450 790 800 810 820 830 840 KIAA08 EEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 EEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPT 460 470 480 490 500 510 850 860 870 880 890 900 KIAA08 PGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 PGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASH 520 530 540 550 560 570 910 920 930 940 950 960 KIAA08 RSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 RSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAAR 580 590 600 610 620 630 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA08 RQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 RQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKL 640 650 660 670 680 690 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA08 SGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 SGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNI 700 710 720 730 740 750 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA08 EEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA10 EEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD 760 770 780 790 800 810 1150 1160 KIAA08 PENKDLLESIKQAVRGIQV ::::::::::::::::::: KIAA10 PENKDLLESIKQAVRGIQV 820 >>KIAA1106 ( 1154 res) fg01888 (1154 aa) initn: 2422 init1: 1572 opt: 2929 Z-score: 1390.4 bits: 269.2 E(): 2.5e-72 Smith-Waterman score: 3331; 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KIAA11 --------NNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRAR--TESEMNSNTSNSLEDDSDK 160 170 180 190 200 260 270 280 290 KIAA08 AASEEGEKGLFIQPEDAEEVVE-VTTER----------SQDLCPQSLEDAASEESSKQKG . :.:. . :.. : : : . . :... .. :. :...:.. . KIAA11 NENL-GRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMN 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 KIAA08 ILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEE---------EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE . . .. :. :: ::: ... . .. : . .:.. ... . . KIAA11 YVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIR 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 KIAA08 EEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPEL-RGPESPSPKPEYSVIVEVRSDD---DKDEDTHSRK ... :. : : . . .: : :. ::. . :.. ..: ..:.:: : . 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KIAA11 ENGTLDLSMNKQRPRDSCCP----------ILTPLEPM-----SPQQQAVMNNRCFQLGE 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 KIAA08 QDEWDRPLDYTK--PSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLT : :: :.:::: : :. :.: .. : .: . .: .:::.::::::. KIAA11 GDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITP----------EDLDPFQEALEERRYPGEVTIP 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 KIAA08 NFKLKF-LSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSAD . : :. :. ::.:.: ::::::::::.:...:. : . KIAA11 SPKPKYPQCKESKKDLIT---------------------LSGCPLADKSIRSMLATSSQE 840 850 860 870 890 900 910 920 930 940 KIAA08 LKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGL ::::::::::::::::::::::::::::::::::...: .:.:::: : ..:::::: : KIAA11 LKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDGQ 880 890 900 910 920 930 950 960 970 980 990 1000 KIAA08 GHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSF :::.::::::::::::::::.:::.: ::::.:::::.:.:: .:::::::::::..::: KIAA11 GHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGSF 940 950 960 970 980 990 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA08 LTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEM ::::::::::::: : ::.::::...:. : ..:. .:::::::::..::..::::::.: KIAA11 LTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQM 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA08 EAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEP :: :..:..::..::.:::.::::::.::.:::.:. ::..:::.::.:::::.::::.: KIAA11 EADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMDP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1130 1140 1150 1160 KIAA08 ICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV : ::::::::.:::.::.::: :::: :::.:::::::::: KIAA11 INEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV 1120 1130 1140 1150 >>KIAA0535 ( 1047 res) hg03847 (1047 aa) initn: 1953 init1: 699 opt: 2484 Z-score: 1182.6 bits: 230.6 E(): 9.4e-61 Smith-Waterman score: 2835; 45.369% identity (67.667% similar) in 1166 aa overlap (47-1167:1-1047) 20 30 40 50 60 70 KIAA08 FRGELLNQRWTHGGKASSCRTSRHLGRHCKMSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSC :. : ::: :::::. . : .. .:: KIAA05 MDAEAEDKTLRTRSKGTEVPMDSLIQELSV 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA08 PTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKKRKLEGAEAEHLVSKRKSHPLKLALDEGYGVD .: .:::: : :.:::: .: . :. KIAA05 A--------------------YDCSMAKKRTAEDQALGVPVNKRKSLLMK---PRHYSPK 40 50 60 140 150 160 170 180 190 KIAA08 SDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETSGQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSNPIGSAT .: .:: : :..: :: ......... . .: : .. . . KIAA05 ADCQEDR-----SDRTEDDGPLE-THGHSTAEEIMIKPMDESLLSTAQEN---------S 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 KIAA08 ASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLVE---EDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEGAAS . .. :: :: ... ::..::.. ... :. :.:... :: : : : KIAA05 SRKEDRYSCYQELMVKSLMHLGKFEKNVSVQTVSENLNDS-----GIQSLKAE------S 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 KIAA08 EEGEKGLFIQPEDAEEVVEVTTERSQDLCPQSLEDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEE .:... ..:. .:... .. . . .: : .: :. : ..: : . .:: . KIAA05 DEADECFLIHSDDGRDKID---DSQPPFC--SSDDNESNSESAENGWDSGSNFSEETKPP 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 KIAA08 EEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPE . . ..... : : . : .. :.. . : : ..: ... :. 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