# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05861.fasta.huge -Q ../query/KIAA0835.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0835, 1167 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986338 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0531+/-0.0085; mu= -25.2632+/- 0.567
 mean_var=455.9706+/-109.538, 0's: 0 Z-trim: 14  B-trim: 5 in 1/39
 Lambda= 0.060063

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA1050  ( 829 res)   hh03308                     ( 829) 5593 500.0 6.2e-142
KIAA1106  ( 1154 res)   fg01888                    (1154) 2929 269.2 2.5e-72
KIAA0535  ( 1047 res)   hg03847                    (1047) 2484 230.6 9.4e-61
KIAA0702  ( 988 res)   hg01814(revised)            ( 988)  273 39.0  0.0042


>>KIAA1050  ( 829 res)   hh03308                          (829 aa)
 initn: 5593 init1: 5593 opt: 5593  Z-score: 2640.0  bits: 500.0 E(): 6.2e-142
Smith-Waterman score: 5593;  100.000% identity (100.000% similar) in 829 aa overlap (339-1167:1-829)

      310       320       330       340       350       360        
KIAA08 EEEEEEEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10                               EEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSA
                                             10        20        30

      370       380       390       400       410       420        
KIAA08 QKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 QKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLE
               40        50        60        70        80        90

      430       440       450       460       470       480        
KIAA08 QAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGLGEPGKAAKPLDTVRKSYYSKDPSRAEKREIKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 QAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGLGEPGKAAKPLDTVRKSYYSKDPSRAEKREIKC
              100       110       120       130       140       150

      490       500       510       520       530       540        
KIAA08 PTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 PTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRN
              160       170       180       190       200       210

      550       560       570       580       590       600        
KIAA08 THRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 THRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRP
              220       230       240       250       260       270

      610       620       630       640       650       660        
KIAA08 NVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQCFDYSQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 NVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQCFDYSQD
              280       290       300       310       320       330

      670       680       690       700       710       720        
KIAA08 AEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRENA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 AEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDLPSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRENA
              340       350       360       370       380       390

      730       740       750       760       770       780        
KIAA08 FPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQASRQDEWDRPLDYTKPSRLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 FPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQASRQDEWDRPLDYTKPSRLRE
              400       410       420       430       440       450

      790       800       810       820       830       840        
KIAA08 EEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 EEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPT
              460       470       480       490       500       510

      850       860       870       880       890       900        
KIAA08 PGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 PGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASH
              520       530       540       550       560       570

      910       920       930       940       950       960        
KIAA08 RSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 RSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAAR
              580       590       600       610       620       630

      970       980       990      1000      1010      1020        
KIAA08 RQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 RQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKL
              640       650       660       670       680       690

     1030      1040      1050      1060      1070      1080        
KIAA08 SGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 SGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNI
              700       710       720       730       740       750

     1090      1100      1110      1120      1130      1140        
KIAA08 EEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA10 EEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD
              760       770       780       790       800       810

     1150      1160       
KIAA08 PENKDLLESIKQAVRGIQV
       :::::::::::::::::::
KIAA10 PENKDLLESIKQAVRGIQV
              820         

>>KIAA1106  ( 1154 res)   fg01888                         (1154 aa)
 initn: 2422 init1: 1572 opt: 2929  Z-score: 1390.4  bits: 269.2 E(): 2.5e-72
Smith-Waterman score: 3331;  48.435% identity (68.946% similar) in 1214 aa overlap (45-1167:21-1154)

           20        30        40        50        60        70    
KIAA08 NEFRGELLNQRWTHGGKASSCRTSRHLGRHCKMSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADL
                                     ::: ...:.:: :::::..: : : .  .:
KIAA11           LWACVLPGVTLPPFLGEKTSCKMEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQEL
                         10        20        30        40        50

            80        90       100       110       120          130
KIAA08 -SCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKKRKLEGAEAEHLVSKRKSHPLKL---ALD
        ::::::: ::::: :::.::::. .:::::::: .  . .. . :::   .:    ..:
KIAA11 FSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKKRKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVD
               60        70        80        90       100       110

              140       150       160       170       180       190
KIAA08 EGYGVDSDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETSGQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSN
       :    ::::.:: . :. .         :: : :   ..: :. .  . :    ..  .:
KIAA11 ECD--DSDGTEDMDEKEED---------EGEEEEEEEENEDHQMNCHNTRIMQDTEKDDN
                120                130       140       150         

              200       210       220       230       240       250
KIAA08 PIGSATASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLVEEDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEG
               ..  :..:. ..: ::::::.:::..  .      .. . .  . :.. .. 
KIAA11 --------NNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRAR--TESEMNSNTSNSLEDDSDK
             160       170       180       190         200         

              260       270                  280       290         
KIAA08 AASEEGEKGLFIQPEDAEEVVE-VTTER----------SQDLCPQSLEDAASEESSKQKG
         .  :.:. .    :.. : : : . .          :...  ..  :. :...:.. .
KIAA11 NENL-GRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMN
     210        220       230       240       250       260        

     300       310       320                330       340       350
KIAA08 ILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEE---------EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
        .   .  ..   :.  :: :::         ...  .  ..  : . .:.. ... . .
KIAA11 YVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIR
      270       280       290       300       310       320        

              360       370        380       390          400      
KIAA08 EEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPEL-RGPESPSPKPEYSVIVEVRSDD---DKDEDTHSRK
       ... :.  :   :   . .   .: :  :. ::. .  :..   ..:   ..:.:: : .
KIAA11 QHVRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSR--VFASCAKEDGCHERDDDTTSVN
      330       340       350       360         370       380      

        410       420       430       440                 450      
KIAA08 STVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPA----------EQSQLGL
       :   :.::    ::.::: :::.::::..:..... :     :          .::   :
KIAA11 S---DRSEEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQL
           390       400       410       420       430       440   

        460          470       480       490       500       510   
KIAA08 GEPGKAAKPLDT---VRKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCP
         ::.  :: ..   :.: ::  ::::.::.: :::::::::::::::::::::::::::
KIAA11 --PGEDRKPKSSDSHVKKPYY--DPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCP
             450       460         470       480       490         

           520       530       540       550       560       570   
KIAA08 HKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQP
       ::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::..::.  
KIAA11 HKDRVPPEILAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKH--
     500       510       520       530       540       550         

           580       590       600       610       620       630   
KIAA08 QTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDY
       :. : ::::. :::.:::::::::::.: :: :: ::  .:::.::::::::.::..:.:
KIAA11 QSCDVSKSSQASDRVLRPMCFVKQLEIPQYG-YRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFEY
       560       570       580        590       600       610      

           640       650       660                                 
KIAA08 ASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQ-----C--------------------------
        :.: ...::: .:::.:: . :::...     :                          
KIAA11 NSYDNHTYGKRAIAPKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGGG
        620       630       640       650       660       670      

                       670       680       690       700        710
KIAA08 -----------FDYSQDAEAAHMAATAILNLSTRCWEMPENLSTKPQDL-PSKSVDIEVD
                  :::..: ::::::::::::::::: :::.:::::::::  ... :.:::
KIAA11 SSASSTCSKSSFDYTHDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEVD
        680       690       700       710       720       730      

              720       730       740       750       760       770
KIAA08 ENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQASR
       :::::::::.:.: :..  :          . .:   .     :  .... . .  : ..
KIAA11 ENGTLDLSMNKQRPRDSCCP----------ILTPLEPM-----SPQQQAVMNNRCFQLGE
        740       750                 760            770       780 

              780         790       800       810       820        
KIAA08 QDEWDRPLDYTK--PSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLT
        : :: :.::::  : :. :.: ..  :          .: .  .: .:::.::::::. 
KIAA11 GDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITP----------EDLDPFQEALEERRYPGEVTIP
             790       800                 810       820       830 

      830        840       850       860       870       880       
KIAA08 NFKLKF-LSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSAD
       . : :.   :. ::.:.:                     ::::::::::.:...:. : .
KIAA11 SPKPKYPQCKESKKDLIT---------------------LSGCPLADKSIRSMLATSSQE
             840                            850       860       870

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KIAA08 LKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::...: .:.:::: : ..:::::: : 
KIAA11 LKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDGQ
              880       890       900       910       920       930

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KIAA08 GHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSF
       :::.::::::::::::::::.:::.: ::::.:::::.:.:: .:::::::::::..:::
KIAA11 GHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGSF
              940       950       960       970       980       990

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KIAA08 LTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEM
       ::::::::::::: : ::.::::...:. : ..:. .:::::::::..::..::::::.:
KIAA11 LTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQM
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KIAA08 EAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEP
       :: :..:..::..::.:::.::::::.::.:::.:. ::..:::.::.:::::.::::.:
KIAA11 EADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMDP
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KIAA08 ICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV
       : ::::::::.:::.::.:::    :::: :::.::::::::::
KIAA11 INEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
             1120      1130      1140      1150    

>>KIAA0535  ( 1047 res)   hg03847                         (1047 aa)
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KIAA08 FRGELLNQRWTHGGKASSCRTSRHLGRHCKMSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSC
                                     :. : :::  :::::. . : ..   .:: 
KIAA05                               MDAEAEDKTLRTRSKGTEVPMDSLIQELSV
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KIAA08 PTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKKRKLEGAEAEHLVSKRKSHPLKLALDEGYGVD
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KIAA05 A--------------------YDCSMAKKRTAEDQALGVPVNKRKSLLMK---PRHYSPK
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KIAA08 SDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETSGQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSNPIGSAT
       .: .::      :   :..: :: ......... . .:      : .. .         .
KIAA05 ADCQEDR-----SDRTEDDGPLE-THGHSTAEEIMIKPMDESLLSTAQEN---------S
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KIAA08 ASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAEETLVE---EDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEGAAS
       . ..  :: :: ... ::..::.. ... :.   :.:...     ::  :  :      :
KIAA05 SRKEDRYSCYQELMVKSLMHLGKFEKNVSVQTVSENLNDS-----GIQSLKAE------S
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KIAA08 EEGEKGLFIQPEDAEEVVEVTTERSQDLCPQSLEDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEE
       .:... ..:. .:... ..   . .  .:  : .:  :.  : ..:  :  . .:: .  
KIAA05 DEADECFLIHSDDGRDKID---DSQPPFC--SSDDNESNSESAENGWDSGSNFSEETKPP
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KIAA08 EEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPE
       .  .    .....  :  : . : ..    :.. . : :       ..: ... :.    
KIAA05 RVPKYVLTDHKKDLLEVPEIKTEGDKFIPCENRCDSETE-------RKDPQNALAE----
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KIAA08 LRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIAL
          : . . .: .         : ..::..:    . . :...   ..:::.::::::::
KIAA05 ---PLDGNAQPSFP--------DVEEEDSESLAVMTEEGSDLEK--AKGNLSLLEQAIAL
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KIAA05 QAERG---CVFHNTYKELDRFLLEHLAGER-RQTKVIDMGGRQIFNNKHSPRPEKRETKC
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       : ::::::::::::::::::::::::: :.: :::::::::::::::::::.::::::::
KIAA05 PIPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKVRVPLEILAMHENVLKCPTPGCTGRGHVNSNRN
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       ::::::::::::::::: :..:.:   ::::. :...  .:        .:::.:     
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       .. :. : ..:::...:: :::.:: :::::::::::::: :   .:  .: :    : :
KIAA05 NF-PSQAITSPRATVSKEQEKFGKVPFDYASFDAQVFGKRPLIQTVQGRKTPPFPESKHF
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KIAA08 -----------------------QCFDYSQDAEAAHMAATA-ILNLSTRCWEMPENLSTK
                              . ..:.: .: .:.::.: :::::::: :  . ::.:
KIAA05 PNPVKFPNRLPSAGAHTQSPGRASSYSYGQCSEDTHIAAAAAILNLSTRCREATDILSNK
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       ::.: .:...:::::::::::::.:.:  ... : .:: .: :   .:..:  ..:    
KIAA05 PQSLHAKGAEIEVDENGTLDLSMKKNRILDKSAPLTSSNTSIP---TPSSSPFKTS----
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KIAA08 SSSMTSPQSSQA-SRQDEWDRPLDYTKPSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEEN
        : ...    ::   :. :: :..:.: .. . :: .:..:..             : ::
KIAA05 -SILVNAAFYQALCDQEGWDTPINYSK-THGKTEEEKEKDPVS-------------SLEN
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KIAA08 FEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADK
       .::.:.:::... . : :. ..:.::::.::::::::::::.:::::::::.::::::::
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KIAA08 SLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDPE
       .:..::::.: .:::::::::::::.::::::::::::::::.:.:::..:::..:::::
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KIAA08 LMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPTP
       : :::: :: : :::::::.:::.::::::::.::::. :::.:.:::  :.: : :: :
KIAA05 L-KCPVIGCDGQGHISGKYTSHRTASGCPLAAKRQKENPLNGASLSWKLNKQELPHCPLP
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KIAA08 GCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLNQ
       ::.: ::.:. :.:::::::::  . . ::::.: .:... :.:..  .:.::::..:..
KIAA05 GCNGLGHVNNVFVTHRSLSGCPLNAQVIKKGKVS-EELMTIKLKATGGIESDEEIRHLDE
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KIAA08 EIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALIQ
       ::..::::: ..:: :..::.::.:::.:::.:::::::::..::.:. ::.:::::::.
KIAA05 EIKELNESNLKIEADMMKLQTQITSMESNLKTIEEENKLIEQNNESLLKELAGLSQALIS
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KIAA08 SLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV
       :::.:.::.: :: ::::.:::.:::::::: .    :: : :::::::::.::.:
KIAA05 SLADIQLPQMGPISEQNFEAYVNTLTDMYSNLERDYSPECKALLESIKQAVKGIHV
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KIAA08 EHLVSKRKSHPLKLALDEGYGVDSDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAEAETSGQDEIHR
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KIAA07 TRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLHSLDPLREVRLAKEKEE-ESLNQGARAQPQAKAE-SK
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KIAA08 PETAE-GRSP-----------VKSHFGSNPIGS---ATASSKGSYSSYQGIIATSLLNLG
       ::  : .. :           .:.    :: :.   : : : : . . .:  :      :
KIAA07 PEEEEPAKLPAVTVTPAPVPDIKGDQKENPGGQEDVAEAESTGEMPGEEGETAGE----G
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       .  :..  :   :  :..   : :     .. ::: ...:::    :. ::.:   .   
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        .::.:  ..  .: ..:.. . :  :   ..:::::::::.::.:::::.:::::::::
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KIAA07 EEEKGNEEPLSLDWPETRQKQAIYLFLLPIVFPLWLTVPDVRRQESRKFFVFTFLGSIMW
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]