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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0827, 1608 aa vs ./tmplib.23663 library 1985897 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0973+/-0.0106; mu= -22.5645+/- 0.716 mean_var=477.3820+/-117.136, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 136 in 1/39 Lambda= 0.058700 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 314 42.3 0.00056 KIAA1816 ( 1162 res) fh16716 (1162) 286 40.0 0.0035 KIAA1819 ( 1173 res) hh00456 (1173) 280 39.5 0.0051 KIAA2018 ( 1685 res) ha04734 (1685) 279 39.5 0.0071 >>KIAA1048 ( 897 res) hh02560 (897 aa) initn: 511 init1: 160 opt: 314 Z-score: 163.3 bits: 42.3 E(): 0.00056 Smith-Waterman score: 350; 26.923% identity (51.099% similar) in 546 aa overlap (1138-1596:338-864) 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA08 MSVQNSGTQQQGNGLFQQGNEMMSLQSGNFLQQSSHSQAQLFHPQNPIADAQNLSQETQG . : :. . .:.. . :: ..:: . . 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