# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh02631.fasta.huge -Q ../query/KIAA0821.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0821, 1566 aa vs ./tmplib.23663 library 1985939 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9439+/-0.0105; mu= -2.8152+/- 0.710 mean_var=451.5367+/-106.814, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.060357 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0786 ( 1021 res) hk05490 (1021) 4235 384.5 6e-107 KIAA0768 ( 872 res) hk05006 ( 872) 2412 225.6 3.3e-59 KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854) 740 80.7 4.6e-15 KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364) 692 76.1 5.3e-14 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 552 64.0 2.7e-10 KIAA0686 ( 1200 res) fj02322 (1200) 355 46.7 3.4e-05 >>KIAA0786 ( 1021 res) hk05490 (1021 aa) initn: 4125 init1: 1971 opt: 4235 Z-score: 2011.9 bits: 384.5 E(): 6e-107 Smith-Waterman score: 4262; 63.234% identity (82.002% similar) in 1039 aa overlap (543-1566:5-1021) 520 530 540 550 560 570 KIAA08 PLTSTASPAATTPLRRAPLTTHPVGAINQLGPDLPPATAPVPSTRRPPAPNLHVSPELFC : ::: : .:. :: :. :: :: KIAA07 EGSKGTKPPPA---VSTTKIPPITNIFPLPERFC 10 20 30 580 590 600 610 620 630 KIAA08 EPREVRRVQWPATQQGMLVERPCPKGTRGIASFQCLPALGLWNPRGPDLSNCTSPWVNQV : . . ..:: ::.::.::::::::::: ::. :. . : :::.::::::::: ::::. 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KIAA07 LRNLTPGGKDSAARSLNK-------------AMVETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRA 40 50 60 70 740 750 760 770 780 790 KIAA08 ATMLLDVLEEGAFLLADNVREPARFLAAKENVVLEVTVLNTEGQVQELVFPQEEYPRKNS ::::: ..::.::.::::. . .:. :::. :.:::....: :: :.. . .. KIAA07 ATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLEDLKFP-ENMGHGST 80 90 100 110 120 130 800 810 820 830 840 850 KIAA08 IQLSAKTIKQNSRNGVVKVVFILYNNLGLFLSTENATVKLAGEAGPGGPGGASLVVNSQV :::::.:.:::.::: ..:.:.:::::: .::::::..::. :: . :..::: : KIAA07 IQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALST---NHSVIVNSPV 140 150 160 170 180 190 860 870 880 890 900 910 KIAA08 IAASINKE-SSRVFLMDPVIFTVAHL-EDKNHFNANCSFWNYSERSMLGYWSTQGCRLVE :.:.:::: :..:.: :::.::: :. .....:: :::::.::.:.: ::::::::::. KIAA07 ITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLT 200 210 220 230 240 250 920 930 940 950 960 970 KIAA08 SNKTHTTCACSHLTNFAVLMAHREI-YQGRINELLLSVITWVGIVISLVCLAICISTFCF .:::::::.:.::::::::::: :. .. ...:::.:::::::..::::: ::: :::: KIAA07 TNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCF 260 270 280 290 300 310 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA08 LRGLQTDRNTIHKNLCINLFLAELLFLVGIDKTQYEIACPIFAGLLHYFFLAAFSWLCLE .::::.:::::::::::.::.::::::.::..:. ::: .::.:::.::::::.:. :: KIAA07 FRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLE 320 330 340 350 360 370 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA08 GVHLYLLLVEVFESEYSRTKYYYLGGYCFPALVVGIAAAIDYRSYGTEKACWLRVDNYFI ::.::..::::::::.:: ::.:: :: .:::.:...::.:::::::.:.::::.:.::: KIAA07 GVQLYIMLVEVFESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFI 380 390 400 410 420 430 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA08 WSFIGPVSFVIVVNLVFLMVTLHKMIRSSSVLKPDSSRLDNIKSWALGAIALLFLLGLTW ::::::....:..:..:: ..:.::.. ...:::.:. :::::::..:::::: :::::: KIAA07 WSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWVIGAIALLCLLGLTW 440 450 460 470 480 490 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA08 AFGLLFINKESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQKKVHKEYSKCLRHSYCCIRSPPG ::::..::. .:.:::::: ::..::.:::.:::.:::::.:::.:::: ..:: . KIAA07 AFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLR-THCCSGKSTE 500 510 520 530 540 550 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA08 GTHGSLKTSAMRSNTRYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTESSFMAGDINSTPTLNRGTMGNH .. :: :::. :. :: ::.:::::::::::::::.::::..:::::. .::: . KIAA07 SSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNR----EG 560 570 580 590 600 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA08 LLTNPVLQPRGGTSPYNTLIAESVGFNPSSPPVFNSPGSYREPKHPLGGREACGMDTLPL ::.: .:.. :::::: KIAA07 LLNN--------------------------------------------ARDTSVMDTLPL 610 620 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA08 NGNFNNSYSLRSGDFPPGDGGPEPPRGRNLADAAAFEKMIISELVHNN----LRGSSSAA ::: .::::. ::.. .. :: : . .:.:: :..::. : : . .. KIAA07 NGNHGNSYSIASGEYL-SNCVQIIDRGYN-HNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSS 630 640 650 660 670 680 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA08 KGPPPPEPPVPPVPGGGGEEEA---GGPGGADRAE---IELLYKALEEPLLLPRAQSVLY . . :.: :..: . .. : .::... . ::: ::. :. KIAA07 EQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTEN 690 700 710 720 730 740 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA08 QSDLDESESCTAEDGATSR-PLSS--------PPGRDSLYASGANLRDSPSYPDSSPEGP .. .. .: . : :: . : :::::.: .: . . . KIAA07 HQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYTSMPTLAGVAATESVTTSTQ 750 760 770 780 790 800 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA08 SEALPPPPPAPPGPPE-IYYTSRPPALVARN---PLQGYYQVRRPSHEGYLAAPGLEGPG .: :::: : : .:: : : : .:: :. :::. : : .:... :. .: KIAA07 TE----PPPAKCGDAEDVYYKSMP-NLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDGFIVPPNKDGTP 810 820 830 840 850 1560 KIAA08 PDGD--GQMQLVTSL :.:. : .::::: KIAA07 PEGSSKGPAHLVTSL 860 870 >>KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854 aa) initn: 752 init1: 385 opt: 740 Z-score: 362.3 bits: 80.7 E(): 4.6e-15 Smith-Waterman score: 885; 27.071% identity (54.444% similar) in 990 aa overlap (572-1508:1907-2815) 550 560 570 580 590 600 KIAA08 LGPDLPPATAPVPSTRRPPAPNLHVSPELFCEPREVRR-VQWPATQQGMLVERPCPKGTR : :: .. . :: :. :. . :::::. KIAA02 KPGVIGRQCDRCDNPFAEVTTNGCEVNYDSC-PRAIEAGIWWPRTRFGLPAAAPCPKGSF 1880 1890 1900 1910 1920 1930 610 620 630 640 650 KIAA08 GIASFQCLPALGLWNPRGPDLSNCTSPWVNQV---AQKIKSGENAANI--ASELARHTRG : : .: : : : :.: :::: ... :.... .:.. . ...:: :. KIAA02 GTAVRHCDEHRG-WLP--PNLFNCTSITFSELKGFAERLQRNESGLDSGRSQQLALLLRN 1940 1950 1960 1970 1980 1990 660 670 680 690 700 710 KIAA08 SIY--AGDVSSSVKLMEQLLDILDAQLQALRPIERESAGKNYNKMHKRERTCKDYIKAVV . :: .:.::. :: : : . .::. .... .. . . .. KIAA02 ATQHTAGYFGSDVKVAYQL---------ATRLLAHESTQRGFGLSATQD---VHFTENLL 2000 2010 2020 2030 2040 720 730 740 750 760 770 KIAA08 ETVDNLLRPEALESWKDMNATEQVHTATMLLDVLEEGAFLLADNVREP--ARFLAAKENV .. . :: . :. .. :: .. ::. : : ::.:.:. . : . :. KIAA02 RVGSALLDTANKRHWELIQQTEG--GTAWLLQHYEAYASALAQNMRHTYLSPFTIVTPNI 2050 2060 2070 2080 2090 780 790 800 KIAA08 VLEVTVL---NTEG------------QVQEL----VFPQ---EEYP---RKNS---IQLS :. :. : : : : .: ..:. .: : : . : KIAA02 VISVVRLDKGNFAGAKLPRYEALRGEQPPDLETTVILPESVFRETPPVVRPAGPGEAQEP 2100 2110 2120 2130 2140 2150 810 820 830 840 850 KIAA08 AKTIKQNSRN-----GVVKVVFILYNNLGLFLSTENATVKLAGEAGPGGPGGASLVVNSQ . ... :. : . . :.: .:. .: . : . .. : : ..:. KIAA02 EELARRQRRHPELSQGEAVASVIIYRTLAGLLPHNYDPDKRSLRV-PKRP-----IINTP 2160 2170 2180 2190 2200 2210 860 870 880 890 900 910 KIAA08 VIAASINKESSRV--FLMDPVIFTVAHLEDKNHFNANCSFWNYS-ERSMLGYWSTQGCRL :.. :.. . . : :: :: ... . : :::.: : : ::..::.. KIAA02 VVSISVHDDEELLPRALDKPVTVQFRLLETEERTKPICVFWNHSILVSGTGGWSARGCEV 2220 2230 2240 2250 2260 2270 920 930 940 950 960 970 KIAA08 VESNKTHTTCACSHLTNFAVLMAHREIYQGRINELLLSVITWVGIVISLVCLAICISTFC : :..:..: :.:.:.::::: . .:.: : :...:.:.. ..:. : . . . KIAA02 VFRNESHVSCQCNHMTSFAVLMDVSRRENGEI--LPLKTLTYVALGVTLAALLLTFFFLT 2280 2290 2300 2310 2320 2330 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA08 FLRGLQTDRNTIHKNLCINLFLAELLFLVGIDKTQYEIACPIFAGLLHYFFLAAFSWLCL .:: :..... :..:: : ::.:.::.::.... .:: ..: :::...: .::: : KIAA02 LLRILRSNQHGIRRNLTAALGLAQLVFLLGINQADLPFACTVIAILLHFLYLCTFSWALL 2340 2350 2360 2370 2380 2390 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA08 EGVHLYLLLVEVFESEYSRTKYYYLGGYCFPALVVGIAAAIDYRSYGTEKACWLRVDNYF :..::: :.:: . . . ..::. :. ::...:.:...: ..::. ::: . . . 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KIAA02 -----------QP--SYIPF--LLREESALNPGQGPPGLGDPGSLFLEGQDQQHDPDTDS 2610 2620 2630 2640 2650 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA08 MDTLPLNGNFNNSY-SLRSGDFPPGDGGPEPPRGRNLADAAAFEKMIISELVHNNLRGSS . : :. . ..:: : .:.: . : . . ...... . :. :. KIAA02 DSDLSLEDDQSGSYASTHSSDSEEEE--EEEEEEAAFPGEQGWDSLLGPGAERLPLH-ST 2660 2670 2680 2690 2700 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA08 SAAKGPPPPEPPVPPVPGGGGEEEAGGPGGADRAEIELLYKAL-EEPLLLPRAQSVLYQS :: : . : : : ..: .:. :: . ... :: .: : : : KIAA02 PKDGGPGPGKAPWPGDFGTTAKESSGN--GAPEERLRENGDALSREGSLGPLPGSSAQPH 2710 2720 2730 2740 2750 2760 1450 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA08 DLDESESCTAEDGATSRPLSSPPGRDSLYASGANLRDSPSYPDSSPEGPSEALPPPPPAP ...: . : : : : .. : : :. :: :.. ::: : : KIAA02 KGILKKKCLPTISEKSSLLRLP-----LEQCTGSSRGS-----SASEG-SRGGPPPRPPP 2770 2780 2790 2800 2810 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA08 PGPPEIYYTSRPPALVARNPLQGYYQVRRPSHEGYLAAPGLEGPGPDGDGQMQLVTSL KIAA02 RQSLQEQLNGVMPIAMSIKAGTVDEDSSGSEFLFFNFLH 2820 2830 2840 2850 >>KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364 aa) initn: 762 init1: 518 opt: 692 Z-score: 343.2 bits: 76.1 E(): 5.3e-14 Smith-Waterman score: 767; 24.132% identity (51.823% similar) in 1152 aa overlap (572-1566:176-1301) 550 560 570 580 590 600 KIAA08 LGPDLPPATAPVPSTRRPPAPNLHVSPELFCEPREVRR-VQWPATQQGMLVERPCPKGTR : :. .: : :: :. :.:. :::.:. 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KIAA08 AILLSLRSLKSNVRGIHANVAAALGVAELLFLLGIHRTHNQLVCTAVAILLHYFFLSTFA 620 630 640 650 660 670 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA08 WLCLEGVHLYLLLVEVFESEYSRTKYYYLGGYCFPALVVGIAAAIDYRSYGTEKACWLRV :: ..:.::: . :: . . . ..:. :. ::...:.:...: ..::. ::. : KIAA08 WLFVQGLHLYRMQVEPRNVDRGAMRFYHALGWGVPAVLLGLAVGLDPEGYGNPDFCWISV 680 690 700 710 720 730 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA08 DNYFIWSFIGPVSFVIVVNLVFLMVTLHKMIRSSSVLKPDSSRLDNIKSWALGAIALLFL . .:::: ::: .:::.: ...... . ... .: : ...: .. ::.: KIAA08 HEPLIWSFAGPVVLVIVMNGTMFLLAARTSCSTGQREAKKTSAL-TLRS----SFLLLLL 740 750 760 770 780 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA08 LGLTWAFGLLFINKESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQKKVHKEY-SKCL--RHSY .. .: :::: .:. ... :: . . ..::. .... :.:. .. . :: . . KIAA08 VSASWLFGLLAVNHSILAFHYLHAGLCGLQGLAVLLLFCVLNADARAAWMPACLGRKAAP 790 800 810 820 830 840 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA08 CCIRSPPGGTHGSLKTSAMRSNT---RYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTESSFMAGDINST : :: :. ...:. .. : :... . : : ..: . . 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KIAA05 RASYIPASDGVQNFFQIVSNLLDEENKEKWED---AQQIYPGSIELMQVIEDFIHIVGMG 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 KIAA08 VREPARFLAAKENVVLEVTVLNTEGQVQELVFPQE------EYPRKNSIQLSA-KTI--- . . ::: . : . . . .. ::.. .. :.. .. :.: KIAA05 MMDFQNSYLMTGNVVASIQKLPAASVLTDINFPMKGRKGMVDWARNSEDRVVIPKSIFTP 700 710 720 730 740 750 810 820 830 840 850 860 KIAA08 ---KQNSRNGVVKVVFILYNNLGLFLST-ENATVKLAGEAGPGGPGGASLVVNSQVIAAS :. ....: . .::.:: :.: : .: :: .::..:... KIAA05 VSSKELDESSVFVLGAVLYKNLDLILPTLRNYTV-----------------INSKIIVVT 760 770 780 790 870 880 890 900 910 920 KIAA08 INKE--SSRVFLMDPVIFTVAHLEDKNHFNANCSFWNYSERSM-LGYWSTQGCRLVESNK : : .. :: . .::: . . .: : .:. :. . :: ::::::. : .. 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KIAA05 AFVGPAAAVVLVNMVIGILVFNKLVSRDGILDKKLKHRAGQMSEPHSGLTLKCAKCGVVS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA08 SWALGAIA-------------LLFLLGLTWAFGLLFI-NKESVVMAYLFTTFNAFQGVFI . ::.: . .: ::.::: ..: . .:.:... ::..:...:: : KIAA05 TTALSATTASNAMASLWSSCVVLPLLALTWMSAVLAMTDKRSILFQILFAVFDSLQGFVI 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1190 1200 1210 1220 KIAA08 FVFHCALQKKVHKEYSKC-LRHSYCCIR-----SPPGGTHGSLKTS-------AMRS--- . :: :...:. . .: ::. : : :.: :... :. : :: KIAA05 VMVHCILRREVQDAF-RCRLRNCQDPINADSSSSFPNG-HAQIMTDFEKDVDIACRSVLH 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA08 ------NTRYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTES-----SFMAGDINST-----PTLNRGTM . ::: ::: . .: .: :. : . :.. : :: . : KIAA05 KDIGPCRAATITGTLSRIS-LNDDEEEKGTNPEGLSYSTLPGNVISKVIIQQPTGLHMPM 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA08 GNHLLTNPVLQPRGGTSPYNTLIAESVGFNPSSPPVFNSPGSYREPKHPLGGREACGMDT . . :.:: :. KIAA05 SMNELSNPCLKKENSELRRTVYLCTDDNLRGADMDIVHPQERMMESDYIVMPRSSVNNQP 1270 1280 1290 1300 1310 1320 >>KIAA0686 ( 1200 res) fj02322 (1200 aa) initn: 306 init1: 137 opt: 355 Z-score: 185.2 bits: 46.7 E(): 3.4e-05 Smith-Waterman score: 357; 23.702% identity (56.885% similar) in 443 aa overlap (850-1266:703-1126) 820 830 840 850 860 870 KIAA08 FILYNNLGLFLSTENATVKLAGEAGPGGPGGASL-VVNSQVIAASINKESSRVFLMD-PV : .: .....:.. :.. .::... : : KIAA06 DVQDAEIMAGKSTCKLVQFTEYSSQQWFISGNNLPTLKNKVLSLSVKGQSSQLLTNDNEV 680 690 700 710 720 730 880 890 900 910 920 930 KIAA08 IFTVAHLEDKNHFNAN-CSFWNYSERSMLGYWSTQGCRLVESNKTHTTCACSHLTNFAVL .. . : . ... : .:: . : :. ..: :...: . .. :::::.. .:: KIAA06 LYRIYAAEPRIIPQTSLCLLWNQAAASWLS--DSQFCKVIEETADYVECACSHMSVYAVY 740 750 760 770 780 790 940 950 960 970 980 990 KIAA08 MAHREIYQGRINELLLSVITWVGIV-ISLVCLAICISTFCFLRGLQTDRNTIHKNLCINL : . :: ... :.. :: .:::. :: .. . . : . 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KIAA06 ERRYLLFFLLSWGLPAFVVILLIVILKGIYHQSMSQIYGLIHGDLCFIPNVYAALFTAAL 910 920 930 940 950 960 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA08 VNLVFLMVTLHKMIRSSSVLKPDSSRLDNI-----KSWALGAIALLF-LLGLTWAFGLLF : :. :.:.. .:.. .: ::. . :.. .. . : :: :...:: .: : KIAA06 VPLTCLVVVFVVFIHAYQV-KPQWKAYDDVFRGRTNAAEIPLILYLFALISVTWLWGGLH 970 980 990 1000 1010 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA08 INKESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQKKVHKEYSKCLRHSYCC-IRSPPGG---- . . : ::. ::..::...:. . : :... .. :: . . :: KIAA06 MAYRHFWMLVLFVIFNSLQGLYVFMVYFIL----HNQMCCPMKASYTVEMNGHPGPSTAF 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA08 -THGSLKTSA---MRSNTRYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTESSFMAGDINSTPTLNRGTM : :: : . ..:. :.. .. :. . .: .: . :.. .: KIAA06 FTPGSGMPPAGGEISKSTQNLIGAMEEVPPDWERASFQQ--GSQASPDLKPSPQNGATFP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA08 GNHLLTNPVLQPRGGTSPYNTLIAESVGFNPSSPPVFNSPGSYREPKHPLGGREACGMDT KIAA06 SSGGYGQGSLIADEESQEFDDLIFALKTGAGLSVSDNESGQGSQEGGTLTDSQIVELRRI 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1566 residues in 1 query sequences 1985939 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:17:33 2008 done: Thu Dec 18 15:17:34 2008 Total Scan time: 0.810 Total Display time: 0.500 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]