# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00220.fasta.huge -Q ../query/KIAA0818.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0818, 375 aa vs ./tmplib.23663 library 1987130 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6102+/-0.00634; mu= 22.0386+/- 0.435 mean_var=150.9441+/-34.598, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.104392 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1907 ( 1737 res) ah00504 (1737) 413 75.0 3.6e-14 KIAA1781 ( 974 res) fg06971(revised) ( 974) 343 63.9 4.3e-11 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 326 61.8 3.1e-10 KIAA0533 ( 1645 res) hg03784 (1645) 303 58.4 3.4e-09 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 292 56.1 8.3e-09 KIAA1857 ( 549 res) fk03350 ( 549) 258 50.6 2.5e-07 KIAA0548 ( 452 res) hh00769 ( 452) 247 48.8 7.2e-07 KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785) 242 49.6 2.4e-06 KIAA0246 ( 2589 res) ef02679 (2589) 239 49.1 3.2e-06 KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854) 214 45.4 4.5e-05 KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364) 189 41.0 0.00047 KIAA0534 ( 1028 res) hg03820s1 (1028) 172 38.2 0.0025 >>KIAA1907 ( 1737 res) ah00504 (1737 aa) initn: 355 init1: 187 opt: 413 Z-score: 346.3 bits: 75.0 E(): 3.6e-14 Smith-Waterman score: 511; 33.913% identity (56.522% similar) in 230 aa overlap (1-222:322-528) 10 20 30 KIAA08 PGYQGLHCETCKEGFYLNYTSGLCQPCDCS :..:: ::: : ::: : ::::.:: KIAA19 GQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFY---GPG-CQPCQCS 300 310 320 330 340 40 50 60 70 80 KIAA08 PHGALSIPCN-SSGKCQCKVGVIGSICDRCQDGYYGFSKNGCLPCQCNNRSA---SCDAL :. . :. ..:.:.:.:: :. :::: ::. : : : :. .. .:: KIAA19 SPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPL--CQLCGCSPAGTLPEGCDE- 350 360 370 380 390 400 90 100 110 120 130 140 KIAA08 TGACLNCQENSKGNHCEECKEGFYQSPDATKECLRCPCSAVTSTGS-CSIKSSELEPECD .: :: :: . : ::..:. :.. :. : : :. . . :. . : KIAA19 AGRCL-CQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPN----CQACTCDPRGALDQLCGAGGL-----C- 410 420 430 440 450 150 160 170 180 190 200 KIAA08 QCKDGYIGPNCNKCENGYYNFDSICRKCQCHGHVDPVKTPKICKPESGECINCLHNTTGF .:. :: : :..: :...: : : :.: .. . : :.::.: .: .::. 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KIAA08 VSGAC-TCPAGWRGTFCEHACPAGFF-GLDCRSAC-NCTAGAACDAVN--GSCLCPAGRR 1010 1020 1030 1040 1050 150 160 170 180 190 KIAA08 EPEC-DQCKDGYIGPNCNK---CENGYYNFDSICRKCQCH-GHVDPVKTPKICKPESGEC :.: . : : ::.. : :: . : . .:.: : . : . . : : . 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KIAA01 PCQCNTAAARCEQATGACV-CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWW-GPEC 170 180 190 200 210 120 130 140 150 160 170 KIAA08 TKECLRCPCSAVTSTGSCSIKSSELEPECDQCKDGYIGPNCN-KCENGYYNFDSI--CRK ..: .: : :: :.: : : :. : :. : : .. . : . KIAA01 QQQC-EC------VRGRCSAASGE----CT-CPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGR 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 KIAA08 CQCHGHVDPVKTPKICKPESGECINCLHNTTGFWCEN-CLEG-YVHDLEGNCIKKEVILP :. : .: :.:..: : .: . .: :.. :: : . .. : .: KIAA01 CK---HNEP------CSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPGTFGESCEQQCPHCRHGEA 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 KIAA08 TPEGSTILVSNASLTTSVPTPVINSTFTPTTLQTIFSVSTSENSTSALADVSWTQFNIII KIAA01 CEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQGSCDTVTGDCVCSAGYWG 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1857 ( 549 res) fk03350 (549 aa) initn: 96 init1: 96 opt: 258 Z-score: 223.5 bits: 50.6 E(): 2.5e-07 Smith-Waterman score: 283; 25.000% identity (50.833% similar) in 240 aa overlap (27-232:306-531) 10 20 30 40 50 KIAA08 PGYQGLHCETCKEGFYLNYTSGLCQPCDCSPHGALSIPCNSSGKCQCKVGVIGSIC : :. :. : ..: .:.:. .. : : KIAA18 LRPALGGTYVQRENLYKYFYAISNIEVIGRCKCNLHANLCSMREGSLQCECEHNTTGPDC 280 290 300 310 320 330 60 70 80 90 KIAA08 DRCQDGY--------------YGFSKNGCLP------CQCNNRSASC---DALTGA-CLN .:. .. .: : :.: :.: ..: : : :. . :.. KIAA18 GKCKKNFRTRSWRAGSYLPLPHG-SPNACAAAGSFGNCECYGHSNRCSYIDFLNVVTCVS 340 350 360 370 380 390 100 110 120 130 140 KIAA08 CQENSKGNHCEECKEGFYQSPDATKE----CLRCPCSAVTSTGSCSIKSSELEPECDQCK :..:..:.::..:. :.:.. .: . :..: :. . :: . .: :. :. KIAA18 CKHNTRGQHCQHCRLGYYRNGSAELDDENVCIECNCNQI---GSVHDRCNET-GFCE-CR 400 410 420 430 440 150 160 170 180 190 200 KIAA08 DGYIGPNCNKCENGYYNFDSICRKCQCHGHVDPVKTPKICKPESGECIN-----CLHNTT .: ::.:. : .: . . : : : . .:. ..: :.. : .. : KIAA18 EGAAGPKCDDCLPTHY-WRQGCYPNVCDD--DQL----LCQ-NGGTCLQNQRCACPRGYT 450 460 470 480 490 500 210 220 230 240 250 260 KIAA08 GFWCENCLEGYVHDLEG-NCIKKEVILPTPEGSTILVSNASLTTSVPTPVINSTFTPTTL : ::. . : : .: . : : KIAA18 GVRCEQPRCDPADDDGGLDCDRAPGAAPRPATLLGCLLLLGLAARLGR 510 520 530 540 >>KIAA0548 ( 452 res) hh00769 (452 aa) initn: 277 init1: 129 opt: 247 Z-score: 215.1 bits: 48.8 E(): 7.2e-07 Smith-Waterman score: 247; 30.508% identity (57.627% similar) in 118 aa overlap (6-119:65-178) 10 20 30 KIAA08 PGYQGLHCETCKEGFYLNYTSGLCQPCDCSPHGAL :. : : :.. : :.:. :. 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KIAA05 ---CINQSICEKCENLTTGKHCETCISGFYGDPTNGGKCQPCKCNGHASLCNTNTGKCFC 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 KIAA08 CQENSKGNHCEECK-EGFYQSPDATKECLRCPCSAVTSTGSCSIKSSELEPECDQCKDGY .. ::..:. :. :. ::. : KIAA05 TTKGVKGDECQLCEVENRYQGNPLRGTCYYTLLIDYQFTFSLSQEDDRYYTAINFVATPD 160 170 180 190 200 210 >>KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785 aa) initn: 404 init1: 162 opt: 242 Z-score: 205.7 bits: 49.6 E(): 2.4e-06 Smith-Waterman score: 354; 28.302% identity (49.434% similar) in 265 aa overlap (4-234:2140-2377) 10 20 30 KIAA08 PGYQGLHCETCKEGFYLNYTSGLCQPCDCSPHG .: .: .:: :. .. .:::.: :. .: KIAA08 SWAFLSCPPEDECANGHHDCNETQNCHDQPHGYEC-SCKTGYTMDNMTGLCRPV-CA-QG 2110 2120 2130 2140 2150 2160 40 50 60 70 80 90 KIAA08 ALSIPCNSSGKCQCKVGVIGSICDRCQDGYYGFSKNGCLPCQCNNRSASCDALTGA---C .. : .:.:. : .: :. :.:: : . : : .:: : KIAA08 CVNGSCVEPDHCRCHFGFVGRNCST--------------ECRCN-RHSEC-AGVGARDHC 2170 2180 2190 2200 2210 100 110 120 130 KIAA08 LNCQENSKGNHCEECKEGFYQSPDATKECLRCPCSAVTSTGS--C-----------SIKS : :....::.:::.: : : . : : :: : .: : :. 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