# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/sh06087.fasta.nr -Q ../query/KIAA0815.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0815, 1640 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7801350 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2056+/-0.000204; mu= 15.2691+/- 0.011 mean_var=113.6940+/-21.357, 0's: 25 Z-trim: 150 B-trim: 13 in 1/65 Lambda= 0.120283 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|72534475|dbj|BAE19678.1| hypothetical protein [ (1640) 13032 2274.3 0 gi|148922038|gb|AAI46387.1| Multiple EGF-like-doma (1541) 12186 2127.5 0 gi|194674113|ref|XP_873582.3| PREDICTED: similar t (1517) 10289 1798.3 0 gi|194208134|ref|XP_001915428.1| PREDICTED: multip (1544) 10151 1774.3 0 gi|123253804|emb|CAM21839.1| multiple EGF-like-dom (1572) 8890 1555.5 0 gi|122065510|sp|Q80V70.3|MEGF6_MOUSE RecName: Full (1572) 8883 1554.3 0 gi|148683015|gb|EDL14962.1| mCG130928 [Mus musculu (1572) 8883 1554.3 0 gi|126343616|ref|XP_001376358.1| PREDICTED: simila (1461) 8846 1547.9 0 gi|46395562|sp|O88281.1|MEGF6_RAT RecName: Full=Mu (1574) 8821 1543.6 0 gi|149024766|gb|EDL81263.1| rCG31589, isoform CRA_ (1484) 8413 1472.7 0 gi|73956667|ref|XP_546739.2| PREDICTED: similar to (1534) 8247 1443.9 0 gi|114550734|ref|XP_513736.2| PREDICTED: EGF-like- (1499) 8149 1426.9 0 gi|149024767|gb|EDL81264.1| rCG31589, isoform CRA_ (1398) 8098 1418.0 0 gi|119591860|gb|EAW71454.1| hCG1810754 [Homo sapie (1229) 7730 1354.1 0 gi|168273094|dbj|BAG10386.1| multiple EGF-like-dom (1229) 7722 1352.7 0 gi|71153516|sp|O75095.3|MEGF6_HUMAN RecName: Full= (1229) 7722 1352.7 0 gi|20269129|dbj|BAA32467.2| MEGF6 [Homo sapiens] (1246) 7722 1352.7 0 gi|123253811|emb|CAM21847.1| multiple EGF-like-dom (1192) 6908 1211.4 0 gi|189535960|ref|XP_693497.3| PREDICTED: similar t (1451) 6221 1092.3 0 gi|189525527|ref|XP_685976.3| PREDICTED: similar t (1310) 5365 943.7 0 gi|47229848|emb|CAG07044.1| unnamed protein produc (1408) 4993 879.2 0 gi|149603802|ref|XP_001517394.1| PREDICTED: simila ( 825) 4668 822.5 0 gi|118100990|ref|XP_417548.2| PREDICTED: similar t (1119) 4439 783.0 0 gi|210096330|gb|EEA44477.1| hypothetical protein B (1354) 4207 742.8 4.3e-211 gi|198428172|ref|XP_002125962.1| PREDICTED: simila (1614) 4165 735.6 7.5e-209 gi|210123225|gb|EEA70927.1| hypothetical protein B (1363) 3838 678.8 8.2e-192 gi|37590123|gb|AAH58571.1| Megf6 protein [Mus musc ( 656) 3629 642.1 4.3e-181 gi|115751480|ref|XP_785128.2| PREDICTED: similar t (1879) 3604 638.3 1.7e-179 gi|120537508|gb|AAI29205.1| Zgc:158328 [Danio reri (1339) 3313 587.7 2.2e-164 gi|74141030|dbj|BAE22092.1| unnamed protein produc ( 546) 3202 567.9 7.7e-159 gi|25058485|gb|AAH39980.1| Multiple EGF-like-domai ( 546) 3182 564.4 8.5e-158 gi|115620256|ref|XP_781397.2| PREDICTED: similar t (1496) 3064 544.5 2.3e-151 gi|156217401|gb|EDO38318.1| predicted protein [Nem ( 880) 2908 517.2 2.4e-143 gi|115712038|ref|XP_001185922.1| PREDICTED: simila ( 993) 2621 467.4 2.5e-128 gi|115751484|ref|XP_001181407.1| PREDICTED: simila (1509) 2565 457.9 2.8e-125 gi|148694120|gb|EDL26067.1| multiple EGF-like-doma (1001) 2552 455.4 1e-124 gi|7510359|pir||T27283 hypothetical protein Y64G10 (1620) 2501 446.9 6.3e-122 gi|109484863|ref|XP_001076145.1| PREDICTED: simila (1092) 2401 429.3 8.3e-117 gi|194206546|ref|XP_001917984.1| PREDICTED: simila (1044) 2396 428.4 1.5e-116 gi|119598161|gb|EAW77755.1| MEGF11 protein, isofor ( 991) 2383 426.1 6.8e-116 gi|149941638|dbj|BAF64841.1| MEGF11 [Homo sapiens] (1044) 2383 426.1 7e-116 gi|119598160|gb|EAW77754.1| MEGF11 protein, isofor ( 849) 2381 425.7 7.9e-116 gi|160410000|sp|A6BM72.2|MEG11_HUMAN RecName: Full (1044) 2382 426.0 7.9e-116 gi|119598162|gb|EAW77756.1| MEGF11 protein, isofor ( 969) 2381 425.8 8.5e-116 gi|176838325|dbj|BAB47410.2| MEGF11 protein [Homo ( 974) 2381 425.8 8.6e-116 gi|181336739|ref|NP_115821.2| multiple EGF-like-do (1044) 2380 425.6 1e-115 gi|219521392|gb|AAI72024.1| Unknown (protein for M ( 934) 2377 425.0 1.3e-115 gi|160410011|sp|Q80T91.3|MEG11_MOUSE RecName: Full (1091) 2377 425.1 1.5e-115 gi|74000897|ref|XP_544734.2| PREDICTED: similar to (1153) 2372 424.3 2.8e-115 gi|160409991|sp|A0JM12.1|MEG10_XENTR RecName: Full (1114) 2354 421.1 2.4e-114 >>gi|72534475|dbj|BAE19678.1| hypothetical protein [Homo (1640 aa) initn: 13032 init1: 13032 opt: 13032 Z-score: 12221.5 bits: 2274.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 13032; 100.000% identity (100.000% similar) in 1640 aa overlap (1-1640:1-1640) 10 20 30 40 50 60 KIAA08 PGRVPAGWTRRSGLRGATLGAGGKPGRSAPAATLGSADRARAPVAASYGARGGGGSGEPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 PGRVPAGWTRRSGLRGATLGAGGKPGRSAPAATLGSADRARAPVAASYGARGGGGSGEPP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 KIAA08 GPPVSRRAEEAPARTMSFLEEARAAGRAVVLALVLLLLPAVPVGASVPPRPLLPLQPGMP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 GPPVSRRAEEAPARTMSFLEEARAAGRAVVLALVLLLLPAVPVGASVPPRPLLPLQPGMP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 KIAA08 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:.::::..:::::::::.:.::.::::::.:::.:.:.:::::: gi|148 PGFFGDGCLQQCNCPTGVPCDPISGLCLCPPGRAGTTCDLDCRRGRFGPGCALRCDCGGG 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1560 1570 1580 1590 1600 1610 KIAA08 ADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREGGPLRLPENPSLAQGLSGHTARLQQTHIPERWTSEAL :::::.::::::::.: :::::: gi|148 ADCDPISGQCHCVDSYTGPTCREVPTQLSSIRPAPQHSSSKAMKH 1530 1540 1550 1560 1570 >>gi|126343616|ref|XP_001376358.1| PREDICTED: similar to (1461 aa) initn: 11306 init1: 8843 opt: 8846 Z-score: 8296.3 bits: 1547.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 8846; 72.517% identity (87.762% similar) in 1430 aa overlap (162-1591:6-1435) 140 150 160 170 180 190 KIAA08 GRRQPCVQALSHTVPVWKAGCGWQAWCVGHERRTVYYMGYRQVYTTEARTVLRCCRGWMQ ..:: :: :::::. : .:: .:: ::.: gi|126 MAEPLQQRTGYYTDYRQVYSMEYQTVYKCCPGWYQ 10 20 30 200 210 220 230 240 250 KIAA08 QPDEEGCLSAECSAGLCFHGGRCVPGSAQPCHCPPGFQGPRCQYDVDECRTHNGGCQHRC ..:::: :. :.::.:: :: :::: :::::::::::::::::::..::::::::: gi|126 LSNDEGCLYPVCNYGVCFNGGNCVEGSAQLCHCPPGFQGPRCQYDVDECQVHNGGCQHRC 40 50 60 70 80 90 260 270 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