# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk10195.fasta.huge -Q ../query/KIAA0809.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0809, 1385 aa vs ./tmplib.23663 library 1986120 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1130+/-0.0081; mu= -2.5223+/- 0.548 mean_var=266.0480+/-64.440, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 23 in 2/38 Lambda= 0.078631 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 323 51.5 2.7e-06 KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041) 303 49.0 9.9e-06 KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966) 302 48.9 1e-05 KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 302 49.0 1.2e-05 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 297 48.3 1.3e-05 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 297 48.5 2e-05 KIAA0444 ( 978 res) hg00035 ( 978) 285 46.7 2.4e-05 KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048) 247 42.4 0.0005 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 616 init1: 247 opt: 323 Z-score: 204.7 bits: 51.5 E(): 2.7e-06 Smith-Waterman score: 431; 23.916% identity (46.224% similar) in 1430 aa overlap (37-1373:401-1672) 10 20 30 40 50 60 KIAA08 QGKNLASEDPKKKRAQKPSHMRRNIRKLLREDQLQ-PVTKAAQQEELERRKRL--EQQRK :.::. : .: . :: :. .: :. . 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KIAA03 -PRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLK---LVHSPSPEVSASAPGAAPLTISS 1170 1180 1190 1200 1210 1220 900 910 920 930 940 950 KIAA08 DKRTSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTSIPAFSQRNWQPTLKGDEKPVASVRPVQ-STPIPM :: . :. ::: : :: : .: .::.:. : :. .:. KIAA03 P--LHVPSSLPG-----PAS--SPMPIP-----NSSPL----ASPVSSTVSVPLSSSLPI 1230 1240 1250 1260 960 970 980 990 1000 1010 KIAA08 -MPRHVPLGGSVSSASSTNPSMNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIPGLNSSTDVQARI .: .: . .:: : : .. :.. . .:. .:. :.:. . .. KIAA03 SVPTTLP---APASAPLTIP-ISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAP-- 1270 1280 1290 1300 1310 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA08 NAGESIHIIRGTKGTYIRTSDGRIFAVRATGKPKVPEDGRMAASGSQGPSCESTSNGRHS .: : : : : . . .. :.: . .: ..:. :. .:: KIAA03 -SGASPSASALTLGLATAPS---LSSSQTPGHPLL-----LAPTSSHVPGLNSTVA---P 1320 1330 1340 1350 1360 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA08 ASSPKAPDPEGLARPVSPDSPEIISELQQYADVAAARESRQSSPSTNAALPGPPAQLMDS : :: .:: : :..:. : . .: : . :. . : . .: . .. KIAA03 ACSPVLVPASALASPF-PSAPNPAP--AQASLLAPASSASQALATPLAPMAAPQTAILAP 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA08 SAVPGTALGTEPRLGGHCLNSSLLVTGQ-PCGDRHPVLDLRGHKRKLATP-PAAQESSRR : :. :. : :. . .:...: : : . : . :.: :: KIAA03 S--PAPPLAPLPVLAPSPGAAPVLASSQTPVPVMAPS-STPGTSLASASPVPAPTPVLAP 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA08 RSRKGHLPAPVQPYEHGYPVSGG-FAMPPVSLNHNLTTPFTSQAGENSLFMGST--PSYY : . ::::: : :.: .:. : .: .: ::. :: :. : KIAA03 SSTQTMLPAPV-PSPLPSPASTQTLALAP-ALAPTLGGSSPSQT--LSLGTGNPQGPFPT 1490 1500 1510 1520 1530 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA08 QLSNLLADARLV-FPVTTDPLVPAGPVSSSSTATSVTASNPSFMLNPSVP-GILPSYSLP : .: . :: :. : :.:. :.. ..: :.. . : : :. : : :...: KIAA03 QTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPLGPTQT-LSLAPAPP---LAPASPVGPAPAHTLT 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA08 F-----SQPLLSEPRM----FAPFPSPVLPSNLSRGMSIYPGY-MSPHAGYPAGGLLRSQ . : ::. . ..: : :.: .. ... :. .:: . . . : KIAA03 LAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGPAAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASG 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1360 1370 1380 KIAA08 VPPFDSHEVAEVGFSSNDDEDKDDDVIEVTGK . :. :... :... . KIAA03 AAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPSPPSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSL 1660 1670 1680 1690 1700 1710 >>KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041 aa) initn: 344 init1: 254 opt: 303 Z-score: 194.7 bits: 49.0 E(): 9.9e-06 Smith-Waterman score: 345; 31.313% identity (61.616% similar) in 198 aa overlap (634-825:104-282) 610 620 630 640 650 660 KIAA08 GVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQ ... . :.::. .:. . . : :.:.::: KIAA13 PYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQ 80 90 100 110 120 130 670 680 690 700 710 720 KIAA08 SLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPS . : ..:..: .:. .: :.:: . . :. :..: :. KIAA13 MVRCLDILEDYLIQRRY------------------TYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPD 140 150 160 170 730 740 750 760 770 780 KIAA08 NLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLV . ..::: :::: ::.:: .:. ..::..::: .: :: : .: ::.: .:::. KIAA13 S-DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI 180 190 200 210 220 230 790 800 810 820 830 KIAA08 ADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLN------PMLNFTRKEVENLLHFVEKEPAPQVS . . :....:. : :.. :..:.: . .... :::.:: KIAA13 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEE 240 250 260 270 280 290 840 850 860 870 880 890 KIAA08 LNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRTS KIAA13 DEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAK 300 310 320 330 340 350 >>KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966 aa) initn: 499 init1: 244 opt: 302 Z-score: 194.3 bits: 48.9 E(): 1e-05 Smith-Waterman score: 479; 26.164% identity (50.562% similar) in 623 aa overlap (219-825:227-702) 190 200 210 220 230 240 KIAA08 VKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKTLQVISFI-DVLFR--HTP :::: ::::::.: :.:. .. .. : : KIAA14 SREYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGP 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 KIAA08 VKTVLAIVPVNTLQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRA :.:.:..:. :: :: : ..: . : ..::: KIAA14 F---LVIAPLSTIPNWEREFRTWTE------------------LNVVVY---HGSQASRR 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 KIAA08 KVMADWVSEGGVLLMGYEMYRLLTLKKSFATGRPKKTKKRSHPVIIDLDEEDRQQEFRRE .. :::: .: :: : . . : .: .. . :. KIAA14 TIQL------------YEMY----FKD--PQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRN 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA08 FEKALCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVD . : ::: ::.::.:: . . ..:: . ...:.::: ::::.. : . .. KIAA14 I------PWRCVVI-DEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLH 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA08 FVRPDFLGTRQEFSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVL :..:. . .. : . : :. .: ..:. :...:. .. :: . . KIAA14 FLEPSRFPSETTFMQEF------GDL--KTEEQVQK-------LQAILKPMMLRRLKEDV 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 KIAA08 KIHLPAKEENVILVRLSKIQRDLYTQFMDR-FRDCGSSGWLG-----LNPLKAFCVCCKI . .: :::..: :.:..::. : .... : ...: . :: . . :: KIAA14 EKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCC-- 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 KIAA08 WNHPDVLYEALQKESLANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQGTKGKGEDSTLASSMGEATNS ::: .. : .: .::. . .:. : : : . KIAA14 -NHPYLINGAEEKI---------LEEF-KETHNAESP---------DFQLQA-------- 500 510 520 600 610 620 630 640 650 KIAA08 KFLQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKIL ..:..: :.::. .:. . : ..: KIAA14 -MIQAAG---------------------------------KLVLIDKLLPKLKAGGHRVL 530 540 660 670 680 690 700 710 KIAA08 VFSQSLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQF .::: . : ..:..: .:. : : :.:: . . :. :..: KIAA14 IFSQMVRCLDILEDYLIQRRYP------------------YERIDGRVRGNLRQAAIDRF 550 560 570 580 590 720 730 740 750 760 770 KIAA08 NDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYI . :.. ..::: :::: ::.:: .:. ..::..::: .: :: : .: ::.: : KIAA14 SKPDS-DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKI 600 610 620 630 640 780 790 800 810 820 830 KIAA08 YRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDL-------NPMLNFTRKEVENLLHFVEKEP :::.. . :....:. : :.. :.... : . ....::.:.:: KIAA14 YRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGA 650 660 670 680 690 700 840 850 860 870 880 890 KIAA08 APQVSLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEE KIAA14 LMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFW 710 720 730 740 750 760 >>KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432 aa) initn: 576 init1: 241 opt: 302 Z-score: 193.1 bits: 49.0 E(): 1.2e-05 Smith-Waterman score: 494; 24.015% identity (51.334% similar) in 787 aa overlap (51-825:538-1158) 30 40 50 60 70 80 KIAA08 AQKPSHMRRNIRKLLREDQLQPVTKAAQQEELERRKRLEQQRKDYAAPIPTVPLEFLPEE .::. ::..:. : . . . . .:. :. KIAA15 LPSGQYTEAEEFFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMR-HFFHED 510 520 530 540 550 560 90 100 110 120 130 140 KIAA08 IALRASDGPQLPPRVLAQEVICLDSSSGSEDEKSSRDEVIELSSGEEDTLHIVDSSESVS . : : : .... :: : : :. ... . : . .: ::. .. KIAA15 ------EEPFNPDYVEVDRI--LDESH-SIDKDNGEPVIYYLV--KWCSLPYEDSTWELK 570 580 590 600 610 150 160 170 180 190 KIAA08 EDDEEEEKGGTHVNDVLNQRDALGRVLVNLNHPPEEENVFLAPQLAR--AVKPHQIGGIR :: .: . . . . ... : : :: . ... :. . .. .:. :. KIAA15 EDVDEGKI--REFKRIQSRHPELKR--VNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVN 620 630 640 650 660 670 200 210 220 230 240 250 KIAA08 FLYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKTLQVISFIDVLFR---HTPVKTVLAIVPV .: :. . .:::: ::::::.: :.:.. .. : : :.:.:. KIAA15 WLL---------FNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFLQEVYNVGIHGP---FLVIAPL 680 690 700 710 260 270 280 290 300 310 KIAA08 NTLQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRAKVMADWVSEG .:. :: ::: : :.. . : ..::: KIAA15 STITNWEREFNTWT-------------EMNTIVY--------HGSLASRQ---------- 720 730 740 320 330 340 350 360 370 KIAA08 GVLLMGYEMYRLLTLKKSFATGRPKKTKKRSHPVIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGP ... :::: . . . . . . .:.. : :. :.: : KIAA15 --MIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWR-------C---- 750 760 770 780 790 380 390 400 410 420 430 KIAA08 DVVICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTR :: ::.::.:: . . ..::.. ...:.::: ::::.. : . .. :..:. . .. KIAA15 --VIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSE 800 810 820 830 840 850 440 450 460 470 480 490 KIAA08 QEFSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEEN .:: . : :. .: ..:. :...:. .. :: . .. .: :.:. KIAA15 SEFLKDF------GDL--KTEEQVQK-------LQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQET 860 870 880 890 500 510 520 530 540 550 KIAA08 VILVRLSKIQRDLYTQFMDRFRDCGSSGWLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLYEALQKESL .: :.:..::. : .... . :.: : . : :..: .. .. KIAA15 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKG-AGHT------------NMPNLLNTMMELRKC 900 910 920 930 940 560 570 580 590 600 610 KIAA08 ANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQGTKGKGEDSTLASSMGEATNSKFLQGVGFNPFQERGN :. : .: : :.: . :.: . KIAA15 CNH------------------PYLINGAEE--------------KIL-----TEFRE-AC 950 960 620 630 640 650 660 670 KIAA08 NIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQSLSTLALIEEFL .:. ... . ...... :.::. .:. . : :.:.::: . : ..:..: KIAA15 HIIPHDF-------HLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYL 970 980 990 1000 1010 1020 680 690 700 710 720 730 KIAA08 GKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTR .: : . : :.:: . . :. :..:. :.. ..::: :: KIAA15 IQR-----------------RYL-YERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDS-DRFVFLLCTR 1030 1040 1050 1060 740 750 760 770 780 790 KIAA08 AGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLVADYTLEKKIYDR :: ::.:: .:. ..::..::: .: :: : .: ::.: .:::.. . :....:. KIAA15 AGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 800 810 820 830 840 KIAA08 QISKQGMSDRVVDDLNP-------MLNFTRKEVENLLHFVEKEPAPQVSLNVKGIKESVL : :.. :..... . .:..::.:.:: KIAA15 ASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDI 1130 1140 1150 1160 1170 1180 850 860 870 880 890 900 KIAA08 QLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRTSVPYTRPSYAQY KIAA15 DQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 >>KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561 aa) initn: 392 init1: 234 opt: 297 Z-score: 192.6 bits: 48.3 E(): 1.3e-05 Smith-Waterman score: 351; 24.765% identity (50.281% similar) in 533 aa overlap (631-1145:1098-1560) 610 620 630 640 650 660 KIAA08 FLQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILV . ... .: :. : :. . . : ..:. KIAA12 NRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLI 1070 1080 1090 1100 1110 1120 670 680 690 700 710 720 KIAA08 FSQSLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFN .:: . :.::.. :. .:.:::::. ::. .. .:. KIAA12 YSQMTRMIDLLEEYM------------------VYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQ 1130 1140 1150 1160 730 740 750 760 770 780 KIAA08 DPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIY . ... ..:::::::: ::.:: .:. :. .:..::: : ::. :..: :: : .: KIAA12 NRNDI--FVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVY 1170 1180 1190 1200 1210 1220 790 800 810 820 830 KIAA08 RLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPMLNFTR-KEVENLLHFVEKEPAPQVSLN ::. :.:..: .: :. .. :.. : . . ::: .:: KIAA12 RLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLL-------------- 1230 1240 1250 1260 1270 840 850 860 870 880 890 KIAA08 VKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEED-----K . . :. : .: .: ..: :: .. : :: : ::. :.. . KIAA12 ---LDDEELE----KKLRLRQEEKRQQEE--TNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRR 1280 1290 1300 1310 1320 900 910 920 930 940 950 KIAA08 RTSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTSIPAFSQRNWQPTLKGDEKPVASVRPVQSTPIPMMPR . .: . : . :..:.: : ::.. . :: .. .:. . KIAA12 KEGVNLVIP----FVPSADNSNLSAD------------GDDSFI-SVDSAMPSPFSEISI 1330 1340 1350 1360 960 970 980 990 1000 1010 KIAA08 HVPLG-GSVSSASSTNPSMNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIPGLNSSTDVQARINAG : ::. :.. . . . :. :. .:.. : : : .:. :. KIAA12 SSELHTGSIPLDESSSDML---VIVDDPASSAPQSRATNSPASITG--SVSDTVNGISIQ 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA08 ESIHIIRGTKGTYIRTSDGRIFAVRATGKPKVPEDGRMAASGSQGPSCESTSNGRHSASS : :: .. : .....:: . .: ...:: . . ... .... KIAA12 EMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGR----SRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAA 1430 1440 1450 1460 1470 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA08 PKAPDPEGLARPVSPDSPEIISELQQYADVAAARESRQSSP-----STNAALPGPPAQL- : .... .: .:: . . : . : .: : ::: : . .:: : .: KIAA12 AYAAYGYNVSKGISASSP-LQTSLVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLH 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA08 MDSSAVPGTAL-----GTEPRLGGHCLNSSLLVTGQPCGDRHPVLDLRGHKRKLATPPAA : :: .: . . ::.: : KIAA12 MTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR 1540 1550 1560 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 536 init1: 246 opt: 297 Z-score: 189.4 bits: 48.5 E(): 2e-05 Smith-Waterman score: 462; 25.437% identity (50.238% similar) in 629 aa overlap (219-825:758-1233) 190 200 210 220 230 240 KIAA08 VKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKTLQVISFI-DVLFRHTPVK :::: ::::::.: :.:. ..:. : .. KIAA03 SRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILL--TGIR 730 740 750 760 770 780 250 260 270 280 290 300 KIAA08 -TVLAIVPVNTLQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRAK : :.:..:. :: :: : .... : .. :: KIAA03 GPFLIIAPLSTIANWEREFRTWTD--------------------INVVV-YHGSLISRQ- 790 800 810 820 310 320 330 340 350 360 KIAA08 VMADWVSEGGVLLMGYEMYRLLTLKKSFATGRPKKTKKRSHPVIIDLDE------EDRQQ ... :::: .. : :: . : . .: .. : KIAA03 -----------MIQQYEMY----FRDS--QGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAI 830 840 850 860 370 380 390 400 410 420 KIAA08 EFRREFEKALCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEY :.: : :: ::.::.:: . . ..:: . ...:.::: ::::.. : KIAA03 EWR-------C------VIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL 870 880 890 900 910 430 440 450 460 470 480 KIAA08 WCMVDFVRPDFLGTRQEFSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRR . .. :..: . ... : . : :. .: ..:. :...:. .. :: KIAA03 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEF------GDL--KTEEQVQK-------LQAILKPMMLRR 920 930 940 950 490 500 510 520 530 KIAA08 GHTVLKIHLPAKEENVILVRLSKIQRDLYTQFMDR-F----RDCGSSGWLGL-NPLKAFC . .. .: :::..: :.:..::. : .... : . :... .: : . . KIAA03 LKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELR 960 970 980 990 1000 1010 540 550 560 570 580 590 KIAA08 VCCKIWNHPDVLYEALQKESLANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQGTKGKGEDSTLASSMG :: ::: .. :: . . .: KIAA03 KCC---NHPYLI------------------------------------KGAEEKI---LG 1020 1030 600 610 620 630 640 650 KIAA08 EATNSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKL : .. .:: :.:. . ...... :.::. .:. . KIAA03 EFRDT-------YNPA------------ASDF---HLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAG 1040 1050 1060 1070 660 670 680 690 700 710 KIAA08 GDKILVFSQSLSTLALIEEFL-GKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERE : :.:.::: . : ..:..: :: . : :.:: . . :. KIAA03 GHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYL-------------------YERIDGRVRGNLRQ 1080 1090 1100 1110 720 730 740 750 760 770 KIAA08 RLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQ :..:. :.. ..::: :::: ::.:: .:. ..::..::: .: :: : .: :: KIAA03 AAIDRFSKPDS-DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 780 790 800 810 820 KIAA08 KKPCYIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNP-------MLNFTRKEVENLLH .: .::::. . :....:: : :.. :..... . ....::.:.:: KIAA03 NKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 830 840 850 860 870 880 KIAA08 FVEKEPAPQVSLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAA KIAA03 RGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGRGSTFAKASFVASGNRTDISL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 >>KIAA0444 ( 978 res) hg00035 (978 aa) initn: 257 init1: 228 opt: 285 Z-score: 187.8 bits: 46.7 E(): 2.4e-05 Smith-Waterman score: 334; 32.683% identity (62.927% similar) in 205 aa overlap (632-831:41-223) 610 620 630 640 650 660 KIAA08 LQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVF ......: :..:: ..... : ..:.: KIAA04 MDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIF 20 30 40 50 60 70 670 680 690 700 710 720 KIAA08 SQSLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFND :: . : :.:.:: : .: . : :.::. . :.. :..:: KIAA04 SQMTKMLDLLEDFL-----------EYEGYK-------YERIDGGITGGLRQEAIDRFNA 80 90 100 110 730 740 750 760 770 780 KIAA08 PSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYR :. . :::::::: ::.:: :. :...:..::: .: :: :..: ::.: .::: KIAA04 PGA-QQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYR 120 130 140 150 160 170 790 800 810 820 830 KIAA08 LVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPML-----NFTRKEVENLLHFVEKEPAPQV .:. ..:..: . :. .. :: : : ..:..:....:.: .: KIAA04 FVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV---RPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDD 180 190 200 210 220 840 850 860 870 880 890 KIAA08 SLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRT KIAA04 VEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISK 230 240 250 260 270 280 >>KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048 aa) initn: 471 init1: 183 opt: 247 Z-score: 164.1 bits: 42.4 E(): 0.0005 Smith-Waterman score: 505; 26.485% identity (52.167% similar) in 623 aa overlap (188-802:516-1017) 160 170 180 190 200 210 KIAA08 NQRDALGRVLVNLNHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGF ..::.: :. .: ::.. :. 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KIAA11 --------SGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQH--------- 880 890 900 910 690 700 710 720 730 740 KIAA08 GAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRV :.::::.: :: .::..:: ... ..:::::.:: ::.:: .:: : KIAA11 ---------RYLRLDGKTQISERIHLIDEFN--TDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVV 920 930 940 950 960 750 760 770 780 790 800 KIAA08 VVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDD .. : . :: .: :: : .: :: : . .:... :.:... .:..: . KIAA11 ILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESML--KINQQKLKLEQDMT 970 980 990 1000 1010 1020 810 820 830 840 850 860 KIAA08 LNPMLNFTRKEVENLLHFVEKEPAPQVSLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESL KIAA11 TVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL 1030 1040 1385 residues in 1 query sequences 1986120 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:16:57 2008 done: Thu Dec 18 15:16:59 2008 Total Scan time: 0.790 Total Display time: 0.560 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]