# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04449mrp2.fasta.nr -Q ../query/KIAA0807.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0807, 1329 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7770257 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5862+/-0.000214; mu= 9.7186+/- 0.012 mean_var=173.8120+/-33.203, 0's: 39 Z-trim: 276 B-trim: 245 in 1/63 Lambda= 0.097282 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119627354|gb|EAX06949.1| microtubule associated (1798) 8882 1260.3 0 gi|62287152|sp|Q6P0Q8.2|MAST2_HUMAN RecName: Full= (1798) 8882 1260.3 0 gi|119627353|gb|EAX06948.1| microtubule associated (1797) 8865 1257.9 0 gi|41350925|gb|AAH65499.1| Microtubule associated (1797) 8865 1257.9 0 gi|109003951|ref|XP_001105249.1| PREDICTED: microt (1464) 8522 1209.7 0 gi|109003948|ref|XP_001105012.1| PREDICTED: microt (1502) 8522 1209.7 0 gi|109003938|ref|XP_001105101.1| PREDICTED: microt (1679) 8522 1209.7 0 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