# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04165mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0806.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0806, 1073 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986432 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7936+/-0.00632; mu= 25.9906+/- 0.430
 mean_var=146.4208+/-35.702, 0's: 0 Z-trim: 42  B-trim: 4 in 1/39
 Lambda= 0.105992

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                     ( 640)  476 85.3   3e-17
KIAA0416  ( 529 res)   hh00236                     ( 529)  384 71.1 4.7e-13
KIAA0862  ( 584 res)   hk06532                     ( 584)  378 70.2 9.3e-13
KIAA0644  ( 887 res)   hj03618                     ( 887)  352 66.6 1.7e-11
KIAA0343  ( 1187 res)   hg01457                    (1187)  352 66.9 1.9e-11
KIAA0756  ( 1222 res)   ff01911                    (1222)  338 64.7 8.7e-11
KIAA1639  ( 2584 res)   af14886                    (2584)  312 61.4 1.8e-09
KIAA1496  ( 920 res)   fj09513                     ( 920)  306 59.6 2.3e-09
KIAA1469  ( 662 res)   fj01881                     ( 662)  300 58.4 3.8e-09
KIAA1916  ( 542 res)   hg01117                     ( 542)  292 57.0 8.2e-09
KIAA1904  ( 821 res)   af00058                     ( 821)  290 57.1 1.2e-08
KIAA0992  ( 772 res)   hk07554                     ( 772)  281 55.6   3e-08
KIAA1297  ( 2242 res)   fg03883                    (2242)  282 56.7 4.2e-08
KIAA1497  ( 730 res)   hg01608                     ( 730)  274 54.5 6.2e-08
KIAA1568  ( 1380 res)   fh22308                    (1380)  271 54.6 1.1e-07
KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                    (1496)  271 54.7 1.1e-07
KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                    (1559)  271 54.7 1.2e-07
KIAA1355  ( 1189 res)   fj01564                    (1189)  268 54.0 1.4e-07
KIAA1246  ( 832 res)   hh00149a                    ( 832)  264 53.1 1.9e-07
KIAA1514  ( 1598 res)   fh00815(revised)           (1598)  263 53.5 2.7e-07
KIAA0405  ( 706 res)   hg01274                     ( 706)  259 52.2   3e-07
KIAA1437  ( 811 res)   hk07206                     ( 811)  254 51.5 5.4e-07
KIAA1484  ( 700 res)   fj06928                     ( 700)  250 50.8 7.8e-07
KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                    (1618)  244 50.6 2.1e-06
KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)            ( 966)  238 49.2 3.2e-06
KIAA1465  ( 785 res)   fh13187                     ( 785)  233 48.3 4.9e-06
KIAA1061  ( 693 res)   hj00491                     ( 693)  232 48.0 5.2e-06
KIAA0848  ( 988 res)   hk05607                     ( 988)  231 48.2 6.7e-06
KIAA1163  ( 437 res)   hj05329                     ( 437)  226 46.7 8.2e-06
KIAA0147  ( 1630 res)   ha01022s1                  (1630)  215 46.2 4.5e-05
KIAA1263  ( 850 res)   hj00608                     ( 850)  207 44.4   8e-05
KIAA1851  ( 523 res)   hg04492                     ( 523)  200 42.9 0.00014
KIAA1531  ( 1206 res)   ph00937                    (1206)  202 43.9 0.00016
KIAA0931  ( 1258 res)   bf00159                    (1258)  201 43.8 0.00018
KIAA1225  ( 1371 res)   fh04221s1                  (1371)  198 43.4 0.00025
KIAA1854  ( 572 res)   fg02232                     ( 572)  189 41.3 0.00046
KIAA1556  ( 1595 res)   fh18619                    (1595)  188 42.0 0.00077
KIAA1628  ( 980 res)   fh14247(revised)            ( 980)  177 39.9   0.002
KIAA0231  ( 823 res)   fk16230                     ( 823)  175 39.5  0.0024
KIAA0606  ( 1369 res)   ph00195                    (1369)  164 38.2  0.0093


>>KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                          (640 aa)
 initn: 523 init1: 162 opt: 476  Z-score: 401.6  bits: 85.3 E(): 3e-17
Smith-Waterman score: 524;  29.284% identity (57.701% similar) in 461 aa overlap (194-644:53-485)

           170       180       190       200       210       220   
KIAA08 ISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLP
                                     : ...:. . :    :. .  .:  :    
KIAA15 FDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICV----RKNLREVPDGIST--
             30        40        50        60            70        

           230       240       250       260       270       280   
KIAA08 HLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNL
       . ..:.:..:.:.:..  .:. :  :. :...:: :  .. ::: :: :.. :::  : :
KIAA15 NTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRL
         80        90       100       110       120       130      

           290       300       310       320        330       340  
KIAA08 TRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLS-YNQLTRLDESAFVGL
       : . .: .  :  :..:.. .: :: :   :..    : .:::.  ..:. ..:.:: ::
KIAA15 TTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGL
        140       150       160       170       180       190      

            350       360       370       380       390       400  
KIAA08 SLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQ
       : :. :::.   . .: .  .  : .:. ::: .:..: ::. .:  : ::  : :: . 
KIAA15 SNLRYLNLAMCNLREIPN--LTPLIKLDELDLSGNHLS-AIRPGS--FQGLMHLQKLWMI
        200       210         220       230          240       250 

            410       420       430       440        450       460 
KIAA08 GNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQTH-LKELILNTSSLLCDCHLKW
        .::. : ..:: .:.:: ...: .: .  . .. :.  : :... :. .   :.: . :
KIAA15 QSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILW
             260       270       280       290       300       310 

             470        480       490       500       510       520
KIAA08 LLQWLVDNNFQHSVNVS-CAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRG
       :  :. :   ....  . :  :  : :. : ..: . :.:     : :   :  . . .:
KIAA15 LSWWIKDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYIGELDQNYFTC---YAPVIVEPPADLNVTEG
             320       330       340       350          360        

              530       540       550       560       570       580
KIAA08 MNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNF
       : . : : : :.: . .: .  . . . . .     ::       :.   . :.. ::. 
KIAA15 MAAELKCRA-STSLTSVSWITPNGTVMTHGAYK---VRI------AVLSDGTLNFTNVTV
      370        380       390       400                410        

              590       600       610           620       630      
KIAA08 TDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMD----LTIRTGAMARLECAAEGH
        : : : :.:.:  : : . .: :.:.   .   ::..    .:..:   .. :  .  .
KIAA15 QDTGMYTCMVSNSVG-NTTASATLNVTAATT---TPFSYFSTVTVETMEPSQDEARTTDN
      420       430        440          450       460       470    

           640       650       660       670       680       690   
KIAA08 ---PAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLS
          :.: ..:.                                                 
KIAA15 NVGPTPVVDWETTNVTTSLTPQSTRSTEKTFTIPVTDINSGIPGIDEVMKTTKIIIGCFV
          480       490       500       510       520       530    

>>KIAA0416  ( 529 res)   hh00236                          (529 aa)
 initn: 314 init1: 256 opt: 384  Z-score: 326.2  bits: 71.1 E(): 4.7e-13
Smith-Waterman score: 384;  32.203% identity (62.034% similar) in 295 aa overlap (203-492:77-365)

            180       190       200       210       220        230 
KIAA08 PRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIF-KLPHLQFLELK
                                     : ..: .:... .    : .. .: .:.: 
KIAA04 CPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLD
         50        60        70        80        90       100      

             240       250       260       270       280       290 
KIAA08 RNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWL
       .:.:. :.  .:::: .:. : .. : :  : . .:  : :...:.:  :.:. ..   .
KIAA04 HNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELF
        110       120       130       140       150       160      

             300       310        320       330       340       350
KIAA08 YGLRMLQQLYVSQNAIERISPDA-WEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNL
       :::: :: :.. .:... :     :. :. :  :::: :.:  : ...:.::  :..:.:
KIAA04 YGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWD-CRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHL
        170       180       190        200       210       220     

              360       370       380       390       400       410
KIAA08 GDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSIT
         :..:.:  . :  ::.:.:: :. :.::  .  . :   :  .: :: : ::.::.: 
KIAA04 EHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKIS-NLTCGMEWTWG--TLEKLDLTGNEIKAID
         230       240       250        260         270       280  

              420       430        440       450       460         
KIAA08 KKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAF-SQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWL--V
         .:  . .:. : ..:: . :.. . . :   :  . :. .   :. ..  : .::   
KIAA04 LTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSF
            290       300       310       320       330       340  

       470       480       490       500       510       520       
KIAA08 DNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTC
       .. ..::.   :  :.   :..::.                                   
KIAA04 QGRWEHSI--LCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISS
            350         360       370       380       390       400

>>KIAA0862  ( 584 res)   hk06532                          (584 aa)
 initn: 325 init1: 119 opt: 378  Z-score: 320.9  bits: 70.2 E(): 9.3e-13
Smith-Waterman score: 381;  27.228% identity (57.178% similar) in 404 aa overlap (52-449:141-527)

              30        40        50        60        70        80 
KIAA08 LGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLL
                                     ::  .: . :.  .   :   :  .:   :
KIAA08 KRSIHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLA---LSENSLTSLPDSL
              120       130       140       150          160       

                90        100       110       120       130        
KIAA08 P--PDTAILDFSHNRLSNW-NISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHN
              .::. ::.: .  ..  . ..:  . . .:..: .    .  :....::. .:
KIAA08 DNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIREN
       170       180       190       200       210       220       

      140       150       160       170       180       190        
KIAA08 IIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNL
        : .. :.  ..   : .::.. : . ..        :.  :.:..:..  :    . ::
KIAA08 KIKQLPAEIGELC-NLITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLP-DTIGNL
       230       240        250       260       270        280     

      200       210       220       230       240       250        
KIAA08 SSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNG
       :: :  . :  ::.: :: .. :   :. :.:. : :. .    ...: .: :: . :: 
KIAA08 SS-LSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNC
          290       300       310       320       330       340    

      260       270       280       290       300       310        
KIAA08 ISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPD--AWE
       ..    :.   ....  :..::: ....  : .   ..:..: ...: .  .  :  .: 
KIAA08 FQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWT
          350       360       370       380       390       400    

        320       330       340       350       360       370      
KIAA08 FCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRN
           . ::.:. ::::.. :..  ::  :: : :..: . ..  :.   : .:. :::..
KIAA08 ---SMVELNLATNQLTKIPEDV-SGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGN-LRKLRELDLEE
             410       420        430       440        450         

        380       390       400       410        420       430     
KIAA08 NEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIG-LESLEHLDLNNNAIMSIQE
       :..    :.  . .: : .: ::.: .::. .. .   :: : .: :: :..: .  . :
KIAA08 NKL----ESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRG--IGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE
     460           470       480       490         500       510   

         440       450       460       470       480       490     
KIAA08 NAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDL
       .  .  .:.:: ::                                              
KIAA08 EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQF
           520       530       540       550       560       570   

>>KIAA0644  ( 887 res)   hj03618                          (887 aa)
 initn: 388 init1: 179 opt: 352  Z-score: 298.1  bits: 66.6 E(): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 449;  26.953% identity (54.492% similar) in 512 aa overlap (2-502:58-492)

                                            10        20        30 
KIAA08                              ATSRSRGKMAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSR
                                     :.  :.: .  :: . .: . . :.    :
KIAA06 TKDGGGAGRRCEVRKRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIRPLHAGREAMEAARAL---R
        30        40        50        60        70        80       

              40        50        60         70        80        90
KIAA08 LLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPL-LDCSRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDF
       ::...  . : ::  .  .::  :.:. :  : :. : :     :..     : :. :  
KIAA06 LLLVV-CGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGL-----RVV-----PKTSSLPS
            90       100       110       120                 130   

              100       110       120        130       140         
KIAA08 SHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFG-EPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQ
        :. :.              ... : .:.:  :  .  ...  :.: .: :  .. ....
KIAA06 PHDVLT-------------YSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFE
                        140       150       160       170       180

     150       160       170        180       190       200        
KIAA08 FYPALESLDLSSNIISEIKTSSF-PRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLN
           :: : :..:... .  ... :  .:. :  ..:.:. :  : :..: : :. ..:.
KIAA06 KLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLES-LVKLRLD
              190       200       210       220       230          

      210       220        230       240       250       260       
KIAA08 RNRMSMIPPKIFK-LPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGIS-KLKDGA
        : .. .:  .:  : .: .:.:. :::...   .:  : .:: :... : .. .:. .:
KIAA06 GNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAA
     240       250       260       270       280       290         

        270       280       290       300       310       320      
KIAA08 FFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDL
        :.                        :: :..: .: :......:  ..   ::. :.:
KIAA06 TFA-----------------------PLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSL
     300                              310       320       330      

        330       340       350       360       370       380      
KIAA08 SYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDA
         ::::.:   :: ::  :..: :  ::....  .... : .:..::: .::.: :.. :
KIAA06 RGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELS-ALHPA
        340       350       360       370       380       390      

        390       400       410       420       430       440      
KIAA08 SEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQTHLKEL
       .  :. :  : .: :..: .....   : .  .: .:::..:.                 
KIAA06 T--FGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNG-----------------
           400       410       420       430                       

        450       460       470          480       490          500
KIAA08 ILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQH---SVNVSCAHPEWLAGQSILNVD---LKDFVC
               :::.:. : .:. : . :    .: :.: ::  : :. .  .:   :..  :
KIAA06 ------WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSC
              440       450       460       470       480       490

              510       520       530       540       550       560
KIAA08 DDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYW
        :                                                          
KIAA06 ADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARE
              500       510       520       530       540       550

>>KIAA0343  ( 1187 res)   hg01457                         (1187 aa)
 initn: 295 init1: 111 opt: 352  Z-score: 297.2  bits: 66.9 E(): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 365;  28.866% identity (56.701% similar) in 291 aa overlap (503-791:258-530)

            480       490       500       510       520       530  
KIAA08 HSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSS
                                     :: :.  .  .    :::  ..: : :  .
KIAA03 RFNHTQTIQQKQPISVKVISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKE--ELRGNVLSLECIA-EG
       230       240       250       260         270       280     

            540       550       560       570       580       590  
KIAA08 SDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTN
         .:.   : :.. .:     .: . :     . .: :  :....:. .: :.::::. :
KIAA03 LPTPI-IYWAKEDGML----PKNRTVY-----KNFEKT--LQIIHVSEADSGNYQCIAKN
           290           300            310         320       330  

            600       610       620       630       640       650  
KIAA08 HFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFP
        .:. . .  .. :.  : .. .:..:..  :  . : : :.:.: :.:::  .: . . 
KIAA03 ALGAIH-HTISVRVKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNG-VPIE
             340       350       360       370       380        390

            660       670       680       690       700        710 
KIAA08 AARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVL-ETPSFIRPLE
        : .   . .  : ..: .::. .. ..:.: :.:  : : ::: ..:: : : .. : .
KIAA03 IAPDDPSRKIDGDTIIF-SNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPAN
              400        410       420       430       440         

              720       730       740       750       760       770
KIAA08 D-KTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAG
           :  .. :.:.:   ::: : ..: :      . :  .    :  : :  :  ...:
KIAA03 TLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTG
     450       460       470       480       490       500         

              780       790       800       810       820       830
KIAA08 KYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSL
        :::.  : ::  .....:..                                       
KIAA03 TYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDATWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLW
     510       520       530       540       550       560         

>>KIAA0756  ( 1222 res)   ff01911                         (1222 aa)
 initn: 361 init1: 174 opt: 338  Z-score: 285.6  bits: 64.7 E(): 8.7e-11
Smith-Waterman score: 361;  28.669% identity (55.973% similar) in 293 aa overlap (503-791:310-582)

            480       490       500       510       520       530  
KIAA08 HSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSS
                                     :. ::  .  . .  ::::.. : : : :.
KIAA07 VLTNHPYNDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMV--LRGMDLLLECIA-SG
     280       290       300       310       320         330       

            540       550        560       570       580       590 
KIAA08 SDSPMSTVWRKDSEILYD-VDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVT
         .:  . ..: ...  : .  :::       ..::. :      ::.  : :.: :...
KIAA07 VPTPDIAWYKKGGDLPSDKAKFENF-------NKALRIT------NVSEEDSGEYFCLAS
        340       350       360                    370       380   

             600       610       620       630       640       650 
KIAA08 NHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDF
       :..::   .  .. :.  : .:  : .: .  :  .:: : :.:.: : ..:. .:   .
KIAA07 NKMGS-IRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNG-EPL
            390       400       410       420       430        440 

             660       670       680       690       700        710
KIAA08 PAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPS-FIRPL
        .:     . .  : ..:  ...: . ..:.: ..:  : : ::: ..::..:  .. : 
KIAA07 QSAPPNPNREVAGDTIIF-RDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPR
             450        460       470       480       490       500

                720       730       740       750       760        
KIAA08 ED--KTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLED
       ..  ...  ..:  :.:   ::: : : : :.     .   .. .  :  : :     ::
KIAA07 NQLIRVILYNRTR-LDCPFFGSPIPTLRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKED
              510        520       530       540       550         

      770       780       790       800       810       820        
KIAA08 AGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGT
        : :::. .: ::  .... :.:                                     
KIAA07 QGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTV
     560       570       580       590       600       610         

>>KIAA1639  ( 2584 res)   af14886                         (2584 aa)
 initn: 275 init1: 201 opt: 312  Z-score: 261.7  bits: 61.4 E(): 1.8e-09
Smith-Waterman score: 312;  31.707% identity (55.122% similar) in 205 aa overlap (600-795:620-818)

     570       580       590       600       610       620         
KIAA08 TSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARL
                                     :.  : : . :.: .   : : . :  ..:
KIAA16 EREDSVRKYLLQARTAIIKSSWVKEICGIQQRLALPVWRPPDFEEELADCTAELGETVKL
     590       600       610       620       630       640         

     630       640       650       660           670       680     
KIAA08 ECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDD----VFFIANVKIEDMGIYSCMA
        : . : : : ::: :::     :..    :.. ::     .... ..   : : : :.:
KIAA16 ACRVTGTPKPVISWYKDG----KAVQVDPHHILIEDPDGSCALILDSLTGVDSGQYMCFA
     650       660           670       680       690       700     

         690       700       710       720       730       740     
KIAA08 QNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLL
        ..::. :. ... :   : :.  .. .  ..:: : . :   :.: :.. : :: : ::
KIAA16 ASAAGNCSTLGKILVQVPPRFVNKVRASPFVEGEDAQFTCTIEGAPYPQIRWYKD-GALL
         710       720       730       740       750       760     

         750            760       770       780       790       800
KIAA08 VTERHFFAAANQ-----LLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSS
       .:  .: . ..      .:.:  :. :: : : : . : ::. :.   :  :.::     
KIAA16 TTGNKFQTLSEPRSGLLVLVIRAASKEDLGLYECELVNRLGSARASAELR-IQSPMLQAQ
          770       780       790       800       810        820   

              810       820       830       840       850       860
KIAA08 QSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITNTEELNLPADI
                                                                   
KIAA16 EQCHREQLVAAVEDTTLERADQEVTSVLKRLLGPKAPGPSTGDLTGPGPCPRGAPALQET
           830       840       850       860       870       880   

>>KIAA1496  ( 920 res)   fj09513                          (920 aa)
 initn: 240 init1: 117 opt: 306  Z-score: 260.0  bits: 59.6 E(): 2.3e-09
Smith-Waterman score: 365;  27.609% identity (58.249% similar) in 297 aa overlap (505-795:118-391)

          480       490       500       510        520       530   
KIAA08 VNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTH-PETIIALRGMNVTLTCTAVSSS
                                     .:.:... :::. : .: .: : : :... 
KIAA14 CVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALGN-
        90       100       110       120       130       140       

           540        550       560       570       580       590  
KIAA08 DSPMSTV-WRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTN
         :.  . ::... . ..   .  .:         .....:.. : .  : :.:.::. :
KIAA14 --PIPQINWRRSDGLPFSSKIK--LR---------KFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAEN
          150       160                  170       180       190   

            600       610       620       630       640       650  
KIAA08 HFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFP
         :.: . ...::    : ...   :. : .      :: : :.: :.  : :.:..   
KIAA14 SRGKNVA-RGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAA---
           200        210       220       230       240            

            660       670       680       690       700         710
KIAA08 AARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLET-PSFIR-PL
        . :.: ..  :. .. :.:... : :...:.:.:  : . ..: : :. . :.: . :.
KIAA14 LVLEERTQI--ENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPM
     250         260       270       280       290       300       

               720       730       740       750        760        
KIAA08 EDKT-VTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQL-LIIVDAGLED
       .  . :  :  . :.:   .::    .: : :  . : :.. ..  :.  : :...   :
KIAA14 KKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGD--VSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKAD
       310       320       330         340       350       360     

      770       780       790       800       810       820        
KIAA08 AGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGT
       :: :::.  : .:   :  .: :.. :                                 
KIAA14 AGTYTCMAENQFGKANGTTHL-VVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDII
         370       380        390       400       410       420    

>>KIAA1469  ( 662 res)   fj01881                          (662 aa)
 initn: 268 init1: 136 opt: 300  Z-score: 256.1  bits: 58.4 E(): 3.8e-09
Smith-Waterman score: 350;  26.857% identity (58.857% similar) in 350 aa overlap (184-520:58-392)

           160       170       180        190       200       210  
KIAA08 LESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNR-ITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRM
                                     :.: .:.. .:  .. ..  : .. :.   
KIAA14 IGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATT--LYLQNNQINN
        30        40        50        60        70          80     

            220       230       240       250       260       270  
KIAA08 SMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNN
       . ::  . .: ... . : .: .   . .  .    .. :..:.:.:  .   ..  .  
KIAA14 AGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL---DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPY
          90       100          110       120       130       140  

            280         290       300       310       320       330
KIAA08 MEELELEHNNLTRVN--KGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQ
       .:::.:. :... :.  .: .    .:. :..:.: .  : :  : . . . :: :. :.
KIAA14 LEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTI-P--WGLPRTIEELRLDDNR
            150       160       170       180          190         

              340       350         360       370       380        
KIAA08 LTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTH--IADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASE
       .. ..  .. ::. :.:: :  : ...  ..: ::  : ::  :.:  : .. :  .   
KIAA14 ISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVN---
     200       210       220       230       240       250         

      390       400       410       420       430       440        
KIAA08 AFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQT-HLKELI
        . : :.: :: :: :.:. .  .::  :..: .::..:: . .. .. :..  .. .::
KIAA14 -LPG-TNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLI
          260       270       280       290       300       310    

       450       460       470          480       490       500    
KIAA08 LNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVS---CAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDD--
       : ..   : :..::. .::  ...  .:::    :  :: . :..: ... . : : :  
KIAA14 LRNNPWYCGCKMKWVRDWL--QSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG
          320       330         340       350       360       370  

             510        520       530       540       550       560
KIAA08 -FLKPQIRTH-PETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYW
            :: :  :.:.   .:                                        
KIAA14 IVSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVT
            380       390       400       410       420       430  

>>KIAA1916  ( 542 res)   hg01117                          (542 aa)
 initn: 423 init1: 153 opt: 292  Z-score: 250.1  bits: 57.0 E(): 8.2e-09
Smith-Waterman score: 292;  32.828% identity (59.091% similar) in 198 aa overlap (348-541:63-256)

       320       330       340       350       360       370       
KIAA08 CQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNN
                                     :.: ..  ..: : .:  : .:: : : .:
KIAA19 CPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSN
             40        50        60        70        80        90  

       380       390       400       410       420       430       
KIAA08 EISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENA
        ..  :.:  .:::::  :  :...::.:..:...:: ::..: ::.: :: : .. ...
KIAA19 SFT-IIRD--DAFAGLFHLEYLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDV
               100       110       120       130       140         

       440        450       460       470       480       490      
KIAA08 FSQTH-LKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLK
       ::.   : :: :  ... :::. :::  ::  .:   : .: :  :     ... .:   
KIAA19 FSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYLWLKMTNSTVS-DVLCIGPPEYQEKKLNDVTSF
     150       160       170       180        190       200        

        500         510        520       530       540       550   
KIAA08 DFVCD--DFLKPQIRTHPE-TIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDT
       :. :   ::.  :   .   .. .. . : . .  :  : .. :   :            
KIAA19 DYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDN
      210       220       230       240       250       260        

           560       570       580       590       600       610   
KIAA08 ENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFL
                                                                   
KIAA19 ITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQLFGGSHIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIEL
      270       280       290       300       310       320        




1073 residues in 1 query   sequences
1986432 residues in 2037 library sequences
 Scomplib [34.26]
 start: Thu Dec 18 15:16:50 2008 done: Thu Dec 18 15:16:51 2008
 Total Scan time:  0.680 Total Display time:  0.250

Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]