# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03049mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0803.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0803, 1708 aa vs ./tmplib.23663 library 1985797 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3853+/-0.00962; mu= -4.0882+/- 0.649 mean_var=442.2044+/-109.496, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.060991 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0402 ( 3284 res) hg01127s1 (3284) 588 68.7 2.4e-11 KIAA0531 ( 999 res) hg03072 ( 999) 297 42.3 0.00063 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 296 42.2 0.00067 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 283 41.5 0.0022 KIAA0216 ( 2067 res) hf00331s1 (2067) 274 40.7 0.0039 KIAA0594 ( 1120 res) hj02896s1 (1120) 267 39.8 0.0042 KIAA0568 ( 1426 res) hh02280 (1426) 268 40.0 0.0045 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 267 39.9 0.0048 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 262 39.7 0.008 >>KIAA0402 ( 3284 res) hg01127s1 (3284 aa) initn: 854 init1: 316 opt: 588 Z-score: 295.4 bits: 68.7 E(): 2.4e-11 Smith-Waterman score: 1151; 25.169% identity (54.944% similar) in 1780 aa overlap (1-1701:1677-3275) 10 20 30 KIAA08 RKEKEITNLEEQLEQFREELENKNEEVQQL :.:.:. .:.::::... .::.::::. .: KIAA04 LDAGRCPEPPSGSPPEGPEIQLEVTQRALLRRESEVLDLKEQLEKMKGDLESKNEEILHL 1650 1660 1670 1680 1690 1700 40 50 60 70 80 90 KIAA08 HMQLEIQKKESTTRLQELEQENKLFKDDMEKLGLAIKESDAMSTQDQHVLFGKFAQIIQE ...:..:...... :.:::.:: .: . . . :.: : . :. . .. .: KIAA04 NLKLDMQNSQTAVSLRELEEENTSLKVIYTR-SSEIEELKATIENLQE----NQKRLQKE 1710 1720 1730 1740 1750 1760 100 110 120 130 140 KIAA08 KEVEIDQLNEQVTKLQQQLKITTDNKVIEE-KNELIRDLETQIECLMSDQECVKRNR--E : ::.::.: . :::..:.. . :..: .. .:.... : .: :.. . 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KIAA04 AYKVEQEKCIAGDLQKTLSEEQEKANSVQKLLAAEQTVVRDLKSDLCESRQKSEQLSRSL 2600 2610 2620 2630 2640 2650 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA08 HKHLKELEAFRLEVKDKTDEVHLLNDTLASEQKKSRELQWALEKEKAKLGRSEERDKEEL . .:. .: ...: .:.. . : ::: :.: :: ::.:. . . : .. . : KIAA04 CEVQQEVLQLRSMLSSKENELKAALQELESEQGKGRALQSQLEEEQLRHLQRESQSAKAL 2660 2670 2680 2690 2700 2710 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA08 EDLKFSLESQKQRNLQLNLLLEQQKQLLNESQQKIESQRMLYDAQLSEEQGRNLELQVLL :.:. :::.:. .. .: . :.... .. :.... .. .: :..:... ::: : KIAA04 EELRASLETQRAQSSRLCVALKHEQTAKDNLQKELRIEHSRCEALLAQERSQLSELQKDL 2720 2730 2740 2750 2760 2770 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA08 ESEKVRIREMSSTLDRERELHAQLQSSDGTGQSRPPLPSEDLLKELQKQLEEKHSRIVEL .:: : :.: .: .:: : ::.. . . .. : ::: :.:..::.:.: KIAA04 AAEKSRTLELSEALRHERLLTEQLSQRTQEACVHQDTQAHHAL--LQK-LKEEKSRVVDL 2780 2790 2800 2810 2820 2830 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA08 LNETEKYKLDSLQTRQQMEKDRQVHRKTLQTEQEANTEGQKKMHELQSKVEDLQRQLEEK :: . ..:...::.: . : : ..:. :.: . : :.. ..:. :...::. . 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KIAA04 STVTQEKLELSRAVSKLEKLLKHHLQKGC---SPSR--------------SERSAWKPDE 3010 3020 3030 3040 3050 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA08 LTLQKSLKRAEAEVYKLKAELRNDSLLQTLSPDSEHVTLKRIYGKYLRAESFRKALIYQK . :.::.: . .: ... . .: ....: .::::::::::::::: KIAA04 TAPQSSLRRPDPG--RLPPAASEEA-------HTSNVKMEKLYLHYLRAESFRKALIYQK 3060 3070 3080 3090 3100 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA08 KYLLLLLGGFQECEDATLALLARMGGQPAFTDLEVITNRPKGFTRFRSAVRVSIAISRMK ::::::.::::. :. ::...:..: :. .. . ::.:: :::::.:::: ::: :.. KIAA04 KYLLLLIGGFQDSEQETLSMIAHLGVFPSKAERK-ITSRP--FTRFRTAVRVVIAILRLR 3110 3120 3130 3140 3150 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA08 FLVRRWHRVTGSVSININRDGFGLNQGAEKTDSFYHSSGGLELYGEPRHTTYRSRSDLDY :::..:..: .: : .: :: . . . . :: :. KIAA04 FLVKKWQEV--------DRKG-ALAQGKAPRPG----PRARQPQSPPRTRESPPTRDVPS 3160 3170 3180 3190 3200 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA08 IRSPLPFQNR--------YPGTPADFNPGS-LACSQLQNYDPDRALTDYITRLEALQRRL .. : ..: . : : .:.: : : . ::...::.:: .::..:.:: KIAA04 GHTRDPARGRRLAAAASPHSGGRATPSPNSRLERSLTASQDPEHSLTEYIHHLEVIQQRL 3210 3220 3230 3240 3250 3260 1700 KIAA08 GTIQSGSTTQFHAGMRR : . ::.. KIAA04 GGVLPDSTSKKSCHPMIKQ 3270 3280 >>KIAA0531 ( 999 res) hg03072 (999 aa) initn: 268 init1: 122 opt: 297 Z-score: 162.4 bits: 42.3 E(): 0.00063 Smith-Waterman score: 307; 21.444% identity (59.519% similar) in 457 aa overlap (894-1344:462-899) 870 880 890 900 910 920 KIAA08 CLEQRIQEQGVEYQAAMECLQKADRRSLLSEIQALHAQMNGRKITLKRE-QESEKPSQEL ::..:. :.. . .... : .:: .:.. 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KIAA05 NLRKLFVQDLTTRVKKS--VELDNDDGGGSAAQ------KQKISFLENNLEQLT-KVHKQ 850 860 870 880 890 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA08 LQFETADDEDFIWVQENIDEIILQLQKLTGQQGEEPSLVSPSTSCGSLTERLLRQNAELT : ..:: KIAA05 LVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRA 900 910 920 930 940 950 >>KIAA1334 ( 989 res) fh15842 (989 aa) initn: 103 init1: 66 opt: 296 Z-score: 161.9 bits: 42.2 E(): 0.00067 Smith-Waterman score: 315; 22.714% identity (57.522% similar) in 678 aa overlap (3-648:351-974) 10 20 30 KIAA08 RKEKEITNLEEQLEQFREELENKNEEVQQLHM : . .: :. : .:.:.:. .. KIAA13 FKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLTLHNKELQD-KL 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 90 KIAA08 QLEIQKKESTTRLQELEQENKLFKDDMEKLGLAIKESDAMSTQDQHVLFGKFAQIIQEKE : . . ::. . :. ... .. : .:: . : : .. ::. .... ... 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KIAA13 VRIQQLQEILQDLQKRLE-SSEAERKQLQVEL-QSRRAELVCLNNTE--ISENSSDLSQK 440 450 460 470 480 490 160 170 180 190 200 KIAA08 LNEVIEKLQQELANI-GQKTSMNAHSLSEEA-DSLKH--QLDVVIAEKLALEQQVETANE :.:. : .. . .. . . .:. .: :. :. .: .: :. : .:.:....: : KIAA13 LKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQNALE 500 510 520 530 540 550 210 220 230 240 250 260 KIAA08 EMTFMKNVLKETNFKMNQLTQELFSLKRERESVEKIQSIPENSVNVAIDHLSKDKPEL-- : :. ..: . :. . .. .: : :...: : .:....:.: : KIAA13 ESERNKEKVRELEEKLVE-REKGTVIKPPVEEYEEMKS----SYCSVIENMNKEKAFLFE 560 570 580 590 600 270 280 290 300 310 KIAA08 -------EVVLTEDALKSLENQTYFKSFEENGKGSIINLETRLL-QLESTVSAKDLELTQ :.. .:.::: .: : : . .: :.. .:.. :: ::.: KIAA13 KYQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQE--ASDEAEDMKEAMN---RMIDELNKQVS----ELSQ 610 620 630 640 650 320 330 340 350 360 KIAA08 CYKQ----IKDMQEQGQFE---TEMLQK----KIVNLQKIVEEKVAAALVSQIQLEAVQE ::. ..:.... ..: .:...: :...: .. . :. :: :... . . KIAA13 LYKEAQAELEDYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDAL-SEMKSQYSKV 660 670 680 690 700 710 370 380 390 400 410 420 KIAA08 YAKFCQDNQTISSEPERTNIQNLNQLREDELGSDISALTLRISELESQVVEMHTSLILEK .. : .: .... : :.. : . :..: .:.: .. ... : . KIAA13 LNELTQLKQLVDAQKE-------NSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHL--AS 720 730 740 750 760 430 440 450 460 470 480 KIAA08 EQVEIAEKNVLEKEKKLLELQKLLEGNEKKQREKEKKRSPQDVEVLKTTTELFHSNEESG ..::.:. ::.::: . . . :: .: . :: ...: .: .:. KIAA13 KEVEVAKL-----EKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEK- 770 780 790 800 810 820 490 500 510 520 530 540 KIAA08 FFNELEALRAESVATKAELASYKEKAEKLQEELLVKETNMTSLQKDLSQVRDHLAEAK-- : ...: : ..:... :.. :..: : :: ... : . ..:....::: : KIAA13 -----EKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRY 830 840 850 860 870 550 560 570 580 590 600 KIAA08 -EKLSILEKEDETEVQESKKACMFEPLPIKLSKSIASQTDGTLKISSSNQTPQIL--VKN :. : ::.. . ...: .: ::.... : .. . . :::.. : : ... KIAA13 SESSSKLEEDKDKKINEMSKEVT------KLKEALNSLSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQ 880 890 900 910 920 930 610 620 630 640 650 660 KIAA08 AGIQINLQ-SECSSEEVTEIISQFTEKIEKMQELHAAEN-LDMESRHISETETLKREHYV :.. : .::.... :.:: . .:. :.:... .: . ... 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KIAA04 GVQAELALQEESVRRSERERRATLDQVATLERSLQATESELRASQEKISKMKANETKLEG 1480 1490 1500 1510 1520 1530 960 970 980 990 1000 1010 KIAA08 QLSSEKMVVAELKSELAQTKLELETTLKAQHKHLK-ELEAFRLEVKDKTDEVHLLNDTLA . : :. :: .:::: :.. :. ::. :: ..:. ... :.: . KIAA04 DKRRLKEVLDA--SESRTVKLEL------QRRSLEGELQRSRLGLSDREAQAQALQDRVD 1540 1550 1560 1570 1580 1020 1030 1040 1050 KIAA08 SEQK-------KSRELQWALEKEKAKLGRSEE-----RDK-----EELEDLKFSLESQKQ : :. :. :: ..:. .. :.. :: ::: : : . . ::.: .. KIAA04 SLQRQVADSEVKAGTLQLTVERLNGALAKVEESEGALRDKVRGLTEALAQSSASLNSTRD 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA08 RNLQLNLLL---EQQKQLLNE---------SQQKIESQRMLYDAQLSEEQGRNLELQ-VL .::.:. : :...:.:.: :. . .:. . ..: . . .:::: : KIAA04 KNLHLQKALTACEHDRQVLQERLDAARQALSEARKQSSSLGEQVQTLRGEVADLELQRVE 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA08 LESEKVRIREM--------SSTLDRERELHAQ---LQSSDGTGQSRPPLPSEDLLKELQK :.. ..::. ...:. ..:. . :: :. : : : .:... 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KIAA05 SYLCCQYHIHEVPVGTEKTRERIERVIQETRLKQIYTAE--EKYVVKTSFYSNKVISSNT 600 610 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 KIAA08 KLLELQKLLEGNEKKQREKEKKRSPQDVEVLKTTTELFHSNEESGFFNELEALRAESVAT .: : : . .::.. ... . . :... . . .:.. ..:: : KIAA05 SLKVAQFLTVTVDLEQRRHLEEQLKEIHRKLQAVDSGLIALRETS--KHLEHKDNELRQK 660 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 KIAA08 KAELASYKEKAEKLQEELLVKETNMTSLQKDLSQVRDHLAEAKEKLSILEKEDETEVQES : :: : : ..:.... : .. ...: ..... .:. :.. : .::.. KIAA05 KKELLERKTKKRQLEQKISSKLGSLKLMEQDTCNLEEEERKASTKIK------EINVQKA 720 730 740 750 760 570 580 590 600 610 620 KIAA08 KKACMFEPLPIKLSKSIASQTDGTLKISSSNQTPQILVKNAGIQINLQSECSSEEVTEII : . . : ::. :. : :.. :. .. .. .. . .. :. ..:: KIAA05 KLVTELTNL-IKICTSLHIQ-----KVDLILQNTTVISEKNKLESDYMAASSQLRLTE-- 770 780 790 800 810 630 640 650 660 670 KIAA08 SQFTEKIEKMQEL-HAAENLDMESRHISET---ETLKREHYVAVQLLKE-ECGTLKAVIQ ..: : :. :.: . ..: ..:.. . .:: .:. . : . . . ..: :.: KIAA05 QHFIELDENRQRLLQKCKELMKRARQVCNLGAEQTLPQEYQTQVPTIPNGHNSSLPMVFQ 820 830 840 850 860 870 680 690 700 710 720 730 KIAA08 CLRSKEGSSIPELAHSDAYQTREICSSDSGSDWGQGIYLTHSQGFDIASEGRGEESESAT : ... :. :: :.: .. . . : ... : :: :. : KIAA05 DL----PNTLDEI---DALLTEERSRASCFTGLNPTIVQEYTK--------REEEIEQLT 880 890 900 910 920 740 750 760 770 780 790 KIAA08 DSFPKKIKGLLRAVHNEGMQVLSLTESPYSDGEDHSIQQVSESWLEERKAYINTIS-SLK . ..:: . . : : ..:.::.: ::. : .. :. ... 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KIAA06 RNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMNLE---KQNA 830 840 850 860 870 880 460 470 480 490 500 510 KIAA08 EKEKKRSPQDVEVLKTTTELFHSNEESGFFN-ELEALRAESVATKAELAS-YKEKAEKLQ : .:.:. : .. . .: . : ... ... :. : :..:.. ..: ..:: KIAA06 ELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELK-EECEEKTKLGKELQQKKQELQ 890 900 910 920 930 940 520 530 540 550 560 570 KIAA08 EEL--LVKETNMTSLQKDLSQVRDHLAEAKEKLSILEKED---ETEVQESKKACMFEPLP .: :. . ..: . : :. .:: :. : :::: : :..: : . : KIAA06 DERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAE--EQYSDLEKEKIMKELEIKEMM-ARHKQELT 950 960 970 980 990 1000 580 590 600 610 620 KIAA08 IKLSKSIASQTDGTLKISS-----SNQTPQILVKNAGIQINLQSECSSEEVTE--IISQF : . .::: . . ..: .:. .. : .: .: :. ..::.. : .:: KIAA06 EK-DATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQL-SRLKDEEISAAAIKAQF 1010 1020 1030 1040 1050 1060 630 640 650 660 670 680 KIAA08 TEKI--EKMQELHAAENLDMESRHISETETLKREHYVAVQLLKEECGTLKAVIQCLRSKE ... :. . .:...: .. ... : .:: . . :. ..: :. .. : : KIAA06 EKQLLTERTLKTQAVNKL---AEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKL 1070 1080 1090 1100 1110 690 700 710 720 KIAA08 GSSI----PELAHSDAYQTRE----------ICSSDSGSDWGQGIYLTHSQGFDIASEGR ... :: . .: ..: . :.:: . .. . :.: .: : KIAA06 TQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 730 740 750 760 770 780 KIAA08 GEESESATDSFPK-KIKGLLRAVHNEGMQVLSLTESPYSDGEDHSIQQVSESWLEERKAY : . : :.::. ...: : KIAA06 GPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPY 1180 1190 1200 1210 1220 1230 >>KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010 aa) initn: 293 init1: 85 opt: 262 Z-score: 142.6 bits: 39.7 E(): 0.008 Smith-Waterman score: 461; 22.262% identity (55.031% similar) in 1123 aa overlap (158-1230:947-1996) 130 140 150 160 170 180 KIAA08 LETQIECLMSDQECVKRNREEEIEQLNEVIEKLQQELANIGQKTSMNAHSLSEEADSL-- ..:.. ..: :. . : .:. : :.: KIAA15 RSAQAEEELAALRAELRGLRGALAAAEAKRQELEETHVSITQEKNDLALQLQAEQDNLAD 920 930 940 950 960 970 190 200 210 220 230 240 KIAA08 -KHQLDVVIAEKLALEQQVETANEEMTFMKNVLKETNFKMNQLTQELFSLKRERESVEKI ... ..: :. :: .:. .:.. ..: . . .: .: ::.. ...: KIAA15 AEERCHLLIKSKVQLEGKVKELSERLEDEEEVNADLAARRRKLEDECTELKKDIDDLELT 980 990 1000 1010 1020 1030 250 260 270 280 290 300 KIAA08 QSIPENSVNVAIDHLSKDKPELEVVLTEDALKSLENQTYFKSFEENGKGSIINLETRLLQ . :. . : .. :. : ..: :.. . ... :...: . .. .:... . 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