# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05692.fasta.nr -Q ../query/KIAA0793.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0793, 1055 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7814184 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9501+/-0.000198; mu= 11.0529+/- 0.011 mean_var=112.0131+/-21.157, 0's: 51 Z-trim: 86 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.121182 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|93204574|sp|O94887.3|FARP2_HUMAN RecName: Full= (1054) 7081 1249.7 0 gi|109101719|ref|XP_001091489.1| PREDICTED: simila (1055) 6887 1215.8 0 gi|81916097|sp|Q91VS8.1|FARP2_MOUSE RecName: Full= (1065) 5864 1036.9 0 gi|74152708|dbj|BAE42626.1| unnamed protein produc (1065) 5854 1035.2 0 gi|194211521|ref|XP_001497741.2| PREDICTED: FERM, (1047) 5794 1024.7 0 gi|149037487|gb|EDL91918.1| FERM, RhoGEF and pleck (1060) 5758 1018.4 0 gi|73994333|ref|XP_543330.2| PREDICTED: similar to (1045) 5501 973.5 0 gi|18204275|gb|AAH21301.1| FARP2 protein [Homo sap ( 647) 4240 752.8 1.3e-214 gi|221043214|dbj|BAH13284.1| unnamed protein produ ( 638) 4229 750.9 4.8e-214 gi|109121202|ref|XP_001089334.1| PREDICTED: simila (1078) 3758 668.8 4.3e-189 gi|73989436|ref|XP_534170.2| PREDICTED: similar to (1019) 3728 663.5 1.6e-187 gi|74762059|sp|Q9Y4F1.1|FARP1_HUMAN RecName: Full= (1045) 3391 604.6 8.7e-170 gi|114650398|ref|XP_001142564.1| PREDICTED: FERM, (1045) 3390 604.4 9.8e-170 gi|168278108|dbj|BAG11032.1| FERM, RhoGEF and plec (1045) 3387 603.9 1.4e-169 gi|75070718|sp|Q5RAB8.1|FARP1_PONAB RecName: Full= (1045) 3374 601.6 6.8e-169 gi|114650404|ref|XP_001142428.1| PREDICTED: FERM, (1045) 3369 600.7 1.2e-168 gi|189520239|ref|XP_001922651.1| PREDICTED: FERM, (1044) 2790 499.5 3.7e-138 gi|189520237|ref|XP_001922658.1| PREDICTED: FERM, (1111) 2637 472.8 4.3e-130 gi|47212534|emb|CAF90550.1| unnamed protein produc (1117) 2526 453.4 3e-124 gi|149730458|ref|XP_001491048.1| PREDICTED: FERM, (1046) 2447 439.5 4.2e-120 gi|126337325|ref|XP_001366226.1| PREDICTED: simila (1045) 2435 437.5 1.8e-119 gi|126337327|ref|XP_001366274.1| PREDICTED: simila (1045) 2432 436.9 2.6e-119 gi|118084665|ref|XP_416976.2| PREDICTED: similar t (1019) 2389 429.4 4.6e-117 gi|119904908|ref|XP_610432.3| PREDICTED: similar t (1046) 2375 427.0 2.6e-116 gi|210124514|gb|EEA72210.1| hypothetical protein B ( 997) 2326 418.4 9.4e-114 gi|212506822|gb|EEB10924.1| FERM, RhoGEF and pleck ( 998) 2325 418.2 1.1e-113 gi|20987936|gb|AAH30329.1| Farp1 protein [Mus musc ( 835) 2273 409.0 5.1e-111 gi|114650402|ref|XP_001142102.1| PREDICTED: FERM, (1022) 2186 393.9 2.2e-106 gi|114650396|ref|XP_509707.2| PREDICTED: FERM, Rho (1076) 2186 393.9 2.3e-106 gi|47940452|gb|AAH71592.1| FARP1 protein [Homo sap (1076) 2179 392.7 5.4e-106 gi|62822133|gb|AAY14682.1| unknown [Homo sapiens] ( 300) 2033 366.7 1e-98 gi|47220960|emb|CAF98189.1| unnamed protein produc (1425) 1859 336.9 4.6e-89 gi|83405603|gb|AAI10756.1| MGC131000 protein [Xeno ( 378) 1710 310.3 1.2e-81 gi|13278388|gb|AAH04009.1| Farp1 protein [Mus musc ( 420) 1700 308.6 4.4e-81 gi|198429471|ref|XP_002123607.1| PREDICTED: simila ( 599) 1702 309.1 4.5e-81 gi|194671909|ref|XP_001250662.2| PREDICTED: simila ( 411) 1691 307.0 1.3e-80 gi|162319134|gb|AAI56365.1| FERM, RhoGEF (Arhgef) (1048) 1664 302.7 6.7e-79 gi|149266279|ref|XP_001473991.1| PREDICTED: simila (1048) 1664 302.7 6.7e-79 gi|149050235|gb|EDM02559.1| FERM, RhoGEF (Arhgef) (1049) 1664 302.7 6.7e-79 gi|148668275|gb|EDL00605.1| FERM, RhoGEF (Arhgef) (1047) 1658 301.6 1.4e-78 gi|149411782|ref|XP_001506249.1| PREDICTED: simila (1047) 1631 296.9 3.7e-77 gi|220679005|emb|CAX13830.1| novel protein similar ( 811) 1590 289.6 4.4e-75 gi|6093248|emb|CAB59185.1| hypothetical protein [H ( 230) 1553 282.6 1.6e-73 gi|20071585|gb|AAH27077.1| Farp1 protein [Mus musc ( 354) 1466 267.6 8.1e-69 gi|189523215|ref|XP_001343862.2| PREDICTED: simila ( 758) 1402 256.7 3.3e-65 gi|193617667|ref|XP_001943157.1| PREDICTED: simila (2271) 1397 256.3 1.3e-64 gi|118089423|ref|XP_426268.2| PREDICTED: hypotheti ( 693) 1354 248.3 1e-62 gi|193917066|gb|EDW15933.1| GI10249 [Drosophila mo ( 607) 1336 245.1 8.3e-62 gi|115637323|ref|XP_792466.2| PREDICTED: hypotheti (1673) 1333 245.0 2.5e-61 gi|193895984|gb|EDV94850.1| GH23060 [Drosophila gr (4831) 1330 244.9 7.7e-61 >>gi|93204574|sp|O94887.3|FARP2_HUMAN RecName: Full=FERM (1054 aa) initn: 7081 init1: 7081 opt: 7081 Z-score: 6691.0 bits: 1249.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 7081; 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