# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05692.fasta.huge -Q ../query/KIAA0793.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0793, 1055 aa vs ./tmplib.23663 library 1986450 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6302+/-0.00871; mu= 2.9056+/- 0.589 mean_var=403.6896+/-97.609, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.063834 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0987 ( 1115 res) hk01713 (1115) 886 96.7 1.8e-20 KIAA0338 ( 934 res) hg01242 ( 934) 843 92.7 2.5e-19 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 586 68.8 2.9e-12 KIAA1548 ( 545 res) fh15779 ( 545) 401 51.6 3.4e-07 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 386 50.4 1e-06 KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621) 327 45.5 6.9e-05 KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 294 41.8 0.00032 >>KIAA0987 ( 1115 res) hk01713 (1115 aa) initn: 813 init1: 406 opt: 886 Z-score: 459.4 bits: 96.7 E(): 1.8e-20 Smith-Waterman score: 908; 35.744% identity (63.223% similar) in 484 aa overlap (41-516:134-596) 20 30 40 50 60 70 KIAA07 VLQTAGMRLGAQTPVGVSTLEPGQTLLPRMQEKHLHLRVKLLDNTMEIFDIEPKCDGQVL . : .. .: :::.. :.: . :::: KIAA09 QLEYQQLEDDKLSQKSSSSKLSRSPLKIVKKPKSMQCKVILLDGSEYTCDVEKRSRGQVL 110 120 130 140 150 160 80 90 100 110 120 130 KIAA07 LTQVWKRLNLVECDYFGMEFQNTQSYWIWLEPMKPIIRQIRRPKNVVLRLAVKFFPPDPG . .: ..:::.: ::::. ...... ::.: : : .:.: . . :::.::::. 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KIAA03 SSSKRYTMSRSLDGAEFSRPASVSENHDAGPDGDKRDEDGESGGQRSEAEEGEVRTPTKI 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 KIAA07 PEFKDSSSSLTDPQVSYVKSP--AAERRSGAVAGGPDT---PSAQPLGPPALQPGPGLST :.: . . . .. .: . ...... : :... . KIAA03 KELKPEQETTPRHKQEFLDKPEDVLLKHQASINELKRTLKEPNSKLIHRDRDWERERRLP 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 KIAA07 KSPQPSPSSRKSPLSLSPAFQVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAGGAGMDCEEPRHKRVPAD .:: ::: . .: . . . : :. . : ::.: .: : KIAA03 SSPA-SPSPKGTPEKANERAGLREGSEEKVKPPRPRAPESDTGDEDQDQERDTVFLKDNH 600 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 KIAA07 EAYFIVKEILATERTYLKDLEVITVWFRSAVVKEDAMPATLMTLLFSNIDPIYEFHRGFL KIAA03 LAIERKCSSITVSSTSSLEAEVDFTVIGDYHGSAFEDFSRSLPELDRDKSDSDTEGLLFS 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1362 ( 699 res) fj02381 (699 aa) initn: 418 init1: 314 opt: 586 Z-score: 312.1 bits: 68.8 E(): 2.9e-12 Smith-Waterman score: 594; 28.157% identity (59.420% similar) in 483 aa overlap (455-928:126-578) 430 440 450 460 470 480 KIAA07 DSSSSLTDPQVSYVKSPAAERRSGAVAGGPDTPSAQPLGPPALQPGPGLSTKSPQPSPSS . : : : :: :: . .: : . KIAA13 PFIMAIRKTQELEWQNSSSMEDADANVYEVEEPYEAPDGQ--LQLGPRHQHSSSGAS-QE 100 110 120 130 140 150 490 500 510 520 530 540 KIAA07 RKSPLSLSPAFQVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAGGAGMDCEEPRHKRVPA--DEAYFIVK ... :.:. ..: : .: . : :... . : : .. . . .... :.: KIAA13 EQNDLGLG---DLPSDEEEIINSSDEDDVSSESSKGEPDPLEDKQDEDNGMKSKVHHIAK 160 170 180 190 200 550 560 570 580 590 KIAA07 EILATERTYLKDLEVITVWFRSAVV---KEDAMPAT---LMTLLFSNIDPIYEFHRGFLR ::...:.... :... . ::.::. .. . :. ... .. . .::..: .:. KIAA13 EIMSSEKVFVDVLKLLHIDFRDAVAHASRQLGKPVIEDRILNQILYYLPQLYELNRDLLK 210 220 230 240 250 260 600 610 620 630 640 650 KIAA07 EVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMRQLKEFTSYFQRHDEVLTELEKATKRCK :.:.:. : .:::.::.... :: ...:... :. .. :.. :. KIAA13 ELEERMLHWT---------EQQRIADIFVKKGPYLKMYSTYIKEFDKNIALLDEQCKKNP 270 280 290 300 310 320 660 670 680 690 700 710 KIAA07 KLEAVYKEFELQKVCY-LPLNTFLLKPIQRLLHYRLLLRRLCGHYSPGHHDYADCHDALK . :: .:::.. : : :. .::::.::. .::::: . :: : .::: KIAA13 GFAAVVREFEMSPCCANLALKHYLLKPVQRIPQYRLLLTDYLKNLIEDAGDYRDTQDALA 330 340 350 360 370 380 720 730 740 750 760 770 KIAA07 AITEVTTTLQHILIRLENLQKLTELQRDLVGIENLIAPGREFIREGCLHKLTKKGLQQRM .. ::.. . . . .:.::: ..: .: : .... ::: :..:: : ::..: .: :: KIAA13 VVIEVANHANDTMKQGDNFQKLMQIQYSLNGHHEIVQPGRVFLKEGILMKLSRKVMQPRM 390 400 410 420 430 440 780 790 800 810 820 830 KIAA07 FFLFSDMLLYTSKGVAGTSHFRIRGLLPLQGMLVEESDNEWSVPHCFTIYAAQKTIVVAA ::::.: ::::. .: ... ..: : :: :.. .: . . . : .........: KIAA13 FFLFNDALLYTTPVQSG--MYKLNNMLSLAGMKVRKPTQE-AYQNELKIESVERSFILSA 450 460 470 480 490 840 850 860 870 880 890 KIAA07 STRLEKEKWMLDLNSAIQAAKSGGDTAPALPGRTVCTRPPRSPNEVSLEQESEDDARGVR :. :...:. .. ::. : : : : :: .:.. :.. : . : . KIAA13 SSATERDEWLEAISRAIEEY--------AKKRITFC--PSRSLDEADSENKEEVSPLGSK 500 510 520 530 540 900 910 920 930 940 950 KIAA07 SSLEGHGQHRANTTMHVCWYRNTSVSRADHSAAVENQLSGYLLRKFKNSHGWQKLWVVFT . . ::. : .: . : . : : : KIAA13 APIWIPDT-RATMCM-ICTSEFTLTWRRHHCRACGKIVCQACSSNKYGLDYLKNQPARVC 550 560 570 580 590 600 960 970 980 990 1000 1010 KIAA07 NFCLFFYKTHQDDYPLASLPLLGYSVSIPREADGIHKDYVFKLQFKSHVYFFRAESKYTF KIAA13 EHCFQELQKLDHQHSPRIGSPGNHKSPSSALSSVLHSIPSGRKQKKIPAALKEVSANTED 610 620 630 640 650 660 >>KIAA1548 ( 545 res) fh15779 (545 aa) initn: 376 init1: 221 opt: 401 Z-score: 221.1 bits: 51.6 E(): 3.4e-07 Smith-Waterman score: 418; 31.339% identity (56.980% similar) in 351 aa overlap (190-512:2-335) 160 170 180 190 200 210 KIAA07 TAALLTSHLLQSEIGDYDETLDREHLKVNEYLPGQQHCLE-KILEFHQKHVGQTPAESDF ..: : . .: :.: ... :::::... KIAA15 RFVPIQTEEMELAIFEKWKEYRGQTPAQAET 10 20 30 220 230 240 250 260 270 KIAA07 QVLEIARKLEMYGIRFHMASDREGTKIQLAVSHMGVLVFQGTTKINTFNWSKVRKLSFKR . :. :. :::::. .:... :.:. .:... :::::.: :::. : : :. .:.::. KIAA15 NYLNKAKWLEMYGVDMHVVKARDGNDYSLGLTPTGVLVFEGDTKIGLFFWPKITRLDFKK 40 50 60 70 80 90 280 290 300 310 320 330 KIAA07 KRF-LIKLHPEVHGPYQD-TLEFLLGSRDECKNFWKICVEYHTFFRLLDQ-PKPKAKAVF ... :. .. . .: :. :. : : ::..:: ::.:.:::: : . .. : KIAA15 NKLTLVVVEDDDQGKEQEHTFVFRLDHPKACKHLWKCAVEHHAFFRLRGPVQKSSHRSGF 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 KIAA07 FSRGSSFRYSGRTQKQLVDYFKDSGMKRIPYERRHSKTHTSVRALT----ADLPKQ---- . :: :::::.:. : . ... . .::: :: . : :.: : :.. KIAA15 IRLGSRFRYSGKTEYQTTK--TNKARRSTSFERRPSKRY-SRRTLQMKACATKPEELSVH 160 170 180 190 200 390 400 410 420 430 KIAA07 -SISFPE-------GLRT--PASPSSANAFYSLSPSTLVPSGLPEFK--DSSSSLTDP-Q ..: :.:. :.::: ..: : . .::. :. . : . KIAA15 NNVSTQSNGSQQAWGMRSALPVSPSISSA-----PVPVEIENLPQSPGTDQHDRKCIPLN 210 220 230 240 250 260 440 450 460 470 480 490 KIAA07 VSYVKSPAA-ERRSGAVAGGPDT-PSAQPLGPPALQPG-PGLSTKSPQPSPSSRKSPLSL .. ..:: : : : :. :: ..: :. . :::. :. . :. KIAA15 IDLLNSPDLLETTIGDVIGASDTMETSQALNDVNVATRLPGLGE--PEVEYETLKDT--- 270 280 290 300 310 500 510 520 530 540 550 KIAA07 SPAFQVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAGGAGMDCEEPRHKRVPADEAYFIVKEILATERTY . : :. .:::::: KIAA15 ----SEKLKQLEMENSPLLSPRSNIDVNINSQEEVVKLTEKCLNNVIESPGLNVMRVPPD 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 (694 aa) initn: 352 init1: 164 opt: 386 Z-score: 212.6 bits: 50.4 E(): 1e-06 Smith-Waterman score: 397; 26.741% identity (57.939% similar) in 359 aa overlap (501-845:281-622) 480 490 500 510 520 530 KIAA07 PGLSTKSPQPSPSSRKSPLSLSPAFQVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAGGAGMDCEEPRHK ::.. ..:: . .. ::: . . . . KIAA11 TNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADD-DAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMR 260 270 280 290 300 540 550 560 570 580 KIAA07 RVPADEAYFIVKEILATERTYLKDL-EVITVWFRSAVVKEDAMPATLMTLLFSNIDPIYE ...:::.::: :.: : .. . :. . : . . .:.::. ::. KIAA11 TN-------VINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYR 310 320 330 340 350 360 590 600 610 620 630 640 KIAA07 FHRGFLREVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMRQLKEFTSYFQRHDEVLTELE ...:.. .:::. : : : . ..: .:... ... .. : . : .. .:: KIAA11 CQKAFVKALEQRFNR-ERP---HLS----ELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELS 370 380 390 400 410 650 660 670 680 690 700 KIAA07 KATKRCKKLEAVYKEFELQKVCYLPLNTFLLKPIQRLLHYRLLLRRLCGHYSPGHHDYAD . :: : . :::. . :. ::: :.:.. .: : : .: . : :.:. : KIAA11 RLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKD 420 430 440 450 460 470 710 720 730 740 750 760 KIAA07 CHDALKAITEVTTTLQHILIRLENLQKLTELQ---RDLVGIENLIAPGREFIREGCLHKL . ::.:. .:. ... ::::..:... : .: : :.:.. . :.: : : .. 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