# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05691.fasta.nr -Q ../query/KIAA0792.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0792, 828 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826638 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8201+/-0.000188; mu= 14.9528+/- 0.010 mean_var=74.5900+/-15.268, 0's: 32 Z-trim: 33 B-trim: 3752 in 2/65 Lambda= 0.148503 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|168267586|dbj|BAG09849.1| transmembrane protein ( 807) 5460 1179.8 0 gi|134035045|sp|O94886.3|TM63A_HUMAN RecName: Full ( 807) 5453 1178.3 0 gi|193785643|dbj|BAG51078.1| unnamed protein produ ( 807) 5430 1173.4 0 gi|75041497|sp|Q5R826.1|TM63A_PONAB RecName: Full= ( 807) 5400 1167.0 0 gi|109018116|ref|XP_001089796.1| PREDICTED: simila ( 853) 5365 1159.5 0 gi|148681191|gb|EDL13138.1| transmembrane protein ( 822) 4933 1066.9 0 gi|81879729|sp|Q91YT8.1|TM63A_MOUSE RecName: Full= ( 804) 4914 1062.9 0 gi|73961485|ref|XP_547510.2| PREDICTED: similar to ( 854) 4903 1060.5 0 gi|154425919|gb|AAI51399.1| TMEM63A protein [Bos t ( 803) 4896 1059.0 0 gi|148681192|gb|EDL13139.1| transmembrane protein ( 812) 4888 1057.3 0 gi|149749213|ref|XP_001490828.1| PREDICTED: simila ( 804) 4817 1042.1 0 gi|205360936|ref|NP_001127968.2| transmembrane pro ( 804) 4813 1041.2 0 gi|74215333|dbj|BAE41880.1| unnamed protein produc ( 773) 4793 1036.9 0 gi|149641617|ref|XP_001512688.1| PREDICTED: hypoth ( 801) 4209 911.8 0 gi|118087827|ref|XP_419384.2| PREDICTED: similar t ( 751) 3684 799.3 0 gi|111308093|gb|AAI21430.1| Transmembrane protein ( 799) 3553 771.3 0 gi|149040882|gb|EDL94839.1| transmembrane protein ( 595) 3528 765.8 0 gi|56270467|gb|AAH87407.1| LOC496016 protein [Xeno ( 803) 3522 764.6 0 gi|56206167|emb|CAI20530.1| transmembrane protein ( 819) 3111 676.6 1.1e-191 gi|119624653|gb|EAX04248.1| transmembrane protein ( 882) 3111 676.6 1.2e-191 gi|109486729|ref|XP_001064861.1| PREDICTED: simila ( 811) 2996 651.9 2.9e-184 gi|194039385|ref|XP_001929588.1| PREDICTED: transm ( 830) 2892 629.7 1.5e-177 gi|74744754|sp|Q5T3F8.1|TM63B_HUMAN RecName: Full= ( 832) 2892 629.7 1.5e-177 gi|119624652|gb|EAX04247.1| transmembrane protein ( 895) 2892 629.7 1.6e-177 gi|194223554|ref|XP_001497713.2| PREDICTED: simila ( 941) 2889 629.1 2.6e-177 gi|123783877|sp|Q3TWI9.1|TM63B_MOUSE RecName: Full ( 832) 2884 628.0 5e-177 gi|76650425|ref|XP_883366.1| PREDICTED: transmembr ( 830) 2883 627.7 5.8e-177 gi|26355286|dbj|BAC41131.1| unnamed protein produc ( 832) 2882 627.5 6.7e-177 gi|118088063|ref|XP_419493.2| PREDICTED: similar t ( 838) 2872 625.4 3e-176 gi|126310104|ref|XP_001367071.1| PREDICTED: simila ( 933) 2845 619.7 1.8e-174 gi|189527230|ref|XP_700116.3| PREDICTED: similar t ( 801) 2780 605.7 2.5e-170 gi|37590694|gb|AAH59283.1| Tmem63b protein [Mus mu ( 656) 2575 561.7 3.6e-157 gi|50748524|ref|XP_421286.1| PREDICTED: hypothetic ( 830) 2457 536.5 1.7e-149 gi|169146683|emb|CAQ15065.1| novel protein [Danio ( 796) 2431 530.9 7.9e-148 gi|117558095|gb|AAI27313.1| LOC100036641 protein [ ( 801) 2427 530.0 1.4e-147 gi|50949999|emb|CAH10540.1| hypothetical protein [ ( 742) 2404 525.1 4.2e-146 gi|189531109|ref|XP_001340928.2| PREDICTED: simila ( 707) 2374 518.6 3.5e-144 gi|47230182|emb|CAG10596.1| unnamed protein produc ( 745) 2359 515.4 3.3e-143 gi|21739774|emb|CAD38916.1| hypothetical protein [ ( 519) 2351 513.6 8.4e-143 gi|47224218|emb|CAG09064.1| unnamed protein produc ( 779) 2318 506.7 1.5e-140 gi|73964333|ref|XP_547926.2| PREDICTED: similar to ( 804) 2099 459.8 2.1e-126 gi|194671064|ref|XP_870387.3| PREDICTED: similar t ( 834) 2094 458.7 4.4e-126 gi|34783710|gb|AAH57136.1| Tmem63b protein [Mus mu ( 523) 2090 457.7 5.8e-126 gi|74719955|sp|Q9P1W3.1|TM63C_HUMAN RecName: Full= ( 806) 2089 457.6 9.1e-126 gi|7417474|gb|AAF62556.1|AC007954_1 unknown [Homo ( 810) 2089 457.6 9.2e-126 gi|193785004|dbj|BAG54157.1| unnamed protein produ ( 806) 2084 456.6 1.9e-125 gi|158455058|gb|AAI19858.2| TMEM63B protein [Bos t ( 521) 2078 455.1 3.4e-125 gi|194225233|ref|XP_001493367.2| PREDICTED: simila ( 830) 2069 453.3 1.8e-124 gi|149025254|gb|EDL81621.1| transmembrane protein ( 802) 2058 451.0 9.1e-124 gi|149025253|gb|EDL81620.1| transmembrane protein ( 787) 2048 448.8 4e-123 >>gi|168267586|dbj|BAG09849.1| transmembrane protein 63A (807 aa) initn: 5460 init1: 5460 opt: 5460 Z-score: 6317.3 bits: 1179.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5460; 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88.712% identity (95.706% similar) in 815 aa overlap (22-828:1-812) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 GPLQRAHPQSFLPLVSGKTGAMMDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNS : .::::. : :::: .::.::::.:::::::::::::: gi|148 MTSSPFLDPWPSKAVFVRERLGLGERPNDSYCYNSAKNS 10 20 30 70 80 90 100 110 KIAA07 TVLQGVTFGGIPTVLLIDVSCFL--------FLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEADSES ::::::::::::::::.:::::: ::::::::::::::::::::::::: ::. gi|148 TVLQGVTFGGIPTVLLLDVSCFLDLLGNSHEFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEAGSEA 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 KIAA07 RFQRLSSTSSSGQQDFENELGCCPWLTAIFRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLV ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 RFQRLSS-SSSGQQDFENELGCCPWLTAIFRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLV 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA07 VVSFLSLCVILPVNLSGDLLDKDPYSFGRTTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFFTVGFM :.:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::.:.:::::.::::: gi|148 VISFLSLCVILPVNLSGDLLGKDPYSFGRTTIANLQTDNDLLWLHTVFSVIYLFLTVGFM 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA07 RHHTQSIKYKEENLVRRTLFITGLPRDARKETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIY :::.::.::::.:::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::: gi|148 WHHTRSIRYKEESLVRQTLFITGLPREARKETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYSVAKLIY 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 KIAA07 LCKEKKKTEKSLTYYTNLQVKTGQRTLINPKPCGQFCCCEVLGCEWEDAISYYTRMKDRL ::::.::::::::::::::.:::.::::::::::::::::: ::: ::::::::::.: : gi|148 LCKERKKTEKSLTYYTNLQAKTGRRTLINPKPCGQFCCCEVQGCEREDAISYYTRMNDSL 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 KIAA07 LERITEEERHVQDQPLGMAFVTFQEKSMATYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELY ::::: :: .:::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::: gi|148 LERITAEESRVQDQPLGMAFVTFREKSMATYILKDFNACKCQGLRCKGEPQPSSYSRELC 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 KIAA07 TSKWTVTFAADPEDICWKNLSIQGLRWWLQWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNV .::::::::. :::::::::::::.:::::::::::.::. ::::::::::.:::::::: gi|148 VSKWTVTFASYPEDICWKNLSIQGVRWWLQWLGINFSLFVVLFFLTTPSIIMSTMDKFNV 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 KIAA07 TKPIHALNNPIISQFFPTLLLWSFSALLPSIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLI ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::..::::::: gi|148 TKPIHALNNPVISQFFPTLLLWSFSALLPSIVYYSTLLESHWTRSGENRIMVSKVYIFLI 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 KIAA07 FMVLILPSLGLTSLDFFFRWLFDKTSSEASIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGME ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::: gi|148 FMVLILPSLGLTSLDFFFRWLFDKTSSETSIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGSGME 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 KIAA07 LLRLPGLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPII ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::: gi|148 LLRLPGLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFEYEFGAMYAWMLCVFTVIMAYSITCPII 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 KIAA07 APFGLIYILLKHMVDRHNLYFVYLPAKLEKGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLG .::::::::::::::::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::.:::::::: gi|148 VPFGLIYILLKHMVDRHNLYFAYLPAKLEKRIHFAAVNQALAAPILCLFWLFFFSFLRLG 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 KIAA07 MKAPATLFTFLVLLLTILVCLAHTCFGCFKHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTP . ::::::::::.:::::.:: .::::::::::: :::::: :::::::::::.:::::: gi|148 LTAPATLFTFLVVLLTILACLLYTCFGCFKHLSPWNYKTEESASDKGSEAEAHVPPPFTP 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 KIAA07 YVPRILNGLASERTALSPQQQQQQTYGAIHNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA ::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::: .::. .:..: : ::. gi|148 YVPRILNGLASERTALSPQQQ--QTYGAIRNISGTLPGQPVAQDPSGTAAYAYQES 760 770 780 790 800 810 828 residues in 1 query sequences 2693465022 residues in 7827732 library sequences Tcomplib [34.26] (8 proc) start: Thu Mar 5 21:36:17 2009 done: Thu Mar 5 21:39:49 2009 Total Scan time: 1612.310 Total Display time: 0.540 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]