# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pj01253.fasta.huge -Q ../query/KIAA0789.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0789, 620 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986885 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.9086+/-0.00498; mu= 21.3968+/- 0.341
 mean_var=84.8849+/-19.800, 0's: 0 Z-trim: 2  B-trim: 48 in 1/39
 Lambda= 0.139206

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA0523  ( 468 res)   hg01394                     ( 468) 1870 385.4 5.6e-108


>>KIAA0523  ( 468 res)   hg01394                          (468 aa)
 initn: 1184 init1: 1184 opt: 1870  Z-score: 2030.4  bits: 385.4 E(): 5.6e-108
Smith-Waterman score: 1870;  56.416% identity (81.416% similar) in 452 aa overlap (169-620:22-468)

      140       150       160       170       180       190        
KIAA07 SIARRYGPWFKGKDGNERAKLGDYGGAWSRALKGRVVREKEEERAKYIGCYLDDTQSRAL
                                     ::  ...:   . :. ::::. :: . :.:
KIAA05          ELRQLRRRWFHHFMSDSQGPPALGPEAARPAIHSRGTYIGCFSDDGHERTL
                        10        20        30        40        50 

      200       210       220       230       240       250        
KIAA07 RGVSFFDYKKMTIFRCQDNCAERGYLYGGLEFGAECYCGHKIQATNVSEAECDMECKGER
       .:. :.: .:::. .::: ::::.:.:.::: :::::::... :..:.  ::. :::::.
KIAA05 KGAVFYDLRKMTVSHCQDACAERSYVYAGLEAGAECYCGNRLPAVSVGLEECNHECKGEK
              60        70        80        90       100       110 

      260       270       280       290       300       310        
KIAA07 GSVCGGANRLSVYRLQLAQESARRYGSAVFRGCFRRPDNLSLALPVTAAMLNMSVDKCVD
       :::::...::::::..  : ..:.  .:..::::: :.:.. :.: .  . :..:  :  
KIAA05 GSVCGAVDRLSVYRVDELQPGSRKRRTATYRGCFRLPENITHAFPSSLIQANVTVGTCSG
             120       130       140       150       160       170 

      320       330       340       350       360       370        
KIAA07 FCTEKEYPLAALAGTACHCGFPTTRFPLHDREDEQLCAQKCSAEEFESCGTPSYFIVYQT
       ::..::.::: : :  :.:..:: :: :.:  : ..:.:   :...       :  ::::
KIAA05 FCSQKEFPLAILRGWECYCAYPTPRFNLRDAMDSSVCGQDPEAQRLAE-----YCEVYQT
             180       190       200       210            220      

      380       390       400       410       420       430        
KIAA07 QVQDNRCMDRRFLPGKSKQLIALASFPGAGNTWARHLIELATGFYTGSYYFDGSLYNKGF
        :::.:: ::::::.::: ..::.::::::::::::::: :::::::::::::.::::::
KIAA05 PVQDTRCTDRRFLPNKSKVFVALSSFPGAGNTWARHLIEHATGFYTGSYYFDGTLYNKGF
        230       240       250       260       270       280      

      440       450       460       470       480       490        
KIAA07 KGERDHWRSGRTICIKTHESGQKEIEAFDAAILLIRNPYKALMAEFNRKYGGHIGFAAHA
       :::.::::: ::::.::::::..::: ::.:::::::::..:.:::::: .::.:.::  
KIAA05 KGEKDHWRSRRTICVKTHESGRREIEMFDSAILLIRNPYRSLVAEFNRKCAGHLGYAADR
        290       300       310       320       330       340      

      500       510       520       530       540       550        
KIAA07 HWKGKEWPEFVRNYAPWWATHTLDWLKFGKKVLVVHFEDLKQDLFVQLGRMVSLLGVAVR
       .::.::::.:: .:: ::..:.:::::.::..::::.:.:...:   : .::..:.:.: 
KIAA05 NWKSKEWPDFVNSYASWWSSHVLDWLKYGKRLLVVHYEELRRSLVPTLREMVAFLNVSVS
        350       360       370       380       390       400      

      560       570       580       590       600       610        
KIAA07 EDRLLCVESQKDGNFKRSGLRKLEYDPYTADMQKTISAYIKMVDAALKGRNLTGVPDDYY
       :.::::::..:.:.:.: : :. . .:.: .:.  :..::. :: ::. .: ::.: .: 
KIAA05 EERLLCVENNKEGSFRRRGRRSHDPEPFTPEMKDLINGYIRTVDQALRDHNWTGLPREYV
        410       420       430       440       450       460      

      620
KIAA07 PR
       ::
KIAA05 PR
         




620 residues in 1 query   sequences
1986885 residues in 2037 library sequences
 Scomplib [34.26]
 start: Thu Dec 18 15:16:04 2008 done: Thu Dec 18 15:16:05 2008
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]