# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05408.fasta.huge -Q ../query/KIAA0783.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0783, 899 aa vs ./tmplib.23663 library 1986606 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9171+/-0.00911; mu= -7.3496+/- 0.617 mean_var=322.1532+/-75.069, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 10 in 2/38 Lambda= 0.071457 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0239 ( 849 res) ha06313 ( 849) 372 52.6 2.3e-07 KIAA1807 ( 702 res) fk00712 ( 702) 364 51.7 3.6e-07 KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214) 290 44.3 0.0001 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 277 42.9 0.00024 KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119) 277 42.9 0.00025 KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100) 274 42.6 0.0003 >>KIAA0239 ( 849 res) ha06313 (849 aa) initn: 425 init1: 130 opt: 372 Z-score: 224.1 bits: 52.6 E(): 2.3e-07 Smith-Waterman score: 470; 25.043% identity (52.696% similar) in 575 aa overlap (143-684:61-586) 120 130 140 150 160 170 KIAA07 KEEEENGERPRKKREKEKEKEKEKEKEKEREKEKEKATVSENVAASAAATTPATSPPAVN :....: ..: . : .. . ::: : KIAA02 EIAHVGQSCFKEYSAGRLRGAHATTTFGRMEEKRRKYSISSD--NSDTTDSHATSTSASR 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 KIAA07 TSPSVPTTTTATEEQVSEPKKWNLRRNRPLLDFVSMEELNDM-----DDYDSEDDNDWRP : ..:..: . . .: : .. :. :... .. : ::: : :: KIAA02 CS-KLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRT----DLITAMKIPDSYQLSPDDYYILAD-PWRQ 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 KIAA07 TVVKRKGRSASQKEGSDGDNED-----DEDEGSGSDEDENDEGNDEDHSSPASEGGCKKK .:: .. :... : :: .. . .. : :.: :: . KIAA02 E--WEKGVQVP--AGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSSTMLGEG-SQPDWPGGSRYD 150 160 170 180 190 290 300 310 320 KIAA07 KSKV----LSRNSADDEELTN---DSLTLSQSKSNEDSLILE------KSQNWSSQKMDH ... : ... .:. : ::: . . ..: . ..:. . ..:. KIAA02 LDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDE 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 KIAA07 ILICCVCLGDNSEDADEIIQCDNCGITVHEGCYGVDGESDSIMSSASENSTEPWFCDACK ..: :: . ..::..:.. ::.:.. ::..:::. . : :.: .: KIAA02 DVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGI-----------LKVPTGSWLCRTCA 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 KIAA07 CGVSPSCELCPNQDGIFKETDAG-RWVHIVCALYVPGVAFGDIDKLRPVT-LTEMNYSKY ::.:.: :::.. : .: : .: .:::. :::..: :..: .:..:.: .... :.. KIAA02 LGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKISHIPASRW 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 KIAA07 GAKECSFCEDPRFARTGVCISCDAGMCRAYFHVTCAQKEGLLSEAAAEEDIADPFFAYCK : ::.:.. ::.::.:. : :::::: .:: .. .. : ..:. KIAA02 -ALSCSLCKEC----TGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSFCQ 370 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 KIAA07 QHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQEREKQLSPEAQARINARLQQYRAKAE-LARSTR .:.: :. . . . : . . : ... : :. . : . . .. KIAA02 EHSDGGPRN-------------EPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVE 430 440 450 460 570 580 590 600 610 620 KIAA07 PQAWVPREKLPRPLTSSASAIRKLMRKAE----LMGISTDIFPVDN-SDTSSSVDGRRKH : . : : . :.. :: :::. :. .:: ::: .. ..: :: . KIAA02 PAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTD--EVDNLAQQEQDVLYRRLK 470 480 490 500 510 520 630 640 650 660 670 KIAA07 KQPALTADFVNYYFERNM-RMIQIQENMAEQK-NIKDKLENEQEKLHVEYNKLCESLEEL : :. ::. :. .: . ...... . : :: .: . ::..: KIAA02 LFTHLRQDLERV---RNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKL-IEQD-LCRGLSTS 530 540 550 560 570 580 680 690 700 710 720 730 KIAA07 QNLNGKLRSEGQGIWALLGRITGQKLNIPAILRAPKERKPSKKEGGTQKTSTLPAVLYSC ..: KIAA02 FPIDGTFFNSWLAQSVQITAENMAMSEWPLNNGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRD 590 600 610 620 630 640 >>KIAA1807 ( 702 res) fk00712 (702 aa) initn: 460 init1: 132 opt: 364 Z-score: 220.7 bits: 51.7 E(): 3.6e-07 Smith-Waterman score: 489; 27.747% identity (59.066% similar) in 364 aa overlap (326-686:59-393) 300 310 320 330 340 350 KIAA07 ELTNDSLTLSQSKSNEDSLILEKSQNWSSQKMDHILICCVCLGDNSEDADEIIQCDNCGI ..:. ..: :: . ..::..:.. ::.:.: KIAA18 YTMERVLEEFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNI 30 40 50 60 70 80 360 370 380 390 400 410 KIAA07 TVHEGCYGVDGESDSIMSSASENSTEPWFCDACKCGVSPSCELCPNQDGIFKETDAG-RW ::..:::. .. :.: :.: .: ::.:.: :::.. : .: : .: .: KIAA18 CVHQACYGI--------LKVPEGS---WLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKW 90 100 110 120 130 420 430 440 450 460 470 KIAA07 VHIVCALYVPGVAFGDIDKLRPVTLTEMNYSKYGAKECSFCEDPRFARTGVCISCDAGMC ::. :::..: :..:. .:..:.: . :. : ::.:.. .: :. :.:.. : KIAA18 VHVSCALWIPEVSIGSPEKMEPITKVSHIPSSRWALVCSLCNE-KF---GASIQCSVKNC 140 150 160 170 180 190 480 490 500 510 520 530 KIAA07 RAYFHVTCAQKEGLLSEAAAEEDIADPFFAYCKQHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQ :. :::::: .:: .. :. : .:: .:... :: . .: : . : KIAA18 RTAFHVTCAFDRGLEMKTILAENDEVKFKSYCPKHSSH--RKPE-------ESLGKGAAQ 200 210 220 230 240 540 550 560 570 580 590 KIAA07 ER-EKQLSPEAQARINARLQQYRAKAELARSTRPQAWVPREKLPRPLTSSASAIRKLMRK : . ::. . : :.: : .:. . :.: : : ... .. : : KIAA18 ENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEAHRV-SVRKQKLQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLP 250 260 270 280 290 300 600 610 620 630 640 650 KIAA07 AELMGISTDIFPVDNS-DTSSSVDGRRKHKQPALTADFVNYYFERNMRMIQIQENMAEQK :.. . . . . . . .. . .: .. :. . :.: . . ...... . . KIAA18 EEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDEEDNLAKREQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVR 310 320 330 340 350 360 660 670 680 690 700 710 KIAA07 NIKDKLENEQEKLHVEYNKLCESLEELQNLNGKLRSEGQGIWALLGRITGQKLNIPAILR :. . ...::.. ..:. :.. :: :: KIAA18 NLT-YMVTRREKIK---RSVCKVQEQIFNLYTKLLEQERVSGVPSSCSSSSLENMLLFNS 370 380 390 400 410 720 730 740 750 760 770 KIAA07 APKERKPSKKEGGTQKTSTLPAVLYSCGICKKNHDQHLLLLCDTCKLHYHLGCLDPPLTR KIAA18 PSVGPDAPKIEDLKWHSAFFRKQMGTSLVHSLKKPHKRDPLQNSPGSEGKTLLKQPDLCG 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214 aa) initn: 333 init1: 151 opt: 290 Z-score: 176.4 bits: 44.3 E(): 0.0001 Smith-Waterman score: 416; 25.547% identity (54.258% similar) in 411 aa overlap (297-677:188-569) 270 280 290 300 310 320 KIAA07 DEDHSSPASEGGCKKKKSKVLSRNSADDEELTNDSLTLSQSKSNEDSLILEKSQNWSSQK .. :.. : .. ...: . .:.. ... KIAA12 DAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLESRSSGAQQSL 160 170 180 190 200 210 330 340 350 360 370 380 KIAA07 MDHILICCVCLGDNSEDADEIIQCDNCGITVHEGCYGVDGESDSIMSSASENSTEPWFCD .:. .::::: :. .... :. :: :...::. :::: .. :.: KIAA12 IDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVPYIPEG-----------QWLCR 220 230 240 250 260 390 400 410 420 430 440 KIAA07 ACKCGVSPS----CELCPNQDGIFKETDAGRWVHIVCALYVPGVAFGDIDKLRPVTLTEM : : ::: : ::::. : ::.:. :.:.:.:::...: : :.. :.:. . KIAA12 -C-CLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDN 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 KIAA07 NYSKYGAKECSFCEDPRFARTGVCISCDAGMCRAYFHVTCAQKEGLLS--EAAAEEDIAD : .:.. . :. :.: : . :::::::. ::. : : .. KIAA12 IPPARWKLTCYICKQKGL---GAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNG 330 340 350 360 370 380 510 520 530 540 550 KIAA07 PFF-----AYCKQHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQEREKQLSPEAQARINARLQQY .: :::. :. .::. . .: . . .: :. . : . . ... .. KIAA12 TIFTVRKTAYCEAHSPPGAATARRKGD-SPRSISETGDEEGLKEGDGEEEEEEEVEEEEQ 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 KIAA07 RAKAELARSTRPQAWVPREKLPRPLTSSASAIRKLMRKAELMGIST-DIFP------VDN .:.. .. : . ::.. :. : .:. .. : : .: . .: . . KIAA12 EAQGGVSGSLKG---VPKK-------SKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAVPQIPS 450 460 470 480 490 610 620 630 640 650 KIAA07 SDTSSSVDGRRKHKQPALTADFVNYYF-ERNMR-----------MIQIQENMAEQKNIKD .. .: ... . . ::.. .:. : .: :.: :::.. . KIAA12 YRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRN-AEQREQDE 500 510 520 530 540 660 670 680 690 700 710 KIAA07 KLENEQEKLHVEYNKLCESLEELQNLNGKLRSEGQGIWALLGRITGQKLNIPAILRAPKE : .:.:. ..:: ..:: KIAA12 KTSAVKEELKY-WQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNVLLR 550 560 570 580 590 600 >>KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073 aa) initn: 315 init1: 127 opt: 277 Z-score: 169.9 bits: 42.9 E(): 0.00024 Smith-Waterman score: 330; 31.395% identity (58.140% similar) in 172 aa overlap (342-509:738-893) 320 330 340 350 360 370 KIAA07 DSLILEKSQNWSSQKMDHILICCVCLGDNSEDADEI-IQCDNCGITVHEGCYGVDGESDS ::. : ..: .:.. :: .:::: KIAA06 KQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPP---- 710 720 730 740 750 760 380 390 400 410 420 KIAA07 IMSSASENSTEPWFCDACKCG-VSPSCELCPNQDGIFKETDAGRWVHIVCALYVPGVAFG ..:::. :.:. :. . . .: :: . : ..... ::::. ::. . . : KIAA06 --AKASED----WMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFV 770 780 790 800 810 430 440 450 460 470 480 KIAA07 DIDKLRPVTLTEMNYSKYGAKECSFCEDPRFARTGVCISCDAGMCRAYFHVTCAQKEGLL .: . :: .... .. : : ::. : .: :..:. : : . :::.::: :.. KIAA06 NIAERSPVDVSKIPLPRFKLK-CIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVM 820 830 840 850 860 870 490 500 510 520 530 540 KIAA07 SEAAAEEDIADPF--FAYCKQHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQEREKQLSPEAQAR . .: :: : : .: KIAA06 MQP---DDW--PFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRL 880 890 900 910 920 930 >>KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119 aa) initn: 236 init1: 117 opt: 277 Z-score: 169.6 bits: 42.9 E(): 0.00025 Smith-Waterman score: 310; 30.128% identity (56.410% similar) in 156 aa overlap (337-491:772-914) 310 320 330 340 350 360 KIAA07 SKSNEDSLILEKSQNWSSQKMDHILICCVCLGDNSEDADEIIQCDNCGITVHEGCYGVDG .::.. .. .: : .: . :: .:::. KIAA08 KSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDG--TSPLIACGKCCLQVHASCYGI-- 750 760 770 780 790 370 380 390 400 410 420 KIAA07 ESDSIMSSASENSTEPWFCDACKCGV-SPSCELCPNQDGIFKETDAGRWVHIVCALYVPG : .: : :. : . . : :: . : .. : ::.:..::. :: KIAA08 --------RPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPE 800 810 820 830 840 430 440 450 460 470 480 KIAA07 VAFGDIDKLRPVTLTEMNYSKYGAKECSFCEDPRFARTGVCISCDAGMCRAYFHVTCAQK . : .. . .:: .. . ... : : .:. .:.::.:. : . ::::::. KIAA08 ARFLNVIERHPVDISAIPEQRWKLK-CVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHA 850 860 870 880 890 900 490 500 510 520 530 540 KIAA07 EGLLSEAAAEEDIADPFFAYCKQHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQEREKQLSPEAQ :.: : KIAA08 AGVLMEPDDWPYVVSITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQ 910 920 930 940 950 960 >>KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100 aa) initn: 264 init1: 137 opt: 274 Z-score: 168.1 bits: 42.6 E(): 0.0003 Smith-Waterman score: 332; 21.252% identity (50.474% similar) in 527 aa overlap (10-491:394-902) 10 20 30 KIAA07 VFSKRPPHGFLMDRSSKRRQVKPLAASLLEALDYDSSDD . .:... : . . :. . . KIAA07 RKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKAS 370 380 390 400 410 420 40 50 60 70 80 90 KIAA07 SDFKVGDASDSEGSGNGSEDASK--DSGEGSCSDSEENILEEELNEDIKVKEEQLKNSAE .:. . ..... ... :..: :..: :: . :. . . :: .. . :.: KIAA07 RSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSE 430 440 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 KIAA07 EEVLSSEKQLIKMEKKEEEENGERPRKKREKEKEKEKEKEKEKEREKEKEKATVSENVAA :: .:. :. . . . . .:. . : : .. . : . .. ..... KIAA07 EESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPL 490 500 510 520 530 540 160 170 180 190 200 KIAA07 SAAATTPATSPPAVNTSPSVPTTTTATEEQ---VSEPKKWNLRRNRPLLD-----FVSME :.. : : :. . :. : . ... :. ..: .. ... . :. : KIAA07 STGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSG 550 560 570 580 590 600 210 220 230 240 250 260 KIAA07 ELND-----MDDYDSEDDNDWRPTVVKRKGRSASQ--KEGSDGDNEDDEDEGSGSDEDEN : :. . . ... ...:: . . .:: :. . .:.: : : :.: KIAA07 ERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPE---VLSIEEEV 610 620 630 640 650 660 270 280 290 300 310 KIAA07 DEGNDEDHSSPASE-GGCKKKKSKVLSRNSADDEELTNDSL--TLSQSKSNEDSLILEKS .: :. ..: . :. . . .. .: .. :: . . :: :.. KIAA07 EE--TESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND 670 680 690 700 710 320 330 340 350 KIAA07 QNWSSQKMDHIL------------ICCVCLGDN----------SEDADEI-IQCDNCGIT : . :.:... .: . .: ::. . :.: .: . KIAA07 ARWET-KLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVR 720 730 740 750 760 770 360 370 380 390 400 410 KIAA07 VHEGCYGVDGESDSIMSSASENSTEPWFCDACKCGV-SPSCELCPNQDGIFKETDAGRWV :: .:::. :.. . :.: :: .. . : :: . : .:.: ..:. KIAA07 VHASCYGIP----------SHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWA 780 790 800 810 820 420 430 440 450 460 470 KIAA07 HIVCALYVPGVAFGDIDKLRPVTLTEMNYSKYGAKECSFCEDPRFAR-TGVCISCDAGMC :..::. :: : : .. . . . .. .. : : ::. : : .:.::.:. : : KIAA07 HVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLK-CIFCRH-RVKRVSGACIQCSYGRC 830 840 850 860 870 880 480 490 500 510 520 530 KIAA07 RAYFHVTCAQKEGLLSEAAAEEDIADPFFAYCKQHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQ : ::::::. :.: : KIAA07 PASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNT 890 900 910 920 930 940 899 residues in 1 query sequences 1986606 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:50 2008 done: Thu Dec 18 15:15:50 2008 Total Scan time: 0.630 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]