# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05362.fasta.huge -Q ../query/KIAA0780.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0780, 1100 aa vs ./tmplib.23663 library 1986405 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7468+/-0.00596; mu= 9.6725+/- 0.406 mean_var=160.0631+/-36.662, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.101374 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119) 2155 327.9 4.9e-90 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 2041 311.2 5e-85 KIAA0234 ( 1512 res) ha02764 (1512) 440 77.2 1.9e-14 KIAA0215 ( 857 res) ha02776 ( 857) 385 68.9 3.5e-12 KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214) 379 68.2 8.1e-12 KIAA0239 ( 849 res) ha06313 ( 849) 373 67.1 1.2e-11 KIAA1807 ( 702 res) fk00712 ( 702) 350 63.7 1.1e-10 KIAA0783 ( 899 res) hk05408 ( 899) 274 52.7 2.8e-07 >>KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119 aa) initn: 3845 init1: 2113 opt: 2155 Z-score: 1708.3 bits: 327.9 E(): 4.9e-90 Smith-Waterman score: 3842; 54.690% identity (75.704% similar) in 1066 aa overlap (37-1055:7-1066) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 SEQLSPSAEQVSQISQISLGRRPLSSLPPPPSRALAPTRAPDTALTIMEVAEVESPLNPS : : :: . . . . : .: .. ::: KIAA08 RIFGASPPRNLAIQKCASRTAAAMG-SEDHGAQNPS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA07 CKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPI ::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.:::::::::: :::::...::::: KIAA08 CKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTYDDIDDVVIPAPI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA07 QQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPI ::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::::::::::::.:: KIAA08 QQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLERKYWKNLTFVSPI 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA07 YGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTED :::::.::.::. : .:::. : :.::.::.::: :::::::::::::::::::::::: KIAA08 YGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTED 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA07 MDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLK :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::: .:: KIAA08 MDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLRHKMTLISPIILK 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA07 KYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKD ::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: :::::: KIAA08 KYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDYGKVATQCTCRKD 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA07 MVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVR-KASRS :::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.:: ..::...: : ... : : KIAA08 MVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSASRASLKAKLLRR 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 KIAA07 FQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGAEV---PNPDSVTD . :: :.:: .. .::.. ::: : :.: KIAA08 SHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPEEEEEEPQPLPHGR 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 KIAA07 DLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCL--STSVTEDIKT . . .:. .. ::: :.:.::..... . : .. .. : . . . 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KIAA06 SLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQV 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 KIAA07 SSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYR-SVPSIS---------S .. . . :: ... . .... :. . :...: : :: : : KIAA06 EDGLTFP---DYSDSTEVKFEELKNVKLEEEDEEEEQEAAALDLSVNPASVGGRLVFSGS 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 KIAA07 EADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNG---L . .: :..: . :. :: : : :: . ... :::: :.:...: . KIAA06 KKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETS---EPLSCRAQGQT-GVLT------VHSYAKGDGRV 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 KIAA07 EPGEIPAVPSGERN-SFKVPSIAE---------GENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQ :: . .: ::. .:: ::: ::. :.:::. : . :..: : KIAA06 TVGEPCTRKKGSAARSFSERELAEVADEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPLVL--Q 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 KIAA07 QAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICT . ::.: : :. :::.::::.::::: .:::.. ::: ::.:.: :.:.. ::::.: KIAA06 ECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKPLSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCM 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 KIAA07 LLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYS--EENIEYSPPNAFL ... ::. . .. ... . .... .. .:::::::::: . .:. : : .: KIAA06 IFQTYHQVEFGGFNQNC---GNASDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTP--YL 690 700 710 720 730 770 780 790 800 810 820 KIAA07 EEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQ ::::::.:.:: :: :::::::::.: . . :.:.::. :: .::::.::::::.. KIAA06 EEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQR 740 750 760 770 780 790 830 840 850 860 870 880 KIAA07 TKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQC .....:.:: ::::. :.::.:. ::. .::..::: :.:::::::..: ::..: :.:: KIAA06 ANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQC 800 810 820 830 840 850 890 900 910 920 930 KIAA07 SYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNV-KSKACEKVISVGQTVI :.::::..:::.::.::::.:.:::::.:: :::::::. ::. ..:. . :..:: :: KIAA06 SHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWPFVVFITCFRHKI-PNLERAKGALQSITAGQKVI 860 870 880 890 900 910 940 950 960 970 980 990 KIAA07 TKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVK .::.: :.:.:.:. .:..::::: ::::::: . .::::::.:::..:::::::::::. KIAA06 SKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFDDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVR 920 930 940 950 960 970 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA07 WPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFVSAGRCHL : ::..::::. .:. .:::::::::::...::.:.::::::::::::.:. : KIAA06 WTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDGSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRF 980 990 1000 1010 1020 1030 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA07 GTCQVNSLSSPHVSQAQQETYLGFWINSKKSQCNIFLSGTY KIAA06 NEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDYIEPALYRAIME 1040 1050 1060 1070 >>KIAA0234 ( 1512 res) ha02764 (1512 aa) initn: 440 init1: 440 opt: 440 Z-score: 351.1 bits: 77.2 E(): 1.9e-14 Smith-Waterman score: 455; 33.193% identity (63.866% similar) in 238 aa overlap (145-356:353-590) 120 130 140 150 160 170 KIAA07 DDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGK---YCTPRYL-DYE . .... : ..:.: : . : .. : KIAA02 EIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTE 330 340 350 360 370 380 180 190 200 210 KIAA07 DLERKYWKNLTFVAPI----YGADINGSIYDEGVD-------------EWNIARLN-TVL .:...:. .. . :::::... . : :. . : .:. KIAA02 LVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVM 390 400 410 420 430 440 220 230 240 250 260 KIAA07 DVVEEE--CGIS--IEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPP :... : :. : :...:.:: :: ..: :: :: :::::::.::::.::..: KIAA02 PVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS 450 460 470 480 490 500 270 280 290 300 310 320 KIAA07 EHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPY ...::.. . . : .. .:.. .::..:..: ..:.: . .: ::::.:::: KIAA02 LAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPR 510 520 530 540 550 560 330 340 350 360 370 380 KIAA07 GYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWK .::.:::.:.: ::..:: :. :. :. KIAA02 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLD 570 580 590 600 610 620 >>KIAA0215 ( 857 res) ha02776 (857 aa) initn: 270 init1: 119 opt: 385 Z-score: 310.6 bits: 68.9 E(): 3.5e-12 Smith-Waterman score: 385; 40.361% identity (62.651% similar) in 166 aa overlap (762-920:246-402) 740 750 760 770 780 790 KIAA07 EGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEIC :.:... . : :: : :: .:::: .. KIAA02 NMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDM-VFCDKCNVCVHQACYGI--LKVP 220 230 240 250 260 270 800 810 820 830 840 KIAA07 DG-WLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNN-KWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQ- .: ::: : . . .: :: .::::: ::.. ::::: ::. .::: .. ::: . KIAA02 EGSWLCRSCVLGIYP-QCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA-CPERMEP 280 290 300 310 320 330 850 860 870 880 890 900 KIAA07 -IDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEP--DD ...:: .: : : .:. . .::::::: : ..:::::: :. :. :. KIAA02 ITKISHIPPSRWALVCNLCKLK----TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDE 340 350 360 370 380 910 920 930 940 950 960 KIAA07 WPYV-VNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVM : . :..:. : KIAA02 GDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVR 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214 aa) initn: 324 init1: 191 opt: 379 Z-score: 304.0 bits: 68.2 E(): 8.1e-12 Smith-Waterman score: 379; 40.541% identity (64.865% similar) in 148 aa overlap (761-903:231-373) 740 750 760 770 780 790 KIAA07 SEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEI : ...... : : . :: :::.: : KIAA12 EKESYLESRSSGAQQSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVP--YI 210 220 230 240 250 800 810 820 830 840 KIAA07 CDG-WLCARCKRN-AWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQ .: ::: : .. . ..: :: .:::.:::....::::.::. .::: :.:. 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